RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553948.1

TTC7B-202, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 7B, humanhuman

TSL 5

Gene TTC7B, Length 630 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC7B-202ENST00000553948 WAPLQ7Z5K2 1190 aa47.5■■■■■ 5.19
TTC7B-202ENST00000553948 ORAI2Q96SN7 254 aa47.5■■■■■ 5.19
TTC7B-202ENST00000553948 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP47.5■■■■■ 5.19
TTC7B-202ENST00000553948 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP47.49■■■■■ 5.19
TTC7B-202ENST00000553948 LAMC1P11047 1609 aa47.48■■■■■ 5.19
TTC7B-202ENST00000553948 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP47.45■■■■■ 5.19
TTC7B-202ENST00000553948 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP47.45■■■■■ 5.19
TTC7B-202ENST00000553948 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP47.45■■■■■ 5.19
TTC7B-202ENST00000553948 CFAP70Q5T0N1 1121 aa47.43■■■■■ 5.18
TTC7B-202ENST00000553948 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa47.41■■■■■ 5.18
TTC7B-202ENST00000553948 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP47.39■■■■■ 5.18
TTC7B-202ENST00000553948 PNPLA6Q8IY17 1366 aa47.39■■■■■ 5.18
TTC7B-202ENST00000553948 SIRT1Q96EB6 747 aa47.37■■■■■ 5.17
TTC7B-202ENST00000553948 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP47.35■■■■■ 5.17
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TTC7B-202ENST00000553948 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP47.34■■■■■ 5.17
TTC7B-202ENST00000553948 NUTM2FA1L443 756 aa47.28■■■■■ 5.16
TTC7B-202ENST00000553948 DCAF11Q8TEB1 546 aa47.28■■■■■ 5.16
TTC7B-202ENST00000553948 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa47.28■■■■■ 5.16
TTC7B-202ENST00000553948 NPHP3Q7Z494 1330 aa47.27■■■■■ 5.16
TTC7B-202ENST00000553948 FMN2Q9NZ56 1722 aa47.26■■■■■ 5.16
TTC7B-202ENST00000553948 STAC3Q96MF2 364 aa47.23■■■■■ 5.15
TTC7B-202ENST00000553948 PRAM1Q96QH2 718 aa47.2■■■■■ 5.15
TTC7B-202ENST00000553948 FOXO3O43524 673 aa47.19■■■■■ 5.14
TTC7B-202ENST00000553948 DLC1Q96QB1 1528 aa47.19■■■■■ 5.14
TTC7B-202ENST00000553948 ADGRB1O14514 1584 aa47.19■■■■■ 5.14
TTC7B-202ENST00000553948 AFF2P51816 1311 aa47.18■■■■■ 5.14
TTC7B-202ENST00000553948 PXDNQ92626 1479 aa47.17■■■■■ 5.14
TTC7B-202ENST00000553948 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP47.16■■■■■ 5.14
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TTC7B-202ENST00000553948 KIF1AQ12756 1690 aa47.11■■■■■ 5.13
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TTC7B-202ENST00000553948 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP47.11■■■■■ 5.13
TTC7B-202ENST00000553948 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP47.11■■■■■ 5.13
TTC7B-202ENST00000553948 TRAK1Q9UPV9 953 aa47.09■■■■■ 5.13
TTC7B-202ENST00000553948 RXRBP28702 533 aa47.07■■■■■ 5.13
TTC7B-202ENST00000553948 NGLY1Q96IV0 654 aa47.05■■■■■ 5.12
TTC7B-202ENST00000553948 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP47.04■■■■■ 5.12
TTC7B-202ENST00000553948 ADGRB2O60241 1585 aa47■■■■■ 5.11
TTC7B-202ENST00000553948 PHF8Q9UPP1 1060 aa46.99■■■■■ 5.11
TTC7B-202ENST00000553948 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP46.96■■■■■ 5.11
TTC7B-202ENST00000553948 KRT28Q7Z3Y7 464 aa46.95■■■■■ 5.11
TTC7B-202ENST00000553948 ANKARQ7Z5J8 1434 aa46.94■■■■■ 5.1
TTC7B-202ENST00000553948 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP46.93■■■■■ 5.1
TTC7B-202ENST00000553948 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa46.92■■■■■ 5.1
TTC7B-202ENST00000553948 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP46.92■■■■■ 5.1
TTC7B-202ENST00000553948 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP46.92■■■■■ 5.1
TTC7B-202ENST00000553948 USP32Q8NFA0 1604 aa46.9■■■■■ 5.1
TTC7B-202ENST00000553948 PSME1Q06323 249 aa46.88■■■■■ 5.1
TTC7B-202ENST00000553948 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP46.87■■■■■ 5.09
TTC7B-202ENST00000553948 USP21Q9UK80 565 aa46.87■■■■■ 5.09
TTC7B-202ENST00000553948 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP46.86■■■■■ 5.09
TTC7B-202ENST00000553948 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP46.85■■■■■ 5.09
TTC7B-202ENST00000553948 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP46.85■■■■■ 5.09
TTC7B-202ENST00000553948 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP46.85■■■■■ 5.09
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TTC7B-202ENST00000553948 TNS3Q68CZ2 1445 aa46.81■■■■■ 5.08
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TTC7B-202ENST00000553948 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP46.77■■■■■ 5.08
TTC7B-202ENST00000553948 PRR36Q9H6K5 1346 aa46.75■■■■■ 5.07
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TTC7B-202ENST00000553948 ATRNO75882 1429 aa46.7■■■■■ 5.07
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TTC7B-202ENST00000553948 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP46.67■■■■■ 5.06
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TTC7B-202ENST00000553948 ATP7BP35670 1465 aa46.59■■■■■ 5.05
TTC7B-202ENST00000553948 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP46.59■■■■■ 5.05
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TTC7B-202ENST00000553948 SLIT2O94813 1529 aa46.57■■■■■ 5.05
TTC7B-202ENST00000553948 NEUROD1Q13562 356 aa46.54■■■■■ 5.04
TTC7B-202ENST00000553948 UNC5CLQ8IV45 518 aa46.54■■■■■ 5.04
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TTC7B-202ENST00000553948 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP46.51■■■■■ 5.04
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TTC7B-202ENST00000553948 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP46.46■■■■■ 5.03
TTC7B-202ENST00000553948 PLCH1Q4KWH8 1693 aa46.44■■■■■ 5.02
TTC7B-202ENST00000553948 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa46.44■■■■■ 5.02
TTC7B-202ENST00000553948 CCDC61Q9Y6R9 512 aa46.43■■■■■ 5.02
TTC7B-202ENST00000553948 NWD2Q9ULI1 1742 aa46.42■■■■■ 5.02
TTC7B-202ENST00000553948 ATAD2Q6PL18 1390 aa46.41■■■■■ 5.02
TTC7B-202ENST00000553948 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa46.41■■■■■ 5.02
TTC7B-202ENST00000553948 RALGAPBQ86X10 1494 aa46.4■■■■■ 5.02
TTC7B-202ENST00000553948 QRICH2Q9H0J4 1663 aa46.39■■■■■ 5.02
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