RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552294.1

CTDSP2-208, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

TSL 5

Gene CTDSP2, Length 436 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2-208ENST00000552294 ATAD2Q6PL18 1390 aa10.53□□□□□ -0.72
CTDSP2-208ENST00000552294 ROCK1Q13464 1354 aa10.52□□□□□ -0.72
CTDSP2-208ENST00000552294 GLI3P10071 1580 aa10.52□□□□□ -0.72
CTDSP2-208ENST00000552294 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP10.52□□□□□ -0.73
CTDSP2-208ENST00000552294 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa10.52□□□□□ -0.73
CTDSP2-208ENST00000552294 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa10.51□□□□□ -0.73
CTDSP2-208ENST00000552294 FOXO3O43524 673 aa10.51□□□□□ -0.73
CTDSP2-208ENST00000552294 WAPLQ7Z5K2 1190 aa10.51□□□□□ -0.73
CTDSP2-208ENST00000552294 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP10.51□□□□□ -0.73
CTDSP2-208ENST00000552294 PLEKHG5O94827 1062 aa10.5□□□□□ -0.73
CTDSP2-208ENST00000552294 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP10.5□□□□□ -0.73
CTDSP2-208ENST00000552294 ZRANB1Q9UGI0 708 aa10.5□□□□□ -0.73
CTDSP2-208ENST00000552294 PTCH1Q13635 1447 aa10.5□□□□□ -0.73
CTDSP2-208ENST00000552294 RALGAPBQ86X10 1494 aa10.49□□□□□ -0.73
CTDSP2-208ENST00000552294 ESCO1Q5FWF5 840 aa10.49□□□□□ -0.73
CTDSP2-208ENST00000552294 CABLES1Q8TDN4 633 aa10.49□□□□□ -0.73
CTDSP2-208ENST00000552294 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP10.48□□□□□ -0.73
CTDSP2-208ENST00000552294 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa10.48□□□□□ -0.73
CTDSP2-208ENST00000552294 FAM182BQ5T319 152 aa10.47□□□□□ -0.73
CTDSP2-208ENST00000552294 SLIT2O94813 1529 aa10.47□□□□□ -0.73
CTDSP2-208ENST00000552294 BRWD3Q6RI45 1802 aa10.47□□□□□ -0.73
CTDSP2-208ENST00000552294 TMEM132EQ6IEE7 984 aa10.46□□□□□ -0.73
CTDSP2-208ENST00000552294 STK26Q9P289 416 aa10.46□□□□□ -0.73
CTDSP2-208ENST00000552294 NAIPQ13075 1403 aa10.45□□□□□ -0.74
CTDSP2-208ENST00000552294 PRAG1Q86YV5 1406 aa10.45□□□□□ -0.74
CTDSP2-208ENST00000552294 UNC5CLQ8IV45 518 aa10.44□□□□□ -0.74
CTDSP2-208ENST00000552294 SEPT12Q8IYM1 358 aa10.44□□□□□ -0.74
CTDSP2-208ENST00000552294 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa10.43□□□□□ -0.74
CTDSP2-208ENST00000552294 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
CTDSP2-208ENST00000552294 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP10.42□□□□□ -0.74
CTDSP2-208ENST00000552294 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa10.42□□□□□ -0.74
CTDSP2-208ENST00000552294 NPHP3Q7Z494 1330 aa10.41□□□□□ -0.74
CTDSP2-208ENST00000552294 HFM1A2PYH4 1435 aa10.41□□□□□ -0.74
CTDSP2-208ENST00000552294 FAM83GA6ND36 823 aa10.4□□□□□ -0.74
CTDSP2-208ENST00000552294 VGFO15240 615 aaPredicted RBP10.4□□□□□ -0.74
CTDSP2-208ENST00000552294 HRCP23327 699 aa10.4□□□□□ -0.74
CTDSP2-208ENST00000552294 KRT28Q7Z3Y7 464 aa10.4□□□□□ -0.74
CTDSP2-208ENST00000552294 PPLO60437 1756 aa10.39□□□□□ -0.75
CTDSP2-208ENST00000552294 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP10.39□□□□□ -0.75
CTDSP2-208ENST00000552294 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP10.39□□□□□ -0.75
CTDSP2-208ENST00000552294 RGL3Q3MIN7 710 aa10.39□□□□□ -0.75
CTDSP2-208ENST00000552294 CCDC125Q86Z20 511 aa10.39□□□□□ -0.75
CTDSP2-208ENST00000552294 USP32Q8NFA0 1604 aa10.39□□□□□ -0.75
CTDSP2-208ENST00000552294 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP10.38□□□□□ -0.75
CTDSP2-208ENST00000552294 VPS72Q15906 364 aa10.38□□□□□ -0.75
CTDSP2-208ENST00000552294 KIF1BO60333 1816 aa10.37□□□□□ -0.75
CTDSP2-208ENST00000552294 TECPR2O15040 1411 aa10.37□□□□□ -0.75
CTDSP2-208ENST00000552294 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa10.37□□□□□ -0.75
CTDSP2-208ENST00000552294 FMN2Q9NZ56 1722 aa10.37□□□□□ -0.75
CTDSP2-208ENST00000552294 PLCH1Q4KWH8 1693 aa10.37□□□□□ -0.75
