RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548122.2

PTPRB-206, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRB, Length 4,237 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-206ENST00000548122 PREX1Q8TCU6 1659 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRB-206ENST00000548122 NUTM2GQ5VZR2 741 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRB-206ENST00000548122 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
PTPRB-206ENST00000548122 CROCC2H7BZ55 1655 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRB-206ENST00000548122 NPHP3Q7Z494 1330 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRB-206ENST00000548122 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
PTPRB-206ENST00000548122 HSPA1LP34931 641 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRB-206ENST00000548122 TET3O43151 1660 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRB-206ENST00000548122 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP7.49□□□□□ -1.21
PTPRB-206ENST00000548122 C8orf37Q96NL8 207 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRB-206ENST00000548122 NBPF1Q3BBV0 1214 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRB-206ENST00000548122 CABP2Q9NPB3 220 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRB-206ENST00000548122 CDK19Q9BWU1 502 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRB-206ENST00000548122 CLSPNQ9HAW4 1339 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRB-206ENST00000548122 KRT28Q7Z3Y7 464 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRB-206ENST00000548122 ABTB2Q8N961 1025 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRB-206ENST00000548122 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRB-206ENST00000548122 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
PTPRB-206ENST00000548122 ADGRB3O60242 1522 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRB-206ENST00000548122 NEFMP07197 916 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRB-206ENST00000548122 PRDM11Q9NQV5 511 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRB-206ENST00000548122 LMTK2Q8IWU2 1503 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRB-206ENST00000548122 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa7.46□□□□□ -1.21
PTPRB-206ENST00000548122 PIK3R4Q99570 1358 aa7.46□□□□□ -1.21
PTPRB-206ENST00000548122 NLRP6P59044 892 aa7.46□□□□□ -1.21
PTPRB-206ENST00000548122 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
PTPRB-206ENST00000548122 ORAI2Q96SN7 254 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRB-206ENST00000548122 MYO3AQ8NEV4 1616 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRB-206ENST00000548122 STRN4Q9NRL3 753 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRB-206ENST00000548122 USP35Q9P2H5 1018 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRB-206ENST00000548122 METP08581 1390 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRB-206ENST00000548122 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
PTPRB-206ENST00000548122 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
PTPRB-206ENST00000548122 CCDC61Q9Y6R9 512 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRB-206ENST00000548122 MROH2AA6NES4 1674 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRB-206ENST00000548122 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRB-206ENST00000548122 WASLO00401 505 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
PTPRB-206ENST00000548122 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
PTPRB-206ENST00000548122 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
PTPRB-206ENST00000548122 KNSTRNQ9Y448 316 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRB-206ENST00000548122 PIK3C2BO00750 1634 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRB-206ENST00000548122 IQGAP3Q86VI3 1631 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRB-206ENST00000548122 NLRP13Q86W25 1043 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRB-206ENST00000548122 UNC13BO14795 1591 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRB-206ENST00000548122 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
PTPRB-206ENST00000548122 GCC2Q8IWJ2 1684 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRB-206ENST00000548122 AMPHP49418 695 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRB-206ENST00000548122 TRPM2O94759 1503 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRB-206ENST00000548122 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
PTPRB-206ENST00000548122 CABP1Q9NZU7 370 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRB-206ENST00000548122 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
PTPRB-206ENST00000548122 CPS1P31327 1500 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRB-206ENST00000548122 COG3Q96JB2 828 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRB-206ENST00000548122 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRB-206ENST00000548122 BRINP3Q76B58 766 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRB-206ENST00000548122 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
PTPRB-206ENST00000548122 KIF1BO60333 1816 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRB-206ENST00000548122 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
PTPRB-206ENST00000548122 ABCC11Q96J66 1382 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRB-206ENST00000548122 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
PTPRB-206ENST00000548122 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
PTPRB-206ENST00000548122 CABLES1Q8TDN4 633 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRB-206ENST00000548122 E9PCH4 1651 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRB-206ENST00000548122 USP47Q96K76 1375 aa7.4□□□□□ -1.23
PTPRB-206ENST00000548122 ROBO2Q9HCK4 1378 aa7.4□□□□□ -1.23
PTPRB-206ENST00000548122 NBPF8Q3BBV2 869 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRB-206ENST00000548122 NLRP2Q9NX02 1062 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRB-206ENST00000548122 JCADQ9P266 1359 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRB-206ENST00000548122 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRB-206ENST00000548122 MORC1Q86VD1 984 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRB-206ENST00000548122 USP21Q9UK80 565 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRB-206ENST00000548122 ATAD2Q6PL18 1390 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRB-206ENST00000548122 SYNMO15061 1565 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRB-206ENST00000548122 MROH1Q8NDA8 1641 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRB-206ENST00000548122 ZBTB22O15209 634 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRB-206ENST00000548122 PDE3BQ13370 1112 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRB-206ENST00000548122 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRB-206ENST00000548122 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRB-206ENST00000548122 ACEP12821 1306 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRB-206ENST00000548122 SLIT1O75093 1534 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRB-206ENST00000548122 ARHGAP23Q9P227 1491 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRB-206ENST00000548122 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRB-206ENST00000548122 IQGAP1P46940 1657 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRB-206ENST00000548122 CLTCL1P53675 1640 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRB-206ENST00000548122 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
PTPRB-206ENST00000548122 ZFYVE9O95405 1425 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRB-206ENST00000548122 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRB-206ENST00000548122 DEPDC5O75140 1603 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRB-206ENST00000548122 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
PTPRB-206ENST00000548122 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
PTPRB-206ENST00000548122 RXRBP28702 533 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRB-206ENST00000548122 CHRNA2Q15822 529 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRB-206ENST00000548122 SIRT1Q96EB6 747 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRB-206ENST00000548122 CFAP53Q96M91 514 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRB-206ENST00000548122 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRB-206ENST00000548122 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRB-206ENST00000548122 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
PTPRB-206ENST00000548122 VWDEQ8N2E2 1590 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRB-206ENST00000548122 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRB-206ENST00000548122 PTMSP20962 102 aa7.36□□□□□ -1.23
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