RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551441.5

CS-227, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 636 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-227ENST00000551441 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
CS-227ENST00000551441 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa24.31■■□□□ 1.48
CS-227ENST00000551441 ATAD2Q6PL18 1390 aa24.3■■□□□ 1.48
CS-227ENST00000551441 HFM1A2PYH4 1435 aa24.3■■□□□ 1.48
CS-227ENST00000551441 FOXO3O43524 673 aa24.3■■□□□ 1.48
CS-227ENST00000551441 WAPLQ7Z5K2 1190 aa24.3■■□□□ 1.48
CS-227ENST00000551441 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
CS-227ENST00000551441 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa24.3■■□□□ 1.48
CS-227ENST00000551441 RGL3Q3MIN7 710 aa24.29■■□□□ 1.48
CS-227ENST00000551441 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa24.29■■□□□ 1.48
CS-227ENST00000551441 ATRNO75882 1429 aa24.28■■□□□ 1.48
CS-227ENST00000551441 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
CS-227ENST00000551441 NPHP3Q7Z494 1330 aa24.26■■□□□ 1.47
CS-227ENST00000551441 EP400Q96L91 3159 aa24.25■■□□□ 1.47
CS-227ENST00000551441 MYOM2P54296 1465 aa24.25■■□□□ 1.47
CS-227ENST00000551441 PXDNQ92626 1479 aa24.25■■□□□ 1.47
CS-227ENST00000551441 PLEKHG5O94827 1062 aa24.24■■□□□ 1.47
CS-227ENST00000551441 TMEM132EQ6IEE7 984 aa24.24■■□□□ 1.47
CS-227ENST00000551441 PRAG1Q86YV5 1406 aa24.24■■□□□ 1.47
CS-227ENST00000551441 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa24.23■■□□□ 1.47
CS-227ENST00000551441 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa24.23■■□□□ 1.47
CS-227ENST00000551441 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
CS-227ENST00000551441 BCL9LQ86UU0 1499 aa24.22■■□□□ 1.47
CS-227ENST00000551441 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
CS-227ENST00000551441 POTEDQ86YR6 584 aa24.17■■□□□ 1.46
CS-227ENST00000551441 ZRANB1Q9UGI0 708 aa24.17■■□□□ 1.46
CS-227ENST00000551441 CCDC144AA2RUR9 1427 aa24.15■■□□□ 1.46
CS-227ENST00000551441 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
CS-227ENST00000551441 IFT172Q9UG01 1749 aa24.13■■□□□ 1.45
CS-227ENST00000551441 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
CS-227ENST00000551441 KRT28Q7Z3Y7 464 aa24.12■■□□□ 1.45
CS-227ENST00000551441 FMN2Q9NZ56 1722 aa24.12■■□□□ 1.45
CS-227ENST00000551441 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa24.11■■□□□ 1.45
CS-227ENST00000551441 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa24.11■■□□□ 1.45
CS-227ENST00000551441 UNC5CLQ8IV45 518 aa24.11■■□□□ 1.45
CS-227ENST00000551441 CABLES1Q8TDN4 633 aa24.11■■□□□ 1.45
CS-227ENST00000551441 GLI3P10071 1580 aa24.11■■□□□ 1.45
CS-227ENST00000551441 TECPR2O15040 1411 aa24.1■■□□□ 1.45
CS-227ENST00000551441 MPHOSPH9Q99550 1183 aa24.1■■□□□ 1.45
CS-227ENST00000551441 RALGAPBQ86X10 1494 aa24.1■■□□□ 1.45
CS-227ENST00000551441 ABCC11Q96J66 1382 aa24.09■■□□□ 1.45
CS-227ENST00000551441 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
CS-227ENST00000551441 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP24.09■■□□□ 1.45
CS-227ENST00000551441 BRWD3Q6RI45 1802 aa24.09■■□□□ 1.45
CS-227ENST00000551441 KNDC1Q76NI1 1749 aa24.09■■□□□ 1.45
CS-227ENST00000551441 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.44
CS-227ENST00000551441 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
CS-227ENST00000551441 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa24.07■■□□□ 1.44
CS-227ENST00000551441 SLIT2O94813 1529 aa24.07■■□□□ 1.44
