RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515011.5

PDE4D-223, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 2,175 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-223ENST00000515011 NINLQ9Y2I6 1382 aa30.47■■■□□ 2.47
PDE4D-223ENST00000515011 DLC1Q96QB1 1528 aa30.46■■■□□ 2.47
PDE4D-223ENST00000515011 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP30.45■■■□□ 2.47
PDE4D-223ENST00000515011 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP30.45■■■□□ 2.46
PDE4D-223ENST00000515011 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP30.44■■■□□ 2.46
PDE4D-223ENST00000515011 PRAM1Q96QH2 718 aa30.44■■■□□ 2.46
PDE4D-223ENST00000515011 CABP2Q9NPB3 220 aa30.43■■■□□ 2.46
PDE4D-223ENST00000515011 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa30.43■■■□□ 2.46
PDE4D-223ENST00000515011 TNRQ92752 1358 aa30.42■■■□□ 2.46
PDE4D-223ENST00000515011 CGNL1Q0VF96 1302 aa30.41■■■□□ 2.46
PDE4D-223ENST00000515011 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP30.41■■■□□ 2.46
PDE4D-223ENST00000515011 ATAD2Q6PL18 1390 aa30.4■■■□□ 2.46
PDE4D-223ENST00000515011 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP30.4■■■□□ 2.46
PDE4D-223ENST00000515011 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa30.4■■■□□ 2.46
PDE4D-223ENST00000515011 POGKQ9P215 609 aa30.4■■■□□ 2.46
PDE4D-223ENST00000515011 NSD2O96028 1365 aa30.4■■■□□ 2.46
PDE4D-223ENST00000515011 MORC1Q86VD1 984 aa30.38■■■□□ 2.45
PDE4D-223ENST00000515011 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP30.36■■■□□ 2.45
PDE4D-223ENST00000515011 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP30.36■■■□□ 2.45
PDE4D-223ENST00000515011 UBR1Q8IWV7 1749 aa30.35■■■□□ 2.45
PDE4D-223ENST00000515011 CDCA7LQ96GN5 454 aa30.35■■■□□ 2.45
PDE4D-223ENST00000515011 ABCC11Q96J66 1382 aa30.34■■■□□ 2.45
PDE4D-223ENST00000515011 A0A1W2PP64 1363 aa30.33■■■□□ 2.45
PDE4D-223ENST00000515011 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa30.33■■■□□ 2.45
PDE4D-223ENST00000515011 RCAN3Q9UKA8 241 aa30.32■■■□□ 2.44
PDE4D-223ENST00000515011 SHPRHQ149N8 1683 aa30.32■■■□□ 2.44
PDE4D-223ENST00000515011 ZNF521Q96K83 1311 aa30.3■■■□□ 2.44
PDE4D-223ENST00000515011 HDGFP51858 240 aaKnown RBP30.3■■■□□ 2.44
PDE4D-223ENST00000515011 CD163L1Q9NR16 1453 aa30.29■■■□□ 2.44
PDE4D-223ENST00000515011 KNDC1Q76NI1 1749 aa30.29■■■□□ 2.44
PDE4D-223ENST00000515011 RRP1P56182 461 aaKnown RBP30.28■■■□□ 2.44
PDE4D-223ENST00000515011 TMEM2Q9UHN6 1383 aa30.27■■■□□ 2.44
PDE4D-223ENST00000515011 NLRP1Q9C000 1473 aa30.27■■■□□ 2.44
PDE4D-223ENST00000515011 CDK19Q9BWU1 502 aa30.25■■■□□ 2.43
PDE4D-223ENST00000515011 METP08581 1390 aa30.25■■■□□ 2.43
PDE4D-223ENST00000515011 TERF2IPQ9NYB0 399 aa30.25■■■□□ 2.43
PDE4D-223ENST00000515011 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa30.24■■■□□ 2.43
PDE4D-223ENST00000515011 TECPR2O15040 1411 aa30.23■■■□□ 2.43
PDE4D-223ENST00000515011 MED14O60244 1454 aa30.23■■■□□ 2.43
PDE4D-223ENST00000515011 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP30.22■■■□□ 2.43
PDE4D-223ENST00000515011 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa30.22■■■□□ 2.43
PDE4D-223ENST00000515011 CCDC146Q8IYE0 955 aa30.22■■■□□ 2.43
PDE4D-223ENST00000515011 CPS1P31327 1500 aa30.21■■■□□ 2.43
PDE4D-223ENST00000515011 WAPLQ7Z5K2 1190 aa30.21■■■□□ 2.43
PDE4D-223ENST00000515011 NGEFQ8N5V2 710 aa30.21■■■□□ 2.43
PDE4D-223ENST00000515011 FAM135BQ49AJ0 1406 aa30.2■■■□□ 2.43
PDE4D-223ENST00000515011 C3P01024 1663 aa30.2■■■□□ 2.43
PDE4D-223ENST00000515011 GOLGA2Q08379 1002 aa30.18■■■□□ 2.42
PDE4D-223ENST00000515011 APAF1O14727 1248 aa30.18■■■□□ 2.42
PDE4D-223ENST00000515011 MTHFSP49914 203 aa30.18■■■□□ 2.42
PDE4D-223ENST00000515011 SIRT1Q96EB6 747 aa30.18■■■□□ 2.42
