RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561191.1

USP3-AS1-209, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 4

Gene USP3-AS1, Length 572 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-209ENST00000561191 SIRT1Q96EB6 747 aa26.73■■□□□ 1.87
USP3-AS1-209ENST00000561191 NBPF1Q3BBV0 1214 aa26.72■■□□□ 1.87
USP3-AS1-209ENST00000561191 SLAIN2Q9P270 581 aa26.72■■□□□ 1.87
USP3-AS1-209ENST00000561191 FMN2Q9NZ56 1722 aa26.71■■□□□ 1.87
USP3-AS1-209ENST00000561191 ADGRB2O60241 1585 aa26.71■■□□□ 1.87
USP3-AS1-209ENST00000561191 PRAM1Q96QH2 718 aa26.7■■□□□ 1.86
USP3-AS1-209ENST00000561191 TRAK1Q9UPV9 953 aa26.7■■□□□ 1.86
USP3-AS1-209ENST00000561191 NBPF8Q3BBV2 869 aa26.69■■□□□ 1.86
USP3-AS1-209ENST00000561191 HSPA1LP34931 641 aa26.68■■□□□ 1.86
USP3-AS1-209ENST00000561191 C1orf167Q5SNV9 1468 aa26.66■■□□□ 1.86
USP3-AS1-209ENST00000561191 PHLPP1O60346 1717 aa26.65■■□□□ 1.86
USP3-AS1-209ENST00000561191 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP26.65■■□□□ 1.86
USP3-AS1-209ENST00000561191 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP26.65■■□□□ 1.86
USP3-AS1-209ENST00000561191 RALGAPBQ86X10 1494 aa26.65■■□□□ 1.86
USP3-AS1-209ENST00000561191 NHSL1Q5SYE7 1610 aa26.65■■□□□ 1.86
USP3-AS1-209ENST00000561191 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP26.64■■□□□ 1.85
USP3-AS1-209ENST00000561191 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP26.62■■□□□ 1.85
USP3-AS1-209ENST00000561191 POGKQ9P215 609 aa26.62■■□□□ 1.85
USP3-AS1-209ENST00000561191 QRICH2Q9H0J4 1663 aa26.62■■□□□ 1.85
USP3-AS1-209ENST00000561191 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP26.61■■□□□ 1.85
USP3-AS1-209ENST00000561191 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP26.61■■□□□ 1.85
USP3-AS1-209ENST00000561191 GPRASP1Q5JY77 1395 aa26.61■■□□□ 1.85
USP3-AS1-209ENST00000561191 BRINP3Q76B58 766 aa26.61■■□□□ 1.85
USP3-AS1-209ENST00000561191 USP32Q8NFA0 1604 aa26.6■■□□□ 1.85
USP3-AS1-209ENST00000561191 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP26.56■■□□□ 1.84
USP3-AS1-209ENST00000561191 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP26.55■■□□□ 1.84
USP3-AS1-209ENST00000561191 KIF1AQ12756 1690 aa26.53■■□□□ 1.84
USP3-AS1-209ENST00000561191 NUTM2FA1L443 756 aa26.52■■□□□ 1.84
USP3-AS1-209ENST00000561191 ORAI2Q96SN7 254 aa26.52■■□□□ 1.84
USP3-AS1-209ENST00000561191 TULP4Q9NRJ4 1543 aa26.52■■□□□ 1.84
USP3-AS1-209ENST00000561191 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa26.5■■□□□ 1.83
USP3-AS1-209ENST00000561191 ANKARQ7Z5J8 1434 aa26.49■■□□□ 1.83
USP3-AS1-209ENST00000561191 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP26.49■■□□□ 1.83
USP3-AS1-209ENST00000561191 ITSN1Q15811 1721 aa26.48■■□□□ 1.83
USP3-AS1-209ENST00000561191 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
USP3-AS1-209ENST00000561191 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa26.47■■□□□ 1.83
USP3-AS1-209ENST00000561191 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP26.46■■□□□ 1.83
USP3-AS1-209ENST00000561191 WASLO00401 505 aaPredicted RBP26.46■■□□□ 1.83
USP3-AS1-209ENST00000561191 CARD11Q9BXL7 1154 aa26.46■■□□□ 1.83
USP3-AS1-209ENST00000561191 ATP7BP35670 1465 aa26.46■■□□□ 1.83
USP3-AS1-209ENST00000561191 SHPRHQ149N8 1683 aa26.46■■□□□ 1.83
USP3-AS1-209ENST00000561191 ESCO1Q5FWF5 840 aa26.45■■□□□ 1.82
USP3-AS1-209ENST00000561191 PRR36Q9H6K5 1346 aa26.44■■□□□ 1.82
USP3-AS1-209ENST00000561191 PXDNQ92626 1479 aa26.43■■□□□ 1.82
USP3-AS1-209ENST00000561191 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP26.42■■□□□ 1.82
USP3-AS1-209ENST00000561191 JCADQ9P266 1359 aa26.39■■□□□ 1.82
USP3-AS1-209ENST00000561191 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP26.39■■□□□ 1.81
USP3-AS1-209ENST00000561191 CDK19Q9BWU1 502 aa26.37■■□□□ 1.81
USP3-AS1-209ENST00000561191 NPHP3Q7Z494 1330 aa26.37■■□□□ 1.81
USP3-AS1-209ENST00000561191 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa26.36■■□□□ 1.81
