RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553961.1

ACTN1-AS1-202, ACTN1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene ACTN1-AS1, Length 599 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 NPHP3Q7Z494 1330 aa20.02■□□□□ 0.8
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 SHPRHQ149N8 1683 aa20.02■□□□□ 0.8
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 LRP6O75581 1613 aa20.02■□□□□ 0.79
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 CFAP70Q5T0N1 1121 aa20.01■□□□□ 0.79
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 C8orf37Q96NL8 207 aa20.01■□□□□ 0.79
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 TECPR2O15040 1411 aa20.01■□□□□ 0.79
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 NUTM2FA1L443 756 aa20■□□□□ 0.79
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 SIRT1Q96EB6 747 aa20■□□□□ 0.79
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 POGKQ9P215 609 aa20■□□□□ 0.79
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 NHSL1Q5SYE7 1610 aa19.99■□□□□ 0.79
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ACTN1-AS1-202ENST00000553961 ADAMTS2O95450 1211 aa19.99■□□□□ 0.79
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 RXRBP28702 533 aa19.99■□□□□ 0.79
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 STAC3Q96MF2 364 aa19.99■□□□□ 0.79
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa19.99■□□□□ 0.79
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP19.99■□□□□ 0.79
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ACTN1-AS1-202ENST00000553961 IFT172Q9UG01 1749 aa19.95■□□□□ 0.78
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa19.95■□□□□ 0.78
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP19.93■□□□□ 0.78
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 NRXN1Q9ULB1 1477 aa19.92■□□□□ 0.78
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP19.92■□□□□ 0.78
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 LAMC1P11047 1609 aa19.91■□□□□ 0.78
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 TRAK1Q9UPV9 953 aa19.91■□□□□ 0.78
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 PSME1Q06323 249 aa19.9■□□□□ 0.78
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ACTN1-AS1-202ENST00000553961 PHF8Q9UPP1 1060 aa19.89■□□□□ 0.77
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 KNDC1Q76NI1 1749 aa19.88■□□□□ 0.77
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ACTN1-AS1-202ENST00000553961 USP21Q9UK80 565 aa19.88■□□□□ 0.77
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 KRT28Q7Z3Y7 464 aa19.87■□□□□ 0.77
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 LMOD2Q6P5Q4 547 aa19.85■□□□□ 0.77
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP19.84■□□□□ 0.77
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP19.84■□□□□ 0.77
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP19.84■□□□□ 0.77
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 PXDNQ92626 1479 aa19.84■□□□□ 0.77
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 DLC1Q96QB1 1528 aa19.82■□□□□ 0.76
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa19.82■□□□□ 0.76
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP19.82■□□□□ 0.76
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP19.82■□□□□ 0.76
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP19.81■□□□□ 0.76
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 KIF1AQ12756 1690 aa19.8■□□□□ 0.76
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ACTN1-AS1-202ENST00000553961 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP19.76■□□□□ 0.75
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 ARHGEF10O15013 1369 aa19.76■□□□□ 0.75
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP19.76■□□□□ 0.75
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP19.76■□□□□ 0.75
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 SBNO1A3KN83 1393 aa19.75■□□□□ 0.75
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 TNS3Q68CZ2 1445 aa19.75■□□□□ 0.75
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 RGS12O14924 1447 aa19.72■□□□□ 0.75
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP19.72■□□□□ 0.75
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ACTN1-AS1-202ENST00000553961 CABLES1Q8TDN4 633 aa19.71■□□□□ 0.75
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 ADGRB2O60241 1585 aa19.7■□□□□ 0.74
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP19.7■□□□□ 0.74
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP19.7■□□□□ 0.74
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 ATAD2Q6PL18 1390 aa19.7■□□□□ 0.74
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 ATRNO75882 1429 aa19.69■□□□□ 0.74
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP19.69■□□□□ 0.74
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 TULP4Q9NRJ4 1543 aa19.68■□□□□ 0.74
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 CDK19Q9BWU1 502 aa19.68■□□□□ 0.74
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 BCL9LQ86UU0 1499 aa19.67■□□□□ 0.74
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 NEUROD1Q13562 356 aa19.67■□□□□ 0.74
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 PRR36Q9H6K5 1346 aa19.67■□□□□ 0.74
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP19.65■□□□□ 0.74
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 NBPF1Q3BBV0 1214 aa19.65■□□□□ 0.74
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 L3MBTL2Q969R5 705 aa19.65■□□□□ 0.74
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 CCDC61Q9Y6R9 512 aa19.65■□□□□ 0.74
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP19.63■□□□□ 0.73
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP19.63■□□□□ 0.73
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 SIN3AQ96ST3 1273 aa19.62■□□□□ 0.73
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 USP32Q8NFA0 1604 aa19.62■□□□□ 0.73
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 SLIT2O94813 1529 aa19.61■□□□□ 0.73
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 A0A0G2JS52 829 aa19.61■□□□□ 0.73
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 MYT1Q01538 1121 aa19.61■□□□□ 0.73
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 VPS72Q15906 364 aa19.61■□□□□ 0.73
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 FAM83GA6ND36 823 aa19.6■□□□□ 0.73
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa19.59■□□□□ 0.73
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 CCDC125Q86Z20 511 aa19.59■□□□□ 0.73
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 BTG4Q9NY30 223 aa19.59■□□□□ 0.73
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP19.59■□□□□ 0.73
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 ACEP12821 1306 aa19.58■□□□□ 0.73
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 PRDM11Q9NQV5 511 aa19.58■□□□□ 0.72
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP19.58■□□□□ 0.72
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 RALGAPBQ86X10 1494 aa19.58■□□□□ 0.72
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 ATP7BP35670 1465 aa19.57■□□□□ 0.72
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