RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567771.5

SPNS1-209, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 3

Gene SPNS1, Length 829 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-209ENST00000567771 PNPLA6Q8IY17 1366 aa37.63■■■■□ 3.61
SPNS1-209ENST00000567771 ABCC11Q96J66 1382 aa37.62■■■■□ 3.61
SPNS1-209ENST00000567771 LAMC1P11047 1609 aa37.6■■■■□ 3.61
SPNS1-209ENST00000567771 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa37.59■■■■□ 3.61
SPNS1-209ENST00000567771 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP37.59■■■■□ 3.61
SPNS1-209ENST00000567771 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa37.57■■■■□ 3.61
SPNS1-209ENST00000567771 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP37.57■■■■□ 3.6
SPNS1-209ENST00000567771 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP37.56■■■■□ 3.6
SPNS1-209ENST00000567771 NRXN1Q9ULB1 1477 aa37.55■■■■□ 3.6
SPNS1-209ENST00000567771 KNDC1Q76NI1 1749 aa37.55■■■■□ 3.6
SPNS1-209ENST00000567771 ESCO1Q5FWF5 840 aa37.54■■■■□ 3.6
SPNS1-209ENST00000567771 MYOM2P54296 1465 aa37.53■■■■□ 3.6
SPNS1-209ENST00000567771 CFAP70Q5T0N1 1121 aa37.53■■■■□ 3.6
SPNS1-209ENST00000567771 AFF2P51816 1311 aa37.52■■■■□ 3.6
SPNS1-209ENST00000567771 NUTM2FA1L443 756 aa37.5■■■■□ 3.59
SPNS1-209ENST00000567771 C8orf37Q96NL8 207 aa37.48■■■■□ 3.59
SPNS1-209ENST00000567771 SIRT1Q96EB6 747 aa37.47■■■■□ 3.59
SPNS1-209ENST00000567771 HRCP23327 699 aa37.46■■■■□ 3.59
SPNS1-209ENST00000567771 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP37.45■■■■□ 3.59
SPNS1-209ENST00000567771 NPHP3Q7Z494 1330 aa37.45■■■■□ 3.59
SPNS1-209ENST00000567771 RXRBP28702 533 aa37.44■■■■□ 3.58
SPNS1-209ENST00000567771 FOXO3O43524 673 aa37.43■■■■□ 3.58
SPNS1-209ENST00000567771 ADAMTS2O95450 1211 aa37.43■■■■□ 3.58
SPNS1-209ENST00000567771 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP37.4■■■■□ 3.58
SPNS1-209ENST00000567771 PXDNQ92626 1479 aa37.39■■■■□ 3.58
SPNS1-209ENST00000567771 FMN2Q9NZ56 1722 aa37.38■■■■□ 3.57
SPNS1-209ENST00000567771 NGLY1Q96IV0 654 aa37.37■■■■□ 3.57
SPNS1-209ENST00000567771 PRAM1Q96QH2 718 aa37.35■■■■□ 3.57
SPNS1-209ENST00000567771 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa37.35■■■■□ 3.57
SPNS1-209ENST00000567771 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP37.34■■■■□ 3.57
SPNS1-209ENST00000567771 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP37.34■■■■□ 3.57
SPNS1-209ENST00000567771 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP37.33■■■■□ 3.57
SPNS1-209ENST00000567771 DCAF11Q8TEB1 546 aa37.33■■■■□ 3.57
SPNS1-209ENST00000567771 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP37.3■■■■□ 3.56
SPNS1-209ENST00000567771 ADGRB1O14514 1584 aa37.29■■■■□ 3.56
SPNS1-209ENST00000567771 DLC1Q96QB1 1528 aa37.29■■■■□ 3.56
SPNS1-209ENST00000567771 POGKQ9P215 609 aa37.28■■■■□ 3.56
SPNS1-209ENST00000567771 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP37.27■■■■□ 3.56
SPNS1-209ENST00000567771 TRAK1Q9UPV9 953 aa37.25■■■■□ 3.55
SPNS1-209ENST00000567771 KIF1AQ12756 1690 aa37.25■■■■□ 3.55
SPNS1-209ENST00000567771 USP21Q9UK80 565 aa37.24■■■■□ 3.55
SPNS1-209ENST00000567771 STAC3Q96MF2 364 aa37.23■■■■□ 3.55
