RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558754.5

MIR9-3HG-205, Transcript of MIR9-3 host gene, humanhuman

TSL 4

Gene MIR9-3HG, Length 786 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIR9-3HG-205ENST00000558754 NRXN1Q9ULB1 1477 aa35.26■■■■□ 3.23
MIR9-3HG-205ENST00000558754 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP35.25■■■■□ 3.23
MIR9-3HG-205ENST00000558754 WAPLQ7Z5K2 1190 aa35.23■■■■□ 3.23
MIR9-3HG-205ENST00000558754 ORAI2Q96SN7 254 aa35.23■■■■□ 3.23
MIR9-3HG-205ENST00000558754 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa35.23■■■■□ 3.23
MIR9-3HG-205ENST00000558754 ABCC11Q96J66 1382 aa35.21■■■■□ 3.23
MIR9-3HG-205ENST00000558754 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP35.2■■■■□ 3.23
MIR9-3HG-205ENST00000558754 PNPLA6Q8IY17 1366 aa35.18■■■■□ 3.22
MIR9-3HG-205ENST00000558754 CFAP70Q5T0N1 1121 aa35.18■■■■□ 3.22
MIR9-3HG-205ENST00000558754 FMN2Q9NZ56 1722 aa35.18■■■■□ 3.22
MIR9-3HG-205ENST00000558754 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP35.17■■■■□ 3.22
MIR9-3HG-205ENST00000558754 NUTM2FA1L443 756 aa35.14■■■■□ 3.22
MIR9-3HG-205ENST00000558754 ESCO1Q5FWF5 840 aa35.12■■■■□ 3.21
MIR9-3HG-205ENST00000558754 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP35.12■■■■□ 3.21
MIR9-3HG-205ENST00000558754 HRCP23327 699 aa35.11■■■■□ 3.21
MIR9-3HG-205ENST00000558754 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP35.09■■■■□ 3.21
MIR9-3HG-205ENST00000558754 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP35.08■■■■□ 3.21
MIR9-3HG-205ENST00000558754 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa35.08■■■■□ 3.21
MIR9-3HG-205ENST00000558754 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP35.06■■■■□ 3.2
MIR9-3HG-205ENST00000558754 KIF1AQ12756 1690 aa35.05■■■■□ 3.2
MIR9-3HG-205ENST00000558754 ADGRB1O14514 1584 aa35.05■■■■□ 3.2
MIR9-3HG-205ENST00000558754 DCAF11Q8TEB1 546 aa35.05■■■■□ 3.2
MIR9-3HG-205ENST00000558754 PXDNQ92626 1479 aa35.04■■■■□ 3.2
MIR9-3HG-205ENST00000558754 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP35.04■■■■□ 3.2
MIR9-3HG-205ENST00000558754 AFF2P51816 1311 aa35.04■■■■□ 3.2
MIR9-3HG-205ENST00000558754 NPHP3Q7Z494 1330 aa35.04■■■■□ 3.2
MIR9-3HG-205ENST00000558754 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP35.03■■■■□ 3.2
MIR9-3HG-205ENST00000558754 DLC1Q96QB1 1528 aa35.02■■■■□ 3.2
MIR9-3HG-205ENST00000558754 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP35.02■■■■□ 3.2
MIR9-3HG-205ENST00000558754 C8orf37Q96NL8 207 aa35.02■■■■□ 3.2
MIR9-3HG-205ENST00000558754 PRAM1Q96QH2 718 aa35.01■■■■□ 3.2
MIR9-3HG-205ENST00000558754 FOXO3O43524 673 aa34.99■■■■□ 3.19
MIR9-3HG-205ENST00000558754 ADAMTS2O95450 1211 aa34.99■■■■□ 3.19
MIR9-3HG-205ENST00000558754 SIRT1Q96EB6 747 aa34.99■■■■□ 3.19
MIR9-3HG-205ENST00000558754 POGKQ9P215 609 aa34.96■■■■□ 3.19
MIR9-3HG-205ENST00000558754 ADGRB2O60241 1585 aa34.95■■■■□ 3.18
MIR9-3HG-205ENST00000558754 TRAK1Q9UPV9 953 aa34.93■■■■□ 3.18
MIR9-3HG-205ENST00000558754 USP32Q8NFA0 1604 aa34.91■■■■□ 3.18
MIR9-3HG-205ENST00000558754 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP34.9■■■■□ 3.18
MIR9-3HG-205ENST00000558754 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP34.9■■■■□ 3.18
MIR9-3HG-205ENST00000558754 RXRBP28702 533 aa34.89■■■■□ 3.18
MIR9-3HG-205ENST00000558754 NGLY1Q96IV0 654 aa34.88■■■■□ 3.17
MIR9-3HG-205ENST00000558754 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP34.86■■■■□ 3.17
MIR9-3HG-205ENST00000558754 STAC3Q96MF2 364 aa34.85■■■■□ 3.17
MIR9-3HG-205ENST00000558754 PHF8Q9UPP1 1060 aa34.84■■■■□ 3.17
MIR9-3HG-205ENST00000558754 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP34.83■■■■□ 3.17
MIR9-3HG-205ENST00000558754 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP34.82■■■■□ 3.16
MIR9-3HG-205ENST00000558754 ANKARQ7Z5J8 1434 aa34.81■■■■□ 3.16
MIR9-3HG-205ENST00000558754 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa34.81■■■■□ 3.16
