RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531092.5

GMDS-AS1-208, humanhuman

TSL 3

Gene GMDS-AS1, Length 744 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDS-AS1-208ENST00000531092 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa20.38■□□□□ 0.85
GMDS-AS1-208ENST00000531092 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
GMDS-AS1-208ENST00000531092 PXDNQ92626 1479 aa20.37■□□□□ 0.85
GMDS-AS1-208ENST00000531092 HRCP23327 699 aa20.37■□□□□ 0.85
GMDS-AS1-208ENST00000531092 APLP2Q06481 763 aa20.37■□□□□ 0.85
GMDS-AS1-208ENST00000531092 UNC5CLQ8IV45 518 aa20.37■□□□□ 0.85
GMDS-AS1-208ENST00000531092 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa20.36■□□□□ 0.85
GMDS-AS1-208ENST00000531092 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
GMDS-AS1-208ENST00000531092 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
GMDS-AS1-208ENST00000531092 SLIT2O94813 1529 aa20.36■□□□□ 0.85
GMDS-AS1-208ENST00000531092 NUP155O75694 1391 aa20.35■□□□□ 0.85
GMDS-AS1-208ENST00000531092 NPHP3Q7Z494 1330 aa20.35■□□□□ 0.85
GMDS-AS1-208ENST00000531092 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa20.35■□□□□ 0.85
GMDS-AS1-208ENST00000531092 SEPT12Q8IYM1 358 aa20.33■□□□□ 0.85
GMDS-AS1-208ENST00000531092 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
GMDS-AS1-208ENST00000531092 PRAG1Q86YV5 1406 aa20.32■□□□□ 0.84
GMDS-AS1-208ENST00000531092 FOXO3O43524 673 aa20.31■□□□□ 0.84
GMDS-AS1-208ENST00000531092 ESCO1Q5FWF5 840 aa20.31■□□□□ 0.84
GMDS-AS1-208ENST00000531092 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
GMDS-AS1-208ENST00000531092 ROCK1Q13464 1354 aa20.27■□□□□ 0.84
GMDS-AS1-208ENST00000531092 HFM1A2PYH4 1435 aa20.27■□□□□ 0.83
GMDS-AS1-208ENST00000531092 VPS72Q15906 364 aa20.26■□□□□ 0.83
GMDS-AS1-208ENST00000531092 KRT27Q7Z3Y8 459 aa20.26■□□□□ 0.83
GMDS-AS1-208ENST00000531092 BAG6P46379 1132 aa20.25■□□□□ 0.83
GMDS-AS1-208ENST00000531092 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa20.25■□□□□ 0.83
GMDS-AS1-208ENST00000531092 CLTCL1P53675 1640 aa20.24■□□□□ 0.83
GMDS-AS1-208ENST00000531092 USP32Q8NFA0 1604 aa20.23■□□□□ 0.83
GMDS-AS1-208ENST00000531092 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa20.23■□□□□ 0.83
GMDS-AS1-208ENST00000531092 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
GMDS-AS1-208ENST00000531092 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
GMDS-AS1-208ENST00000531092 VGFO15240 615 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
GMDS-AS1-208ENST00000531092 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
GMDS-AS1-208ENST00000531092 NUTM2FA1L443 756 aa20.18■□□□□ 0.82
GMDS-AS1-208ENST00000531092 YY1P25490 414 aa20.18■□□□□ 0.82
GMDS-AS1-208ENST00000531092 NWD2Q9ULI1 1742 aa20.17■□□□□ 0.82
GMDS-AS1-208ENST00000531092 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
GMDS-AS1-208ENST00000531092 KIF1BO60333 1816 aa20.17■□□□□ 0.82
GMDS-AS1-208ENST00000531092 NAIPQ13075 1403 aa20.17■□□□□ 0.82
GMDS-AS1-208ENST00000531092 PLCH1Q4KWH8 1693 aa20.16■□□□□ 0.82
GMDS-AS1-208ENST00000531092 CABLES1Q8TDN4 633 aa20.15■□□□□ 0.82
GMDS-AS1-208ENST00000531092 KRT28Q7Z3Y7 464 aa20.13■□□□□ 0.81
GMDS-AS1-208ENST00000531092 CCDC144AA2RUR9 1427 aa20.12■□□□□ 0.81
GMDS-AS1-208ENST00000531092 RGPD1P0DJD0 1748 aa20.12■□□□□ 0.81
GMDS-AS1-208ENST00000531092 DISP2A7MBM2 1401 aa20.11■□□□□ 0.81
GMDS-AS1-208ENST00000531092 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
GMDS-AS1-208ENST00000531092 WAPLQ7Z5K2 1190 aa20.11■□□□□ 0.81
GMDS-AS1-208ENST00000531092 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa20.1■□□□□ 0.81
GMDS-AS1-208ENST00000531092 A0A0G2JS52 829 aa20.1■□□□□ 0.81
GMDS-AS1-208ENST00000531092 FAM83GA6ND36 823 aa20.1■□□□□ 0.81