USP3-AS1-209ENST00000561191 PHF8Q9UPP1 1060 aa26.36■■□□□ 1.81
USP3-AS1-209ENST00000561191 FOXO3O43524 673 aa26.35■■□□□ 1.81
USP3-AS1-209ENST00000561191 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP26.34■■□□□ 1.81
USP3-AS1-209ENST00000561191 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP26.33■■□□□ 1.81
USP3-AS1-209ENST00000561191 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP26.32■■□□□ 1.8
USP3-AS1-209ENST00000561191 PNPLA6Q8IY17 1366 aa26.32■■□□□ 1.8
USP3-AS1-209ENST00000561191 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP26.32■■□□□ 1.8
USP3-AS1-209ENST00000561191 USP47Q96K76 1375 aa26.32■■□□□ 1.8
USP3-AS1-209ENST00000561191 LRP6O75581 1613 aa26.3■■□□□ 1.8
USP3-AS1-209ENST00000561191 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa26.3■■□□□ 1.8
USP3-AS1-209ENST00000561191 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP26.29■■□□□ 1.8
USP3-AS1-209ENST00000561191 CABP2Q9NPB3 220 aa26.29■■□□□ 1.8
USP3-AS1-209ENST00000561191 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP26.28■■□□□ 1.8
USP3-AS1-209ENST00000561191 EVC2Q86UK5 1308 aa26.28■■□□□ 1.8
USP3-AS1-209ENST00000561191 ALS2Q96Q42 1657 aa26.26■■□□□ 1.79
USP3-AS1-209ENST00000561191 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa26.26■■□□□ 1.79
USP3-AS1-209ENST00000561191 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa26.25■■□□□ 1.79
USP3-AS1-209ENST00000561191 TESK2Q96S53 571 aa26.25■■□□□ 1.79
USP3-AS1-209ENST00000561191 TNS3Q68CZ2 1445 aa26.24■■□□□ 1.79
USP3-AS1-209ENST00000561191 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP26.24■■□□□ 1.79
USP3-AS1-209ENST00000561191 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa26.24■■□□□ 1.79
USP3-AS1-209ENST00000561191 CCDC61Q9Y6R9 512 aa26.24■■□□□ 1.79
USP3-AS1-209ENST00000561191 KRT28Q7Z3Y7 464 aa26.23■■□□□ 1.79
USP3-AS1-209ENST00000561191 ABCA3Q99758 1704 aa26.22■■□□□ 1.79
USP3-AS1-209ENST00000561191 SBNO1A3KN83 1393 aa26.21■■□□□ 1.79
USP3-AS1-209ENST00000561191 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa26.21■■□□□ 1.79
USP3-AS1-209ENST00000561191 AKAP12Q02952 1782 aa26.21■■□□□ 1.79
USP3-AS1-209ENST00000561191 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP26.2■■□□□ 1.78
USP3-AS1-209ENST00000561191 PLEKHG3A1L390 1219 aa26.19■■□□□ 1.78
USP3-AS1-209ENST00000561191 PSME1Q06323 249 aa26.19■■□□□ 1.78
USP3-AS1-209ENST00000561191 DISP3Q9P2K9 1392 aa26.19■■□□□ 1.78
USP3-AS1-209ENST00000561191 ACEP12821 1306 aa26.18■■□□□ 1.78
USP3-AS1-209ENST00000561191 ATAD2Q6PL18 1390 aa26.18■■□□□ 1.78
USP3-AS1-209ENST00000561191 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa26.17■■□□□ 1.78
USP3-AS1-209ENST00000561191 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP26.17■■□□□ 1.78
USP3-AS1-209ENST00000561191 NRKQ7Z2Y5 1582 aa26.15■■□□□ 1.78
USP3-AS1-209ENST00000561191 MON2Q7Z3U7 1717 aa26.14■■□□□ 1.78
USP3-AS1-209ENST00000561191 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP26.14■■□□□ 1.78
USP3-AS1-209ENST00000561191 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP26.14■■□□□ 1.78
USP3-AS1-209ENST00000561191 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP26.14■■□□□ 1.78
USP3-AS1-209ENST00000561191 CABP1Q9NZU7 370 aa26.14■■□□□ 1.78
USP3-AS1-209ENST00000561191 ARHGEF10O15013 1369 aa26.12■■□□□ 1.77
USP3-AS1-209ENST00000561191 USP6P35125 1406 aa26.11■■□□□ 1.77
USP3-AS1-209ENST00000561191 CD163L1Q9NR16 1453 aa26.1■■□□□ 1.77
USP3-AS1-209ENST00000561191 MYOM1P52179 1685 aa26.09■■□□□ 1.77
USP3-AS1-209ENST00000561191 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP26.08■■□□□ 1.77
USP3-AS1-209ENST00000561191 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP26.08■■□□□ 1.77
USP3-AS1-209ENST00000561191 PIK3C2AO00443 1686 aa26.08■■□□□ 1.77
USP3-AS1-209ENST00000561191 SSH2Q76I76 1423 aa26.07■■□□□ 1.76
USP3-AS1-209ENST00000561191 LMOD2Q6P5Q4 547 aa26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13 ms