RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000521452.1

TMEM200B-202, Transcript of transmembrane protein 200B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMEM200B, Length 2,501 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM200B-202ENST00000521452 NINLQ9Y2I6 1382 aa27.69■■■□□ 2.02
TMEM200B-202ENST00000521452 TMEM132EQ6IEE7 984 aa27.69■■■□□ 2.02
TMEM200B-202ENST00000521452 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa27.69■■■□□ 2.02
TMEM200B-202ENST00000521452 RLBP1P12271 317 aa27.68■■■□□ 2.02
TMEM200B-202ENST00000521452 KIF1BO60333 1816 aa27.68■■■□□ 2.02
TMEM200B-202ENST00000521452 NRXN1Q9ULB1 1477 aa27.67■■■□□ 2.02
TMEM200B-202ENST00000521452 MROH2AA6NES4 1674 aa27.66■■■□□ 2.02
TMEM200B-202ENST00000521452 MTHFSP49914 203 aa27.66■■■□□ 2.02
TMEM200B-202ENST00000521452 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa27.66■■■□□ 2.02
TMEM200B-202ENST00000521452 EFCAB6Q5THR3 1501 aa27.66■■■□□ 2.02
TMEM200B-202ENST00000521452 ABCA9Q8IUA7 1624 aa27.65■■■□□ 2.02
TMEM200B-202ENST00000521452 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP27.64■■■□□ 2.02
TMEM200B-202ENST00000521452 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP27.64■■■□□ 2.01
TMEM200B-202ENST00000521452 IFT172Q9UG01 1749 aa27.63■■■□□ 2.01
TMEM200B-202ENST00000521452 SHPRHQ149N8 1683 aa27.62■■■□□ 2.01
TMEM200B-202ENST00000521452 MYO3AQ8NEV4 1616 aa27.62■■■□□ 2.01
TMEM200B-202ENST00000521452 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP27.62■■■□□ 2.01
TMEM200B-202ENST00000521452 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP27.62■■■□□ 2.01
TMEM200B-202ENST00000521452 WDR63Q8IWG1 891 aa27.61■■■□□ 2.01
TMEM200B-202ENST00000521452 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa27.6■■■□□ 2.01
TMEM200B-202ENST00000521452 IQSEC2Q5JU85 1478 aa27.59■■■□□ 2.01
TMEM200B-202ENST00000521452 GGT6Q6P531 493 aa27.56■■■□□ 2
TMEM200B-202ENST00000521452 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP27.56■■■□□ 2
TMEM200B-202ENST00000521452 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa27.56■■■□□ 2
TMEM200B-202ENST00000521452 ADGRB3O60242 1522 aa27.56■■■□□ 2
TMEM200B-202ENST00000521452 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP27.56■■■□□ 2
TMEM200B-202ENST00000521452 CFAP53Q96M91 514 aa27.56■■■□□ 2
TMEM200B-202ENST00000521452 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa27.55■■■□□ 2
TMEM200B-202ENST00000521452 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP27.55■■■□□ 2
TMEM200B-202ENST00000521452 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa27.54■■■□□ 2
TMEM200B-202ENST00000521452 NLRP1Q9C000 1473 aa27.54■■■□□ 2
TMEM200B-202ENST00000521452 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP27.54■■■□□ 2
TMEM200B-202ENST00000521452 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP27.54■■■□□ 2
TMEM200B-202ENST00000521452 BECN1Q14457 450 aa27.54■■■□□ 2
TMEM200B-202ENST00000521452 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP27.53■■■□□ 2
TMEM200B-202ENST00000521452 CCDC27Q2M243 656 aa27.53■■■□□ 2
TMEM200B-202ENST00000521452 NPATQ14207 1427 aa27.52■■■□□ 2
TMEM200B-202ENST00000521452 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa27.52■■■□□ 2
TMEM200B-202ENST00000521452 ADGRB1O14514 1584 aa27.52■■■□□ 2
TMEM200B-202ENST00000521452 AAMPQ13685 434 aa27.51■■■□□ 2
TMEM200B-202ENST00000521452 QRICH2Q9H0J4 1663 aa27.51■■□□□ 1.99
TMEM200B-202ENST00000521452 MYH16Q9H6N6 1097 aa27.5■■□□□ 1.99
TMEM200B-202ENST00000521452 LMTK2Q8IWU2 1503 aa27.5■■□□□ 1.99
TMEM200B-202ENST00000521452 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP27.49■■□□□ 1.99
TMEM200B-202ENST00000521452 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP27.48■■□□□ 1.99
TMEM200B-202ENST00000521452 ASXL2Q76L83 1435 aa27.48■■□□□ 1.99
TMEM200B-202ENST00000521452 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP27.47■■□□□ 1.99
TMEM200B-202ENST00000521452 TBC1D32Q96NH3 1257 aa27.47■■□□□ 1.99
TMEM200B-202ENST00000521452 CABP2Q9NPB3 220 aa27.47■■□□□ 1.99
