RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542443.5

TRDN-204, Transcript of triadin, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRDN, Length 1,294 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDN-204ENST00000542443 GUCA2AQ02747 115 aa11.01□□□□□ -0.65
TRDN-204ENST00000542443 MSS51Q4VC12 460 aa11.01□□□□□ -0.65
TRDN-204ENST00000542443 FOXC1Q12948 553 aa11□□□□□ -0.65
TRDN-204ENST00000542443 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
TRDN-204ENST00000542443 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
TRDN-204ENST00000542443 GDF9O60383 454 aa10.98□□□□□ -0.65
TRDN-204ENST00000542443 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP10.98□□□□□ -0.65
TRDN-204ENST00000542443 RPIAP49247 311 aa10.98□□□□□ -0.65
TRDN-204ENST00000542443 PRR20EP86478 221 aa10.98□□□□□ -0.65
TRDN-204ENST00000542443 PRR20CP86479 221 aa10.98□□□□□ -0.65
TRDN-204ENST00000542443 PRR20DP86480 221 aa10.98□□□□□ -0.65
TRDN-204ENST00000542443 PRR20BP86481 221 aa10.98□□□□□ -0.65
TRDN-204ENST00000542443 PRR20AP86496 221 aa10.98□□□□□ -0.65
TRDN-204ENST00000542443 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP10.97□□□□□ -0.65
TRDN-204ENST00000542443 PKDCCQ504Y2 493 aa10.96□□□□□ -0.65
TRDN-204ENST00000542443 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP10.96□□□□□ -0.65
TRDN-204ENST00000542443 FAM187AA6NFU0 413 aa10.95□□□□□ -0.66
TRDN-204ENST00000542443 AMHR2Q16671 573 aa10.95□□□□□ -0.66
TRDN-204ENST00000542443 MMP16P51512 607 aa10.94□□□□□ -0.66
TRDN-204ENST00000542443 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP10.94□□□□□ -0.66
TRDN-204ENST00000542443 PKD2L1Q9P0L9 805 aa10.94□□□□□ -0.66
TRDN-204ENST00000542443 CCDC24Q8N4L8 307 aa10.93□□□□□ -0.66
TRDN-204ENST00000542443 DGAT1O75907 488 aa10.92□□□□□ -0.66
TRDN-204ENST00000542443 DXOO77932 396 aaKnown RBP10.92□□□□□ -0.66
TRDN-204ENST00000542443 FDX1P10109 184 aa10.92□□□□□ -0.66
TRDN-204ENST00000542443 SPIRE2Q8WWL2 714 aa10.91□□□□□ -0.66
TRDN-204ENST00000542443 C6orf229H3BNL8 230 aa10.9□□□□□ -0.66
TRDN-204ENST00000542443 TRIM66O15016 1216 aa10.9□□□□□ -0.66
TRDN-204ENST00000542443 AK7Q96M32 723 aa10.9□□□□□ -0.66
TRDN-204ENST00000542443 PCDHGC3Q9UN70 934 aa10.9□□□□□ -0.66
TRDN-204ENST00000542443 NDUFV2P19404 249 aa10.89□□□□□ -0.67
TRDN-204ENST00000542443 PARP9Q8IXQ6 854 aa10.89□□□□□ -0.67
TRDN-204ENST00000542443 BEGAINQ9BUH8 593 aa10.89□□□□□ -0.67
TRDN-204ENST00000542443 MOXD2PA6NHM9 499 aa10.88□□□□□ -0.67
TRDN-204ENST00000542443 MYT1Q01538 1121 aa10.88□□□□□ -0.67
TRDN-204ENST00000542443 RETREG3Q86VR2 466 aa10.88□□□□□ -0.67
TRDN-204ENST00000542443 SLC24A3Q9HC58 644 aa10.88□□□□□ -0.67
TRDN-204ENST00000542443 JUNDP17535 347 aa10.87□□□□□ -0.67
TRDN-204ENST00000542443 TRIM32Q13049 653 aa10.87□□□□□ -0.67
TRDN-204ENST00000542443 CYP4X1Q8N118 509 aa10.87□□□□□ -0.67
TRDN-204ENST00000542443 ZNF787Q6DD87 383 aa10.86□□□□□ -0.67
TRDN-204ENST00000542443 MS4A1P11836 297 aa10.84□□□□□ -0.67
TRDN-204ENST00000542443 TOR4AQ9NXH8 423 aa10.84□□□□□ -0.67
TRDN-204ENST00000542443 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP10.83□□□□□ -0.68
TRDN-204ENST00000542443 TBC1D2Q9BYX2 928 aa10.83□□□□□ -0.68
TRDN-204ENST00000542443 ST8SIA5O15466 376 aa10.82□□□□□ -0.68
TRDN-204ENST00000542443 NUDT12Q9BQG2 462 aa10.82□□□□□ -0.68
TRDN-204ENST00000542443 WNT7AO00755 349 aa10.81□□□□□ -0.68
TRDN-204ENST00000542443 PDE4DQ08499 809 aa10.8□□□□□ -0.68
TRDN-204ENST00000542443 MRGPRX2Q96LB1 330 aa10.8□□□□□ -0.68
