RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000585091.1

CENPX-211, Transcript of centromere protein X, humanhuman

TSL 3

Gene CENPX, Length 739 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPX-211ENST00000585091 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP29.81■■■□□ 2.36
CENPX-211ENST00000585091 CCDC125Q86Z20 511 aa29.8■■■□□ 2.36
CENPX-211ENST00000585091 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa29.79■■■□□ 2.36
CENPX-211ENST00000585091 EP400Q96L91 3159 aa29.79■■■□□ 2.36
CENPX-211ENST00000585091 PRAG1Q86YV5 1406 aa29.78■■■□□ 2.36
CENPX-211ENST00000585091 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP29.77■■■□□ 2.36
CENPX-211ENST00000585091 RGL3Q3MIN7 710 aa29.77■■■□□ 2.36
CENPX-211ENST00000585091 STK26Q9P289 416 aa29.74■■■□□ 2.35
CENPX-211ENST00000585091 IFT172Q9UG01 1749 aa29.74■■■□□ 2.35
CENPX-211ENST00000585091 CCDC144AA2RUR9 1427 aa29.72■■■□□ 2.35
CENPX-211ENST00000585091 NUTM2FA1L443 756 aa29.72■■■□□ 2.35
CENPX-211ENST00000585091 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP29.72■■■□□ 2.35
CENPX-211ENST00000585091 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa29.72■■■□□ 2.35
CENPX-211ENST00000585091 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP29.71■■■□□ 2.35
CENPX-211ENST00000585091 WAPLQ7Z5K2 1190 aa29.71■■■□□ 2.35
CENPX-211ENST00000585091 ESCO1Q5FWF5 840 aa29.7■■■□□ 2.35
CENPX-211ENST00000585091 ATRNO75882 1429 aa29.7■■■□□ 2.34
CENPX-211ENST00000585091 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa29.7■■■□□ 2.34
CENPX-211ENST00000585091 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa29.68■■■□□ 2.34
CENPX-211ENST00000585091 TMEM132EQ6IEE7 984 aa29.68■■■□□ 2.34
CENPX-211ENST00000585091 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP29.67■■■□□ 2.34
CENPX-211ENST00000585091 MPHOSPH9Q99550 1183 aa29.67■■■□□ 2.34
CENPX-211ENST00000585091 PXDNQ92626 1479 aa29.65■■■□□ 2.34
CENPX-211ENST00000585091 FOXO3O43524 673 aa29.63■■■□□ 2.33
CENPX-211ENST00000585091 KNDC1Q76NI1 1749 aa29.62■■■□□ 2.33
CENPX-211ENST00000585091 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP29.62■■■□□ 2.33
CENPX-211ENST00000585091 TECPR2O15040 1411 aa29.62■■■□□ 2.33
CENPX-211ENST00000585091 MYOM2P54296 1465 aa29.61■■■□□ 2.33
CENPX-211ENST00000585091 NPHP3Q7Z494 1330 aa29.61■■■□□ 2.33
CENPX-211ENST00000585091 PIK3C2GO75747 1445 aa29.6■■■□□ 2.33
CENPX-211ENST00000585091 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa29.59■■■□□ 2.33
CENPX-211ENST00000585091 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP29.59■■■□□ 2.33
CENPX-211ENST00000585091 FMN2Q9NZ56 1722 aa29.58■■■□□ 2.33
CENPX-211ENST00000585091 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP29.56■■■□□ 2.32
CENPX-211ENST00000585091 BCL9LQ86UU0 1499 aa29.55■■■□□ 2.32
CENPX-211ENST00000585091 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP29.55■■■□□ 2.32
CENPX-211ENST00000585091 ABCC11Q96J66 1382 aa29.55■■■□□ 2.32
CENPX-211ENST00000585091 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP29.55■■■□□ 2.32
CENPX-211ENST00000585091 DEFB132Q7Z7B7 95 aa29.55■■■□□ 2.32
CENPX-211ENST00000585091 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP29.55■■■□□ 2.32
CENPX-211ENST00000585091 LRP5O75197 1615 aa29.55■■■□□ 2.32
CENPX-211ENST00000585091 PLEKHG5O94827 1062 aa29.48■■■□□ 2.31
CENPX-211ENST00000585091 KIF1AQ12756 1690 aa29.47■■■□□ 2.31
CENPX-211ENST00000585091 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP29.47■■■□□ 2.31
CENPX-211ENST00000585091 CFAP70Q5T0N1 1121 aa29.47■■■□□ 2.31
CENPX-211ENST00000585091 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP29.46■■■□□ 2.31
CENPX-211ENST00000585091 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP29.44■■■□□ 2.3
