RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517323.2

TRPS1-206, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 5

Gene TRPS1, Length 2,171 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-206ENST00000517323 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
TRPS1-206ENST00000517323 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
TRPS1-206ENST00000517323 MYOM1P52179 1685 aa21.51■■□□□ 1.03
TRPS1-206ENST00000517323 TECPR2O15040 1411 aa21.5■■□□□ 1.03
TRPS1-206ENST00000517323 NUTM2FA1L443 756 aa21.49■■□□□ 1.03
TRPS1-206ENST00000517323 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa21.49■■□□□ 1.03
TRPS1-206ENST00000517323 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
TRPS1-206ENST00000517323 STRCP1A6NGW2 1772 aa21.47■■□□□ 1.03
TRPS1-206ENST00000517323 CDK19Q9BWU1 502 aa21.46■■□□□ 1.03
TRPS1-206ENST00000517323 TMC1Q8TDI8 760 aa21.46■■□□□ 1.03
TRPS1-206ENST00000517323 EVC2Q86UK5 1308 aa21.45■■□□□ 1.02
TRPS1-206ENST00000517323 PANK3Q9H999 370 aa21.45■■□□□ 1.02
TRPS1-206ENST00000517323 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa21.44■■□□□ 1.02
TRPS1-206ENST00000517323 FAM135BQ49AJ0 1406 aa21.44■■□□□ 1.02
TRPS1-206ENST00000517323 PTCH1Q13635 1447 aa21.42■■□□□ 1.02
TRPS1-206ENST00000517323 PIK3R4Q99570 1358 aa21.4■■□□□ 1.02
TRPS1-206ENST00000517323 NALCNQ8IZF0 1738 aa21.4■■□□□ 1.02
TRPS1-206ENST00000517323 WASLO00401 505 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
TRPS1-206ENST00000517323 CDCA8Q53HL2 280 aa21.39■■□□□ 1.01
TRPS1-206ENST00000517323 SIRT1Q96EB6 747 aa21.38■■□□□ 1.01
TRPS1-206ENST00000517323 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
TRPS1-206ENST00000517323 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
TRPS1-206ENST00000517323 PRR36Q9H6K5 1346 aa21.37■■□□□ 1.01
TRPS1-206ENST00000517323 CARD14Q9BXL6 1004 aa21.36■■□□□ 1.01
TRPS1-206ENST00000517323 NWD1Q149M9 1564 aa21.35■■□□□ 1.01
TRPS1-206ENST00000517323 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
TRPS1-206ENST00000517323 CABP1Q9NZU7 370 aa21.35■■□□□ 1.01
TRPS1-206ENST00000517323 C14orf37Q86TY3 774 aa21.34■■□□□ 1.01
TRPS1-206ENST00000517323 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
TRPS1-206ENST00000517323 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1.01
TRPS1-206ENST00000517323 ANP32CO43423 234 aa21.32■■□□□ 1
TRPS1-206ENST00000517323 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
TRPS1-206ENST00000517323 ADGRB2O60241 1585 aa21.32■■□□□ 1
TRPS1-206ENST00000517323 USP32Q8NFA0 1604 aa21.31■■□□□ 1
TRPS1-206ENST00000517323 SLC24A1O60721 1099 aa21.31■■□□□ 1
TRPS1-206ENST00000517323 ATP7BP35670 1465 aa21.3■■□□□ 1
TRPS1-206ENST00000517323 CD163L1Q9NR16 1453 aa21.29■■□□□ 1
TRPS1-206ENST00000517323 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa21.29■■□□□ 1
TRPS1-206ENST00000517323 A0A1W2PP64 1363 aa21.29■■□□□ 1
TRPS1-206ENST00000517323 TMEM94Q12767 1356 aa21.29■■□□□ 1
TRPS1-206ENST00000517323 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP21.28■■□□□ 1
TRPS1-206ENST00000517323 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP21.28■■□□□ 1
TRPS1-206ENST00000517323 ATAD2Q6PL18 1390 aa21.28■■□□□ 1
TRPS1-206ENST00000517323 CCDC184Q52MB2 194 aa21.27■■□□□ 1
TRPS1-206ENST00000517323 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa21.27■■□□□ 1
TRPS1-206ENST00000517323 NSD3Q9BZ95 1437 aa21.26■□□□□ 0.99
TRPS1-206ENST00000517323 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa21.25■□□□□ 0.99
TRPS1-206ENST00000517323 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP21.25■□□□□ 0.99
TRPS1-206ENST00000517323 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP21.25■□□□□ 0.99
