RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551155.1

CS-224, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 558 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-224ENST00000551155 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP13.39□□□□□ -0.27
CS-224ENST00000551155 PIP4K2BP78356 416 aa13.38□□□□□ -0.27
CS-224ENST00000551155 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa13.38□□□□□ -0.27
CS-224ENST00000551155 DLC1Q96QB1 1528 aa13.38□□□□□ -0.27
CS-224ENST00000551155 SLAIN2Q9P270 581 aa13.37□□□□□ -0.27
CS-224ENST00000551155 TRAK1Q9UPV9 953 aa13.37□□□□□ -0.27
CS-224ENST00000551155 WAPLQ7Z5K2 1190 aa13.36□□□□□ -0.27
CS-224ENST00000551155 POGKQ9P215 609 aa13.36□□□□□ -0.27
CS-224ENST00000551155 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP13.34□□□□□ -0.27
CS-224ENST00000551155 NBPF1Q3BBV0 1214 aa13.34□□□□□ -0.27
CS-224ENST00000551155 PRAM1Q96QH2 718 aa13.34□□□□□ -0.27
CS-224ENST00000551155 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP13.33□□□□□ -0.27
CS-224ENST00000551155 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa13.33□□□□□ -0.28
CS-224ENST00000551155 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa13.32□□□□□ -0.28
CS-224ENST00000551155 NBPF8Q3BBV2 869 aa13.32□□□□□ -0.28
CS-224ENST00000551155 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa13.32□□□□□ -0.28
CS-224ENST00000551155 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP13.3□□□□□ -0.28
CS-224ENST00000551155 MST1RQ04912 1400 aa13.3□□□□□ -0.28
CS-224ENST00000551155 RALGAPBQ86X10 1494 aa13.29□□□□□ -0.28
CS-224ENST00000551155 FMN2Q9NZ56 1722 aa13.29□□□□□ -0.28
CS-224ENST00000551155 ADGRB2O60241 1585 aa13.28□□□□□ -0.28
CS-224ENST00000551155 CARD11Q9BXL7 1154 aa13.28□□□□□ -0.28
CS-224ENST00000551155 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP13.28□□□□□ -0.28
CS-224ENST00000551155 GPRASP1Q5JY77 1395 aa13.28□□□□□ -0.28
CS-224ENST00000551155 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP13.27□□□□□ -0.29
CS-224ENST00000551155 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP13.27□□□□□ -0.29
CS-224ENST00000551155 C1orf167Q5SNV9 1468 aa13.27□□□□□ -0.29
CS-224ENST00000551155 PHLPP1O60346 1717 aa13.26□□□□□ -0.29
CS-224ENST00000551155 HSPA1LP34931 641 aa13.26□□□□□ -0.29
CS-224ENST00000551155 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP13.26□□□□□ -0.29
CS-224ENST00000551155 BRINP3Q76B58 766 aa13.26□□□□□ -0.29
CS-224ENST00000551155 QRICH2Q9H0J4 1663 aa13.26□□□□□ -0.29
CS-224ENST00000551155 WASLO00401 505 aaPredicted RBP13.25□□□□□ -0.29
CS-224ENST00000551155 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP13.25□□□□□ -0.29
CS-224ENST00000551155 ESCO1Q5FWF5 840 aa13.24□□□□□ -0.29
CS-224ENST00000551155 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP13.24□□□□□ -0.29
CS-224ENST00000551155 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP13.24□□□□□ -0.29
CS-224ENST00000551155 ANKARQ7Z5J8 1434 aa13.23□□□□□ -0.29
CS-224ENST00000551155 NUTM2FA1L443 756 aa13.23□□□□□ -0.29
CS-224ENST00000551155 ORAI2Q96SN7 254 aa13.23□□□□□ -0.29
CS-224ENST00000551155 KIF1AQ12756 1690 aa13.23□□□□□ -0.29
CS-224ENST00000551155 NHSL1Q5SYE7 1610 aa13.23□□□□□ -0.29
CS-224ENST00000551155 SLC24A1O60721 1099 aa13.22□□□□□ -0.29
CS-224ENST00000551155 TULP4Q9NRJ4 1543 aa13.22□□□□□ -0.29
CS-224ENST00000551155 ITSN1Q15811 1721 aa13.22□□□□□ -0.29
CS-224ENST00000551155 NPHP3Q7Z494 1330 aa13.2□□□□□ -0.3
CS-224ENST00000551155 EVC2Q86UK5 1308 aa13.2□□□□□ -0.3
CS-224ENST00000551155 CDK19Q9BWU1 502 aa13.2□□□□□ -0.3
CS-224ENST00000551155 USP32Q8NFA0 1604 aa13.2□□□□□ -0.3
CS-224ENST00000551155 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP13.19□□□□□ -0.3
