RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000526207.1

TXNRD1-210, Transcript of thioredoxin reductase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TXNRD1, Length 551 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNRD1-210ENST00000526207 MYOM3Q5VTT5 1437 aa11.56□□□□□ -0.56
TXNRD1-210ENST00000526207 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP11.56□□□□□ -0.56
TXNRD1-210ENST00000526207 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa11.56□□□□□ -0.56
TXNRD1-210ENST00000526207 RGS12O14924 1447 aa11.55□□□□□ -0.56
TXNRD1-210ENST00000526207 ABCC5O15440 1437 aa11.55□□□□□ -0.56
TXNRD1-210ENST00000526207 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP11.55□□□□□ -0.56
TXNRD1-210ENST00000526207 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa11.55□□□□□ -0.56
TXNRD1-210ENST00000526207 NHSL1Q5SYE7 1610 aa11.55□□□□□ -0.56
TXNRD1-210ENST00000526207 PTPN23Q9H3S7 1636 aa11.54□□□□□ -0.56
TXNRD1-210ENST00000526207 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP11.54□□□□□ -0.56
TXNRD1-210ENST00000526207 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa11.54□□□□□ -0.56
TXNRD1-210ENST00000526207 RXRBP28702 533 aa11.53□□□□□ -0.56
TXNRD1-210ENST00000526207 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa11.53□□□□□ -0.56
TXNRD1-210ENST00000526207 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP11.52□□□□□ -0.57
TXNRD1-210ENST00000526207 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP11.52□□□□□ -0.57
TXNRD1-210ENST00000526207 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP11.52□□□□□ -0.57
TXNRD1-210ENST00000526207 BCANQ96GW7 911 aa11.52□□□□□ -0.57
TXNRD1-210ENST00000526207 DAPK1P53355 1430 aa11.52□□□□□ -0.57
TXNRD1-210ENST00000526207 RIMS2Q9UQ26 1411 aa11.52□□□□□ -0.57
TXNRD1-210ENST00000526207 MAP3K13O43283 966 aa11.51□□□□□ -0.57
TXNRD1-210ENST00000526207 RASEFQ8IZ41 740 aa11.51□□□□□ -0.57
TXNRD1-210ENST00000526207 SCUBE2Q9NQ36 999 aa11.51□□□□□ -0.57
TXNRD1-210ENST00000526207 AFF2P51816 1311 aa11.51□□□□□ -0.57
TXNRD1-210ENST00000526207 KANK1Q14678 1352 aa11.51□□□□□ -0.57
TXNRD1-210ENST00000526207 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa11.51□□□□□ -0.57
TXNRD1-210ENST00000526207 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa11.5□□□□□ -0.57
TXNRD1-210ENST00000526207 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa11.5□□□□□ -0.57
TXNRD1-210ENST00000526207 PCDH10Q9P2E7 1040 aa11.5□□□□□ -0.57
TXNRD1-210ENST00000526207 TIE1P35590 1138 aa11.49□□□□□ -0.57
TXNRD1-210ENST00000526207 VPS8Q8N3P4 1428 aa11.49□□□□□ -0.57
TXNRD1-210ENST00000526207 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
TXNRD1-210ENST00000526207 BRINP3Q76B58 766 aa11.48□□□□□ -0.57
TXNRD1-210ENST00000526207 PTPRUQ92729 1446 aa11.48□□□□□ -0.57
TXNRD1-210ENST00000526207 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa11.48□□□□□ -0.57
TXNRD1-210ENST00000526207 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa11.48□□□□□ -0.57
TXNRD1-210ENST00000526207 E9PCH4 1651 aa11.47□□□□□ -0.57
TXNRD1-210ENST00000526207 UNC13BO14795 1591 aa11.47□□□□□ -0.57
TXNRD1-210ENST00000526207 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP11.47□□□□□ -0.57
TXNRD1-210ENST00000526207 C14orf37Q86TY3 774 aa11.47□□□□□ -0.57
TXNRD1-210ENST00000526207 NALCNQ8IZF0 1738 aa11.46□□□□□ -0.57
TXNRD1-210ENST00000526207 SETD5Q9C0A6 1442 aa11.46□□□□□ -0.57
TXNRD1-210ENST00000526207 CHIC2Q9UKJ5 165 aa11.46□□□□□ -0.57
TXNRD1-210ENST00000526207 TRPM2O94759 1503 aa11.45□□□□□ -0.58
TXNRD1-210ENST00000526207 MST1RQ04912 1400 aa11.45□□□□□ -0.58
TXNRD1-210ENST00000526207 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP11.45□□□□□ -0.58
TXNRD1-210ENST00000526207 CADPS2Q86UW7 1296 aa11.45□□□□□ -0.58
TXNRD1-210ENST00000526207 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP11.45□□□□□ -0.58
TXNRD1-210ENST00000526207 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP11.45□□□□□ -0.58
