RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548759.1

DTX1-204, Transcript of deltex E3 ubiquitin ligase 1, humanhuman

TSL 2

Gene DTX1, Length 940 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX1-204ENST00000548759 HRCP23327 699 aa40.71■■■■■ 4.11
DTX1-204ENST00000548759 CFAP70Q5T0N1 1121 aa40.68■■■■■ 4.1
DTX1-204ENST00000548759 TECPR2O15040 1411 aa40.67■■■■■ 4.1
DTX1-204ENST00000548759 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP40.65■■■■■ 4.1
DTX1-204ENST00000548759 ESCO1Q5FWF5 840 aa40.64■■■■■ 4.1
DTX1-204ENST00000548759 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa40.63■■■■■ 4.1
DTX1-204ENST00000548759 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP40.62■■■■■ 4.09
DTX1-204ENST00000548759 NUTM2FA1L443 756 aa40.61■■■■■ 4.09
DTX1-204ENST00000548759 NRXN1Q9ULB1 1477 aa40.6■■■■■ 4.09
DTX1-204ENST00000548759 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP40.6■■■■■ 4.09
DTX1-204ENST00000548759 PNPLA6Q8IY17 1366 aa40.6■■■■■ 4.09
DTX1-204ENST00000548759 MYOM2P54296 1465 aa40.59■■■■■ 4.09
DTX1-204ENST00000548759 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP40.59■■■■■ 4.09
DTX1-204ENST00000548759 SIRT1Q96EB6 747 aa40.58■■■■■ 4.09
DTX1-204ENST00000548759 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa40.58■■■■■ 4.09
DTX1-204ENST00000548759 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa40.57■■■■■ 4.08
DTX1-204ENST00000548759 DCAF11Q8TEB1 546 aa40.54■■■■■ 4.08
DTX1-204ENST00000548759 KNDC1Q76NI1 1749 aa40.52■■■■■ 4.08
DTX1-204ENST00000548759 FOXO3O43524 673 aa40.51■■■■■ 4.08
DTX1-204ENST00000548759 LAMC1P11047 1609 aa40.5■■■■■ 4.07
DTX1-204ENST00000548759 NPHP3Q7Z494 1330 aa40.5■■■■■ 4.07
DTX1-204ENST00000548759 AFF2P51816 1311 aa40.49■■■■■ 4.07
DTX1-204ENST00000548759 C8orf37Q96NL8 207 aa40.49■■■■■ 4.07
DTX1-204ENST00000548759 ADAMTS2O95450 1211 aa40.47■■■■■ 4.07
DTX1-204ENST00000548759 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP40.47■■■■■ 4.07
DTX1-204ENST00000548759 PRAM1Q96QH2 718 aa40.47■■■■■ 4.07
DTX1-204ENST00000548759 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP40.46■■■■■ 4.07
DTX1-204ENST00000548759 POGKQ9P215 609 aa40.44■■■■■ 4.06
DTX1-204ENST00000548759 RXRBP28702 533 aa40.42■■■■■ 4.06
DTX1-204ENST00000548759 NGLY1Q96IV0 654 aa40.41■■■■■ 4.06
DTX1-204ENST00000548759 STAC3Q96MF2 364 aa40.41■■■■■ 4.06
DTX1-204ENST00000548759 TRAK1Q9UPV9 953 aa40.39■■■■■ 4.06
DTX1-204ENST00000548759 PXDNQ92626 1479 aa40.34■■■■■ 4.05
DTX1-204ENST00000548759 FMN2Q9NZ56 1722 aa40.34■■■■■ 4.05
DTX1-204ENST00000548759 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP40.34■■■■■ 4.05
DTX1-204ENST00000548759 ADGRB1O14514 1584 aa40.31■■■■■ 4.04
DTX1-204ENST00000548759 PHF8Q9UPP1 1060 aa40.3■■■■■ 4.04
DTX1-204ENST00000548759 DLC1Q96QB1 1528 aa40.3■■■■■ 4.04
DTX1-204ENST00000548759 KRT28Q7Z3Y7 464 aa40.29■■■■■ 4.04
DTX1-204ENST00000548759 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP40.26■■■■■ 4.04
DTX1-204ENST00000548759 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP40.23■■■■■ 4.03
DTX1-204ENST00000548759 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP40.23■■■■■ 4.03
DTX1-204ENST00000548759 USP21Q9UK80 565 aa40.23■■■■■ 4.03
DTX1-204ENST00000548759 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa40.22■■■■■ 4.03
DTX1-204ENST00000548759 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP40.22■■■■■ 4.03
DTX1-204ENST00000548759 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP40.2■■■■■ 4.03
DTX1-204ENST00000548759 PSME1Q06323 249 aa40.2■■■■■ 4.03
DTX1-204ENST00000548759 KIF1AQ12756 1690 aa40.2■■■■■ 4.03
DTX1-204ENST00000548759 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP40.19■■■■■ 4.02
