RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557130.1

UBE2CP1-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 C pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene UBE2CP1, Length 554 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2CP1-201ENST00000557130 UGGT1Q9NYU2 1555 aa10.07□□□□□ -0.8
UBE2CP1-201ENST00000557130 HECW2Q9P2P5 1572 aa10.07□□□□□ -0.8
UBE2CP1-201ENST00000557130 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa10.07□□□□□ -0.8
UBE2CP1-201ENST00000557130 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP10.07□□□□□ -0.8
UBE2CP1-201ENST00000557130 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP10.07□□□□□ -0.8
UBE2CP1-201ENST00000557130 ABCC3O15438 1527 aa10.07□□□□□ -0.8
UBE2CP1-201ENST00000557130 MYOM1P52179 1685 aa10.06□□□□□ -0.8
UBE2CP1-201ENST00000557130 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa10.06□□□□□ -0.8
UBE2CP1-201ENST00000557130 APAF1O14727 1248 aa10.06□□□□□ -0.8
UBE2CP1-201ENST00000557130 MORC1Q86VD1 984 aa10.06□□□□□ -0.8
UBE2CP1-201ENST00000557130 PROM2Q8N271 834 aa10.06□□□□□ -0.8
UBE2CP1-201ENST00000557130 CRBNQ96SW2 442 aa10.06□□□□□ -0.8
UBE2CP1-201ENST00000557130 TRAK1Q9UPV9 953 aa10.06□□□□□ -0.8
UBE2CP1-201ENST00000557130 EVC2Q86UK5 1308 aa10.06□□□□□ -0.8
UBE2CP1-201ENST00000557130 PDE4AP27815 886 aa10.05□□□□□ -0.8
UBE2CP1-201ENST00000557130 BACH2Q9BYV9 841 aa10.05□□□□□ -0.8
UBE2CP1-201ENST00000557130 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa10.05□□□□□ -0.8
UBE2CP1-201ENST00000557130 ADGRB1O14514 1584 aa10.05□□□□□ -0.8
UBE2CP1-201ENST00000557130 CGNL1Q0VF96 1302 aa10.05□□□□□ -0.8
UBE2CP1-201ENST00000557130 NSD2O96028 1365 aa10.04□□□□□ -0.8
UBE2CP1-201ENST00000557130 PPLO60437 1756 aa10.04□□□□□ -0.8
UBE2CP1-201ENST00000557130 PLIN1O60240 522 aa10.04□□□□□ -0.8
UBE2CP1-201ENST00000557130 RAPGEF3O95398 923 aa10.04□□□□□ -0.8
UBE2CP1-201ENST00000557130 AAMPQ13685 434 aa10.04□□□□□ -0.8
UBE2CP1-201ENST00000557130 IDI1Q13907 227 aa10.04□□□□□ -0.8
UBE2CP1-201ENST00000557130 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP10.04□□□□□ -0.8
UBE2CP1-201ENST00000557130 WDR63Q8IWG1 891 aa10.04□□□□□ -0.8
UBE2CP1-201ENST00000557130 CFAP53Q96M91 514 aa10.04□□□□□ -0.8
UBE2CP1-201ENST00000557130 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
UBE2CP1-201ENST00000557130 NINLQ9Y2I6 1382 aa10.03□□□□□ -0.8
UBE2CP1-201ENST00000557130 PDE3AQ14432 1141 aa10.03□□□□□ -0.8
UBE2CP1-201ENST00000557130 CCDC27Q2M243 656 aa10.03□□□□□ -0.8
UBE2CP1-201ENST00000557130 TMEM132EQ6IEE7 984 aa10.03□□□□□ -0.8
UBE2CP1-201ENST00000557130 RUNDC1Q96C34 613 aa10.03□□□□□ -0.8
UBE2CP1-201ENST00000557130 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP10.03□□□□□ -0.8
UBE2CP1-201ENST00000557130 MROH2AA6NES4 1674 aa10.02□□□□□ -0.8
UBE2CP1-201ENST00000557130 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
UBE2CP1-201ENST00000557130 KDM2BQ8NHM5 1336 aa10.02□□□□□ -0.81
UBE2CP1-201ENST00000557130 GLI2P10070 1586 aa10.01□□□□□ -0.81
UBE2CP1-201ENST00000557130 PIK3C2BO00750 1634 aa10.01□□□□□ -0.81
UBE2CP1-201ENST00000557130 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
UBE2CP1-201ENST00000557130 WWC1Q8IX03 1113 aa10.01□□□□□ -0.81
UBE2CP1-201ENST00000557130 CCDC146Q8IYE0 955 aa10.01□□□□□ -0.81
UBE2CP1-201ENST00000557130 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa10□□□□□ -0.81
UBE2CP1-201ENST00000557130 NSD3Q9BZ95 1437 aa10□□□□□ -0.81
UBE2CP1-201ENST00000557130 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa10□□□□□ -0.81
UBE2CP1-201ENST00000557130 USP32Q8NFA0 1604 aa10□□□□□ -0.81
UBE2CP1-201ENST00000557130 MTHFSP49914 203 aa9.99□□□□□ -0.81
UBE2CP1-201ENST00000557130 C20orf194Q5TEA3 1177 aa9.99□□□□□ -0.81
UBE2CP1-201ENST00000557130 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
