RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574205.5

CTDNEP1-209, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 1,506 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-209ENST00000574205 DCCP43146 1447 aa47.21■■■■■ 5.15
CTDNEP1-209ENST00000574205 FBXO41Q8TF61 875 aa47.19■■■■■ 5.14
CTDNEP1-209ENST00000574205 POGKQ9P215 609 aa47.18■■■■■ 5.14
CTDNEP1-209ENST00000574205 CADPS2Q86UW7 1296 aa47.15■■■■■ 5.14
CTDNEP1-209ENST00000574205 ATF3P18847 181 aa47.14■■■■■ 5.14
CTDNEP1-209ENST00000574205 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP47.1■■■■■ 5.13
CTDNEP1-209ENST00000574205 CARD11Q9BXL7 1154 aa47.1■■■■■ 5.13
CTDNEP1-209ENST00000574205 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa47.08■■■■■ 5.13
CTDNEP1-209ENST00000574205 SLAIN2Q9P270 581 aa47.02■■■■■ 5.12
CTDNEP1-209ENST00000574205 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP47.02■■■■■ 5.12
CTDNEP1-209ENST00000574205 PIP4K2BP78356 416 aa47■■■■■ 5.12
CTDNEP1-209ENST00000574205 ADGRB2O60241 1585 aa47■■■■■ 5.11
CTDNEP1-209ENST00000574205 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP46.98■■■■■ 5.11
CTDNEP1-209ENST00000574205 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP46.98■■■■■ 5.11
CTDNEP1-209ENST00000574205 MST1RQ04912 1400 aa46.97■■■■■ 5.11
CTDNEP1-209ENST00000574205 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP46.95■■■■■ 5.11
CTDNEP1-209ENST00000574205 QRICH2Q9H0J4 1663 aa46.94■■■■■ 5.1
CTDNEP1-209ENST00000574205 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP46.91■■■■■ 5.1
CTDNEP1-209ENST00000574205 FMN2Q9NZ56 1722 aa46.91■■■■■ 5.1
CTDNEP1-209ENST00000574205 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa46.88■■■■■ 5.1
CTDNEP1-209ENST00000574205 C1orf167Q5SNV9 1468 aa46.87■■■■■ 5.09
CTDNEP1-209ENST00000574205 WASLO00401 505 aaPredicted RBP46.82■■■■■ 5.09
CTDNEP1-209ENST00000574205 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP46.82■■■■■ 5.09
CTDNEP1-209ENST00000574205 USP47Q96K76 1375 aa46.79■■■■■ 5.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa46.77■■■■■ 5.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 NUTM2FA1L443 756 aa46.77■■■■■ 5.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 BRINP3Q76B58 766 aa46.77■■■■■ 5.08
CTDNEP1-209ENST00000574205 TULP4Q9NRJ4 1543 aa46.74■■■■■ 5.07
CTDNEP1-209ENST00000574205 ANKARQ7Z5J8 1434 aa46.74■■■■■ 5.07
CTDNEP1-209ENST00000574205 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP46.71■■■■■ 5.07
CTDNEP1-209ENST00000574205 USP32Q8NFA0 1604 aa46.71■■■■■ 5.07
CTDNEP1-209ENST00000574205 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa46.7■■■■■ 5.07
CTDNEP1-209ENST00000574205 ORAI2Q96SN7 254 aa46.7■■■■■ 5.07
CTDNEP1-209ENST00000574205 CDK19Q9BWU1 502 aa46.7■■■■■ 5.07
CTDNEP1-209ENST00000574205 ESCO1Q5FWF5 840 aa46.68■■■■■ 5.06
CTDNEP1-209ENST00000574205 EVC2Q86UK5 1308 aa46.66■■■■■ 5.06
CTDNEP1-209ENST00000574205 ATP7BP35670 1465 aa46.63■■■■■ 5.06
CTDNEP1-209ENST00000574205 PRR36Q9H6K5 1346 aa46.62■■■■■ 5.05
CTDNEP1-209ENST00000574205 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP46.62■■■■■ 5.05
CTDNEP1-209ENST00000574205 HSPA1LP34931 641 aa46.61■■■■■ 5.05
CTDNEP1-209ENST00000574205 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP46.61■■■■■ 5.05
CTDNEP1-209ENST00000574205 NHSL1Q5SYE7 1610 aa46.61■■■■■ 5.05
CTDNEP1-209ENST00000574205 KIF1AQ12756 1690 aa46.6■■■■■ 5.05
CTDNEP1-209ENST00000574205 TESK2Q96S53 571 aa46.6■■■■■ 5.05
CTDNEP1-209ENST00000574205 ITSN1Q15811 1721 aa46.59■■■■■ 5.05
CTDNEP1-209ENST00000574205 SLC24A1O60721 1099 aa46.59■■■■■ 5.05
CTDNEP1-209ENST00000574205 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP46.58■■■■■ 5.05
CTDNEP1-209ENST00000574205 PHLPP1O60346 1717 aa46.58■■■■■ 5.05
CTDNEP1-209ENST00000574205 CABP2Q9NPB3 220 aa46.56■■■■■ 5.04
CTDNEP1-209ENST00000574205 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP46.55■■■■■ 5.04
