RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561293.5

MEIS3-212, Transcript of Meis homeobox 3, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene MEIS3, Length 1,918 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3-212ENST00000561293 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP30■■■□□ 2.39
MEIS3-212ENST00000561293 MSH6P52701 1360 aa29.98■■■□□ 2.39
MEIS3-212ENST00000561293 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa29.98■■■□□ 2.39
MEIS3-212ENST00000561293 C19orf44Q9H6X5 657 aa29.98■■■□□ 2.39
MEIS3-212ENST00000561293 UBAP1LF5GYI3 381 aa29.95■■■□□ 2.39
MEIS3-212ENST00000561293 PIP4K2BP78356 416 aa29.95■■■□□ 2.39
MEIS3-212ENST00000561293 SIRT1Q96EB6 747 aa29.95■■■□□ 2.39
MEIS3-212ENST00000561293 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP29.94■■■□□ 2.38
MEIS3-212ENST00000561293 ATF3P18847 181 aa29.92■■■□□ 2.38
MEIS3-212ENST00000561293 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP29.92■■■□□ 2.38
MEIS3-212ENST00000561293 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP29.92■■■□□ 2.38
MEIS3-212ENST00000561293 QRICH2Q9H0J4 1663 aa29.9■■■□□ 2.38
MEIS3-212ENST00000561293 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa29.87■■■□□ 2.37
MEIS3-212ENST00000561293 TESK2Q96S53 571 aa29.87■■■□□ 2.37
MEIS3-212ENST00000561293 CABP2Q9NPB3 220 aa29.87■■■□□ 2.37
MEIS3-212ENST00000561293 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP29.86■■■□□ 2.37
MEIS3-212ENST00000561293 CDK19Q9BWU1 502 aa29.86■■■□□ 2.37
MEIS3-212ENST00000561293 WASLO00401 505 aaPredicted RBP29.85■■■□□ 2.37
MEIS3-212ENST00000561293 CADPS2Q86UW7 1296 aa29.85■■■□□ 2.37
MEIS3-212ENST00000561293 SLAIN2Q9P270 581 aa29.85■■■□□ 2.37
MEIS3-212ENST00000561293 ORAI2Q96SN7 254 aa29.84■■■□□ 2.37
MEIS3-212ENST00000561293 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP29.83■■■□□ 2.37
MEIS3-212ENST00000561293 TULP4Q9NRJ4 1543 aa29.83■■■□□ 2.37
MEIS3-212ENST00000561293 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP29.83■■■□□ 2.37
MEIS3-212ENST00000561293 PRR36Q9H6K5 1346 aa29.82■■■□□ 2.36
MEIS3-212ENST00000561293 MST1RQ04912 1400 aa29.82■■■□□ 2.36
MEIS3-212ENST00000561293 TOM1O60784 492 aa29.82■■■□□ 2.36
MEIS3-212ENST00000561293 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP29.82■■■□□ 2.36
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MEIS3-212ENST00000561293 DISP3Q9P2K9 1392 aa29.79■■■□□ 2.36
MEIS3-212ENST00000561293 IQSEC2Q5JU85 1478 aa29.78■■■□□ 2.36
MEIS3-212ENST00000561293 DCCP43146 1447 aa29.78■■■□□ 2.36
MEIS3-212ENST00000561293 ESCO1Q5FWF5 840 aa29.78■■■□□ 2.36
MEIS3-212ENST00000561293 C1orf167Q5SNV9 1468 aa29.77■■■□□ 2.36
MEIS3-212ENST00000561293 ADGRB2O60241 1585 aa29.77■■■□□ 2.36
MEIS3-212ENST00000561293 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa29.76■■■□□ 2.35
MEIS3-212ENST00000561293 POLR3GLQ9BT43 218 aa29.76■■■□□ 2.35
MEIS3-212ENST00000561293 BRINP3Q76B58 766 aa29.75■■■□□ 2.35
MEIS3-212ENST00000561293 EVC2Q86UK5 1308 aa29.74■■■□□ 2.35
MEIS3-212ENST00000561293 FMN2Q9NZ56 1722 aa29.74■■■□□ 2.35
MEIS3-212ENST00000561293 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP29.74■■■□□ 2.35
MEIS3-212ENST00000561293 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP29.74■■■□□ 2.35
MEIS3-212ENST00000561293 USP32Q8NFA0 1604 aa29.73■■■□□ 2.35
MEIS3-212ENST00000561293 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP29.73■■■□□ 2.35
MEIS3-212ENST00000561293 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP29.73■■■□□ 2.35