CENPX-211ENST00000585091 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa29.44■■■□□ 2.3
CENPX-211ENST00000585091 NRXN1Q9ULB1 1477 aa29.43■■■□□ 2.3
CENPX-211ENST00000585091 KRT28Q7Z3Y7 464 aa29.43■■■□□ 2.3
CENPX-211ENST00000585091 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP29.4■■■□□ 2.3
CENPX-211ENST00000585091 USP32Q8NFA0 1604 aa29.4■■■□□ 2.3
CENPX-211ENST00000585091 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP29.39■■■□□ 2.3
CENPX-211ENST00000585091 CABLES1Q8TDN4 633 aa29.39■■■□□ 2.3
CENPX-211ENST00000585091 PRAM1Q96QH2 718 aa29.39■■■□□ 2.3
CENPX-211ENST00000585091 RALGAPBQ86X10 1494 aa29.39■■■□□ 2.3
CENPX-211ENST00000585091 GLI3P10071 1580 aa29.39■■■□□ 2.29
CENPX-211ENST00000585091 PHF8Q9UPP1 1060 aa29.38■■■□□ 2.29
CENPX-211ENST00000585091 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP29.38■■■□□ 2.29
CENPX-211ENST00000585091 HRCP23327 699 aa29.37■■■□□ 2.29
CENPX-211ENST00000585091 UNC5CLQ8IV45 518 aa29.37■■■□□ 2.29
CENPX-211ENST00000585091 SLIT2O94813 1529 aa29.36■■■□□ 2.29
CENPX-211ENST00000585091 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa29.36■■■□□ 2.29
CENPX-211ENST00000585091 TNS3Q68CZ2 1445 aa29.36■■■□□ 2.29
CENPX-211ENST00000585091 ABCA3Q99758 1704 aa29.34■■■□□ 2.29
CENPX-211ENST00000585091 BRWD3Q6RI45 1802 aa29.34■■■□□ 2.29
CENPX-211ENST00000585091 SIRT1Q96EB6 747 aa29.34■■■□□ 2.29
CENPX-211ENST00000585091 LMOD2Q6P5Q4 547 aa29.33■■■□□ 2.29
CENPX-211ENST00000585091 PLCH1Q4KWH8 1693 aa29.32■■■□□ 2.28
CENPX-211ENST00000585091 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP29.32■■■□□ 2.28
CENPX-211ENST00000585091 SEPT12Q8IYM1 358 aa29.32■■■□□ 2.28
CENPX-211ENST00000585091 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa29.32■■■□□ 2.28
CENPX-211ENST00000585091 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP29.3■■■□□ 2.28
CENPX-211ENST00000585091 POGKQ9P215 609 aa29.3■■■□□ 2.28
CENPX-211ENST00000585091 ADGRB1O14514 1584 aa29.29■■■□□ 2.28
CENPX-211ENST00000585091 DLC1Q96QB1 1528 aa29.28■■■□□ 2.28
CENPX-211ENST00000585091 PSME1Q06323 249 aa29.27■■■□□ 2.28
CENPX-211ENST00000585091 TRAK1Q9UPV9 953 aa29.27■■■□□ 2.28
CENPX-211ENST00000585091 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa29.27■■■□□ 2.28
CENPX-211ENST00000585091 ADGRB2O60241 1585 aa29.25■■■□□ 2.27
CENPX-211ENST00000585091 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP29.24■■■□□ 2.27
CENPX-211ENST00000585091 BAG6P46379 1132 aa29.24■■■□□ 2.27
CENPX-211ENST00000585091 SBNO1A3KN83 1393 aa29.24■■■□□ 2.27
CENPX-211ENST00000585091 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP29.23■■■□□ 2.27
CENPX-211ENST00000585091 KRT27Q7Z3Y8 459 aa29.23■■■□□ 2.27
CENPX-211ENST00000585091 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP29.22■■■□□ 2.27
CENPX-211ENST00000585091 NWD2Q9ULI1 1742 aa29.22■■■□□ 2.27
CENPX-211ENST00000585091 PRR36Q9H6K5 1346 aa29.21■■■□□ 2.27
CENPX-211ENST00000585091 ANKARQ7Z5J8 1434 aa29.2■■■□□ 2.27
CENPX-211ENST00000585091 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP29.2■■■□□ 2.26
CENPX-211ENST00000585091 ARHGEF10O15013 1369 aa29.19■■■□□ 2.26
CENPX-211ENST00000585091 DCAF11Q8TEB1 546 aa29.19■■■□□ 2.26
CENPX-211ENST00000585091 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP29.19■■■□□ 2.26
CENPX-211ENST00000585091 FAM83GA6ND36 823 aa29.18■■■□□ 2.26
CENPX-211ENST00000585091 VPS72Q15906 364 aa29.18■■■□□ 2.26
CENPX-211ENST00000585091 YY1P25490 414 aa29.17■■■□□ 2.26
CENPX-211ENST00000585091 ALS2Q96Q42 1657 aa29.17■■■□□ 2.26
CENPX-211ENST00000585091 NRAPQ86VF7 1730 aa29.17■■■□□ 2.26
CENPX-211ENST00000585091 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP29.15■■■□□ 2.26
CENPX-211ENST00000585091 TULP4Q9NRJ4 1543 aa29.14■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.4 ms