TRPS1-206ENST00000517323 KNSTRNQ9Y448 316 aa21.25■□□□□ 0.99
TRPS1-206ENST00000517323 FMN2Q9NZ56 1722 aa21.25■□□□□ 0.99
TRPS1-206ENST00000517323 CCDC61Q9Y6R9 512 aa21.24■□□□□ 0.99
TRPS1-206ENST00000517323 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP21.23■□□□□ 0.99
TRPS1-206ENST00000517323 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa21.23■□□□□ 0.99
TRPS1-206ENST00000517323 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa21.23■□□□□ 0.99
TRPS1-206ENST00000517323 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP21.22■□□□□ 0.99
TRPS1-206ENST00000517323 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP21.21■□□□□ 0.99
TRPS1-206ENST00000517323 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa21.21■□□□□ 0.99
TRPS1-206ENST00000517323 LRRC7Q96NW7 1537 aa21.2■□□□□ 0.98
TRPS1-206ENST00000517323 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP21.19■□□□□ 0.98
TRPS1-206ENST00000517323 ITSN1Q15811 1721 aa21.18■□□□□ 0.98
TRPS1-206ENST00000517323 ACEP12821 1306 aa21.18■□□□□ 0.98
TRPS1-206ENST00000517323 ORAI2Q96SN7 254 aa21.18■□□□□ 0.98
TRPS1-206ENST00000517323 TERF2IPQ9NYB0 399 aa21.17■□□□□ 0.98
TRPS1-206ENST00000517323 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP21.17■□□□□ 0.98
TRPS1-206ENST00000517323 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP21.17■□□□□ 0.98
TRPS1-206ENST00000517323 ZRANB1Q9UGI0 708 aa21.17■□□□□ 0.98
TRPS1-206ENST00000517323 GGNBP2Q9H3C7 697 aa21.16■□□□□ 0.98
TRPS1-206ENST00000517323 C19orf44Q9H6X5 657 aa21.16■□□□□ 0.98
TRPS1-206ENST00000517323 DMRT2Q9Y5R5 561 aa21.16■□□□□ 0.98
TRPS1-206ENST00000517323 AKAP12Q02952 1782 aa21.16■□□□□ 0.98
TRPS1-206ENST00000517323 ESCO1Q5FWF5 840 aa21.16■□□□□ 0.98
TRPS1-206ENST00000517323 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP21.16■□□□□ 0.98
TRPS1-206ENST00000517323 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP21.15■□□□□ 0.98
TRPS1-206ENST00000517323 NINLQ9Y2I6 1382 aa21.15■□□□□ 0.98
TRPS1-206ENST00000517323 PARD3Q8TEW0 1356 aa21.14■□□□□ 0.97
TRPS1-206ENST00000517323 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP21.14■□□□□ 0.97
TRPS1-206ENST00000517323 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP21.13■□□□□ 0.97
TRPS1-206ENST00000517323 MON2Q7Z3U7 1717 aa21.13■□□□□ 0.97
TRPS1-206ENST00000517323 FBLN1P23142 703 aa21.13■□□□□ 0.97
TRPS1-206ENST00000517323 NME9Q86XW9 330 aa21.13■□□□□ 0.97
TRPS1-206ENST00000517323 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP21.13■□□□□ 0.97
TRPS1-206ENST00000517323 PLEKHG3A1L390 1219 aa21.11■□□□□ 0.97
TRPS1-206ENST00000517323 FYB1O15117 783 aa21.11■□□□□ 0.97
TRPS1-206ENST00000517323 ATF3P18847 181 aa21.11■□□□□ 0.97
TRPS1-206ENST00000517323 CGNL1Q0VF96 1302 aa21.1■□□□□ 0.97
TRPS1-206ENST00000517323 ANKARQ7Z5J8 1434 aa21.1■□□□□ 0.97
TRPS1-206ENST00000517323 PHF8Q9UPP1 1060 aa21.1■□□□□ 0.97
TRPS1-206ENST00000517323 KIF20BQ96Q89 1820 aa21.09■□□□□ 0.97
TRPS1-206ENST00000517323 MSH6P52701 1360 aa21.09■□□□□ 0.97
TRPS1-206ENST00000517323 FOXO3O43524 673 aa21.09■□□□□ 0.97
TRPS1-206ENST00000517323 MRS2Q9HD23 443 aa21.09■□□□□ 0.97
TRPS1-206ENST00000517323 MST1RQ04912 1400 aa21.08■□□□□ 0.97
TRPS1-206ENST00000517323 C1orf167Q5SNV9 1468 aa21.08■□□□□ 0.97
TRPS1-206ENST00000517323 PLEKHG5O94827 1062 aa21.08■□□□□ 0.97
TRPS1-206ENST00000517323 NRKQ7Z2Y5 1582 aa21.07■□□□□ 0.96
TRPS1-206ENST00000517323 NUTM2GQ5VZR2 741 aa21.07■□□□□ 0.96
TRPS1-206ENST00000517323 USP6P35125 1406 aa21.07■□□□□ 0.96
TRPS1-206ENST00000517323 RALBP1Q15311 655 aa21.07■□□□□ 0.96
TRPS1-206ENST00000517323 MORC1Q86VD1 984 aa21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.9 ms