RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514472.1

FGFR4-216, Transcript of fibroblast growth factor receptor 4, human

TSL 4

Gene FGFR4, Length 552 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FGFR4-216	ENST00000514472	ACIN1	Q9UKV3	1341 aa	Known RBP	33.19	■■■□□ 2.9
FGFR4-216	ENST00000514472	PIK3C2G	O75747	1445 aa		33.19	■■■□□ 2.9
FGFR4-216	ENST00000514472	LRPPRC	P42704	1394 aa	Known RBP	33.18	■■■□□ 2.9
FGFR4-216	ENST00000514472	ABCC11	Q96J66	1382 aa		33.16	■■■□□ 2.9
FGFR4-216	ENST00000514472	CDK12	Q9NYV4	1490 aa	Predicted RBP	33.16	■■■□□ 2.9
FGFR4-216	ENST00000514472	C8orf37	Q96NL8	207 aa		33.15	■■■□□ 2.9
FGFR4-216	ENST00000514472	WAPL	Q7Z5K2	1190 aa		33.14	■■■□□ 2.9
FGFR4-216	ENST00000514472	STK26	Q9P289	416 aa		33.14	■■■□□ 2.9
FGFR4-216	ENST00000514472	TMEM132E	Q6IEE7	984 aa		33.13	■■■□□ 2.89
FGFR4-216	ENST00000514472	COL22A1	Q8NFW1	1626 aa	Predicted RBP	33.11	■■■□□ 2.89
FGFR4-216	ENST00000514472	ESCO1	Q5FWF5	840 aa		33.09	■■■□□ 2.89
FGFR4-216	ENST00000514472	UPF1	Q92900	1129 aa	Known RBP eCLIP	33.09	■■■□□ 2.89	8e-11	■■■□□ 18.7
FGFR4-216	ENST00000514472	PLEKHH1	Q9ULM0	1364 aa		33.09	■■■□□ 2.89
FGFR4-216	ENST00000514472	ADAMTS2	O95450	1211 aa		33.08	■■■□□ 2.89
FGFR4-216	ENST00000514472	QTRT2	Q9H974	415 aa	Known RBP	33.08	■■■□□ 2.89
FGFR4-216	ENST00000514472	YTHDC2	Q9H6S0	1430 aa	Known RBP	33.08	■■■□□ 2.89
FGFR4-216	ENST00000514472	NRXN1	Q9ULB1	1477 aa		33.07	■■■□□ 2.88
FGFR4-216	ENST00000514472	PXDN	Q92626	1479 aa		33.06	■■■□□ 2.88
FGFR4-216	ENST00000514472	NPHP3	Q7Z494	1330 aa		33.06	■■■□□ 2.88
FGFR4-216	ENST00000514472	FMN2	Q9NZ56	1722 aa		33.05	■■■□□ 2.88
FGFR4-216	ENST00000514472	NGLY1	Q96IV0	654 aa		33.05	■■■□□ 2.88
FGFR4-216	ENST00000514472	C14orf93	Q9H972	538 aa	Known RBP	33.05	■■■□□ 2.88
FGFR4-216	ENST00000514472	RAB3GAP2	Q9H2M9	1393 aa		33.04	■■■□□ 2.88
FGFR4-216	ENST00000514472	RBM6	P78332	1123 aa	Known RBP	33.03	■■■□□ 2.88
FGFR4-216	ENST00000514472	SIRT1	Q96EB6	747 aa		33.03	■■■□□ 2.88
FGFR4-216	ENST00000514472	MYOM2	P54296	1465 aa		33.03	■■■□□ 2.88
FGFR4-216	ENST00000514472	FOXO3	O43524	673 aa		33.02	■■■□□ 2.88
FGFR4-216	ENST00000514472	NUTM2F	A1L443	756 aa		33	■■■□□ 2.87
FGFR4-216	ENST00000514472	MARF1	Q9Y4F3	1742 aa	Known RBP	32.99	■■■□□ 2.87
FGFR4-216	ENST00000514472	RGPD8	O14715	1765 aa	Predicted RBP	32.99	■■■□□ 2.87
FGFR4-216	ENST00000514472	RGS12	O14924	1447 aa		32.99	■■■□□ 2.87
