RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512427.5

HOXC-AS1-202, HOXC cluster antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5

Gene HOXC-AS1, Length 290 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS1-202ENST00000512427 CCDC125Q86Z20 511 aa13.96□□□□□ -0.17
HOXC-AS1-202ENST00000512427 ZRANB1Q9UGI0 708 aa13.96□□□□□ -0.17
HOXC-AS1-202ENST00000512427 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP13.96□□□□□ -0.17
HOXC-AS1-202ENST00000512427 ATRNO75882 1429 aa13.96□□□□□ -0.18
HOXC-AS1-202ENST00000512427 ESCO1Q5FWF5 840 aa13.95□□□□□ -0.18
HOXC-AS1-202ENST00000512427 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa13.95□□□□□ -0.18
HOXC-AS1-202ENST00000512427 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP13.94□□□□□ -0.18
HOXC-AS1-202ENST00000512427 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP13.94□□□□□ -0.18
HOXC-AS1-202ENST00000512427 MYOM2P54296 1465 aa13.93□□□□□ -0.18
HOXC-AS1-202ENST00000512427 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP13.93□□□□□ -0.18
HOXC-AS1-202ENST00000512427 PPLO60437 1756 aa13.91□□□□□ -0.18
HOXC-AS1-202ENST00000512427 FOXO3O43524 673 aa13.9□□□□□ -0.18
HOXC-AS1-202ENST00000512427 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP13.9□□□□□ -0.18
HOXC-AS1-202ENST00000512427 PXDNQ92626 1479 aa13.9□□□□□ -0.18
HOXC-AS1-202ENST00000512427 BCL9LQ86UU0 1499 aa13.89□□□□□ -0.19
HOXC-AS1-202ENST00000512427 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP13.89□□□□□ -0.19
HOXC-AS1-202ENST00000512427 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa13.88□□□□□ -0.19
HOXC-AS1-202ENST00000512427 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa13.88□□□□□ -0.19
HOXC-AS1-202ENST00000512427 CCDC144AA2RUR9 1427 aa13.88□□□□□ -0.19
HOXC-AS1-202ENST00000512427 TECPR2O15040 1411 aa13.88□□□□□ -0.19
HOXC-AS1-202ENST00000512427 EP400Q96L91 3159 aa13.87□□□□□ -0.19
HOXC-AS1-202ENST00000512427 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP13.87□□□□□ -0.19
HOXC-AS1-202ENST00000512427 STK26Q9P289 416 aa13.87□□□□□ -0.19
HOXC-AS1-202ENST00000512427 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP13.86□□□□□ -0.19
HOXC-AS1-202ENST00000512427 UNC5CLQ8IV45 518 aa13.86□□□□□ -0.19
HOXC-AS1-202ENST00000512427 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP13.86□□□□□ -0.19
HOXC-AS1-202ENST00000512427 KIF1AQ12756 1690 aa13.85□□□□□ -0.19
HOXC-AS1-202ENST00000512427 ABCC11Q96J66 1382 aa13.85□□□□□ -0.19
HOXC-AS1-202ENST00000512427 NUTM2FA1L443 756 aa13.85□□□□□ -0.19
HOXC-AS1-202ENST00000512427 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP13.85□□□□□ -0.19
HOXC-AS1-202ENST00000512427 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa13.85□□□□□ -0.19
HOXC-AS1-202ENST00000512427 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa13.85□□□□□ -0.19
HOXC-AS1-202ENST00000512427 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP13.84□□□□□ -0.19
HOXC-AS1-202ENST00000512427 RGL3Q3MIN7 710 aa13.84□□□□□ -0.19
HOXC-AS1-202ENST00000512427 WAPLQ7Z5K2 1190 aa13.84□□□□□ -0.19
HOXC-AS1-202ENST00000512427 KNDC1Q76NI1 1749 aa13.84□□□□□ -0.19
HOXC-AS1-202ENST00000512427 RALGAPBQ86X10 1494 aa13.83□□□□□ -0.2
HOXC-AS1-202ENST00000512427 PSME1Q06323 249 aa13.83□□□□□ -0.2
HOXC-AS1-202ENST00000512427 SLIT2O94813 1529 aa13.83□□□□□ -0.2
HOXC-AS1-202ENST00000512427 KRT28Q7Z3Y7 464 aa13.82□□□□□ -0.2
HOXC-AS1-202ENST00000512427 USP32Q8NFA0 1604 aa13.82□□□□□ -0.2
HOXC-AS1-202ENST00000512427 FMN2Q9NZ56 1722 aa13.81□□□□□ -0.2
HOXC-AS1-202ENST00000512427 SIRT1Q96EB6 747 aa13.81□□□□□ -0.2
HOXC-AS1-202ENST00000512427 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP13.81□□□□□ -0.2
HOXC-AS1-202ENST00000512427 PIK3C2GO75747 1445 aa13.81□□□□□ -0.2
HOXC-AS1-202ENST00000512427 TNS3Q68CZ2 1445 aa13.81□□□□□ -0.2
HOXC-AS1-202ENST00000512427 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa13.81□□□□□ -0.2
