RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525711.1

UBASH3B-202, Transcript of ubiquitin associated and SH3 domain containing B, humanhuman

TSL 4

Gene UBASH3B, Length 572 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3B-202ENST00000525711 ATRNO75882 1429 aa21.55■■□□□ 1.04
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UBASH3B-202ENST00000525711 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa21.55■■□□□ 1.04
UBASH3B-202ENST00000525711 ZRANB1Q9UGI0 708 aa21.54■■□□□ 1.04
UBASH3B-202ENST00000525711 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
UBASH3B-202ENST00000525711 NPHP3Q7Z494 1330 aa21.53■■□□□ 1.04
UBASH3B-202ENST00000525711 MYOM2P54296 1465 aa21.52■■□□□ 1.03
UBASH3B-202ENST00000525711 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa21.51■■□□□ 1.03
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UBASH3B-202ENST00000525711 ESCO1Q5FWF5 840 aa21.48■■□□□ 1.03
UBASH3B-202ENST00000525711 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
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UBASH3B-202ENST00000525711 BCL9LQ86UU0 1499 aa21.46■■□□□ 1.03
UBASH3B-202ENST00000525711 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
UBASH3B-202ENST00000525711 KIF1AQ12756 1690 aa21.45■■□□□ 1.02
UBASH3B-202ENST00000525711 KNDC1Q76NI1 1749 aa21.45■■□□□ 1.02
UBASH3B-202ENST00000525711 BRWD3Q6RI45 1802 aa21.44■■□□□ 1.02
UBASH3B-202ENST00000525711 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
UBASH3B-202ENST00000525711 FMN2Q9NZ56 1722 aa21.43■■□□□ 1.02
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UBASH3B-202ENST00000525711 IFT172Q9UG01 1749 aa21.42■■□□□ 1.02
UBASH3B-202ENST00000525711 FOXO3O43524 673 aa21.41■■□□□ 1.02
UBASH3B-202ENST00000525711 USP32Q8NFA0 1604 aa21.4■■□□□ 1.02
UBASH3B-202ENST00000525711 GLI3P10071 1580 aa21.4■■□□□ 1.02
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UBASH3B-202ENST00000525711 TECPR2O15040 1411 aa21.38■■□□□ 1.01
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UBASH3B-202ENST00000525711 CCDC144AA2RUR9 1427 aa21.36■■□□□ 1.01
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UBASH3B-202ENST00000525711 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa21.32■■□□□ 1
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UBASH3B-202ENST00000525711 WAPLQ7Z5K2 1190 aa21.31■■□□□ 1
UBASH3B-202ENST00000525711 ABCC11Q96J66 1382 aa21.31■■□□□ 1
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UBASH3B-202ENST00000525711 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa21.3■■□□□ 1
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UBASH3B-202ENST00000525711 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa21.27■■□□□ 1
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UBASH3B-202ENST00000525711 KRT28Q7Z3Y7 464 aa21.27■■□□□ 1
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UBASH3B-202ENST00000525711 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa21.26■□□□□ 0.99
UBASH3B-202ENST00000525711 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP21.26■□□□□ 0.99
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UBASH3B-202ENST00000525711 NRXN1Q9ULB1 1477 aa21.21■□□□□ 0.99
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UBASH3B-202ENST00000525711 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP21.1■□□□□ 0.97
UBASH3B-202ENST00000525711 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP21.1■□□□□ 0.97
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UBASH3B-202ENST00000525711 BTG4Q9NY30 223 aa21.08■□□□□ 0.97
UBASH3B-202ENST00000525711 POGKQ9P215 609 aa21.08■□□□□ 0.97
UBASH3B-202ENST00000525711 ITSN1Q15811 1721 aa21.07■□□□□ 0.96
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UBASH3B-202ENST00000525711 CFAP70Q5T0N1 1121 aa21.07■□□□□ 0.96
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UBASH3B-202ENST00000525711 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa21.06■□□□□ 0.96
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