RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568622.1

KIAA0556-208, Transcript of KIAA0556, humanhuman

TSL 2

Gene KIAA0556, Length 570 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA0556-208ENST00000568622 PXDNQ92626 1479 aa16.81■□□□□ 0.28
KIAA0556-208ENST00000568622 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP16.81■□□□□ 0.28
KIAA0556-208ENST00000568622 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa16.8■□□□□ 0.28
KIAA0556-208ENST00000568622 IFT172Q9UG01 1749 aa16.8■□□□□ 0.28
KIAA0556-208ENST00000568622 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP16.77■□□□□ 0.28
KIAA0556-208ENST00000568622 ABCC11Q96J66 1382 aa16.77■□□□□ 0.28
KIAA0556-208ENST00000568622 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa16.77■□□□□ 0.28
KIAA0556-208ENST00000568622 NPHP3Q7Z494 1330 aa16.77■□□□□ 0.28
KIAA0556-208ENST00000568622 KNDC1Q76NI1 1749 aa16.77■□□□□ 0.28
KIAA0556-208ENST00000568622 ADAMTS2O95450 1211 aa16.77■□□□□ 0.28
KIAA0556-208ENST00000568622 FOXD1Q16676 465 aa16.77■□□□□ 0.28
KIAA0556-208ENST00000568622 NGLY1Q96IV0 654 aa16.77■□□□□ 0.28
KIAA0556-208ENST00000568622 CCDC144AA2RUR9 1427 aa16.77■□□□□ 0.27
KIAA0556-208ENST00000568622 PIK3C2GO75747 1445 aa16.77■□□□□ 0.27
KIAA0556-208ENST00000568622 ATRNO75882 1429 aa16.77■□□□□ 0.27
KIAA0556-208ENST00000568622 BCL9LQ86UU0 1499 aa16.75■□□□□ 0.27
KIAA0556-208ENST00000568622 USP21Q9UK80 565 aa16.75■□□□□ 0.27
KIAA0556-208ENST00000568622 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
KIAA0556-208ENST00000568622 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa16.73■□□□□ 0.27
KIAA0556-208ENST00000568622 ESCO1Q5FWF5 840 aa16.72■□□□□ 0.27
KIAA0556-208ENST00000568622 WAPLQ7Z5K2 1190 aa16.72■□□□□ 0.27
KIAA0556-208ENST00000568622 MPHOSPH9Q99550 1183 aa16.72■□□□□ 0.27
KIAA0556-208ENST00000568622 NRXN1Q9ULB1 1477 aa16.72■□□□□ 0.27
KIAA0556-208ENST00000568622 FMN2Q9NZ56 1722 aa16.71■□□□□ 0.27
KIAA0556-208ENST00000568622 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP16.71■□□□□ 0.27
KIAA0556-208ENST00000568622 FOXO3O43524 673 aa16.71■□□□□ 0.27
KIAA0556-208ENST00000568622 SIRT1Q96EB6 747 aa16.71■□□□□ 0.27
KIAA0556-208ENST00000568622 ATAD2Q6PL18 1390 aa16.71■□□□□ 0.27
KIAA0556-208ENST00000568622 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP16.7■□□□□ 0.26
KIAA0556-208ENST00000568622 RGL3Q3MIN7 710 aa16.69■□□□□ 0.26
KIAA0556-208ENST00000568622 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP16.69■□□□□ 0.26
KIAA0556-208ENST00000568622 KIF1AQ12756 1690 aa16.69■□□□□ 0.26
KIAA0556-208ENST00000568622 TMEM132EQ6IEE7 984 aa16.68■□□□□ 0.26
KIAA0556-208ENST00000568622 SLIT2O94813 1529 aa16.68■□□□□ 0.26
KIAA0556-208ENST00000568622 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa16.68■□□□□ 0.26
KIAA0556-208ENST00000568622 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
KIAA0556-208ENST00000568622 STK26Q9P289 416 aa16.67■□□□□ 0.26
KIAA0556-208ENST00000568622 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP16.66■□□□□ 0.26
KIAA0556-208ENST00000568622 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP16.65■□□□□ 0.26
KIAA0556-208ENST00000568622 NUTM2FA1L443 756 aa16.64■□□□□ 0.25
KIAA0556-208ENST00000568622 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP16.64■□□□□ 0.25
KIAA0556-208ENST00000568622 GLI3P10071 1580 aa16.64■□□□□ 0.25
KIAA0556-208ENST00000568622 USP32Q8NFA0 1604 aa16.63■□□□□ 0.25
KIAA0556-208ENST00000568622 EP400Q96L91 3159 aa16.63■□□□□ 0.25
KIAA0556-208ENST00000568622 DLC1Q96QB1 1528 aa16.62■□□□□ 0.25
KIAA0556-208ENST00000568622 TNS3Q68CZ2 1445 aa16.62■□□□□ 0.25
KIAA0556-208ENST00000568622 RALGAPBQ86X10 1494 aa16.61■□□□□ 0.25
KIAA0556-208ENST00000568622 CCDC125Q86Z20 511 aa16.61■□□□□ 0.25
KIAA0556-208ENST00000568622 UNC5CLQ8IV45 518 aa16.61■□□□□ 0.25
