RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514596.1

CTBP1-215, Transcript of C-terminal binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene CTBP1, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP1-215ENST00000514596 C1orf167Q5SNV9 1468 aa27.4■■□□□ 1.98
CTBP1-215ENST00000514596 ZRANB1Q9UGI0 708 aa27.4■■□□□ 1.98
CTBP1-215ENST00000514596 USP21Q9UK80 565 aa27.4■■□□□ 1.98
CTBP1-215ENST00000514596 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP27.4■■□□□ 1.98
CTBP1-215ENST00000514596 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa27.4■■□□□ 1.98
CTBP1-215ENST00000514596 PTCH1Q13635 1447 aa27.38■■□□□ 1.97
CTBP1-215ENST00000514596 IFT172Q9UG01 1749 aa27.37■■□□□ 1.97
CTBP1-215ENST00000514596 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP27.35■■□□□ 1.97
CTBP1-215ENST00000514596 EP400Q96L91 3159 aa27.34■■□□□ 1.97
CTBP1-215ENST00000514596 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP27.33■■□□□ 1.97
CTBP1-215ENST00000514596 ATRNO75882 1429 aa27.32■■□□□ 1.96
CTBP1-215ENST00000514596 VGFO15240 615 aaPredicted RBP27.31■■□□□ 1.96
CTBP1-215ENST00000514596 CCDC125Q86Z20 511 aa27.3■■□□□ 1.96
CTBP1-215ENST00000514596 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP27.3■■□□□ 1.96
CTBP1-215ENST00000514596 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP27.3■■□□□ 1.96
CTBP1-215ENST00000514596 ORAI2Q96SN7 254 aa27.29■■□□□ 1.96
CTBP1-215ENST00000514596 RGL3Q3MIN7 710 aa27.28■■□□□ 1.96
CTBP1-215ENST00000514596 MYOM2P54296 1465 aa27.26■■□□□ 1.95
CTBP1-215ENST00000514596 ROBO2Q9HCK4 1378 aa27.24■■□□□ 1.95
CTBP1-215ENST00000514596 PCGF6Q9BYE7 350 aa27.24■■□□□ 1.95
CTBP1-215ENST00000514596 PRAG1Q86YV5 1406 aa27.22■■□□□ 1.95
CTBP1-215ENST00000514596 NPHP3Q7Z494 1330 aa27.21■■□□□ 1.95
CTBP1-215ENST00000514596 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP27.2■■□□□ 1.94
CTBP1-215ENST00000514596 BCL9LQ86UU0 1499 aa27.19■■□□□ 1.94
CTBP1-215ENST00000514596 NRXN1Q9ULB1 1477 aa27.19■■□□□ 1.94
CTBP1-215ENST00000514596 PIK3C2GO75747 1445 aa27.19■■□□□ 1.94
CTBP1-215ENST00000514596 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa27.17■■□□□ 1.94
CTBP1-215ENST00000514596 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP27.16■■□□□ 1.94
CTBP1-215ENST00000514596 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa27.15■■□□□ 1.94
CTBP1-215ENST00000514596 ESCO1Q5FWF5 840 aa27.15■■□□□ 1.94
CTBP1-215ENST00000514596 STAC3Q96MF2 364 aa27.15■■□□□ 1.94
CTBP1-215ENST00000514596 PXDNQ92626 1479 aa27.14■■□□□ 1.94
CTBP1-215ENST00000514596 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP27.13■■□□□ 1.93
CTBP1-215ENST00000514596 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP27.12■■□□□ 1.93
CTBP1-215ENST00000514596 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP27.11■■□□□ 1.93
CTBP1-215ENST00000514596 FOXO3O43524 673 aa27.08■■□□□ 1.93
CTBP1-215ENST00000514596 DCAF11Q8TEB1 546 aa27.07■■□□□ 1.92
CTBP1-215ENST00000514596 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP27.06■■□□□ 1.92
CTBP1-215ENST00000514596 UNC5CLQ8IV45 518 aa27.06■■□□□ 1.92
CTBP1-215ENST00000514596 RALGAPBQ86X10 1494 aa27.06■■□□□ 1.92
CTBP1-215ENST00000514596 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP27.05■■□□□ 1.92
CTBP1-215ENST00000514596 GLI3P10071 1580 aa27.04■■□□□ 1.92
CTBP1-215ENST00000514596 SLIT2O94813 1529 aa27.03■■□□□ 1.92
CTBP1-215ENST00000514596 SIN3AQ96ST3 1273 aa27.03■■□□□ 1.92
CTBP1-215ENST00000514596 KNDC1Q76NI1 1749 aa27.02■■□□□ 1.92
CTBP1-215ENST00000514596 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP27.01■■□□□ 1.91
CTBP1-215ENST00000514596 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa27.01■■□□□ 1.91
