RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567147.5

RNPS1-222, Transcript of RNA binding protein with serine rich domain 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene RNPS1, Length 830 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNPS1-222ENST00000567147 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP25.94■■□□□ 1.74
RNPS1-222ENST00000567147 CCDC144AA2RUR9 1427 aa25.92■■□□□ 1.74
RNPS1-222ENST00000567147 PTCH1Q13635 1447 aa25.92■■□□□ 1.74
RNPS1-222ENST00000567147 RGL3Q3MIN7 710 aa25.92■■□□□ 1.74
RNPS1-222ENST00000567147 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa25.91■■□□□ 1.74
RNPS1-222ENST00000567147 EP400Q96L91 3159 aa25.9■■□□□ 1.74
RNPS1-222ENST00000567147 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP25.9■■□□□ 1.74
RNPS1-222ENST00000567147 ATRNO75882 1429 aa25.89■■□□□ 1.74
RNPS1-222ENST00000567147 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP25.88■■□□□ 1.73
RNPS1-222ENST00000567147 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP25.87■■□□□ 1.73
RNPS1-222ENST00000567147 ZRANB1Q9UGI0 708 aa25.85■■□□□ 1.73
RNPS1-222ENST00000567147 ESCO1Q5FWF5 840 aa25.84■■□□□ 1.73
RNPS1-222ENST00000567147 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP25.83■■□□□ 1.73
RNPS1-222ENST00000567147 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa25.83■■□□□ 1.73
RNPS1-222ENST00000567147 MYOM2P54296 1465 aa25.83■■□□□ 1.73
RNPS1-222ENST00000567147 BCL9LQ86UU0 1499 aa25.82■■□□□ 1.72
RNPS1-222ENST00000567147 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa25.82■■□□□ 1.72
RNPS1-222ENST00000567147 PXDNQ92626 1479 aa25.8■■□□□ 1.72
RNPS1-222ENST00000567147 PPLO60437 1756 aa25.8■■□□□ 1.72
RNPS1-222ENST00000567147 NUTM2FA1L443 756 aa25.8■■□□□ 1.72
RNPS1-222ENST00000567147 FOXO3O43524 673 aa25.8■■□□□ 1.72
RNPS1-222ENST00000567147 HRCP23327 699 aa25.79■■□□□ 1.72
RNPS1-222ENST00000567147 NPHP3Q7Z494 1330 aa25.79■■□□□ 1.72
RNPS1-222ENST00000567147 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa25.78■■□□□ 1.72
RNPS1-222ENST00000567147 PRAG1Q86YV5 1406 aa25.78■■□□□ 1.72
RNPS1-222ENST00000567147 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP25.76■■□□□ 1.71
RNPS1-222ENST00000567147 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa25.76■■□□□ 1.71
RNPS1-222ENST00000567147 STK26Q9P289 416 aa25.74■■□□□ 1.71
RNPS1-222ENST00000567147 WAPLQ7Z5K2 1190 aa25.72■■□□□ 1.71
RNPS1-222ENST00000567147 CCDC125Q86Z20 511 aa25.72■■□□□ 1.71
RNPS1-222ENST00000567147 GLI3P10071 1580 aa25.7■■□□□ 1.71
RNPS1-222ENST00000567147 BRWD3Q6RI45 1802 aa25.69■■□□□ 1.7
RNPS1-222ENST00000567147 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP25.68■■□□□ 1.7
RNPS1-222ENST00000567147 RALGAPBQ86X10 1494 aa25.68■■□□□ 1.7
RNPS1-222ENST00000567147 PLEKHG5O94827 1062 aa25.68■■□□□ 1.7
RNPS1-222ENST00000567147 TMEM132EQ6IEE7 984 aa25.68■■□□□ 1.7
RNPS1-222ENST00000567147 DEFB132Q7Z7B7 95 aa25.66■■□□□ 1.7
RNPS1-222ENST00000567147 UNC5CLQ8IV45 518 aa25.66■■□□□ 1.7
RNPS1-222ENST00000567147 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP25.66■■□□□ 1.7
RNPS1-222ENST00000567147 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa25.66■■□□□ 1.7
RNPS1-222ENST00000567147 PIK3C2GO75747 1445 aa25.64■■□□□ 1.7
RNPS1-222ENST00000567147 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP25.64■■□□□ 1.7
RNPS1-222ENST00000567147 SLIT2O94813 1529 aa25.63■■□□□ 1.69
RNPS1-222ENST00000567147 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP25.63■■□□□ 1.69
RNPS1-222ENST00000567147 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa25.63■■□□□ 1.69
RNPS1-222ENST00000567147 FMN2Q9NZ56 1722 aa25.62■■□□□ 1.69
RNPS1-222ENST00000567147 CFAP70Q5T0N1 1121 aa25.61■■□□□ 1.69
