RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547052.1

BRF1-209, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, humanhuman

TSL 5

Gene BRF1, Length 771 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRF1-209ENST00000547052 NBPF1Q3BBV0 1214 aa25.37■■□□□ 1.65
BRF1-209ENST00000547052 PRAM1Q96QH2 718 aa25.37■■□□□ 1.65
BRF1-209ENST00000547052 CARD11Q9BXL7 1154 aa25.37■■□□□ 1.65
BRF1-209ENST00000547052 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
BRF1-209ENST00000547052 NBPF8Q3BBV2 869 aa25.36■■□□□ 1.65
BRF1-209ENST00000547052 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa25.35■■□□□ 1.65
BRF1-209ENST00000547052 FBXO41Q8TF61 875 aa25.34■■□□□ 1.65
BRF1-209ENST00000547052 GPRASP1Q5JY77 1395 aa25.33■■□□□ 1.65
BRF1-209ENST00000547052 WAPLQ7Z5K2 1190 aa25.33■■□□□ 1.65
BRF1-209ENST00000547052 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP25.32■■□□□ 1.64
BRF1-209ENST00000547052 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
BRF1-209ENST00000547052 ADGRB2O60241 1585 aa25.31■■□□□ 1.64
BRF1-209ENST00000547052 FMN2Q9NZ56 1722 aa25.29■■□□□ 1.64
BRF1-209ENST00000547052 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa25.29■■□□□ 1.64
BRF1-209ENST00000547052 PIP4K2BP78356 416 aa25.28■■□□□ 1.64
BRF1-209ENST00000547052 ITSN1Q15811 1721 aa25.27■■□□□ 1.64
BRF1-209ENST00000547052 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa25.26■■□□□ 1.63
BRF1-209ENST00000547052 SLAIN2Q9P270 581 aa25.25■■□□□ 1.63
BRF1-209ENST00000547052 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
BRF1-209ENST00000547052 SLC24A1O60721 1099 aa25.23■■□□□ 1.63
BRF1-209ENST00000547052 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
BRF1-209ENST00000547052 KIF1AQ12756 1690 aa25.2■■□□□ 1.63
BRF1-209ENST00000547052 MST1RQ04912 1400 aa25.2■■□□□ 1.62
BRF1-209ENST00000547052 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
BRF1-209ENST00000547052 USP47Q96K76 1375 aa25.18■■□□□ 1.62
BRF1-209ENST00000547052 EVC2Q86UK5 1308 aa25.17■■□□□ 1.62
BRF1-209ENST00000547052 PHLPP1O60346 1717 aa25.17■■□□□ 1.62
BRF1-209ENST00000547052 TULP4Q9NRJ4 1543 aa25.17■■□□□ 1.62
BRF1-209ENST00000547052 C1orf167Q5SNV9 1468 aa25.16■■□□□ 1.62
BRF1-209ENST00000547052 WASLO00401 505 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
BRF1-209ENST00000547052 ANKARQ7Z5J8 1434 aa25.16■■□□□ 1.62
BRF1-209ENST00000547052 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
BRF1-209ENST00000547052 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa25.15■■□□□ 1.62
BRF1-209ENST00000547052 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
BRF1-209ENST00000547052 ESCO1Q5FWF5 840 aa25.12■■□□□ 1.61
BRF1-209ENST00000547052 NUTM2FA1L443 756 aa25.11■■□□□ 1.61
BRF1-209ENST00000547052 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP25.11■■□□□ 1.61
BRF1-209ENST00000547052 NHSL1Q5SYE7 1610 aa25.11■■□□□ 1.61
BRF1-209ENST00000547052 CDK19Q9BWU1 502 aa25.1■■□□□ 1.61
BRF1-209ENST00000547052 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa25.08■■□□□ 1.61
BRF1-209ENST00000547052 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.6
BRF1-209ENST00000547052 USP32Q8NFA0 1604 aa25.08■■□□□ 1.6
BRF1-209ENST00000547052 BRINP3Q76B58 766 aa25.07■■□□□ 1.6
BRF1-209ENST00000547052 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa25.07■■□□□ 1.6
BRF1-209ENST00000547052 CDCA8Q53HL2 280 aa25.06■■□□□ 1.6
BRF1-209ENST00000547052 TMF1P82094 1093 aa25.05■■□□□ 1.6
BRF1-209ENST00000547052 NPHP3Q7Z494 1330 aa25.05■■□□□ 1.6
BRF1-209ENST00000547052 ATAD2Q6PL18 1390 aa25.05■■□□□ 1.6
BRF1-209ENST00000547052 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
