RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530727.5

PTPRC-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 1,962 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-214ENST00000530727 C6orf229H3BNL8 230 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRC-214ENST00000530727 MYSM1Q5VVJ2 828 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRC-214ENST00000530727 RIC3Q7Z5B4 369 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRC-214ENST00000530727 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
PTPRC-214ENST00000530727 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
PTPRC-214ENST00000530727 RSPH6AQ9H0K4 717 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRC-214ENST00000530727 RNF223E7ERA6 249 aa7.98□□□□□ -1.13
PTPRC-214ENST00000530727 SPTLC1O15269 473 aa7.98□□□□□ -1.13
PTPRC-214ENST00000530727 GJA5P36382 358 aa7.98□□□□□ -1.13
PTPRC-214ENST00000530727 MSS51Q4VC12 460 aa7.98□□□□□ -1.13
PTPRC-214ENST00000530727 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP7.98□□□□□ -1.13
PTPRC-214ENST00000530727 PRDM9Q9NQV7 894 aa7.98□□□□□ -1.13
PTPRC-214ENST00000530727 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP7.97□□□□□ -1.13
PTPRC-214ENST00000530727 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRC-214ENST00000530727 RGS20O76081 388 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRC-214ENST00000530727 RETREG3Q86VR2 466 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRC-214ENST00000530727 PLEKHG3A1L390 1219 aa7.96□□□□□ -1.14
PTPRC-214ENST00000530727 CLK2P49760 499 aaKnown RBP7.96□□□□□ -1.14
PTPRC-214ENST00000530727 MTMR2Q13614 643 aa7.96□□□□□ -1.14
PTPRC-214ENST00000530727 ANKLE1Q8NAG6 615 aa7.96□□□□□ -1.14
PTPRC-214ENST00000530727 POLR3EQ9NVU0 708 aa7.96□□□□□ -1.14
PTPRC-214ENST00000530727 LIMD1Q9UGP4 676 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRC-214ENST00000530727 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
PTPRC-214ENST00000530727 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRC-214ENST00000530727 IL27Q8NEV9 243 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRC-214ENST00000530727 ZBTB3Q9H5J0 574 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRC-214ENST00000530727 SPDYE5A6NIY4 337 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRC-214ENST00000530727 SH3D19Q5HYK7 790 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRC-214ENST00000530727 PRKD2Q9BZL6 878 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRC-214ENST00000530727 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP7.93□□□□□ -1.14
PTPRC-214ENST00000530727 HRCP23327 699 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRC-214ENST00000530727 MMP16P51512 607 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRC-214ENST00000530727 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP7.92□□□□□ -1.14
PTPRC-214ENST00000530727 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP7.92□□□□□ -1.14
PTPRC-214ENST00000530727 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP7.92□□□□□ -1.14
PTPRC-214ENST00000530727 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP7.92□□□□□ -1.14
PTPRC-214ENST00000530727 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP7.92□□□□□ -1.14
PTPRC-214ENST00000530727 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP7.92□□□□□ -1.14
PTPRC-214ENST00000530727 PRR7Q8TB68 274 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRC-214ENST00000530727 CABLES1Q8TDN4 633 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRC-214ENST00000530727 DXOO77932 396 aaKnown RBP7.91□□□□□ -1.14
PTPRC-214ENST00000530727 JUNDP17535 347 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRC-214ENST00000530727 TUSC1Q2TAM9 212 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRC-214ENST00000530727 QPCTQ16769 361 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRC-214ENST00000530727 V9GY48 417 aaPredicted RBP7.9□□□□□ -1.14
PTPRC-214ENST00000530727 PLA2G2CQ5R387 149 aa7.9□□□□□ -1.15
PTPRC-214ENST00000530727 CCDC24Q8N4L8 307 aa7.9□□□□□ -1.15
PTPRC-214ENST00000530727 LILRB3O75022 631 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRC-214ENST00000530727 SLC19A1P41440 591 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRC-214ENST00000530727 TSC1Q92574 1164 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRC-214ENST00000530727 CFAP99D6REC4 459 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRC-214ENST00000530727 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP7.88□□□□□ -1.15
