RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558954.5

RABGGTA-208, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 4

Gene RABGGTA, Length 570 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-208ENST00000558954 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa27.06■■□□□ 1.92
RABGGTA-208ENST00000558954 ADGRB2O60241 1585 aa27.05■■□□□ 1.92
RABGGTA-208ENST00000558954 WAPLQ7Z5K2 1190 aa27.04■■□□□ 1.92
RABGGTA-208ENST00000558954 RALGAPBQ86X10 1494 aa27.03■■□□□ 1.92
RABGGTA-208ENST00000558954 TRAK1Q9UPV9 953 aa27.03■■□□□ 1.92
RABGGTA-208ENST00000558954 QRICH2Q9H0J4 1663 aa27.02■■□□□ 1.92
RABGGTA-208ENST00000558954 MST1RQ04912 1400 aa27.02■■□□□ 1.92
RABGGTA-208ENST00000558954 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP27.01■■□□□ 1.91
RABGGTA-208ENST00000558954 NBPF1Q3BBV0 1214 aa27.01■■□□□ 1.91
RABGGTA-208ENST00000558954 PRAM1Q96QH2 718 aa27.01■■□□□ 1.91
RABGGTA-208ENST00000558954 SLAIN2Q9P270 581 aa27.01■■□□□ 1.91
RABGGTA-208ENST00000558954 POGKQ9P215 609 aa27■■□□□ 1.91
RABGGTA-208ENST00000558954 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa26.99■■□□□ 1.91
RABGGTA-208ENST00000558954 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP26.99■■□□□ 1.91
RABGGTA-208ENST00000558954 NBPF8Q3BBV2 869 aa26.98■■□□□ 1.91
RABGGTA-208ENST00000558954 PHLPP1O60346 1717 aa26.98■■□□□ 1.91
RABGGTA-208ENST00000558954 GPRASP1Q5JY77 1395 aa26.97■■□□□ 1.91
RABGGTA-208ENST00000558954 NHSL1Q5SYE7 1610 aa26.95■■□□□ 1.91
RABGGTA-208ENST00000558954 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP26.95■■□□□ 1.9
RABGGTA-208ENST00000558954 C1orf167Q5SNV9 1468 aa26.93■■□□□ 1.9
RABGGTA-208ENST00000558954 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP26.93■■□□□ 1.9
RABGGTA-208ENST00000558954 ITSN1Q15811 1721 aa26.92■■□□□ 1.9
RABGGTA-208ENST00000558954 KIF1AQ12756 1690 aa26.92■■□□□ 1.9
RABGGTA-208ENST00000558954 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP26.91■■□□□ 1.9
RABGGTA-208ENST00000558954 USP32Q8NFA0 1604 aa26.89■■□□□ 1.9
RABGGTA-208ENST00000558954 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP26.88■■□□□ 1.89
RABGGTA-208ENST00000558954 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP26.88■■□□□ 1.89
RABGGTA-208ENST00000558954 HSPA1LP34931 641 aa26.87■■□□□ 1.89
RABGGTA-208ENST00000558954 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP26.87■■□□□ 1.89
RABGGTA-208ENST00000558954 TULP4Q9NRJ4 1543 aa26.86■■□□□ 1.89
RABGGTA-208ENST00000558954 BRINP3Q76B58 766 aa26.86■■□□□ 1.89
RABGGTA-208ENST00000558954 CARD11Q9BXL7 1154 aa26.85■■□□□ 1.89
RABGGTA-208ENST00000558954 ANKARQ7Z5J8 1434 aa26.84■■□□□ 1.89
RABGGTA-208ENST00000558954 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP26.84■■□□□ 1.89
RABGGTA-208ENST00000558954 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa26.82■■□□□ 1.88
RABGGTA-208ENST00000558954 NUTM2FA1L443 756 aa26.79■■□□□ 1.88
RABGGTA-208ENST00000558954 WASLO00401 505 aaPredicted RBP26.78■■□□□ 1.88
RABGGTA-208ENST00000558954 SHPRHQ149N8 1683 aa26.78■■□□□ 1.88
RABGGTA-208ENST00000558954 ATP7BP35670 1465 aa26.77■■□□□ 1.88
RABGGTA-208ENST00000558954 ORAI2Q96SN7 254 aa26.77■■□□□ 1.88
RABGGTA-208ENST00000558954 ESCO1Q5FWF5 840 aa26.76■■□□□ 1.87
RABGGTA-208ENST00000558954 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa26.75■■□□□ 1.87
RABGGTA-208ENST00000558954 NPHP3Q7Z494 1330 aa26.7■■□□□ 1.87
RABGGTA-208ENST00000558954 PXDNQ92626 1479 aa26.7■■□□□ 1.87
RABGGTA-208ENST00000558954 USP47Q96K76 1375 aa26.7■■□□□ 1.86
RABGGTA-208ENST00000558954 PRR36Q9H6K5 1346 aa26.69■■□□□ 1.86
RABGGTA-208ENST00000558954 CDK19Q9BWU1 502 aa26.69■■□□□ 1.86
RABGGTA-208ENST00000558954 EVC2Q86UK5 1308 aa26.68■■□□□ 1.86
RABGGTA-208ENST00000558954 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP26.67■■□□□ 1.86
RABGGTA-208ENST00000558954 PHF8Q9UPP1 1060 aa26.67■■□□□ 1.86
RABGGTA-208ENST00000558954 JCADQ9P266 1359 aa26.67■■□□□ 1.86
