RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534197.5

GNPTG-209, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunit gamma, human

TSL 3

Gene GNPTG, Length 420 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GNPTG-209	ENST00000534197	WAPL	Q7Z5K2	1190 aa		32.83	■■■□□ 2.85
GNPTG-209	ENST00000534197	C8orf37	Q96NL8	207 aa		32.83	■■■□□ 2.85
GNPTG-209	ENST00000534197	TECPR2	O15040	1411 aa		32.83	■■■□□ 2.85
GNPTG-209	ENST00000534197	PIK3C2G	O75747	1445 aa		32.83	■■■□□ 2.85
GNPTG-209	ENST00000534197	KNDC1	Q76NI1	1749 aa		32.81	■■■□□ 2.84
GNPTG-209	ENST00000534197	LRPPRC	P42704	1394 aa	Known RBP	32.81	■■■□□ 2.84
GNPTG-209	ENST00000534197	PLEKHH1	Q9ULM0	1364 aa		32.81	■■■□□ 2.84
GNPTG-209	ENST00000534197	ADAMTS2	O95450	1211 aa		32.77	■■■□□ 2.84
GNPTG-209	ENST00000534197	ABCC11	Q96J66	1382 aa		32.77	■■■□□ 2.84
GNPTG-209	ENST00000534197	ESCO1	Q5FWF5	840 aa		32.76	■■■□□ 2.83
GNPTG-209	ENST00000534197	CDK12	Q9NYV4	1490 aa	Predicted RBP	32.74	■■■□□ 2.83
GNPTG-209	ENST00000534197	NUTM2F	A1L443	756 aa		32.74	■■■□□ 2.83
GNPTG-209	ENST00000534197	UPF1	Q92900	1129 aa	Known RBP eCLIP	32.74	■■■□□ 2.83
GNPTG-209	ENST00000534197	COL22A1	Q8NFW1	1626 aa	Predicted RBP	32.73	■■■□□ 2.83
GNPTG-209	ENST00000534197	YTHDC2	Q9H6S0	1430 aa	Known RBP	32.73	■■■□□ 2.83
GNPTG-209	ENST00000534197	PXDN	Q92626	1479 aa		32.73	■■■□□ 2.83
GNPTG-209	ENST00000534197	RAB3GAP2	Q9H2M9	1393 aa		32.72	■■■□□ 2.83
GNPTG-209	ENST00000534197	QTRT2	Q9H974	415 aa	Known RBP	32.72	■■■□□ 2.83
GNPTG-209	ENST00000534197	NRXN1	Q9ULB1	1477 aa		32.7	■■■□□ 2.83
GNPTG-209	ENST00000534197	XPC	Q01831	940 aa	Predicted RBP	32.7	■■■□□ 2.83
GNPTG-209	ENST00000534197	NGLY1	Q96IV0	654 aa		32.7	■■■□□ 2.83
GNPTG-209	ENST00000534197	FMN2	Q9NZ56	1722 aa		32.69	■■■□□ 2.82
GNPTG-209	ENST00000534197	FOXO3	O43524	673 aa		32.69	■■■□□ 2.82
GNPTG-209	ENST00000534197	C14orf93	Q9H972	538 aa	Known RBP	32.69	■■■□□ 2.82
GNPTG-209	ENST00000534197	NPHP3	Q7Z494	1330 aa		32.68	■■■□□ 2.82
GNPTG-209	ENST00000534197	RGS12	O14924	1447 aa		32.68	■■■□□ 2.82
GNPTG-209	ENST00000534197	CFAP70	Q5T0N1	1121 aa		32.67	■■■□□ 2.82
GNPTG-209	ENST00000534197	RGPD8	O14715	1765 aa	Predicted RBP	32.66	■■■□□ 2.82
GNPTG-209	ENST00000534197	MYOM2	P54296	1465 aa		32.66	■■■□□ 2.82
GNPTG-209	ENST00000534197	RBM6	P78332	1123 aa	Known RBP	32.65	■■■□□ 2.82
GNPTG-209	ENST00000534197	ACIN1	Q9UKV3	1341 aa	Known RBP	32.65	■■■□□ 2.82