DTX1-204ENST00000548759 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa40.18■■■■■ 4.02
DTX1-204ENST00000548759 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP40.16■■■■■ 4.02
DTX1-204ENST00000548759 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP40.14■■■■■ 4.02
DTX1-204ENST00000548759 ANKARQ7Z5J8 1434 aa40.13■■■■■ 4.01
DTX1-204ENST00000548759 WASLO00401 505 aaPredicted RBP40.12■■■■■ 4.01
DTX1-204ENST00000548759 LMOD2Q6P5Q4 547 aa40.11■■■■■ 4.01
DTX1-204ENST00000548759 PLEKHG5O94827 1062 aa40.1■■■■■ 4.01
DTX1-204ENST00000548759 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP40.1■■■■■ 4.01
DTX1-204ENST00000548759 ADGRB2O60241 1585 aa40.09■■■■■ 4.01
DTX1-204ENST00000548759 PRR36Q9H6K5 1346 aa40.07■■■■■ 4
DTX1-204ENST00000548759 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP40.06■■■■■ 4
DTX1-204ENST00000548759 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP40.06■■■■■ 4
DTX1-204ENST00000548759 TNS3Q68CZ2 1445 aa40.06■■■■■ 4
DTX1-204ENST00000548759 USP32Q8NFA0 1604 aa40.05■■■■■ 4
DTX1-204ENST00000548759 CABLES1Q8TDN4 633 aa40.05■■■■■ 4
DTX1-204ENST00000548759 SBNO1A3KN83 1393 aa40.05■■■■■ 4
DTX1-204ENST00000548759 RGS12O14924 1447 aa40.05■■■■■ 4
DTX1-204ENST00000548759 NBPF1Q3BBV0 1214 aa40.03■■■■■ 4
DTX1-204ENST00000548759 BCL9LQ86UU0 1499 aa40■■■■□ 3.99
DTX1-204ENST00000548759 ATRNO75882 1429 aa40■■■■□ 3.99
DTX1-204ENST00000548759 TULP4Q9NRJ4 1543 aa39.98■■■■□ 3.99
DTX1-204ENST00000548759 ARHGEF10O15013 1369 aa39.97■■■■□ 3.99
DTX1-204ENST00000548759 GPRASP1Q5JY77 1395 aa39.97■■■■□ 3.99
DTX1-204ENST00000548759 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP39.97■■■■□ 3.99
DTX1-204ENST00000548759 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP39.97■■■■□ 3.99
DTX1-204ENST00000548759 SIN3AQ96ST3 1273 aa39.97■■■■□ 3.99
DTX1-204ENST00000548759 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP39.96■■■■□ 3.99
DTX1-204ENST00000548759 L3MBTL2Q969R5 705 aa39.95■■■■□ 3.99
DTX1-204ENST00000548759 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP39.95■■■■□ 3.99
DTX1-204ENST00000548759 CDK19Q9BWU1 502 aa39.95■■■■□ 3.99
DTX1-204ENST00000548759 UNC5CLQ8IV45 518 aa39.93■■■■□ 3.98
DTX1-204ENST00000548759 NEUROD1Q13562 356 aa39.92■■■■□ 3.98
DTX1-204ENST00000548759 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP39.92■■■■□ 3.98
DTX1-204ENST00000548759 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa39.91■■■■□ 3.98
DTX1-204ENST00000548759 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP39.88■■■■□ 3.97
DTX1-204ENST00000548759 SLIT2O94813 1529 aa39.87■■■■□ 3.97
DTX1-204ENST00000548759 FAM83GA6ND36 823 aa39.82■■■■□ 3.97
DTX1-204ENST00000548759 ATP7BP35670 1465 aa39.81■■■■□ 3.96
DTX1-204ENST00000548759 CCDC61Q9Y6R9 512 aa39.81■■■■□ 3.96
DTX1-204ENST00000548759 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP39.8■■■■□ 3.96
DTX1-204ENST00000548759 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP39.79■■■■□ 3.96
DTX1-204ENST00000548759 ATAD2Q6PL18 1390 aa39.79■■■■□ 3.96
DTX1-204ENST00000548759 RALGAPBQ86X10 1494 aa39.75■■■■□ 3.95
DTX1-204ENST00000548759 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP39.75■■■■□ 3.95
DTX1-204ENST00000548759 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP39.75■■■■□ 3.95
DTX1-204ENST00000548759 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP39.74■■■■□ 3.95
DTX1-204ENST00000548759 ACEP12821 1306 aa39.74■■■■□ 3.95
DTX1-204ENST00000548759 VPS72Q15906 364 aa39.74■■■■□ 3.95
DTX1-204ENST00000548759 NBPF8Q3BBV2 869 aa39.73■■■■□ 3.95
DTX1-204ENST00000548759 ITSN1Q15811 1721 aa39.73■■■■□ 3.95
DTX1-204ENST00000548759 ALS2Q96Q42 1657 aa39.73■■■■□ 3.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.5 ms