PDE4D-223ENST00000515011 ATP7BP35670 1465 aa30.18■■■□□ 2.42
PDE4D-223ENST00000515011 CFAP53Q96M91 514 aa30.17■■■□□ 2.42
PDE4D-223ENST00000515011 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa30.17■■■□□ 2.42
PDE4D-223ENST00000515011 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP30.17■■■□□ 2.42
PDE4D-223ENST00000515011 DUSP27Q5VZP5 1158 aa30.16■■■□□ 2.42
PDE4D-223ENST00000515011 KIF20BQ96Q89 1820 aa30.14■■■□□ 2.42
PDE4D-223ENST00000515011 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa30.14■■■□□ 2.42
PDE4D-223ENST00000515011 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa30.14■■■□□ 2.41
PDE4D-223ENST00000515011 CABP1Q9NZU7 370 aa30.13■■■□□ 2.41
PDE4D-223ENST00000515011 SLFN5Q08AF3 891 aa30.12■■■□□ 2.41
PDE4D-223ENST00000515011 FYB1O15117 783 aa30.11■■■□□ 2.41
PDE4D-223ENST00000515011 IQSEC2Q5JU85 1478 aa30.11■■■□□ 2.41
PDE4D-223ENST00000515011 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP30.11■■■□□ 2.41
PDE4D-223ENST00000515011 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP30.1■■■□□ 2.41
PDE4D-223ENST00000515011 GGNBP2Q9H3C7 697 aa30.1■■■□□ 2.41
PDE4D-223ENST00000515011 WASLO00401 505 aaPredicted RBP30.1■■■□□ 2.41
PDE4D-223ENST00000515011 TXNDC2Q86VQ3 553 aa30.09■■■□□ 2.41
PDE4D-223ENST00000515011 SLIT1O75093 1534 aa30.08■■■□□ 2.41
PDE4D-223ENST00000515011 RUNDC1Q96C34 613 aa30.07■■■□□ 2.4
PDE4D-223ENST00000515011 ARHGAP23Q9P227 1491 aa30.07■■■□□ 2.4
PDE4D-223ENST00000515011 CCDC136Q96JN2 1154 aa30.07■■■□□ 2.4
PDE4D-223ENST00000515011 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP30.06■■■□□ 2.4
PDE4D-223ENST00000515011 LTKP29376 864 aa30.05■■■□□ 2.4
PDE4D-223ENST00000515011 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP30.04■■■□□ 2.4
PDE4D-223ENST00000515011 E9PSI1 815 aa30.03■■■□□ 2.4
PDE4D-223ENST00000515011 ADGRB2O60241 1585 aa30.03■■■□□ 2.4
PDE4D-223ENST00000515011 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa30.03■■■□□ 2.4
PDE4D-223ENST00000515011 EXOC6Q8TAG9 804 aa30.03■■■□□ 2.4
PDE4D-223ENST00000515011 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP30.02■■■□□ 2.4
PDE4D-223ENST00000515011 ROBO2Q9HCK4 1378 aa30.02■■■□□ 2.4
PDE4D-223ENST00000515011 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa30.01■■■□□ 2.39
PDE4D-223ENST00000515011 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP30■■■□□ 2.39
PDE4D-223ENST00000515011 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP29.99■■■□□ 2.39
PDE4D-223ENST00000515011 WWC1Q8IX03 1113 aa29.99■■■□□ 2.39
PDE4D-223ENST00000515011 EID1Q9Y6B2 187 aa29.99■■■□□ 2.39
PDE4D-223ENST00000515011 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP29.98■■■□□ 2.39
PDE4D-223ENST00000515011 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP29.98■■■□□ 2.39
PDE4D-223ENST00000515011 TCP11L2Q8N4U5 519 aa29.97■■■□□ 2.39
PDE4D-223ENST00000515011 MON2Q7Z3U7 1717 aa29.97■■■□□ 2.39
PDE4D-223ENST00000515011 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP29.97■■■□□ 2.39
PDE4D-223ENST00000515011 PLIN1O60240 522 aa29.96■■■□□ 2.39
PDE4D-223ENST00000515011 DMRT2Q9Y5R5 561 aa29.96■■■□□ 2.39
PDE4D-223ENST00000515011 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP29.95■■■□□ 2.38
PDE4D-223ENST00000515011 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP29.95■■■□□ 2.38
PDE4D-223ENST00000515011 PNPLA6Q8IY17 1366 aa29.95■■■□□ 2.38
PDE4D-223ENST00000515011 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP29.94■■■□□ 2.38
PDE4D-223ENST00000515011 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP29.94■■■□□ 2.38
PDE4D-223ENST00000515011 AKAP12Q02952 1782 aa29.94■■■□□ 2.38
PDE4D-223ENST00000515011 CCDC27Q2M243 656 aa29.94■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17 ms