CTBP1-215ENST00000514596 LRP5O75197 1615 aa27■■□□□ 1.91
CTBP1-215ENST00000514596 NEUROD1Q13562 356 aa26.99■■□□□ 1.91
CTBP1-215ENST00000514596 BRWD3Q6RI45 1802 aa26.99■■□□□ 1.91
CTBP1-215ENST00000514596 TECPR2O15040 1411 aa26.99■■□□□ 1.91
CTBP1-215ENST00000514596 USP32Q8NFA0 1604 aa26.98■■□□□ 1.91
CTBP1-215ENST00000514596 DEFB132Q7Z7B7 95 aa26.98■■□□□ 1.91
CTBP1-215ENST00000514596 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa26.98■■□□□ 1.91
CTBP1-215ENST00000514596 KIF1AQ12756 1690 aa26.97■■□□□ 1.91
CTBP1-215ENST00000514596 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa26.96■■□□□ 1.91
CTBP1-215ENST00000514596 CLSPNQ9HAW4 1339 aa26.96■■□□□ 1.91
CTBP1-215ENST00000514596 NUTM2FA1L443 756 aa26.96■■□□□ 1.91
CTBP1-215ENST00000514596 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP26.96■■□□□ 1.91
CTBP1-215ENST00000514596 ADGRB1O14514 1584 aa26.96■■□□□ 1.91
CTBP1-215ENST00000514596 CFAP70Q5T0N1 1121 aa26.95■■□□□ 1.9
CTBP1-215ENST00000514596 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP26.94■■□□□ 1.9
CTBP1-215ENST00000514596 SEPT12Q8IYM1 358 aa26.94■■□□□ 1.9
CTBP1-215ENST00000514596 L3MBTL2Q969R5 705 aa26.94■■□□□ 1.9
CTBP1-215ENST00000514596 ABCC11Q96J66 1382 aa26.94■■□□□ 1.9
CTBP1-215ENST00000514596 STK26Q9P289 416 aa26.92■■□□□ 1.9
CTBP1-215ENST00000514596 FMN2Q9NZ56 1722 aa26.92■■□□□ 1.9
CTBP1-215ENST00000514596 TONSLQ96HA7 1378 aa26.92■■□□□ 1.9
CTBP1-215ENST00000514596 VPS72Q15906 364 aa26.91■■□□□ 1.9
CTBP1-215ENST00000514596 TMEM132EQ6IEE7 984 aa26.91■■□□□ 1.9
CTBP1-215ENST00000514596 WAPLQ7Z5K2 1190 aa26.91■■□□□ 1.9
CTBP1-215ENST00000514596 NWD2Q9ULI1 1742 aa26.9■■□□□ 1.9
CTBP1-215ENST00000514596 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP26.89■■□□□ 1.9
CTBP1-215ENST00000514596 DLC1Q96QB1 1528 aa26.89■■□□□ 1.89
CTBP1-215ENST00000514596 KRT28Q7Z3Y7 464 aa26.88■■□□□ 1.89
CTBP1-215ENST00000514596 KRT27Q7Z3Y8 459 aa26.88■■□□□ 1.89
CTBP1-215ENST00000514596 PLCH1Q4KWH8 1693 aa26.88■■□□□ 1.89
CTBP1-215ENST00000514596 TNS3Q68CZ2 1445 aa26.87■■□□□ 1.89
CTBP1-215ENST00000514596 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP26.85■■□□□ 1.89
CTBP1-215ENST00000514596 BAG6P46379 1132 aa26.85■■□□□ 1.89
CTBP1-215ENST00000514596 PSME1Q06323 249 aa26.85■■□□□ 1.89
CTBP1-215ENST00000514596 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa26.84■■□□□ 1.89
CTBP1-215ENST00000514596 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa26.84■■□□□ 1.89
CTBP1-215ENST00000514596 SIRT1Q96EB6 747 aa26.82■■□□□ 1.88
CTBP1-215ENST00000514596 A0A0G2JS52 829 aa26.81■■□□□ 1.88
CTBP1-215ENST00000514596 MYT1Q01538 1121 aa26.81■■□□□ 1.88
CTBP1-215ENST00000514596 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP26.8■■□□□ 1.88
CTBP1-215ENST00000514596 ABCA3Q99758 1704 aa26.8■■□□□ 1.88
CTBP1-215ENST00000514596 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP26.8■■□□□ 1.88
CTBP1-215ENST00000514596 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP26.8■■□□□ 1.88
CTBP1-215ENST00000514596 CABLES1Q8TDN4 633 aa26.8■■□□□ 1.88
CTBP1-215ENST00000514596 PHF8Q9UPP1 1060 aa26.8■■□□□ 1.88
CTBP1-215ENST00000514596 ARHGEF10O15013 1369 aa26.8■■□□□ 1.88
CTBP1-215ENST00000514596 SBNO1A3KN83 1393 aa26.78■■□□□ 1.88
CTBP1-215ENST00000514596 PLEKHG5O94827 1062 aa26.77■■□□□ 1.88
CTBP1-215ENST00000514596 LMOD2Q6P5Q4 547 aa26.77■■□□□ 1.88
CTBP1-215ENST00000514596 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP26.76■■□□□ 1.88
CTBP1-215ENST00000514596 TRAK1Q9UPV9 953 aa26.74■■□□□ 1.87
CTBP1-215ENST00000514596 RGPD1P0DJD0 1748 aa26.73■■□□□ 1.87
CTBP1-215ENST00000514596 ADGRB2O60241 1585 aa26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.2 ms