RNPS1-222ENST00000567147 USP32Q8NFA0 1604 aa25.61■■□□□ 1.69
RNPS1-222ENST00000567147 ABCC11Q96J66 1382 aa25.6■■□□□ 1.69
RNPS1-222ENST00000567147 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP25.6■■□□□ 1.69
RNPS1-222ENST00000567147 CABLES1Q8TDN4 633 aa25.6■■□□□ 1.69
RNPS1-222ENST00000567147 KRT28Q7Z3Y7 464 aa25.59■■□□□ 1.69
RNPS1-222ENST00000567147 SEPT12Q8IYM1 358 aa25.59■■□□□ 1.69
RNPS1-222ENST00000567147 TECPR2O15040 1411 aa25.59■■□□□ 1.69
RNPS1-222ENST00000567147 IFT172Q9UG01 1749 aa25.59■■□□□ 1.69
RNPS1-222ENST00000567147 KIF1AQ12756 1690 aa25.58■■□□□ 1.69
RNPS1-222ENST00000567147 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP25.58■■□□□ 1.69
RNPS1-222ENST00000567147 KNDC1Q76NI1 1749 aa25.57■■□□□ 1.68
RNPS1-222ENST00000567147 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa25.57■■□□□ 1.68
RNPS1-222ENST00000567147 NRXN1Q9ULB1 1477 aa25.56■■□□□ 1.68
RNPS1-222ENST00000567147 DCAF11Q8TEB1 546 aa25.56■■□□□ 1.68
RNPS1-222ENST00000567147 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP25.56■■□□□ 1.68
RNPS1-222ENST00000567147 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP25.55■■□□□ 1.68
RNPS1-222ENST00000567147 PLCH1Q4KWH8 1693 aa25.55■■□□□ 1.68
RNPS1-222ENST00000567147 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP25.55■■□□□ 1.68
RNPS1-222ENST00000567147 SIRT1Q96EB6 747 aa25.54■■□□□ 1.68
RNPS1-222ENST00000567147 LMOD2Q6P5Q4 547 aa25.53■■□□□ 1.68
RNPS1-222ENST00000567147 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP25.53■■□□□ 1.68
RNPS1-222ENST00000567147 VPS72Q15906 364 aa25.51■■□□□ 1.67
RNPS1-222ENST00000567147 TNS3Q68CZ2 1445 aa25.51■■□□□ 1.67
RNPS1-222ENST00000567147 STAC3Q96MF2 364 aa25.5■■□□□ 1.67
RNPS1-222ENST00000567147 ABCA3Q99758 1704 aa25.5■■□□□ 1.67
RNPS1-222ENST00000567147 PHF8Q9UPP1 1060 aa25.5■■□□□ 1.67
RNPS1-222ENST00000567147 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP25.49■■□□□ 1.67
RNPS1-222ENST00000567147 KRT27Q7Z3Y8 459 aa25.49■■□□□ 1.67
RNPS1-222ENST00000567147 NWD2Q9ULI1 1742 aa25.49■■□□□ 1.67
RNPS1-222ENST00000567147 A0A0G2JS52 829 aa25.48■■□□□ 1.67
RNPS1-222ENST00000567147 MYT1Q01538 1121 aa25.48■■□□□ 1.67
RNPS1-222ENST00000567147 PSME1Q06323 249 aa25.47■■□□□ 1.67
RNPS1-222ENST00000567147 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP25.47■■□□□ 1.67
RNPS1-222ENST00000567147 PRAM1Q96QH2 718 aa25.46■■□□□ 1.67
RNPS1-222ENST00000567147 LRP5O75197 1615 aa25.45■■□□□ 1.67
RNPS1-222ENST00000567147 FAM83GA6ND36 823 aa25.44■■□□□ 1.66
RNPS1-222ENST00000567147 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
RNPS1-222ENST00000567147 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa25.43■■□□□ 1.66
RNPS1-222ENST00000567147 POGKQ9P215 609 aa25.43■■□□□ 1.66
RNPS1-222ENST00000567147 TRAK1Q9UPV9 953 aa25.42■■□□□ 1.66
RNPS1-222ENST00000567147 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
RNPS1-222ENST00000567147 SBNO1A3KN83 1393 aa25.41■■□□□ 1.66
RNPS1-222ENST00000567147 BAG6P46379 1132 aa25.39■■□□□ 1.66
RNPS1-222ENST00000567147 FAM182BQ5T319 152 aa25.39■■□□□ 1.66
RNPS1-222ENST00000567147 NRAPQ86VF7 1730 aa25.39■■□□□ 1.65
RNPS1-222ENST00000567147 ARHGEF10O15013 1369 aa25.39■■□□□ 1.65
RNPS1-222ENST00000567147 BTG4Q9NY30 223 aa25.37■■□□□ 1.65
RNPS1-222ENST00000567147 ADGRB1O14514 1584 aa25.36■■□□□ 1.65
RNPS1-222ENST00000567147 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP25.35■■□□□ 1.65
RNPS1-222ENST00000567147 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP25.34■■□□□ 1.65
RNPS1-222ENST00000567147 DLC1Q96QB1 1528 aa25.33■■□□□ 1.65
RNPS1-222ENST00000567147 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP25.32■■□□□ 1.64
RNPS1-222ENST00000567147 RGPD1P0DJD0 1748 aa25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.7 ms