CTDSP2-208ENST00000552294 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP10.37□□□□□ -0.75
CTDSP2-208ENST00000552294 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP10.37□□□□□ -0.75
CTDSP2-208ENST00000552294 LRP5O75197 1615 aa10.36□□□□□ -0.75
CTDSP2-208ENST00000552294 ADRA2BP18089 450 aa10.36□□□□□ -0.75
CTDSP2-208ENST00000552294 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP10.36□□□□□ -0.75
CTDSP2-208ENST00000552294 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP10.36□□□□□ -0.75
CTDSP2-208ENST00000552294 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP10.36□□□□□ -0.75
CTDSP2-208ENST00000552294 KRT27Q7Z3Y8 459 aa10.36□□□□□ -0.75
CTDSP2-208ENST00000552294 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa10.36□□□□□ -0.75
CTDSP2-208ENST00000552294 ABCA3Q99758 1704 aa10.36□□□□□ -0.75
CTDSP2-208ENST00000552294 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP10.35□□□□□ -0.75
CTDSP2-208ENST00000552294 ABCC11Q96J66 1382 aa10.35□□□□□ -0.75
CTDSP2-208ENST00000552294 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa10.34□□□□□ -0.75
CTDSP2-208ENST00000552294 TNS3Q68CZ2 1445 aa10.34□□□□□ -0.75
CTDSP2-208ENST00000552294 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP10.34□□□□□ -0.75
CTDSP2-208ENST00000552294 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP10.34□□□□□ -0.75
CTDSP2-208ENST00000552294 PHF8Q9UPP1 1060 aa10.34□□□□□ -0.75
CTDSP2-208ENST00000552294 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP10.34□□□□□ -0.75
CTDSP2-208ENST00000552294 PRR36Q9H6K5 1346 aa10.33□□□□□ -0.76
CTDSP2-208ENST00000552294 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP10.33□□□□□ -0.76
CTDSP2-208ENST00000552294 NRAPQ86VF7 1730 aa10.33□□□□□ -0.76
CTDSP2-208ENST00000552294 CFAP70Q5T0N1 1121 aa10.33□□□□□ -0.76
CTDSP2-208ENST00000552294 LMOD2Q6P5Q4 547 aa10.33□□□□□ -0.76
CTDSP2-208ENST00000552294 PIK3C2GO75747 1445 aa10.33□□□□□ -0.76
CTDSP2-208ENST00000552294 BTG4Q9NY30 223 aa10.32□□□□□ -0.76
CTDSP2-208ENST00000552294 IFT172Q9UG01 1749 aa10.32□□□□□ -0.76
CTDSP2-208ENST00000552294 CCDC144AA2RUR9 1427 aa10.32□□□□□ -0.76
CTDSP2-208ENST00000552294 NRXN1Q9ULB1 1477 aa10.31□□□□□ -0.76
CTDSP2-208ENST00000552294 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP10.31□□□□□ -0.76
CTDSP2-208ENST00000552294 UTRNP46939 3433 aa10.3□□□□□ -0.76
CTDSP2-208ENST00000552294 A0A0G2JS52 829 aa10.3□□□□□ -0.76
CTDSP2-208ENST00000552294 MYT1Q01538 1121 aa10.3□□□□□ -0.76
CTDSP2-208ENST00000552294 PRAM1Q96QH2 718 aa10.3□□□□□ -0.76
CTDSP2-208ENST00000552294 CAMKK2Q96RR4 588 aa10.3□□□□□ -0.76
CTDSP2-208ENST00000552294 KNDC1Q76NI1 1749 aa10.3□□□□□ -0.76
CTDSP2-208ENST00000552294 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP10.3□□□□□ -0.76
CTDSP2-208ENST00000552294 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP10.3□□□□□ -0.76
CTDSP2-208ENST00000552294 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP10.29□□□□□ -0.76
CTDSP2-208ENST00000552294 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa10.29□□□□□ -0.76
CTDSP2-208ENST00000552294 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa10.29□□□□□ -0.76
CTDSP2-208ENST00000552294 KIF1AQ12756 1690 aa10.28□□□□□ -0.76
CTDSP2-208ENST00000552294 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa10.28□□□□□ -0.76
CTDSP2-208ENST00000552294 SBNO1A3KN83 1393 aa10.28□□□□□ -0.76
CTDSP2-208ENST00000552294 NWD2Q9ULI1 1742 aa10.28□□□□□ -0.76
CTDSP2-208ENST00000552294 TRIM37O94972 964 aa10.28□□□□□ -0.76
CTDSP2-208ENST00000552294 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP10.28□□□□□ -0.76
CTDSP2-208ENST00000552294 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP10.28□□□□□ -0.76
CTDSP2-208ENST00000552294 CHRNA2Q15822 529 aa10.28□□□□□ -0.76
CTDSP2-208ENST00000552294 PTF1AQ7RTS3 328 aa10.28□□□□□ -0.76
CTDSP2-208ENST00000552294 BAG6P46379 1132 aa10.27□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 285.6 ms