TMEM200B-202ENST00000521452 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP27.46■■□□□ 1.99
TMEM200B-202ENST00000521452 MVPQ14764 893 aaKnown RBP27.46■■□□□ 1.99
TMEM200B-202ENST00000521452 POGKQ9P215 609 aa27.46■■□□□ 1.99
TMEM200B-202ENST00000521452 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP27.46■■□□□ 1.99
TMEM200B-202ENST00000521452 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP27.45■■□□□ 1.98
TMEM200B-202ENST00000521452 EVC2Q86UK5 1308 aa27.45■■□□□ 1.98
TMEM200B-202ENST00000521452 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP27.44■■□□□ 1.98
TMEM200B-202ENST00000521452 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa27.44■■□□□ 1.98
TMEM200B-202ENST00000521452 PPLO60437 1756 aa27.43■■□□□ 1.98
TMEM200B-202ENST00000521452 ANTXR1Q9H6X2 564 aa27.43■■□□□ 1.98
TMEM200B-202ENST00000521452 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa27.42■■□□□ 1.98
TMEM200B-202ENST00000521452 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP27.42■■□□□ 1.98
TMEM200B-202ENST00000521452 TBC1D2Q9BYX2 928 aa27.42■■□□□ 1.98
TMEM200B-202ENST00000521452 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa27.41■■□□□ 1.98
TMEM200B-202ENST00000521452 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP27.4■■□□□ 1.98
TMEM200B-202ENST00000521452 USP32Q8NFA0 1604 aa27.4■■□□□ 1.98
TMEM200B-202ENST00000521452 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP27.39■■□□□ 1.98
TMEM200B-202ENST00000521452 SMC4Q9NTJ3 1288 aa27.39■■□□□ 1.98
TMEM200B-202ENST00000521452 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP27.39■■□□□ 1.98
TMEM200B-202ENST00000521452 ZMYM3Q14202 1370 aa27.38■■□□□ 1.97
TMEM200B-202ENST00000521452 TULP4Q9NRJ4 1543 aa27.38■■□□□ 1.97
TMEM200B-202ENST00000521452 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa27.37■■□□□ 1.97
TMEM200B-202ENST00000521452 TRIM27P14373 513 aa27.37■■□□□ 1.97
TMEM200B-202ENST00000521452 GGNBP2Q9H3C7 697 aa27.37■■□□□ 1.97
TMEM200B-202ENST00000521452 NSD2O96028 1365 aa27.36■■□□□ 1.97
TMEM200B-202ENST00000521452 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP27.36■■□□□ 1.97
TMEM200B-202ENST00000521452 SSH1Q8WYL5 1049 aa27.35■■□□□ 1.97
TMEM200B-202ENST00000521452 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP27.35■■□□□ 1.97
TMEM200B-202ENST00000521452 PLEKHF1Q96S99 279 aa27.35■■□□□ 1.97
TMEM200B-202ENST00000521452 VGFO15240 615 aaPredicted RBP27.35■■□□□ 1.97
TMEM200B-202ENST00000521452 GLI2P10070 1586 aa27.35■■□□□ 1.97
TMEM200B-202ENST00000521452 TMPOP42166 694 aaKnown RBP27.34■■□□□ 1.97
TMEM200B-202ENST00000521452 STK26Q9P289 416 aa27.34■■□□□ 1.97
TMEM200B-202ENST00000521452 TRIM35Q9UPQ4 493 aa27.34■■□□□ 1.97
TMEM200B-202ENST00000521452 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa27.34■■□□□ 1.97
TMEM200B-202ENST00000521452 ITPRIPQ8IWB1 547 aa27.34■■□□□ 1.97
TMEM200B-202ENST00000521452 CD109Q6YHK3 1445 aa27.33■■□□□ 1.97
TMEM200B-202ENST00000521452 A0A1W2PP64 1363 aa27.33■■□□□ 1.96
TMEM200B-202ENST00000521452 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP27.32■■□□□ 1.96
TMEM200B-202ENST00000521452 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP27.31■■□□□ 1.96
TMEM200B-202ENST00000521452 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP27.31■■□□□ 1.96
TMEM200B-202ENST00000521452 ADGRB2O60241 1585 aa27.31■■□□□ 1.96
TMEM200B-202ENST00000521452 POGZQ7Z3K3 1410 aa27.3■■□□□ 1.96
TMEM200B-202ENST00000521452 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP27.3■■□□□ 1.96
TMEM200B-202ENST00000521452 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa27.29■■□□□ 1.96
TMEM200B-202ENST00000521452 C22orf23Q9BZE7 217 aa27.29■■□□□ 1.96
TMEM200B-202ENST00000521452 ABCC3O15438 1527 aa27.29■■□□□ 1.96
TMEM200B-202ENST00000521452 ABCC11Q96J66 1382 aa27.28■■□□□ 1.96
TMEM200B-202ENST00000521452 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP27.28■■□□□ 1.96
TMEM200B-202ENST00000521452 DDX19BQ9UMR2 479 aa27.28■■□□□ 1.96
TMEM200B-202ENST00000521452 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP27.27■■□□□ 1.96
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