RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568829.1

SPNS1-211, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 5

Gene SPNS1, Length 780 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-211ENST00000568829 ESCO1Q5FWF5 840 aa24.37■■□□□ 1.49
SPNS1-211ENST00000568829 STAC3Q96MF2 364 aa24.37■■□□□ 1.49
SPNS1-211ENST00000568829 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
SPNS1-211ENST00000568829 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
SPNS1-211ENST00000568829 IFT172Q9UG01 1749 aa24.36■■□□□ 1.49
SPNS1-211ENST00000568829 TMEM132EQ6IEE7 984 aa24.36■■□□□ 1.49
SPNS1-211ENST00000568829 PNPLA6Q8IY17 1366 aa24.36■■□□□ 1.49
SPNS1-211ENST00000568829 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa24.36■■□□□ 1.49
SPNS1-211ENST00000568829 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
SPNS1-211ENST00000568829 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
SPNS1-211ENST00000568829 MYOM2P54296 1465 aa24.35■■□□□ 1.49
SPNS1-211ENST00000568829 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
SPNS1-211ENST00000568829 WAPLQ7Z5K2 1190 aa24.34■■□□□ 1.49
SPNS1-211ENST00000568829 RXRBP28702 533 aa24.33■■□□□ 1.49
SPNS1-211ENST00000568829 LAMC1P11047 1609 aa24.32■■□□□ 1.48
SPNS1-211ENST00000568829 C8orf37Q96NL8 207 aa24.31■■□□□ 1.48
SPNS1-211ENST00000568829 NRXN1Q9ULB1 1477 aa24.31■■□□□ 1.48
SPNS1-211ENST00000568829 AFF2P51816 1311 aa24.31■■□□□ 1.48
SPNS1-211ENST00000568829 KNDC1Q76NI1 1749 aa24.3■■□□□ 1.48
SPNS1-211ENST00000568829 CFAP70Q5T0N1 1121 aa24.29■■□□□ 1.48
SPNS1-211ENST00000568829 NGLY1Q96IV0 654 aa24.28■■□□□ 1.48
SPNS1-211ENST00000568829 FOXO3O43524 673 aa24.26■■□□□ 1.47
SPNS1-211ENST00000568829 POGKQ9P215 609 aa24.26■■□□□ 1.47
SPNS1-211ENST00000568829 ADAMTS2O95450 1211 aa24.25■■□□□ 1.47
SPNS1-211ENST00000568829 NUTM2FA1L443 756 aa24.24■■□□□ 1.47
SPNS1-211ENST00000568829 DCAF11Q8TEB1 546 aa24.24■■□□□ 1.47
SPNS1-211ENST00000568829 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa24.24■■□□□ 1.47
SPNS1-211ENST00000568829 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
SPNS1-211ENST00000568829 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP24.23■■□□□ 1.47
SPNS1-211ENST00000568829 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
SPNS1-211ENST00000568829 PRAM1Q96QH2 718 aa24.22■■□□□ 1.47
SPNS1-211ENST00000568829 PSME1Q06323 249 aa24.21■■□□□ 1.47
SPNS1-211ENST00000568829 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa24.21■■□□□ 1.47
SPNS1-211ENST00000568829 DLC1Q96QB1 1528 aa24.19■■□□□ 1.46
SPNS1-211ENST00000568829 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
SPNS1-211ENST00000568829 USP21Q9UK80 565 aa24.17■■□□□ 1.46
SPNS1-211ENST00000568829 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
SPNS1-211ENST00000568829 PHF8Q9UPP1 1060 aa24.17■■□□□ 1.46
SPNS1-211ENST00000568829 PXDNQ92626 1479 aa24.17■■□□□ 1.46
SPNS1-211ENST00000568829 KIF1AQ12756 1690 aa24.17■■□□□ 1.46
SPNS1-211ENST00000568829 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP24.16■■□□□ 1.46
SPNS1-211ENST00000568829 FMN2Q9NZ56 1722 aa24.15■■□□□ 1.46
SPNS1-211ENST00000568829 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
SPNS1-211ENST00000568829 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
SPNS1-211ENST00000568829 KRT28Q7Z3Y7 464 aa24.15■■□□□ 1.46
SPNS1-211ENST00000568829 TRAK1Q9UPV9 953 aa24.15■■□□□ 1.46
SPNS1-211ENST00000568829 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.45
SPNS1-211ENST00000568829 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa24.12■■□□□ 1.45
SPNS1-211ENST00000568829 ANKARQ7Z5J8 1434 aa24.12■■□□□ 1.45
SPNS1-211ENST00000568829 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