GNPTG-209	ENST00000534197	MARF1	Q9Y4F3	1742 aa	Known RBP	32.61	■■■□□ 2.81
GNPTG-209	ENST00000534197	SIRT1	Q96EB6	747 aa		32.6	■■■□□ 2.81
GNPTG-209	ENST00000534197	USP21	Q9UK80	565 aa		32.6	■■■□□ 2.81
GNPTG-209	ENST00000534197	FNBP4	Q8N3X1	1017 aa	Predicted RBP	32.59	■■■□□ 2.81
GNPTG-209	ENST00000534197	DHX57	Q6P158	1386 aa	Known RBP	32.57	■■■□□ 2.8
GNPTG-209	ENST00000534197	KIF1A	Q12756	1690 aa		32.56	■■■□□ 2.8
GNPTG-209	ENST00000534197	SAFB2	Q14151	953 aa	Known RBP eCLIP	32.53	■■■□□ 2.8
GNPTG-209	ENST00000534197	ATRN	O75882	1429 aa		32.52	■■■□□ 2.8
GNPTG-209	ENST00000534197	PRAM1	Q96QH2	718 aa		32.52	■■■□□ 2.8
GNPTG-209	ENST00000534197	TRPC5	Q9UL62	973 aa	Predicted RBP	32.52	■■■□□ 2.8
GNPTG-209	ENST00000534197	ADGRB1	O14514	1584 aa		32.51	■■■□□ 2.79
GNPTG-209	ENST00000534197	BCL9L	Q86UU0	1499 aa		32.51	■■■□□ 2.79
GNPTG-209	ENST00000534197	SPATA31A3	Q5VYP0	1347 aa		32.51	■■■□□ 2.79
GNPTG-209	ENST00000534197	DLC1	Q96QB1	1528 aa		32.48	■■■□□ 2.79
GNPTG-209	ENST00000534197	KRT28	Q7Z3Y7	464 aa		32.48	■■■□□ 2.79
GNPTG-209	ENST00000534197	USP32	Q8NFA0	1604 aa		32.47	■■■□□ 2.79
GNPTG-209	ENST00000534197	PHF8	Q9UPP1	1060 aa		32.46	■■■□□ 2.79
GNPTG-209	ENST00000534197	KDM2A	Q9Y2K7	1162 aa		32.44	■■■□□ 2.78
GNPTG-209	ENST00000534197	DCAF11	Q8TEB1	546 aa		32.42	■■■□□ 2.78
GNPTG-209	ENST00000534197	POGK	Q9P215	609 aa		32.41	■■■□□ 2.78
GNPTG-209	ENST00000534197	TRAK1	Q9UPV9	953 aa		32.41	■■■□□ 2.78
GNPTG-209	ENST00000534197	ADGRB2	O60241	1585 aa		32.41	■■■□□ 2.78
GNPTG-209	ENST00000534197	TNKS1BP1	Q9C0C2	1729 aa	Known RBP	32.4	■■■□□ 2.78
GNPTG-209	ENST00000534197	TNS3	Q68CZ2	1445 aa		32.39	■■■□□ 2.78
GNPTG-209	ENST00000534197	HIRIP3	Q9BW71	556 aa	Predicted RBP	32.38	■■■□□ 2.77
GNPTG-209	ENST00000534197	SLIT2	O94813	1529 aa		32.37	■■■□□ 2.77
GNPTG-209	ENST00000534197	CABLES1	Q8TDN4	633 aa		32.37	■■■□□ 2.77
GNPTG-209	ENST00000534197	EP400	Q96L91	3159 aa		32.37	■■■□□ 2.77
GNPTG-209	ENST00000534197	HRC	P23327	699 aa		32.36	■■■□□ 2.77
GNPTG-209	ENST00000534197	PMFBP1	Q8TBY8	1022 aa		32.36	■■■□□ 2.77
GNPTG-209	ENST00000534197	ABCA3	Q99758	1704 aa		32.36	■■■□□ 2.77
GNPTG-209	ENST00000534197	GJD4	Q96KN9	370 aa	Predicted RBP	32.35	■■■□□ 2.77
GNPTG-209	ENST00000534197	ANKAR	Q7Z5J8	1434 aa		32.34	■■■□□ 2.77
GNPTG-209	ENST00000534197	ATAD2	Q6PL18	1390 aa		32.34	■■■□□ 2.77
GNPTG-209	ENST00000534197	PLEKHG5	O94827	1062 aa		32.34	■■■□□ 2.77