KIAA0556-208ENST00000568622 ADGRB1O14514 1584 aa16.6■□□□□ 0.25
KIAA0556-208ENST00000568622 CFAP70Q5T0N1 1121 aa16.6■□□□□ 0.25
KIAA0556-208ENST00000568622 KRT28Q7Z3Y7 464 aa16.6■□□□□ 0.25
KIAA0556-208ENST00000568622 SBNO1A3KN83 1393 aa16.6■□□□□ 0.25
KIAA0556-208ENST00000568622 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
KIAA0556-208ENST00000568622 ADGRB2O60241 1585 aa16.6■□□□□ 0.25
KIAA0556-208ENST00000568622 PHF8Q9UPP1 1060 aa16.59■□□□□ 0.25
KIAA0556-208ENST00000568622 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP16.59■□□□□ 0.25
KIAA0556-208ENST00000568622 ANKARQ7Z5J8 1434 aa16.58■□□□□ 0.24
KIAA0556-208ENST00000568622 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa16.58■□□□□ 0.24
KIAA0556-208ENST00000568622 ABCA3Q99758 1704 aa16.57■□□□□ 0.24
KIAA0556-208ENST00000568622 NWD2Q9ULI1 1742 aa16.56■□□□□ 0.24
KIAA0556-208ENST00000568622 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
KIAA0556-208ENST00000568622 PRAM1Q96QH2 718 aa16.55■□□□□ 0.24
KIAA0556-208ENST00000568622 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP16.54■□□□□ 0.24
KIAA0556-208ENST00000568622 ARHGEF10O15013 1369 aa16.54■□□□□ 0.24
KIAA0556-208ENST00000568622 PLCH1Q4KWH8 1693 aa16.54■□□□□ 0.24
KIAA0556-208ENST00000568622 PSME1Q06323 249 aa16.54■□□□□ 0.24
KIAA0556-208ENST00000568622 VPS72Q15906 364 aa16.54■□□□□ 0.24
KIAA0556-208ENST00000568622 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP16.53■□□□□ 0.24
KIAA0556-208ENST00000568622 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa16.52■□□□□ 0.24
KIAA0556-208ENST00000568622 BRWD3Q6RI45 1802 aa16.52■□□□□ 0.24
KIAA0556-208ENST00000568622 CABLES1Q8TDN4 633 aa16.52■□□□□ 0.24
KIAA0556-208ENST00000568622 ZRANB1Q9UGI0 708 aa16.52■□□□□ 0.24
KIAA0556-208ENST00000568622 ALS2Q96Q42 1657 aa16.51■□□□□ 0.23
KIAA0556-208ENST00000568622 NRAPQ86VF7 1730 aa16.5■□□□□ 0.23
KIAA0556-208ENST00000568622 TULP4Q9NRJ4 1543 aa16.5■□□□□ 0.23
KIAA0556-208ENST00000568622 PRR36Q9H6K5 1346 aa16.49■□□□□ 0.23
KIAA0556-208ENST00000568622 FAM83GA6ND36 823 aa16.49■□□□□ 0.23
KIAA0556-208ENST00000568622 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP16.49■□□□□ 0.23
KIAA0556-208ENST00000568622 SEPT12Q8IYM1 358 aa16.49■□□□□ 0.23
KIAA0556-208ENST00000568622 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa16.48■□□□□ 0.23
KIAA0556-208ENST00000568622 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa16.47■□□□□ 0.23
KIAA0556-208ENST00000568622 STAC3Q96MF2 364 aa16.47■□□□□ 0.23
KIAA0556-208ENST00000568622 POGKQ9P215 609 aa16.46■□□□□ 0.23
KIAA0556-208ENST00000568622 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP16.46■□□□□ 0.23
KIAA0556-208ENST00000568622 TRAK1Q9UPV9 953 aa16.45■□□□□ 0.22
KIAA0556-208ENST00000568622 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP16.44■□□□□ 0.22
KIAA0556-208ENST00000568622 WASLO00401 505 aaPredicted RBP16.44■□□□□ 0.22
KIAA0556-208ENST00000568622 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP16.44■□□□□ 0.22
KIAA0556-208ENST00000568622 DEFB132Q7Z7B7 95 aa16.44■□□□□ 0.22
KIAA0556-208ENST00000568622 GPRASP1Q5JY77 1395 aa16.43■□□□□ 0.22
KIAA0556-208ENST00000568622 HRCP23327 699 aa16.43■□□□□ 0.22
KIAA0556-208ENST00000568622 KRT27Q7Z3Y8 459 aa16.43■□□□□ 0.22
KIAA0556-208ENST00000568622 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP16.43■□□□□ 0.22
KIAA0556-208ENST00000568622 ATP7BP35670 1465 aa16.42■□□□□ 0.22
KIAA0556-208ENST00000568622 LMOD2Q6P5Q4 547 aa16.42■□□□□ 0.22
KIAA0556-208ENST00000568622 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP16.42■□□□□ 0.22
KIAA0556-208ENST00000568622 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP16.42■□□□□ 0.22
KIAA0556-208ENST00000568622 DCAF11Q8TEB1 546 aa16.41■□□□□ 0.22
KIAA0556-208ENST00000568622 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24 ms