HOXC-AS1-202ENST00000512427 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP13.81□□□□□ -0.2
HOXC-AS1-202ENST00000512427 GLI3P10071 1580 aa13.8□□□□□ -0.2
HOXC-AS1-202ENST00000512427 TMEM132EQ6IEE7 984 aa13.8□□□□□ -0.2
HOXC-AS1-202ENST00000512427 PHF8Q9UPP1 1060 aa13.8□□□□□ -0.2
HOXC-AS1-202ENST00000512427 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP13.8□□□□□ -0.2
HOXC-AS1-202ENST00000512427 ARHGEF10O15013 1369 aa13.8□□□□□ -0.2
HOXC-AS1-202ENST00000512427 IFT172Q9UG01 1749 aa13.79□□□□□ -0.2
HOXC-AS1-202ENST00000512427 VPS72Q15906 364 aa13.79□□□□□ -0.2
HOXC-AS1-202ENST00000512427 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa13.79□□□□□ -0.2
HOXC-AS1-202ENST00000512427 SEPT12Q8IYM1 358 aa13.78□□□□□ -0.2
HOXC-AS1-202ENST00000512427 SBNO1A3KN83 1393 aa13.78□□□□□ -0.2
HOXC-AS1-202ENST00000512427 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP13.78□□□□□ -0.2
HOXC-AS1-202ENST00000512427 LMOD2Q6P5Q4 547 aa13.77□□□□□ -0.21
HOXC-AS1-202ENST00000512427 MPHOSPH9Q99550 1183 aa13.77□□□□□ -0.21
HOXC-AS1-202ENST00000512427 NWD2Q9ULI1 1742 aa13.76□□□□□ -0.21
HOXC-AS1-202ENST00000512427 KRT27Q7Z3Y8 459 aa13.76□□□□□ -0.21
HOXC-AS1-202ENST00000512427 NRXN1Q9ULB1 1477 aa13.75□□□□□ -0.21
HOXC-AS1-202ENST00000512427 A0A0G2JS52 829 aa13.75□□□□□ -0.21
HOXC-AS1-202ENST00000512427 BAG6P46379 1132 aa13.75□□□□□ -0.21
HOXC-AS1-202ENST00000512427 MYT1Q01538 1121 aa13.75□□□□□ -0.21
HOXC-AS1-202ENST00000512427 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP13.75□□□□□ -0.21
HOXC-AS1-202ENST00000512427 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP13.74□□□□□ -0.21
HOXC-AS1-202ENST00000512427 DEFB132Q7Z7B7 95 aa13.74□□□□□ -0.21
HOXC-AS1-202ENST00000512427 ANKARQ7Z5J8 1434 aa13.73□□□□□ -0.21
HOXC-AS1-202ENST00000512427 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP13.73□□□□□ -0.21
HOXC-AS1-202ENST00000512427 PLCH1Q4KWH8 1693 aa13.73□□□□□ -0.21
HOXC-AS1-202ENST00000512427 CABLES1Q8TDN4 633 aa13.73□□□□□ -0.21
HOXC-AS1-202ENST00000512427 POGKQ9P215 609 aa13.73□□□□□ -0.21
HOXC-AS1-202ENST00000512427 BRWD3Q6RI45 1802 aa13.73□□□□□ -0.21
HOXC-AS1-202ENST00000512427 PLEKHG5O94827 1062 aa13.72□□□□□ -0.21
HOXC-AS1-202ENST00000512427 PRAM1Q96QH2 718 aa13.72□□□□□ -0.21
HOXC-AS1-202ENST00000512427 GPRASP1Q5JY77 1395 aa13.71□□□□□ -0.21
HOXC-AS1-202ENST00000512427 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP13.71□□□□□ -0.21
HOXC-AS1-202ENST00000512427 CFAP70Q5T0N1 1121 aa13.71□□□□□ -0.21
HOXC-AS1-202ENST00000512427 LRP5O75197 1615 aa13.71□□□□□ -0.22
HOXC-AS1-202ENST00000512427 ABCA3Q99758 1704 aa13.7□□□□□ -0.22
HOXC-AS1-202ENST00000512427 DLC1Q96QB1 1528 aa13.7□□□□□ -0.22
HOXC-AS1-202ENST00000512427 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP13.7□□□□□ -0.22
HOXC-AS1-202ENST00000512427 FAM83GA6ND36 823 aa13.69□□□□□ -0.22
HOXC-AS1-202ENST00000512427 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa13.69□□□□□ -0.22
HOXC-AS1-202ENST00000512427 ADGRB2O60241 1585 aa13.68□□□□□ -0.22
HOXC-AS1-202ENST00000512427 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP13.68□□□□□ -0.22
HOXC-AS1-202ENST00000512427 BTG4Q9NY30 223 aa13.68□□□□□ -0.22
HOXC-AS1-202ENST00000512427 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP13.67□□□□□ -0.22
HOXC-AS1-202ENST00000512427 NRAPQ86VF7 1730 aa13.65□□□□□ -0.22
HOXC-AS1-202ENST00000512427 TULP4Q9NRJ4 1543 aa13.64□□□□□ -0.23
HOXC-AS1-202ENST00000512427 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP13.64□□□□□ -0.23
HOXC-AS1-202ENST00000512427 HRCP23327 699 aa13.64□□□□□ -0.23
HOXC-AS1-202ENST00000512427 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP13.64□□□□□ -0.23
HOXC-AS1-202ENST00000512427 PRDM11Q9NQV5 511 aa13.64□□□□□ -0.23
HOXC-AS1-202ENST00000512427 TRAK1Q9UPV9 953 aa13.64□□□□□ -0.23
HOXC-AS1-202ENST00000512427 RGPD1P0DJD0 1748 aa13.64□□□□□ -0.23
HOXC-AS1-202ENST00000512427 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.6 ms