FGFR4-216	ENST00000514472	CFAP70	Q5T0N1	1121 aa		32.98	■■■□□ 2.87
FGFR4-216	ENST00000514472	FNBP4	Q8N3X1	1017 aa	Predicted RBP	32.97	■■■□□ 2.87
FGFR4-216	ENST00000514472	XPC	Q01831	940 aa	Predicted RBP	32.96	■■■□□ 2.87
FGFR4-216	ENST00000514472	KIF1A	Q12756	1690 aa		32.95	■■■□□ 2.87
FGFR4-216	ENST00000514472	USP21	Q9UK80	565 aa		32.95	■■■□□ 2.87
FGFR4-216	ENST00000514472	DHX57	Q6P158	1386 aa	Known RBP	32.95	■■■□□ 2.86
FGFR4-216	ENST00000514472	TRPC5	Q9UL62	973 aa	Predicted RBP	32.9	■■■□□ 2.86
FGFR4-216	ENST00000514472	ATRN	O75882	1429 aa		32.87	■■■□□ 2.85
FGFR4-216	ENST00000514472	DLC1	Q96QB1	1528 aa		32.87	■■■□□ 2.85
FGFR4-216	ENST00000514472	SPATA31A3	Q5VYP0	1347 aa		32.86	■■■□□ 2.85
FGFR4-216	ENST00000514472	BCL9L	Q86UU0	1499 aa		32.85	■■■□□ 2.85
FGFR4-216	ENST00000514472	ADGRB1	O14514	1584 aa		32.84	■■■□□ 2.85
FGFR4-216	ENST00000514472	PRAM1	Q96QH2	718 aa		32.84	■■■□□ 2.85
FGFR4-216	ENST00000514472	KRT28	Q7Z3Y7	464 aa		32.83	■■■□□ 2.85
FGFR4-216	ENST00000514472	HRC	P23327	699 aa		32.81	■■■□□ 2.84
FGFR4-216	ENST00000514472	SAFB2	Q14151	953 aa	Known RBP eCLIP	32.81	■■■□□ 2.84
FGFR4-216	ENST00000514472	PHF8	Q9UPP1	1060 aa		32.81	■■■□□ 2.84
FGFR4-216	ENST00000514472	TNKS1BP1	Q9C0C2	1729 aa	Known RBP	32.8	■■■□□ 2.84
FGFR4-216	ENST00000514472	USP32	Q8NFA0	1604 aa		32.79	■■■□□ 2.84
FGFR4-216	ENST00000514472	EP400	Q96L91	3159 aa		32.78	■■■□□ 2.84
FGFR4-216	ENST00000514472	ADGRB2	O60241	1585 aa		32.78	■■■□□ 2.84
FGFR4-216	ENST00000514472	POGK	Q9P215	609 aa		32.76	■■■□□ 2.83
FGFR4-216	ENST00000514472	PSME1	Q06323	249 aa		32.74	■■■□□ 2.83
FGFR4-216	ENST00000514472	DCAF11	Q8TEB1	546 aa		32.74	■■■□□ 2.83
FGFR4-216	ENST00000514472	TNS3	Q68CZ2	1445 aa		32.74	■■■□□ 2.83
FGFR4-216	ENST00000514472	SLIT2	O94813	1529 aa		32.73	■■■□□ 2.83
FGFR4-216	ENST00000514472	TRAK1	Q9UPV9	953 aa		32.73	■■■□□ 2.83
FGFR4-216	ENST00000514472	KDM2A	Q9Y2K7	1162 aa		32.73	■■■□□ 2.83
FGFR4-216	ENST00000514472	ANKAR	Q7Z5J8	1434 aa		32.73	■■■□□ 2.83
FGFR4-216	ENST00000514472	ATAD2	Q6PL18	1390 aa		32.72	■■■□□ 2.83
FGFR4-216	ENST00000514472	STAC3	Q96MF2	364 aa		32.72	■■■□□ 2.83
FGFR4-216	ENST00000514472	SBNO1	A3KN83	1393 aa		32.71	■■■□□ 2.83
FGFR4-216	ENST00000514472	GJD4	Q96KN9	370 aa	Predicted RBP	32.71	■■■□□ 2.83
FGFR4-216	ENST00000514472	ABCA3	Q99758	1704 aa		32.7	■■■□□ 2.83
FGFR4-216	ENST00000514472	UNC5CL	Q8IV45	518 aa		32.68	■■■□□ 2.82