BRF1-209ENST00000547052 ATP7BP35670 1465 aa25.03■■□□□ 1.6
BRF1-209ENST00000547052 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
BRF1-209ENST00000547052 PHF8Q9UPP1 1060 aa25.03■■□□□ 1.6
BRF1-209ENST00000547052 ORAI2Q96SN7 254 aa25.02■■□□□ 1.6
BRF1-209ENST00000547052 CCDC61Q9Y6R9 512 aa25.01■■□□□ 1.59
BRF1-209ENST00000547052 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
BRF1-209ENST00000547052 CABP2Q9NPB3 220 aa25■■□□□ 1.59
BRF1-209ENST00000547052 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP24.98■■□□□ 1.59
BRF1-209ENST00000547052 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa24.98■■□□□ 1.59
BRF1-209ENST00000547052 HSPA1LP34931 641 aa24.98■■□□□ 1.59
BRF1-209ENST00000547052 PSME1Q06323 249 aa24.98■■□□□ 1.59
BRF1-209ENST00000547052 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
BRF1-209ENST00000547052 PRR36Q9H6K5 1346 aa24.95■■□□□ 1.58
BRF1-209ENST00000547052 FOXO3O43524 673 aa24.95■■□□□ 1.58
BRF1-209ENST00000547052 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.58
BRF1-209ENST00000547052 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa24.95■■□□□ 1.58
BRF1-209ENST00000547052 NINLQ9Y2I6 1382 aa24.94■■□□□ 1.58
BRF1-209ENST00000547052 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
BRF1-209ENST00000547052 TESK2Q96S53 571 aa24.94■■□□□ 1.58
BRF1-209ENST00000547052 AKAP12Q02952 1782 aa24.94■■□□□ 1.58
BRF1-209ENST00000547052 SHPRHQ149N8 1683 aa24.94■■□□□ 1.58
BRF1-209ENST00000547052 TMC1Q8TDI8 760 aa24.91■■□□□ 1.58
BRF1-209ENST00000547052 JCADQ9P266 1359 aa24.9■■□□□ 1.58
BRF1-209ENST00000547052 PLEKHG3A1L390 1219 aa24.89■■□□□ 1.58
BRF1-209ENST00000547052 KRT28Q7Z3Y7 464 aa24.89■■□□□ 1.58
BRF1-209ENST00000547052 PXDNQ92626 1479 aa24.89■■□□□ 1.57
BRF1-209ENST00000547052 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
BRF1-209ENST00000547052 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
BRF1-209ENST00000547052 TERF2IPQ9NYB0 399 aa24.87■■□□□ 1.57
BRF1-209ENST00000547052 CABP1Q9NZU7 370 aa24.87■■□□□ 1.57
BRF1-209ENST00000547052 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
BRF1-209ENST00000547052 DISP3Q9P2K9 1392 aa24.87■■□□□ 1.57
BRF1-209ENST00000547052 ACEP12821 1306 aa24.86■■□□□ 1.57
BRF1-209ENST00000547052 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
BRF1-209ENST00000547052 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
BRF1-209ENST00000547052 POLR3GLQ9BT43 218 aa24.86■■□□□ 1.57
BRF1-209ENST00000547052 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
BRF1-209ENST00000547052 MON2Q7Z3U7 1717 aa24.86■■□□□ 1.57
BRF1-209ENST00000547052 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
BRF1-209ENST00000547052 SBNO1A3KN83 1393 aa24.85■■□□□ 1.57
BRF1-209ENST00000547052 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
BRF1-209ENST00000547052 ARHGEF10O15013 1369 aa24.84■■□□□ 1.57
BRF1-209ENST00000547052 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
BRF1-209ENST00000547052 LMOD2Q6P5Q4 547 aa24.84■■□□□ 1.57
BRF1-209ENST00000547052 TNS3Q68CZ2 1445 aa24.84■■□□□ 1.57
BRF1-209ENST00000547052 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP24.81■■□□□ 1.56
BRF1-209ENST00000547052 ALS2Q96Q42 1657 aa24.81■■□□□ 1.56
BRF1-209ENST00000547052 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa24.81■■□□□ 1.56
BRF1-209ENST00000547052 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
BRF1-209ENST00000547052 MYOM1P52179 1685 aa24.8■■□□□ 1.56
BRF1-209ENST00000547052 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
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