UBE2CP1-201ENST00000557130 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa9.99□□□□□ -0.81
UBE2CP1-201ENST00000557130 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
UBE2CP1-201ENST00000557130 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa9.98□□□□□ -0.81
UBE2CP1-201ENST00000557130 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
UBE2CP1-201ENST00000557130 TCP11L2Q8N4U5 519 aa9.98□□□□□ -0.81
UBE2CP1-201ENST00000557130 TERF2IPQ9NYB0 399 aa9.98□□□□□ -0.81
UBE2CP1-201ENST00000557130 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
UBE2CP1-201ENST00000557130 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
UBE2CP1-201ENST00000557130 QRICH2Q9H0J4 1663 aa9.97□□□□□ -0.81
UBE2CP1-201ENST00000557130 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
UBE2CP1-201ENST00000557130 DDRGK1Q96HY6 314 aa9.96□□□□□ -0.82
UBE2CP1-201ENST00000557130 ATAD2Q6PL18 1390 aa9.96□□□□□ -0.82
UBE2CP1-201ENST00000557130 RICTORQ6R327 1708 aa9.96□□□□□ -0.82
UBE2CP1-201ENST00000557130 BCAR3O75815 825 aa9.95□□□□□ -0.82
UBE2CP1-201ENST00000557130 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
UBE2CP1-201ENST00000557130 MYH16Q9H6N6 1097 aa9.95□□□□□ -0.82
UBE2CP1-201ENST00000557130 CABP2Q9NPB3 220 aa9.95□□□□□ -0.82
UBE2CP1-201ENST00000557130 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa9.95□□□□□ -0.82
UBE2CP1-201ENST00000557130 MED14O60244 1454 aa9.94□□□□□ -0.82
UBE2CP1-201ENST00000557130 ABCC11Q96J66 1382 aa9.94□□□□□ -0.82
UBE2CP1-201ENST00000557130 RARSP54136 660 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
UBE2CP1-201ENST00000557130 FAM161AQ3B820 660 aa9.94□□□□□ -0.82
UBE2CP1-201ENST00000557130 POGKQ9P215 609 aa9.94□□□□□ -0.82
UBE2CP1-201ENST00000557130 AGLP35573 1532 aa9.93□□□□□ -0.82
UBE2CP1-201ENST00000557130 YEATS2Q9ULM3 1422 aa9.93□□□□□ -0.82
UBE2CP1-201ENST00000557130 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
UBE2CP1-201ENST00000557130 FAM69CQ0P6D2 419 aa9.93□□□□□ -0.82
UBE2CP1-201ENST00000557130 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
UBE2CP1-201ENST00000557130 CYB5RLQ6IPT4 315 aa9.93□□□□□ -0.82
UBE2CP1-201ENST00000557130 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
UBE2CP1-201ENST00000557130 SIRT1Q96EB6 747 aa9.93□□□□□ -0.82
UBE2CP1-201ENST00000557130 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa9.93□□□□□ -0.82
UBE2CP1-201ENST00000557130 TULP4Q9NRJ4 1543 aa9.92□□□□□ -0.82
UBE2CP1-201ENST00000557130 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
UBE2CP1-201ENST00000557130 IL16Q14005 1332 aa9.92□□□□□ -0.82
UBE2CP1-201ENST00000557130 FYB1O15117 783 aa9.92□□□□□ -0.82
UBE2CP1-201ENST00000557130 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
UBE2CP1-201ENST00000557130 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
UBE2CP1-201ENST00000557130 HDGFP51858 240 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
UBE2CP1-201ENST00000557130 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP9.92□□□□□ -0.82
UBE2CP1-201ENST00000557130 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa9.92□□□□□ -0.82
UBE2CP1-201ENST00000557130 PRAM1Q96QH2 718 aa9.92□□□□□ -0.82
UBE2CP1-201ENST00000557130 STK26Q9P289 416 aa9.92□□□□□ -0.82
UBE2CP1-201ENST00000557130 REREQ9P2R6 1566 aa9.92□□□□□ -0.82
UBE2CP1-201ENST00000557130 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
UBE2CP1-201ENST00000557130 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
UBE2CP1-201ENST00000557130 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP9.91□□□□□ -0.82
UBE2CP1-201ENST00000557130 CLUAP1Q96AJ1 413 aa9.91□□□□□ -0.82
UBE2CP1-201ENST00000557130 CDK19Q9BWU1 502 aa9.91□□□□□ -0.82
UBE2CP1-201ENST00000557130 USP35Q9P2H5 1018 aa9.91□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.1 ms