SPNS1-209ENST00000567771 PHF8Q9UPP1 1060 aa37.23■■■■□ 3.55
SPNS1-209ENST00000567771 KRT28Q7Z3Y7 464 aa37.22■■■■□ 3.55
SPNS1-209ENST00000567771 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP37.22■■■■□ 3.55
SPNS1-209ENST00000567771 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP37.22■■■■□ 3.55
SPNS1-209ENST00000567771 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP37.22■■■■□ 3.55
SPNS1-209ENST00000567771 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa37.21■■■■□ 3.55
SPNS1-209ENST00000567771 RGS12O14924 1447 aa37.2■■■■□ 3.55
SPNS1-209ENST00000567771 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP37.16■■■■□ 3.54
SPNS1-209ENST00000567771 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP37.15■■■■□ 3.54
SPNS1-209ENST00000567771 ADGRB2O60241 1585 aa37.13■■■■□ 3.53
SPNS1-209ENST00000567771 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP37.12■■■■□ 3.53
SPNS1-209ENST00000567771 ANKARQ7Z5J8 1434 aa37.12■■■■□ 3.53
SPNS1-209ENST00000567771 USP32Q8NFA0 1604 aa37.11■■■■□ 3.53
SPNS1-209ENST00000567771 PSME1Q06323 249 aa37.11■■■■□ 3.53
SPNS1-209ENST00000567771 ATRNO75882 1429 aa37.1■■■■□ 3.53
SPNS1-209ENST00000567771 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP37.1■■■■□ 3.53
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SPNS1-209ENST00000567771 BCL9LQ86UU0 1499 aa37.09■■■■□ 3.53
SPNS1-209ENST00000567771 TNS3Q68CZ2 1445 aa37.09■■■■□ 3.53
SPNS1-209ENST00000567771 SBNO1A3KN83 1393 aa37.05■■■■□ 3.52
SPNS1-209ENST00000567771 PRR36Q9H6K5 1346 aa37.04■■■■□ 3.52
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SPNS1-209ENST00000567771 LMOD2Q6P5Q4 547 aa37.01■■■■□ 3.52
SPNS1-209ENST00000567771 PLEKHG5O94827 1062 aa37■■■■□ 3.51
SPNS1-209ENST00000567771 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP37■■■■□ 3.51
SPNS1-209ENST00000567771 TULP4Q9NRJ4 1543 aa37■■■■□ 3.51
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SPNS1-209ENST00000567771 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP36.98■■■■□ 3.51
SPNS1-209ENST00000567771 SLIT2O94813 1529 aa36.97■■■■□ 3.51
SPNS1-209ENST00000567771 ARHGEF10O15013 1369 aa36.96■■■■□ 3.51
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SPNS1-209ENST00000567771 ATAD2Q6PL18 1390 aa36.9■■■■□ 3.5
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SPNS1-209ENST00000567771 GLI3P10071 1580 aa36.83■■■■□ 3.49
SPNS1-209ENST00000567771 ALS2Q96Q42 1657 aa36.83■■■■□ 3.49
SPNS1-209ENST00000567771 FAM83GA6ND36 823 aa36.81■■■■□ 3.48
SPNS1-209ENST00000567771 PLCH1Q4KWH8 1693 aa36.8■■■■□ 3.48
SPNS1-209ENST00000567771 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP36.79■■■■□ 3.48
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SPNS1-209ENST00000567771 ITSN1Q15811 1721 aa36.77■■■■□ 3.48
SPNS1-209ENST00000567771 L3MBTL2Q969R5 705 aa36.77■■■■□ 3.48
SPNS1-209ENST00000567771 SIN3AQ96ST3 1273 aa36.77■■■■□ 3.48
SPNS1-209ENST00000567771 NWD2Q9ULI1 1742 aa36.76■■■■□ 3.47
SPNS1-209ENST00000567771 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP36.72■■■■□ 3.47
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SPNS1-209ENST00000567771 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP36.7■■■■□ 3.47
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