SPNS1-211ENST00000568829 ADGRB1O14514 1584 aa24.1■■□□□ 1.45
SPNS1-211ENST00000568829 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP24.08■■□□□ 1.451e-9■■■■□ 21.7
SPNS1-211ENST00000568829 ARHGEF10O15013 1369 aa24.07■■□□□ 1.44
SPNS1-211ENST00000568829 SBNO1A3KN83 1393 aa24.06■■□□□ 1.44
SPNS1-211ENST00000568829 ADGRB2O60241 1585 aa24.05■■□□□ 1.44
SPNS1-211ENST00000568829 TNS3Q68CZ2 1445 aa24.05■■□□□ 1.44
SPNS1-211ENST00000568829 LMOD2Q6P5Q4 547 aa24.05■■□□□ 1.44
SPNS1-211ENST00000568829 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
SPNS1-211ENST00000568829 GPRASP1Q5JY77 1395 aa24.04■■□□□ 1.44
SPNS1-211ENST00000568829 WASLO00401 505 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
SPNS1-211ENST00000568829 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
SPNS1-211ENST00000568829 RGS12O14924 1447 aa24.02■■□□□ 1.44
SPNS1-211ENST00000568829 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa24.02■■□□□ 1.44
SPNS1-211ENST00000568829 ATRNO75882 1429 aa24.01■■□□□ 1.43
SPNS1-211ENST00000568829 UNC5CLQ8IV45 518 aa24■■□□□ 1.43
SPNS1-211ENST00000568829 ATAD2Q6PL18 1390 aa24■■□□□ 1.43
SPNS1-211ENST00000568829 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP23.99■■□□□ 1.43
SPNS1-211ENST00000568829 TULP4Q9NRJ4 1543 aa23.99■■□□□ 1.43
SPNS1-211ENST00000568829 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP23.98■■□□□ 1.43
SPNS1-211ENST00000568829 BCL9LQ86UU0 1499 aa23.97■■□□□ 1.43
SPNS1-211ENST00000568829 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP23.96■■□□□ 1.43
SPNS1-211ENST00000568829 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP23.95■■□□□ 1.42
SPNS1-211ENST00000568829 USP32Q8NFA0 1604 aa23.93■■□□□ 1.42
SPNS1-211ENST00000568829 SLIT2O94813 1529 aa23.93■■□□□ 1.42
SPNS1-211ENST00000568829 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa23.93■■□□□ 1.42
SPNS1-211ENST00000568829 CABLES1Q8TDN4 633 aa23.92■■□□□ 1.42
SPNS1-211ENST00000568829 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP23.92■■□□□ 1.42
SPNS1-211ENST00000568829 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP23.91■■□□□ 1.42
SPNS1-211ENST00000568829 PRR36Q9H6K5 1346 aa23.9■■□□□ 1.42
SPNS1-211ENST00000568829 PLEKHG5O94827 1062 aa23.9■■□□□ 1.42
SPNS1-211ENST00000568829 CCDC125Q86Z20 511 aa23.9■■□□□ 1.42
SPNS1-211ENST00000568829 CDK19Q9BWU1 502 aa23.9■■□□□ 1.42
SPNS1-211ENST00000568829 CCDC61Q9Y6R9 512 aa23.89■■□□□ 1.41
SPNS1-211ENST00000568829 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP23.89■■□□□ 1.41
SPNS1-211ENST00000568829 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP23.88■■□□□ 1.41
SPNS1-211ENST00000568829 VPS72Q15906 364 aa23.88■■□□□ 1.41
SPNS1-211ENST00000568829 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP23.88■■□□□ 1.41
SPNS1-211ENST00000568829 ITSN1Q15811 1721 aa23.86■■□□□ 1.41
SPNS1-211ENST00000568829 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP23.85■■□□□ 1.41
SPNS1-211ENST00000568829 RALGAPBQ86X10 1494 aa23.85■■□□□ 1.41
SPNS1-211ENST00000568829 ATP7BP35670 1465 aa23.84■■□□□ 1.41
SPNS1-211ENST00000568829 NBPF1Q3BBV0 1214 aa23.84■■□□□ 1.41
SPNS1-211ENST00000568829 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP23.83■■□□□ 1.41
SPNS1-211ENST00000568829 FAM83GA6ND36 823 aa23.82■■□□□ 1.4
SPNS1-211ENST00000568829 L3MBTL2Q969R5 705 aa23.82■■□□□ 1.4
SPNS1-211ENST00000568829 NWD2Q9ULI1 1742 aa23.81■■□□□ 1.4
SPNS1-211ENST00000568829 PLEKHG3A1L390 1219 aa23.81■■□□□ 1.4
SPNS1-211ENST00000568829 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP23.81■■□□□ 1.4
SPNS1-211ENST00000568829 BTG4Q9NY30 223 aa23.8■■□□□ 1.4
SPNS1-211ENST00000568829 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 117.9 ms