GNPTG-209	ENST00000534197	PSME1	Q06323	249 aa		32.34	■■■□□ 2.77
GNPTG-209	ENST00000534197	SBNO1	A3KN83	1393 aa		32.33	■■■□□ 2.77
GNPTG-209	ENST00000534197	GLI3	P10071	1580 aa		32.33	■■■□□ 2.77
GNPTG-209	ENST00000534197	MINK1	Q8N4C8	1332 aa	Predicted RBP	32.33	■■■□□ 2.77
GNPTG-209	ENST00000534197	PRR36	Q9H6K5	1346 aa		32.32	■■■□□ 2.76
GNPTG-209	ENST00000534197	UNC5CL	Q8IV45	518 aa		32.32	■■■□□ 2.76
GNPTG-209	ENST00000534197	TRPM3	Q9HCF6	1732 aa	Predicted RBP	32.31	■■■□□ 2.76
GNPTG-209	ENST00000534197	RALGAPB	Q86X10	1494 aa		32.29	■■■□□ 2.76
GNPTG-209	ENST00000534197	ARHGEF28	Q8N1W1	1705 aa	Known RBP	32.29	■■■□□ 2.76
GNPTG-209	ENST00000534197	PLCH1	Q4KWH8	1693 aa		32.28	■■■□□ 2.76
GNPTG-209	ENST00000534197	LMOD2	Q6P5Q4	547 aa		32.28	■■■□□ 2.76
GNPTG-209	ENST00000534197	BRWD3	Q6RI45	1802 aa		32.26	■■■□□ 2.75
GNPTG-209	ENST00000534197	TULP4	Q9NRJ4	1543 aa		32.26	■■■□□ 2.75
GNPTG-209	ENST00000534197	HAP1	P54257	671 aa	Predicted RBP	32.25	■■■□□ 2.75
GNPTG-209	ENST00000534197	ALS2	Q96Q42	1657 aa		32.24	■■■□□ 2.75
GNPTG-209	ENST00000534197	ARHGEF10	O15013	1369 aa		32.24	■■■□□ 2.75
GNPTG-209	ENST00000534197	WASL	O00401	505 aa	Predicted RBP	32.24	■■■□□ 2.75
GNPTG-209	ENST00000534197	STAC3	Q96MF2	364 aa		32.24	■■■□□ 2.75
GNPTG-209	ENST00000534197	NWD2	Q9ULI1	1742 aa		32.23	■■■□□ 2.75
GNPTG-209	ENST00000534197	FAM83G	A6ND36	823 aa		32.19	■■■□□ 2.74
GNPTG-209	ENST00000534197	EIF3A	Q14152	1382 aa	Known RBP	32.17	■■■□□ 2.74
GNPTG-209	ENST00000534197	VPS72	Q15906	364 aa		32.16	■■■□□ 2.74
GNPTG-209	ENST00000534197	CRYBG1	Q9Y4K1	1723 aa		32.15	■■■□□ 2.74
GNPTG-209	ENST00000534197	GPRASP1	Q5JY77	1395 aa		32.15	■■■□□ 2.74
GNPTG-209	ENST00000534197	NRAP	Q86VF7	1730 aa		32.14	■■■□□ 2.74
GNPTG-209	ENST00000534197	ATP7B	P35670	1465 aa		32.14	■■■□□ 2.74
GNPTG-209	ENST00000534197	ITSN1	Q15811	1721 aa		32.12	■■■□□ 2.73
GNPTG-209	ENST00000534197	KIAA1210	Q9ULL0	1709 aa		32.12	■■■□□ 2.73
GNPTG-209	ENST00000534197	SEPT12	Q8IYM1	358 aa		32.11	■■■□□ 2.73
GNPTG-209	ENST00000534197	NGDN	Q8NEJ9	315 aa	Known RBP	32.11	■■■□□ 2.73
GNPTG-209	ENST00000534197	SRCAP	Q6ZRS2	3230 aa		32.1	■■■□□ 2.73
GNPTG-209	ENST00000534197	NUDT16	Q96DE0	195 aa	Known RBP	32.1	■■■□□ 2.73
GNPTG-209	ENST00000534197	ONECUT3	O60422	494 aa	Predicted RBP	32.08	■■■□□ 2.73
GNPTG-209	ENST00000534197	NBPF1	Q3BBV0	1214 aa		32.08	■■■□□ 2.73

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