CS-227ENST00000551441 LMOD2Q6P5Q4 547 aa24.07■■□□□ 1.44
CS-227ENST00000551441 DEFB132Q7Z7B7 95 aa24.07■■□□□ 1.44
CS-227ENST00000551441 CCDC125Q86Z20 511 aa24.06■■□□□ 1.44
CS-227ENST00000551441 PIK3C2GO75747 1445 aa24.06■■□□□ 1.44
CS-227ENST00000551441 KIF1AQ12756 1690 aa24.05■■□□□ 1.44
CS-227ENST00000551441 PHF8Q9UPP1 1060 aa24.05■■□□□ 1.44
CS-227ENST00000551441 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
CS-227ENST00000551441 USP32Q8NFA0 1604 aa24.05■■□□□ 1.44
CS-227ENST00000551441 CFAP70Q5T0N1 1121 aa24.04■■□□□ 1.44
CS-227ENST00000551441 SEPT12Q8IYM1 358 aa24.03■■□□□ 1.44
CS-227ENST00000551441 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa24.01■■□□□ 1.43
CS-227ENST00000551441 TNS3Q68CZ2 1445 aa24.01■■□□□ 1.43
CS-227ENST00000551441 PLCH1Q4KWH8 1693 aa23.99■■□□□ 1.43
CS-227ENST00000551441 PSME1Q06323 249 aa23.99■■□□□ 1.43
CS-227ENST00000551441 PRAM1Q96QH2 718 aa23.99■■□□□ 1.43
CS-227ENST00000551441 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP23.99■■□□□ 1.43
CS-227ENST00000551441 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP23.99■■□□□ 1.43
CS-227ENST00000551441 A0A0G2JS52 829 aa23.97■■□□□ 1.43
CS-227ENST00000551441 MYT1Q01538 1121 aa23.97■■□□□ 1.43
CS-227ENST00000551441 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP23.96■■□□□ 1.43
CS-227ENST00000551441 VPS72Q15906 364 aa23.96■■□□□ 1.43
CS-227ENST00000551441 ABCA3Q99758 1704 aa23.96■■□□□ 1.43
CS-227ENST00000551441 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP23.95■■□□□ 1.42
CS-227ENST00000551441 FAM83GA6ND36 823 aa23.94■■□□□ 1.42
CS-227ENST00000551441 SIRT1Q96EB6 747 aa23.94■■□□□ 1.42
CS-227ENST00000551441 POGKQ9P215 609 aa23.94■■□□□ 1.42
CS-227ENST00000551441 NRXN1Q9ULB1 1477 aa23.94■■□□□ 1.42
CS-227ENST00000551441 KRT27Q7Z3Y8 459 aa23.93■■□□□ 1.42
CS-227ENST00000551441 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP23.93■■□□□ 1.42
CS-227ENST00000551441 SBNO1A3KN83 1393 aa23.91■■□□□ 1.42
CS-227ENST00000551441 NWD2Q9ULI1 1742 aa23.9■■□□□ 1.42
CS-227ENST00000551441 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP23.9■■□□□ 1.42
CS-227ENST00000551441 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP23.9■■□□□ 1.42
CS-227ENST00000551441 TRAK1Q9UPV9 953 aa23.89■■□□□ 1.41
CS-227ENST00000551441 FAM182BQ5T319 152 aa23.88■■□□□ 1.41
CS-227ENST00000551441 BTG4Q9NY30 223 aa23.88■■□□□ 1.41
CS-227ENST00000551441 ARHGEF10O15013 1369 aa23.88■■□□□ 1.41
CS-227ENST00000551441 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP23.87■■□□□ 1.41
CS-227ENST00000551441 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP23.87■■□□□ 1.41
CS-227ENST00000551441 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa23.85■■□□□ 1.41
CS-227ENST00000551441 NRAPQ86VF7 1730 aa23.84■■□□□ 1.41
CS-227ENST00000551441 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP23.84■■□□□ 1.41
CS-227ENST00000551441 PRR36Q9H6K5 1346 aa23.84■■□□□ 1.41
CS-227ENST00000551441 DLC1Q96QB1 1528 aa23.81■■□□□ 1.4
CS-227ENST00000551441 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP23.81■■□□□ 1.4
CS-227ENST00000551441 ANKARQ7Z5J8 1434 aa23.81■■□□□ 1.4
CS-227ENST00000551441 MSH5O43196 834 aa23.8■■□□□ 1.4
CS-227ENST00000551441 BAG6P46379 1132 aa23.8■■□□□ 1.4
CS-227ENST00000551441 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP23.8■■□□□ 1.4
CS-227ENST00000551441 ALS2Q96Q42 1657 aa23.79■■□□□ 1.4
CS-227ENST00000551441 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP23.79■■□□□ 1.4
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