PTPRC-214ENST00000530727 NUDT12Q9BQG2 462 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRC-214ENST00000530727 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP7.87□□□□□ -1.15
PTPRC-214ENST00000530727 DESI1Q6ICB0 168 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRC-214ENST00000530727 LIAT1Q6ZQX7 453 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRC-214ENST00000530727 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP7.87□□□□□ -1.15
PTPRC-214ENST00000530727 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP7.86□□□□□ -1.15
PTPRC-214ENST00000530727 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP7.86□□□□□ -1.15
PTPRC-214ENST00000530727 GOPCQ9HD26 462 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRC-214ENST00000530727 PTPRNQ16849 979 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRC-214ENST00000530727 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP7.86□□□□□ -1.15
PTPRC-214ENST00000530727 CCNYL3P0C7X3 344 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRC-214ENST00000530727 SPRYD7Q5W111 196 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRC-214ENST00000530727 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
PTPRC-214ENST00000530727 RPIAP49247 311 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRC-214ENST00000530727 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
PTPRC-214ENST00000530727 ZNF697Q5TEC3 545 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRC-214ENST00000530727 LYPD8Q6UX82 237 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRC-214ENST00000530727 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP7.82□□□□□ -1.16
PTPRC-214ENST00000530727 PPP2R2DQ66LE6 453 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRC-214ENST00000530727 CTHP32929 405 aa7.81□□□□□ -1.16
PTPRC-214ENST00000530727 TRIM32Q13049 653 aa7.81□□□□□ -1.16
PTPRC-214ENST00000530727 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP7.81□□□□□ -1.16
PTPRC-214ENST00000530727 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP7.81□□□□□ -1.16
PTPRC-214ENST00000530727 EVA1BQ9NVM1 165 aa7.81□□□□□ -1.16
PTPRC-214ENST00000530727 KCNH2Q12809 1159 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRC-214ENST00000530727 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP7.8□□□□□ -1.16
PTPRC-214ENST00000530727 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP7.8□□□□□ -1.16
PTPRC-214ENST00000530727 AP1G2O75843 785 aa7.79□□□□□ -1.16
PTPRC-214ENST00000530727 RFC5P40937 340 aa7.79□□□□□ -1.16
PTPRC-214ENST00000530727 CTDSPL2Q05D32 466 aa7.79□□□□□ -1.16
PTPRC-214ENST00000530727 UNC93B1Q9H1C4 597 aa7.79□□□□□ -1.16
PTPRC-214ENST00000530727 MAP10Q9P2G4 905 aa7.78□□□□□ -1.16
PTPRC-214ENST00000530727 FOXC1Q12948 553 aa7.77□□□□□ -1.17
PTPRC-214ENST00000530727 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa7.77□□□□□ -1.17
PTPRC-214ENST00000530727 GFRA3O60609 400 aa7.77□□□□□ -1.17
PTPRC-214ENST00000530727 F12P00748 615 aaPredicted RBP7.77□□□□□ -1.17
PTPRC-214ENST00000530727 TNFRSF10AO00220 468 aa7.76□□□□□ -1.17
PTPRC-214ENST00000530727 LINC01559Q495D7 138 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRC-214ENST00000530727 TRIM67Q6ZTA4 783 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRC-214ENST00000530727 LRRN4Q8WUT4 740 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRC-214ENST00000530727 GDF9O60383 454 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRC-214ENST00000530727 USP17L8P0C7I0 530 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRC-214ENST00000530727 WNT7BP56706 349 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRC-214ENST00000530727 LAPTM4AQ15012 233 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRC-214ENST00000530727 TMEM259Q4ZIN3 620 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRC-214ENST00000530727 BAP1Q92560 729 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRC-214ENST00000530727 SKOR1P84550 965 aa7.73□□□□□ -1.17
PTPRC-214ENST00000530727 PRR20EP86478 221 aa7.73□□□□□ -1.17
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