MIR9-3HG-205ENST00000558754 KRT28Q7Z3Y7 464 aa34.8■■■■□ 3.16
MIR9-3HG-205ENST00000558754 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP34.8■■■■□ 3.16
MIR9-3HG-205ENST00000558754 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa34.78■■■■□ 3.16
MIR9-3HG-205ENST00000558754 TULP4Q9NRJ4 1543 aa34.77■■■■□ 3.16
MIR9-3HG-205ENST00000558754 USP21Q9UK80 565 aa34.77■■■■□ 3.16
MIR9-3HG-205ENST00000558754 RGS12O14924 1447 aa34.77■■■■□ 3.16
MIR9-3HG-205ENST00000558754 TNS3Q68CZ2 1445 aa34.77■■■■□ 3.16
MIR9-3HG-205ENST00000558754 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP34.74■■■■□ 3.15
MIR9-3HG-205ENST00000558754 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa34.74■■■■□ 3.15
MIR9-3HG-205ENST00000558754 ABCA3Q99758 1704 aa34.74■■■■□ 3.15
MIR9-3HG-205ENST00000558754 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP34.74■■■■□ 3.15
MIR9-3HG-205ENST00000558754 PLEKHG5O94827 1062 aa34.72■■■■□ 3.15
MIR9-3HG-205ENST00000558754 ITSN1Q15811 1721 aa34.72■■■■□ 3.15
MIR9-3HG-205ENST00000558754 PSME1Q06323 249 aa34.71■■■■□ 3.15
MIR9-3HG-205ENST00000558754 PRR36Q9H6K5 1346 aa34.7■■■■□ 3.15
MIR9-3HG-205ENST00000558754 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP34.69■■■■□ 3.14
MIR9-3HG-205ENST00000558754 LMOD2Q6P5Q4 547 aa34.69■■■■□ 3.14
MIR9-3HG-205ENST00000558754 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP34.69■■■■□ 3.14
MIR9-3HG-205ENST00000558754 WASLO00401 505 aaPredicted RBP34.68■■■■□ 3.14
MIR9-3HG-205ENST00000558754 ATRNO75882 1429 aa34.67■■■■□ 3.14
MIR9-3HG-205ENST00000558754 SBNO1A3KN83 1393 aa34.67■■■■□ 3.14
MIR9-3HG-205ENST00000558754 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP34.67■■■■□ 3.14
MIR9-3HG-205ENST00000558754 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP34.67■■■■□ 3.14
MIR9-3HG-205ENST00000558754 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP34.66■■■■□ 3.14
MIR9-3HG-205ENST00000558754 BCL9LQ86UU0 1499 aa34.64■■■■□ 3.14
MIR9-3HG-205ENST00000558754 ATP7BP35670 1465 aa34.63■■■■□ 3.13
MIR9-3HG-205ENST00000558754 ARHGEF10O15013 1369 aa34.62■■■■□ 3.13
MIR9-3HG-205ENST00000558754 CABLES1Q8TDN4 633 aa34.62■■■■□ 3.13
MIR9-3HG-205ENST00000558754 PLCH1Q4KWH8 1693 aa34.62■■■■□ 3.13
MIR9-3HG-205ENST00000558754 ALS2Q96Q42 1657 aa34.62■■■■□ 3.13
MIR9-3HG-205ENST00000558754 NBPF1Q3BBV0 1214 aa34.61■■■■□ 3.13
MIR9-3HG-205ENST00000558754 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP34.61■■■■□ 3.13
MIR9-3HG-205ENST00000558754 GPRASP1Q5JY77 1395 aa34.6■■■■□ 3.13
MIR9-3HG-205ENST00000558754 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa34.58■■■■□ 3.13
MIR9-3HG-205ENST00000558754 SIN3AQ96ST3 1273 aa34.57■■■■□ 3.12
MIR9-3HG-205ENST00000558754 SLIT2O94813 1529 aa34.56■■■■□ 3.12
MIR9-3HG-205ENST00000558754 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP34.56■■■■□ 3.12
MIR9-3HG-205ENST00000558754 QRICH2Q9H0J4 1663 aa34.56■■■■□ 3.12
MIR9-3HG-205ENST00000558754 L3MBTL2Q969R5 705 aa34.54■■■■□ 3.12
MIR9-3HG-205ENST00000558754 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa34.53■■■■□ 3.12
MIR9-3HG-205ENST00000558754 NEUROD1Q13562 356 aa34.53■■■■□ 3.12
MIR9-3HG-205ENST00000558754 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP34.53■■■■□ 3.12
MIR9-3HG-205ENST00000558754 NWD2Q9ULI1 1742 aa34.52■■■■□ 3.12
MIR9-3HG-205ENST00000558754 CDK19Q9BWU1 502 aa34.51■■■■□ 3.12
MIR9-3HG-205ENST00000558754 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa34.51■■■■□ 3.12
MIR9-3HG-205ENST00000558754 GLI3P10071 1580 aa34.5■■■■□ 3.11
MIR9-3HG-205ENST00000558754 UNC5CLQ8IV45 518 aa34.49■■■■□ 3.11
MIR9-3HG-205ENST00000558754 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP34.48■■■■□ 3.11
MIR9-3HG-205ENST00000558754 RALGAPBQ86X10 1494 aa34.47■■■■□ 3.11
MIR9-3HG-205ENST00000558754 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP34.46■■■■□ 3.11
MIR9-3HG-205ENST00000558754 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP34.46■■■■□ 3.11
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