CTDNEP1-209ENST00000574205 PHF8Q9UPP1 1060 aa46.54■■■■■ 5.04
CTDNEP1-209ENST00000574205 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa46.53■■■■■ 5.04
CTDNEP1-209ENST00000574205 CCDC61Q9Y6R9 512 aa46.51■■■■■ 5.04
CTDNEP1-209ENST00000574205 NPHP3Q7Z494 1330 aa46.49■■■■■ 5.03
CTDNEP1-209ENST00000574205 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP46.49■■■■■ 5.03
CTDNEP1-209ENST00000574205 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP46.48■■■■■ 5.03
CTDNEP1-209ENST00000574205 FOXO3O43524 673 aa46.48■■■■■ 5.03
CTDNEP1-209ENST00000574205 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa46.45■■■■■ 5.03
CTDNEP1-209ENST00000574205 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP46.44■■■■■ 5.03
CTDNEP1-209ENST00000574205 ATAD2Q6PL18 1390 aa46.43■■■■■ 5.02
CTDNEP1-209ENST00000574205 TMF1P82094 1093 aa46.42■■■■■ 5.02
CTDNEP1-209ENST00000574205 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP46.41■■■■■ 5.02
CTDNEP1-209ENST00000574205 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa46.41■■■■■ 5.02
CTDNEP1-209ENST00000574205 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP46.4■■■■■ 5.02
CTDNEP1-209ENST00000574205 PXDNQ92626 1479 aa46.38■■■■■ 5.02
CTDNEP1-209ENST00000574205 PLEKHG3A1L390 1219 aa46.38■■■■■ 5.01
CTDNEP1-209ENST00000574205 DISP3Q9P2K9 1392 aa46.37■■■■■ 5.01
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP46.37■■■■■ 5.01
CTDNEP1-209ENST00000574205 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP46.35■■■■■ 5.01
CTDNEP1-209ENST00000574205 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP46.33■■■■■ 5.01
CTDNEP1-209ENST00000574205 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP46.33■■■■■ 5.01
CTDNEP1-209ENST00000574205 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP46.32■■■■■ 5.01
CTDNEP1-209ENST00000574205 PSME1Q06323 249 aa46.32■■■■■ 5.01
CTDNEP1-209ENST00000574205 CABP1Q9NZU7 370 aa46.32■■■■■ 5.01
CTDNEP1-209ENST00000574205 CDCA8Q53HL2 280 aa46.3■■■■■ 5
CTDNEP1-209ENST00000574205 KRT28Q7Z3Y7 464 aa46.3■■■■■ 5
CTDNEP1-209ENST00000574205 ACEP12821 1306 aa46.29■■■■■ 5
CTDNEP1-209ENST00000574205 JCADQ9P266 1359 aa46.27■■■■■ 5
CTDNEP1-209ENST00000574205 SHPRHQ149N8 1683 aa46.22■■■■■ 4.99
CTDNEP1-209ENST00000574205 SBNO1A3KN83 1393 aa46.21■■■■■ 4.99
CTDNEP1-209ENST00000574205 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP46.19■■■■■ 4.99
CTDNEP1-209ENST00000574205 NINLQ9Y2I6 1382 aa46.19■■■■■ 4.98
CTDNEP1-209ENST00000574205 TMC1Q8TDI8 760 aa46.18■■■■■ 4.98
CTDNEP1-209ENST00000574205 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa46.17■■■■■ 4.98
CTDNEP1-209ENST00000574205 TNS3Q68CZ2 1445 aa46.16■■■■■ 4.98
CTDNEP1-209ENST00000574205 AKAP12Q02952 1782 aa46.15■■■■■ 4.98
CTDNEP1-209ENST00000574205 PNPLA6Q8IY17 1366 aa46.15■■■■■ 4.98
CTDNEP1-209ENST00000574205 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa46.13■■■■■ 4.98
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP46.13■■■■■ 4.97
CTDNEP1-209ENST00000574205 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP46.13■■■■■ 4.97
CTDNEP1-209ENST00000574205 USP6P35125 1406 aa46.11■■■■■ 4.97
CTDNEP1-209ENST00000574205 CD163L1Q9NR16 1453 aa46.09■■■■■ 4.97
CTDNEP1-209ENST00000574205 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP46.09■■■■■ 4.97
CTDNEP1-209ENST00000574205 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa46.08■■■■■ 4.97
CTDNEP1-209ENST00000574205 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP46.08■■■■■ 4.97
CTDNEP1-209ENST00000574205 ALS2Q96Q42 1657 aa46.08■■■■■ 4.97
CTDNEP1-209ENST00000574205 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP46.07■■■■■ 4.97
CTDNEP1-209ENST00000574205 ARHGEF10O15013 1369 aa46.07■■■■■ 4.96
CTDNEP1-209ENST00000574205 TERF2IPQ9NYB0 399 aa46.06■■■■■ 4.96
CTDNEP1-209ENST00000574205 MON2Q7Z3U7 1717 aa46.05■■■■■ 4.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 76.9 ms