CS-224ENST00000551155 RNF39Q9H2S5 420 aa13.19□□□□□ -0.3
CS-224ENST00000551155 PHF8Q9UPP1 1060 aa13.19□□□□□ -0.3
CS-224ENST00000551155 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP13.19□□□□□ -0.3
CS-224ENST00000551155 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa13.19□□□□□ -0.3
CS-224ENST00000551155 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP13.18□□□□□ -0.3
CS-224ENST00000551155 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP13.18□□□□□ -0.3
CS-224ENST00000551155 FOXO3O43524 673 aa13.17□□□□□ -0.3
CS-224ENST00000551155 CCDC61Q9Y6R9 512 aa13.17□□□□□ -0.3
CS-224ENST00000551155 JCADQ9P266 1359 aa13.17□□□□□ -0.3
CS-224ENST00000551155 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP13.16□□□□□ -0.3
CS-224ENST00000551155 PSME1Q06323 249 aa13.16□□□□□ -0.3
CS-224ENST00000551155 USP47Q96K76 1375 aa13.16□□□□□ -0.3
CS-224ENST00000551155 ATP7BP35670 1465 aa13.16□□□□□ -0.3
CS-224ENST00000551155 SHPRHQ149N8 1683 aa13.15□□□□□ -0.3
CS-224ENST00000551155 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa13.15□□□□□ -0.3
CS-224ENST00000551155 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP13.15□□□□□ -0.3
CS-224ENST00000551155 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa13.15□□□□□ -0.31
CS-224ENST00000551155 PRR36Q9H6K5 1346 aa13.14□□□□□ -0.31
CS-224ENST00000551155 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
CS-224ENST00000551155 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa13.14□□□□□ -0.31
CS-224ENST00000551155 CABP2Q9NPB3 220 aa13.14□□□□□ -0.31
CS-224ENST00000551155 PXDNQ92626 1479 aa13.13□□□□□ -0.31
CS-224ENST00000551155 KRT28Q7Z3Y7 464 aa13.13□□□□□ -0.31
CS-224ENST00000551155 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
CS-224ENST00000551155 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa13.13□□□□□ -0.31
CS-224ENST00000551155 ATAD2Q6PL18 1390 aa13.12□□□□□ -0.31
CS-224ENST00000551155 PLEKHG3A1L390 1219 aa13.12□□□□□ -0.31
CS-224ENST00000551155 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa13.12□□□□□ -0.31
CS-224ENST00000551155 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP13.11□□□□□ -0.31
CS-224ENST00000551155 TMF1P82094 1093 aa13.11□□□□□ -0.31
CS-224ENST00000551155 TESK2Q96S53 571 aa13.11□□□□□ -0.31
CS-224ENST00000551155 SBNO1A3KN83 1393 aa13.1□□□□□ -0.31
CS-224ENST00000551155 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
CS-224ENST00000551155 CDCA8Q53HL2 280 aa13.1□□□□□ -0.31
CS-224ENST00000551155 ACEP12821 1306 aa13.1□□□□□ -0.31
CS-224ENST00000551155 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
CS-224ENST00000551155 CABP1Q9NZU7 370 aa13.09□□□□□ -0.31
CS-224ENST00000551155 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
CS-224ENST00000551155 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa13.09□□□□□ -0.31
CS-224ENST00000551155 PNPLA6Q8IY17 1366 aa13.08□□□□□ -0.31
CS-224ENST00000551155 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.32
CS-224ENST00000551155 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.32
CS-224ENST00000551155 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.32
CS-224ENST00000551155 ARHGEF10O15013 1369 aa13.07□□□□□ -0.32
CS-224ENST00000551155 TNS3Q68CZ2 1445 aa13.07□□□□□ -0.32
CS-224ENST00000551155 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
CS-224ENST00000551155 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
CS-224ENST00000551155 AKAP12Q02952 1782 aa13.06□□□□□ -0.32
CS-224ENST00000551155 NINLQ9Y2I6 1382 aa13.06□□□□□ -0.32
CS-224ENST00000551155 ALS2Q96Q42 1657 aa13.05□□□□□ -0.32
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