RABGGTA-208ENST00000558954 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP26.65■■□□□ 1.86
RABGGTA-208ENST00000558954 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP26.65■■□□□ 1.86
RABGGTA-208ENST00000558954 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP26.65■■□□□ 1.86
RABGGTA-208ENST00000558954 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP26.65■■□□□ 1.86
RABGGTA-208ENST00000558954 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP26.65■■□□□ 1.86
RABGGTA-208ENST00000558954 FOXO3O43524 673 aa26.64■■□□□ 1.86
RABGGTA-208ENST00000558954 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP26.63■■□□□ 1.85
RABGGTA-208ENST00000558954 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP26.61■■□□□ 1.85
RABGGTA-208ENST00000558954 AKAP12Q02952 1782 aa26.61■■□□□ 1.85
RABGGTA-208ENST00000558954 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa26.6■■□□□ 1.85
RABGGTA-208ENST00000558954 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa26.59■■□□□ 1.85
RABGGTA-208ENST00000558954 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa26.59■■□□□ 1.85
RABGGTA-208ENST00000558954 CABP2Q9NPB3 220 aa26.59■■□□□ 1.85
RABGGTA-208ENST00000558954 CCDC61Q9Y6R9 512 aa26.59■■□□□ 1.85
RABGGTA-208ENST00000558954 ALS2Q96Q42 1657 aa26.59■■□□□ 1.85
RABGGTA-208ENST00000558954 ATAD2Q6PL18 1390 aa26.58■■□□□ 1.84
RABGGTA-208ENST00000558954 SLC24A1O60721 1099 aa26.57■■□□□ 1.84
RABGGTA-208ENST00000558954 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP26.57■■□□□ 1.84
RABGGTA-208ENST00000558954 PNPLA6Q8IY17 1366 aa26.57■■□□□ 1.84
RABGGTA-208ENST00000558954 TESK2Q96S53 571 aa26.56■■□□□ 1.84
RABGGTA-208ENST00000558954 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP26.56■■□□□ 1.84
RABGGTA-208ENST00000558954 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
RABGGTA-208ENST00000558954 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa26.55■■□□□ 1.84
RABGGTA-208ENST00000558954 TNS3Q68CZ2 1445 aa26.55■■□□□ 1.84
RABGGTA-208ENST00000558954 ABCA3Q99758 1704 aa26.54■■□□□ 1.84
RABGGTA-208ENST00000558954 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
RABGGTA-208ENST00000558954 PSME1Q06323 249 aa26.54■■□□□ 1.84
RABGGTA-208ENST00000558954 KRT28Q7Z3Y7 464 aa26.53■■□□□ 1.84
RABGGTA-208ENST00000558954 SBNO1A3KN83 1393 aa26.53■■□□□ 1.84
RABGGTA-208ENST00000558954 MON2Q7Z3U7 1717 aa26.53■■□□□ 1.84
RABGGTA-208ENST00000558954 PLEKHG3A1L390 1219 aa26.52■■□□□ 1.84
RABGGTA-208ENST00000558954 LRP6O75581 1613 aa26.5■■□□□ 1.83
RABGGTA-208ENST00000558954 ACEP12821 1306 aa26.49■■□□□ 1.83
RABGGTA-208ENST00000558954 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa26.49■■□□□ 1.83
RABGGTA-208ENST00000558954 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa26.48■■□□□ 1.83
RABGGTA-208ENST00000558954 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP26.48■■□□□ 1.83
RABGGTA-208ENST00000558954 NRKQ7Z2Y5 1582 aa26.48■■□□□ 1.83
RABGGTA-208ENST00000558954 ARHGEF10O15013 1369 aa26.47■■□□□ 1.83
RABGGTA-208ENST00000558954 DISP3Q9P2K9 1392 aa26.47■■□□□ 1.83
RABGGTA-208ENST00000558954 TMF1P82094 1093 aa26.47■■□□□ 1.83
RABGGTA-208ENST00000558954 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
RABGGTA-208ENST00000558954 CABP1Q9NZU7 370 aa26.46■■□□□ 1.83
RABGGTA-208ENST00000558954 MYOM1P52179 1685 aa26.46■■□□□ 1.83
RABGGTA-208ENST00000558954 NINLQ9Y2I6 1382 aa26.45■■□□□ 1.82
RABGGTA-208ENST00000558954 USP6P35125 1406 aa26.43■■□□□ 1.82
RABGGTA-208ENST00000558954 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP26.43■■□□□ 1.82
RABGGTA-208ENST00000558954 CDCA8Q53HL2 280 aa26.42■■□□□ 1.82
RABGGTA-208ENST00000558954 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP26.42■■□□□ 1.82
RABGGTA-208ENST00000558954 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP26.41■■□□□ 1.82
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