GMDS-AS1-208ENST00000531092 MYT1Q01538 1121 aa20.1■□□□□ 0.81
GMDS-AS1-208ENST00000531092 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
GMDS-AS1-208ENST00000531092 FAM182BQ5T319 152 aa20.1■□□□□ 0.81
GMDS-AS1-208ENST00000531092 TNS3Q68CZ2 1445 aa20.1■□□□□ 0.81
GMDS-AS1-208ENST00000531092 KIF1AQ12756 1690 aa20.1■□□□□ 0.81
GMDS-AS1-208ENST00000531092 PLEKHG5O94827 1062 aa20.08■□□□□ 0.81
GMDS-AS1-208ENST00000531092 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
GMDS-AS1-208ENST00000531092 TECPR2O15040 1411 aa20.08■□□□□ 0.8
GMDS-AS1-208ENST00000531092 ABCA3Q99758 1704 aa20.07■□□□□ 0.8
GMDS-AS1-208ENST00000531092 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
GMDS-AS1-208ENST00000531092 FMN2Q9NZ56 1722 aa20.07■□□□□ 0.8
GMDS-AS1-208ENST00000531092 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa20.07■□□□□ 0.8
GMDS-AS1-208ENST00000531092 PPLO60437 1756 aa20.06■□□□□ 0.8
GMDS-AS1-208ENST00000531092 NRAPQ86VF7 1730 aa20.06■□□□□ 0.8
GMDS-AS1-208ENST00000531092 ITGAEP38570 1179 aa20.05■□□□□ 0.8
GMDS-AS1-208ENST00000531092 CAMKK2Q96RR4 588 aa20.05■□□□□ 0.8
GMDS-AS1-208ENST00000531092 STK26Q9P289 416 aa20.05■□□□□ 0.8
GMDS-AS1-208ENST00000531092 PSME1Q06323 249 aa20.03■□□□□ 0.8
GMDS-AS1-208ENST00000531092 SBNO1A3KN83 1393 aa20.03■□□□□ 0.8
GMDS-AS1-208ENST00000531092 PHF8Q9UPP1 1060 aa20.02■□□□□ 0.8
GMDS-AS1-208ENST00000531092 ABCC11Q96J66 1382 aa20.02■□□□□ 0.8
GMDS-AS1-208ENST00000531092 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
GMDS-AS1-208ENST00000531092 BTG4Q9NY30 223 aa20.01■□□□□ 0.79
GMDS-AS1-208ENST00000531092 ARHGEF10O15013 1369 aa20■□□□□ 0.79
GMDS-AS1-208ENST00000531092 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa20■□□□□ 0.79
GMDS-AS1-208ENST00000531092 LMOD2Q6P5Q4 547 aa19.99■□□□□ 0.79
GMDS-AS1-208ENST00000531092 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa19.99■□□□□ 0.79
GMDS-AS1-208ENST00000531092 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa19.99■□□□□ 0.79
GMDS-AS1-208ENST00000531092 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa19.99■□□□□ 0.79
GMDS-AS1-208ENST00000531092 KNDC1Q76NI1 1749 aa19.98■□□□□ 0.79
GMDS-AS1-208ENST00000531092 NRXN1Q9ULB1 1477 aa19.98■□□□□ 0.79
GMDS-AS1-208ENST00000531092 TMEM132EQ6IEE7 984 aa19.97■□□□□ 0.79
GMDS-AS1-208ENST00000531092 TRIM37O94972 964 aa19.96■□□□□ 0.79
GMDS-AS1-208ENST00000531092 PARD3Q8TEW0 1356 aa19.95■□□□□ 0.79
GMDS-AS1-208ENST00000531092 ADGRB2O60241 1585 aa19.95■□□□□ 0.78
GMDS-AS1-208ENST00000531092 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP19.95■□□□□ 0.78
GMDS-AS1-208ENST00000531092 IFT172Q9UG01 1749 aa19.94■□□□□ 0.78
GMDS-AS1-208ENST00000531092 APBA3O96018 575 aa19.93■□□□□ 0.78
GMDS-AS1-208ENST00000531092 FAM196AQ6ZSG2 479 aa19.93■□□□□ 0.78
GMDS-AS1-208ENST00000531092 RREB1Q92766 1687 aa19.93■□□□□ 0.78
GMDS-AS1-208ENST00000531092 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP19.93■□□□□ 0.78
GMDS-AS1-208ENST00000531092 NUP188Q5SRE5 1749 aa19.91■□□□□ 0.78
GMDS-AS1-208ENST00000531092 SIRT1Q96EB6 747 aa19.91■□□□□ 0.78
GMDS-AS1-208ENST00000531092 NINLQ9Y2I6 1382 aa19.91■□□□□ 0.78
GMDS-AS1-208ENST00000531092 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP19.91■□□□□ 0.78
GMDS-AS1-208ENST00000531092 SPON1Q9HCB6 807 aa19.9■□□□□ 0.78
GMDS-AS1-208ENST00000531092 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP19.9■□□□□ 0.78
GMDS-AS1-208ENST00000531092 DCAF8L1A6NGE4 600 aa19.89■□□□□ 0.77
GMDS-AS1-208ENST00000531092 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa19.89■□□□□ 0.77
GMDS-AS1-208ENST00000531092 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP19.89■□□□□ 0.77
GMDS-AS1-208ENST00000531092 KCNQ2O43526 872 aa19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41 ms