TXNRD1-210ENST00000526207 C19orf44Q9H6X5 657 aa11.45□□□□□ -0.58
TXNRD1-210ENST00000526207 SLC52A1Q9NWF4 448 aa11.45□□□□□ -0.58
TXNRD1-210ENST00000526207 TBX22Q9Y458 520 aa11.45□□□□□ -0.58
TXNRD1-210ENST00000526207 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP11.44□□□□□ -0.58
TXNRD1-210ENST00000526207 ATF3P18847 181 aa11.44□□□□□ -0.58
TXNRD1-210ENST00000526207 C8orf37Q96NL8 207 aa11.44□□□□□ -0.58
TXNRD1-210ENST00000526207 PNPLA6Q8IY17 1366 aa11.43□□□□□ -0.58
TXNRD1-210ENST00000526207 TTLL13PA6NNM8 815 aa11.43□□□□□ -0.58
TXNRD1-210ENST00000526207 MIER1Q8N108 512 aa11.43□□□□□ -0.58
TXNRD1-210ENST00000526207 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP11.43□□□□□ -0.58
TXNRD1-210ENST00000526207 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP11.43□□□□□ -0.58
TXNRD1-210ENST00000526207 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa11.43□□□□□ -0.58
TXNRD1-210ENST00000526207 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP11.42□□□□□ -0.58
TXNRD1-210ENST00000526207 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa11.41□□□□□ -0.58
TXNRD1-210ENST00000526207 ADGRL2O95490 1459 aa11.41□□□□□ -0.58
TXNRD1-210ENST00000526207 LAMC1P11047 1609 aa11.41□□□□□ -0.58
TXNRD1-210ENST00000526207 DCCP43146 1447 aa11.41□□□□□ -0.58
TXNRD1-210ENST00000526207 PIK3R4Q99570 1358 aa11.41□□□□□ -0.58
TXNRD1-210ENST00000526207 PLEKHG5O94827 1062 aa11.4□□□□□ -0.58
TXNRD1-210ENST00000526207 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa11.4□□□□□ -0.58
TXNRD1-210ENST00000526207 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP11.4□□□□□ -0.58
TXNRD1-210ENST00000526207 CHGAP10645 457 aaKnown RBP11.39□□□□□ -0.59
TXNRD1-210ENST00000526207 ATAD2Q6PL18 1390 aa11.39□□□□□ -0.59
TXNRD1-210ENST00000526207 ADAMTS2O95450 1211 aa11.38□□□□□ -0.59
TXNRD1-210ENST00000526207 IQGAP3Q86VI3 1631 aa11.37□□□□□ -0.59
TXNRD1-210ENST00000526207 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP11.37□□□□□ -0.59
TXNRD1-210ENST00000526207 BRWD3Q6RI45 1802 aa11.37□□□□□ -0.59
TXNRD1-210ENST00000526207 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa11.36□□□□□ -0.59
TXNRD1-210ENST00000526207 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP11.36□□□□□ -0.59
TXNRD1-210ENST00000526207 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP11.36□□□□□ -0.59
TXNRD1-210ENST00000526207 NGLY1Q96IV0 654 aa11.36□□□□□ -0.59
TXNRD1-210ENST00000526207 TRIM35Q9UPQ4 493 aa11.36□□□□□ -0.59
TXNRD1-210ENST00000526207 ATRNO75882 1429 aa11.35□□□□□ -0.59
TXNRD1-210ENST00000526207 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa11.35□□□□□ -0.59
TXNRD1-210ENST00000526207 SEC24BO95487 1268 aa11.35□□□□□ -0.59
TXNRD1-210ENST00000526207 HDGFP51858 240 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
TXNRD1-210ENST00000526207 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa11.35□□□□□ -0.59
TXNRD1-210ENST00000526207 METP08581 1390 aa11.34□□□□□ -0.59
TXNRD1-210ENST00000526207 EP400Q96L91 3159 aa11.34□□□□□ -0.59
TXNRD1-210ENST00000526207 LRP5O75197 1615 aa11.34□□□□□ -0.59
TXNRD1-210ENST00000526207 C1orf167Q5SNV9 1468 aa11.33□□□□□ -0.6
TXNRD1-210ENST00000526207 IER5LQ5T953 404 aa11.33□□□□□ -0.6
TXNRD1-210ENST00000526207 SGIP1Q9BQI5 828 aa11.33□□□□□ -0.6
TXNRD1-210ENST00000526207 USP21Q9UK80 565 aa11.33□□□□□ -0.6
TXNRD1-210ENST00000526207 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa11.33□□□□□ -0.6
TXNRD1-210ENST00000526207 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
TXNRD1-210ENST00000526207 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa11.32□□□□□ -0.6
TXNRD1-210ENST00000526207 NUBP1P53384 320 aa11.32□□□□□ -0.6
TXNRD1-210ENST00000526207 GLI3P10071 1580 aa11.32□□□□□ -0.6
TXNRD1-210ENST00000526207 PTCH1Q13635 1447 aa11.31□□□□□ -0.6
TXNRD1-210ENST00000526207 BCL9LQ86UU0 1499 aa11.31□□□□□ -0.6
TXNRD1-210ENST00000526207 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa11.3□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.8 ms