FGFR4-216	ENST00000514472	PMFBP1	Q8TBY8	1022 aa		32.66	■■■□□ 2.82
FGFR4-216	ENST00000514472	HIRIP3	Q9BW71	556 aa	Predicted RBP	32.66	■■■□□ 2.82
FGFR4-216	ENST00000514472	GLI3	P10071	1580 aa		32.66	■■■□□ 2.82
FGFR4-216	ENST00000514472	TRPM3	Q9HCF6	1732 aa	Predicted RBP	32.65	■■■□□ 2.82
FGFR4-216	ENST00000514472	CABLES1	Q8TDN4	633 aa		32.65	■■■□□ 2.82
FGFR4-216	ENST00000514472	ARHGEF10	O15013	1369 aa		32.64	■■■□□ 2.82
FGFR4-216	ENST00000514472	MINK1	Q8N4C8	1332 aa	Predicted RBP	32.64	■■■□□ 2.82
FGFR4-216	ENST00000514472	NWD2	Q9ULI1	1742 aa		32.63	■■■□□ 2.81
FGFR4-216	ENST00000514472	ARHGEF28	Q8N1W1	1705 aa	Known RBP	32.63	■■■□□ 2.81
FGFR4-216	ENST00000514472	PLCH1	Q4KWH8	1693 aa		32.62	■■■□□ 2.81
FGFR4-216	ENST00000514472	RALGAPB	Q86X10	1494 aa		32.62	■■■□□ 2.81
FGFR4-216	ENST00000514472	TULP4	Q9NRJ4	1543 aa		32.61	■■■□□ 2.81
FGFR4-216	ENST00000514472	PRR36	Q9H6K5	1346 aa		32.61	■■■□□ 2.81
FGFR4-216	ENST00000514472	ALS2	Q96Q42	1657 aa		32.6	■■■□□ 2.81
FGFR4-216	ENST00000514472	WASL	O00401	505 aa	Predicted RBP	32.6	■■■□□ 2.81
FGFR4-216	ENST00000514472	EIF3A	Q14152	1382 aa	Known RBP	32.59	■■■□□ 2.81
FGFR4-216	ENST00000514472	BRWD3	Q6RI45	1802 aa		32.59	■■■□□ 2.81
FGFR4-216	ENST00000514472	HAP1	P54257	671 aa	Predicted RBP	32.59	■■■□□ 2.81
FGFR4-216	ENST00000514472	LMOD2	Q6P5Q4	547 aa		32.59	■■■□□ 2.81
FGFR4-216	ENST00000514472	PLEKHG5	O94827	1062 aa		32.55	■■■□□ 2.8
FGFR4-216	ENST00000514472	SRCAP	Q6ZRS2	3230 aa		32.54	■■■□□ 2.8
FGFR4-216	ENST00000514472	VPS72	Q15906	364 aa		32.53	■■■□□ 2.8
FGFR4-216	ENST00000514472	GPRASP1	Q5JY77	1395 aa		32.53	■■■□□ 2.8
FGFR4-216	ENST00000514472	ITSN1	Q15811	1721 aa		32.52	■■■□□ 2.8
FGFR4-216	ENST00000514472	KIAA1210	Q9ULL0	1709 aa		32.52	■■■□□ 2.8
FGFR4-216	ENST00000514472	FAM83G	A6ND36	823 aa		32.51	■■■□□ 2.79
FGFR4-216	ENST00000514472	CCDC125	Q86Z20	511 aa		32.51	■■■□□ 2.79
FGFR4-216	ENST00000514472	CRYBG1	Q9Y4K1	1723 aa		32.5	■■■□□ 2.79
FGFR4-216	ENST00000514472	NRAP	Q86VF7	1730 aa		32.48	■■■□□ 2.79
FGFR4-216	ENST00000514472	ATP7B	P35670	1465 aa		32.48	■■■□□ 2.79
FGFR4-216	ENST00000514472	ONECUT3	O60422	494 aa	Predicted RBP	32.47	■■■□□ 2.79
FGFR4-216	ENST00000514472	NGDN	Q8NEJ9	315 aa	Known RBP	32.46	■■■□□ 2.79
FGFR4-216	ENST00000514472	SEPT12	Q8IYM1	358 aa		32.45	■■■□□ 2.79
FGFR4-216	ENST00000514472	COL14A1	Q05707	1796 aa	Known RBP	32.45	■■■□□ 2.78

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