TRDN-204ENST00000542443 MTMR2Q13614 643 aa10.79□□□□□ -0.68
TRDN-204ENST00000542443 DIXDC1Q155Q3 683 aa10.79□□□□□ -0.68
TRDN-204ENST00000542443 PRR7Q8TB68 274 aa10.79□□□□□ -0.68
TRDN-204ENST00000542443 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP10.78□□□□□ -0.68
TRDN-204ENST00000542443 AAASQ9NRG9 546 aa10.78□□□□□ -0.68
TRDN-204ENST00000542443 SKOR1P84550 965 aa10.77□□□□□ -0.69
TRDN-204ENST00000542443 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP10.77□□□□□ -0.69
TRDN-204ENST00000542443 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP10.77□□□□□ -0.69
TRDN-204ENST00000542443 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP10.77□□□□□ -0.69
TRDN-204ENST00000542443 CCNYL3P0C7X3 344 aa10.76□□□□□ -0.69
TRDN-204ENST00000542443 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP10.76□□□□□ -0.69
TRDN-204ENST00000542443 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa10.76□□□□□ -0.69
TRDN-204ENST00000542443 SPDYE5A6NIY4 337 aa10.75□□□□□ -0.69
TRDN-204ENST00000542443 POTECB2RU33 542 aa10.75□□□□□ -0.69
TRDN-204ENST00000542443 WNT7BP56706 349 aa10.75□□□□□ -0.69
TRDN-204ENST00000542443 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa10.75□□□□□ -0.69
TRDN-204ENST00000542443 GJA5P36382 358 aa10.74□□□□□ -0.69
TRDN-204ENST00000542443 PTPRNQ16849 979 aa10.74□□□□□ -0.69
TRDN-204ENST00000542443 RIC3Q7Z5B4 369 aa10.74□□□□□ -0.69
TRDN-204ENST00000542443 J3QL48 77 aa10.73□□□□□ -0.69
TRDN-204ENST00000542443 AXIN1O15169 862 aa10.73□□□□□ -0.69
TRDN-204ENST00000542443 SPTLC1O15269 473 aa10.73□□□□□ -0.69
TRDN-204ENST00000542443 SMPD1P17405 629 aa10.73□□□□□ -0.69
TRDN-204ENST00000542443 AVPP01185 164 aa10.72□□□□□ -0.69
TRDN-204ENST00000542443 HRCP23327 699 aa10.71□□□□□ -0.69
TRDN-204ENST00000542443 CABLES1Q8TDN4 633 aa10.71□□□□□ -0.69
TRDN-204ENST00000542443 ZBTB3Q9H5J0 574 aa10.71□□□□□ -0.69
TRDN-204ENST00000542443 EVA1BQ9NVM1 165 aa10.71□□□□□ -0.69
TRDN-204ENST00000542443 DACH1Q9UI36 760 aa10.71□□□□□ -0.69
TRDN-204ENST00000542443 NEUROD2Q15784 382 aa10.7□□□□□ -0.7
TRDN-204ENST00000542443 DESI1Q6ICB0 168 aa10.7□□□□□ -0.7
TRDN-204ENST00000542443 CRIPAKQ8N1N5 446 aa10.7□□□□□ -0.7
TRDN-204ENST00000542443 EHBP1Q8NDI1 1231 aa10.7□□□□□ -0.7
TRDN-204ENST00000542443 UNC93B1Q9H1C4 597 aa10.7□□□□□ -0.7
TRDN-204ENST00000542443 CFAP99D6REC4 459 aa10.69□□□□□ -0.7
TRDN-204ENST00000542443 KCNH2Q12809 1159 aa10.69□□□□□ -0.7
TRDN-204ENST00000542443 CTC1Q2NKJ3 1217 aa10.69□□□□□ -0.7
TRDN-204ENST00000542443 LINC01559Q495D7 138 aa10.69□□□□□ -0.7
TRDN-204ENST00000542443 MYSM1Q5VVJ2 828 aa10.69□□□□□ -0.7
TRDN-204ENST00000542443 ALDH1A1P00352 501 aa10.68□□□□□ -0.7
TRDN-204ENST00000542443 CTHP32929 405 aa10.68□□□□□ -0.7
TRDN-204ENST00000542443 BAP1Q92560 729 aa10.68□□□□□ -0.7
TRDN-204ENST00000542443 TSC1Q92574 1164 aa10.68□□□□□ -0.7
TRDN-204ENST00000542443 LIMD1Q9UGP4 676 aa10.68□□□□□ -0.7
TRDN-204ENST00000542443 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP10.67□□□□□ -0.7
TRDN-204ENST00000542443 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP10.67□□□□□ -0.7
TRDN-204ENST00000542443 SH3BP2P78314 561 aa10.67□□□□□ -0.7
TRDN-204ENST00000542443 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP10.67□□□□□ -0.7
TRDN-204ENST00000542443 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP10.67□□□□□ -0.7
TRDN-204ENST00000542443 HPS1Q92902 700 aa10.67□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 90.8 ms