MEIS3-212ENST00000561293 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa29.7■■■□□ 2.35
MEIS3-212ENST00000561293 ATP7BP35670 1465 aa29.7■■■□□ 2.34
MEIS3-212ENST00000561293 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa29.68■■■□□ 2.34
MEIS3-212ENST00000561293 FOXO3O43524 673 aa29.67■■■□□ 2.34
MEIS3-212ENST00000561293 TMF1P82094 1093 aa29.67■■■□□ 2.34
MEIS3-212ENST00000561293 CABP1Q9NZU7 370 aa29.66■■■□□ 2.34
MEIS3-212ENST00000561293 TMC1Q8TDI8 760 aa29.65■■■□□ 2.34
MEIS3-212ENST00000561293 FBXO41Q8TF61 875 aa29.63■■■□□ 2.33
MEIS3-212ENST00000561293 PHF8Q9UPP1 1060 aa29.63■■■□□ 2.33
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MEIS3-212ENST00000561293 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa29.61■■■□□ 2.33
MEIS3-212ENST00000561293 ANKARQ7Z5J8 1434 aa29.6■■■□□ 2.33
MEIS3-212ENST00000561293 HSPA1LP34931 641 aa29.6■■■□□ 2.33
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MEIS3-212ENST00000561293 KIF7Q2M1P5 1343 aa29.55■■■□□ 2.32
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MEIS3-212ENST00000561293 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa29.52■■■□□ 2.32
MEIS3-212ENST00000561293 WASHC2AQ641Q2 1341 aa29.52■■■□□ 2.32
MEIS3-212ENST00000561293 PSME1Q06323 249 aa29.51■■■□□ 2.31
MEIS3-212ENST00000561293 PLEKHG3A1L390 1219 aa29.49■■■□□ 2.31
MEIS3-212ENST00000561293 KRT28Q7Z3Y7 464 aa29.49■■■□□ 2.31
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MEIS3-212ENST00000561293 LMOD2Q6P5Q4 547 aa29.46■■■□□ 2.31
MEIS3-212ENST00000561293 CD163L1Q9NR16 1453 aa29.46■■■□□ 2.31
MEIS3-212ENST00000561293 ITSN1Q15811 1721 aa29.46■■■□□ 2.31
MEIS3-212ENST00000561293 CDCA8Q53HL2 280 aa29.45■■■□□ 2.31
MEIS3-212ENST00000561293 SLC24A1O60721 1099 aa29.45■■■□□ 2.3
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MEIS3-212ENST00000561293 PXDNQ92626 1479 aa29.44■■■□□ 2.3
MEIS3-212ENST00000561293 A0A1W2PP64 1363 aa29.44■■■□□ 2.3
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MEIS3-212ENST00000561293 NHSL1Q5SYE7 1610 aa29.43■■■□□ 2.3
MEIS3-212ENST00000561293 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP29.43■■■□□ 2.3
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MEIS3-212ENST00000561293 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP29.43■■■□□ 2.3
MEIS3-212ENST00000561293 MYOM1P52179 1685 aa29.42■■■□□ 2.3
MEIS3-212ENST00000561293 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP29.41■■■□□ 2.3
MEIS3-212ENST00000561293 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP29.41■■■□□ 2.3
MEIS3-212ENST00000561293 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP29.4■■■□□ 2.3
MEIS3-212ENST00000561293 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP29.4■■■□□ 2.3
MEIS3-212ENST00000561293 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP29.39■■■□□ 2.3
MEIS3-212ENST00000561293 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP29.38■■■□□ 2.29
MEIS3-212ENST00000561293 USP6P35125 1406 aa29.37■■■□□ 2.29
MEIS3-212ENST00000561293 CARD14Q9BXL6 1004 aa29.37■■■□□ 2.29
MEIS3-212ENST00000561293 PANK3Q9H999 370 aa29.36■■■□□ 2.29
MEIS3-212ENST00000561293 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP29.35■■■□□ 2.29
MEIS3-212ENST00000561293 ZRANB1Q9UGI0 708 aa29.35■■■□□ 2.29
MEIS3-212ENST00000561293 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP29.35■■■□□ 2.29
MEIS3-212ENST00000561293 CABLES1Q8TDN4 633 aa29.35■■■□□ 2.29
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