RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511412.1

ALYREF-203, Transcript of Aly/REF export factor, humanhuman

TSL 3

Gene ALYREF, Length 533 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREF-203ENST00000511412 ORAI2Q96SN7 254 aa36.49■■■■□ 3.43
ALYREF-203ENST00000511412 STK26Q9P289 416 aa36.49■■■■□ 3.43
ALYREF-203ENST00000511412 MYOM2P54296 1465 aa36.49■■■■□ 3.43
ALYREF-203ENST00000511412 ABCC11Q96J66 1382 aa36.47■■■■□ 3.43
ALYREF-203ENST00000511412 NRXN1Q9ULB1 1477 aa36.46■■■■□ 3.43
ALYREF-203ENST00000511412 TMEM132EQ6IEE7 984 aa36.45■■■■□ 3.43
ALYREF-203ENST00000511412 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP36.44■■■■□ 3.42
ALYREF-203ENST00000511412 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP36.43■■■■□ 3.42
ALYREF-203ENST00000511412 WAPLQ7Z5K2 1190 aa36.41■■■■□ 3.42
ALYREF-203ENST00000511412 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa36.4■■■■□ 3.42
ALYREF-203ENST00000511412 AFF2P51816 1311 aa36.37■■■■□ 3.41
ALYREF-203ENST00000511412 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP36.37■■■■□ 3.41
ALYREF-203ENST00000511412 FMN2Q9NZ56 1722 aa36.37■■■■□ 3.41
ALYREF-203ENST00000511412 ESCO1Q5FWF5 840 aa36.36■■■■□ 3.41
ALYREF-203ENST00000511412 NPHP3Q7Z494 1330 aa36.34■■■■□ 3.41
ALYREF-203ENST00000511412 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP36.34■■■■□ 3.41
ALYREF-203ENST00000511412 C8orf37Q96NL8 207 aa36.33■■■■□ 3.41
ALYREF-203ENST00000511412 CFAP70Q5T0N1 1121 aa36.32■■■■□ 3.4
ALYREF-203ENST00000511412 PXDNQ92626 1479 aa36.31■■■■□ 3.4
ALYREF-203ENST00000511412 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP36.31■■■■□ 3.4
ALYREF-203ENST00000511412 KIF1AQ12756 1690 aa36.29■■■■□ 3.4
ALYREF-203ENST00000511412 RXRBP28702 533 aa36.29■■■■□ 3.4
ALYREF-203ENST00000511412 SIRT1Q96EB6 747 aa36.29■■■■□ 3.4
ALYREF-203ENST00000511412 NUTM2FA1L443 756 aa36.28■■■■□ 3.4
ALYREF-203ENST00000511412 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP36.27■■■■□ 3.4
ALYREF-203ENST00000511412 ADAMTS2O95450 1211 aa36.26■■■■□ 3.4
ALYREF-203ENST00000511412 HRCP23327 699 aa36.25■■■■□ 3.39
ALYREF-203ENST00000511412 DLC1Q96QB1 1528 aa36.24■■■■□ 3.39
ALYREF-203ENST00000511412 FOXO3O43524 673 aa36.23■■■■□ 3.39
ALYREF-203ENST00000511412 ADGRB1O14514 1584 aa36.22■■■■□ 3.39
ALYREF-203ENST00000511412 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP36.2■■■■□ 3.39
ALYREF-203ENST00000511412 NGLY1Q96IV0 654 aa36.2■■■■□ 3.39
ALYREF-203ENST00000511412 PRAM1Q96QH2 718 aa36.18■■■■□ 3.38
ALYREF-203ENST00000511412 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP36.17■■■■□ 3.38
ALYREF-203ENST00000511412 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP36.16■■■■□ 3.38
ALYREF-203ENST00000511412 ADGRB2O60241 1585 aa36.15■■■■□ 3.38
ALYREF-203ENST00000511412 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP36.15■■■■□ 3.38
ALYREF-203ENST00000511412 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP36.14■■■■□ 3.38
ALYREF-203ENST00000511412 DCAF11Q8TEB1 546 aa36.14■■■■□ 3.38
ALYREF-203ENST00000511412 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP36.13■■■■□ 3.37
ALYREF-203ENST00000511412 RGS12O14924 1447 aa36.13■■■■□ 3.37
ALYREF-203ENST00000511412 POGKQ9P215 609 aa36.12■■■■□ 3.37
ALYREF-203ENST00000511412 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa36.12■■■■□ 3.37
ALYREF-203ENST00000511412 STAC3Q96MF2 364 aa36.1■■■■□ 3.37
ALYREF-203ENST00000511412 USP21Q9UK80 565 aa36.1■■■■□ 3.37
ALYREF-203ENST00000511412 PHF8Q9UPP1 1060 aa36.07■■■■□ 3.36
ALYREF-203ENST00000511412 ANKARQ7Z5J8 1434 aa36.07■■■■□ 3.36
ALYREF-203ENST00000511412 USP32Q8NFA0 1604 aa36.06■■■■□ 3.36
ALYREF-203ENST00000511412 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP36.06■■■■□ 3.36
ALYREF-203ENST00000511412 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP36.06■■■■□ 3.36
ALYREF-203ENST00000511412 TRAK1Q9UPV9 953 aa36.06■■■■□ 3.36
ALYREF-203ENST00000511412 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa36.06■■■■□ 3.36
ALYREF-203ENST00000511412 KRT28Q7Z3Y7 464 aa36.04■■■■□ 3.36
ALYREF-203ENST00000511412 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP36.04■■■■□ 3.36
ALYREF-203ENST00000511412 TNS3Q68CZ2 1445 aa36.03■■■■□ 3.36
ALYREF-203ENST00000511412 ATRNO75882 1429 aa36.02■■■■□ 3.36
ALYREF-203ENST00000511412 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP36■■■■□ 3.35
ALYREF-203ENST00000511412 PSME1Q06323 249 aa35.98■■■■□ 3.35
ALYREF-203ENST00000511412 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP35.98■■■■□ 3.35
ALYREF-203ENST00000511412 TULP4Q9NRJ4 1543 aa35.97■■■■□ 3.35
ALYREF-203ENST00000511412 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP35.97■■■■□ 3.35
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ALYREF-203ENST00000511412 BCL9LQ86UU0 1499 aa35.96■■■■□ 3.35
ALYREF-203ENST00000511412 SBNO1A3KN83 1393 aa35.95■■■■□ 3.35
ALYREF-203ENST00000511412 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP35.95■■■■□ 3.35
ALYREF-203ENST00000511412 ABCA3Q99758 1704 aa35.94■■■■□ 3.34
ALYREF-203ENST00000511412 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa35.91■■■■□ 3.34
ALYREF-203ENST00000511412 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa35.91■■■■□ 3.34
ALYREF-203ENST00000511412 ARHGEF10O15013 1369 aa35.9■■■■□ 3.34
ALYREF-203ENST00000511412 SLIT2O94813 1529 aa35.89■■■■□ 3.34
ALYREF-203ENST00000511412 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP35.88■■■■□ 3.34
ALYREF-203ENST00000511412 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP35.88■■■■□ 3.33
ALYREF-203ENST00000511412 WASLO00401 505 aaPredicted RBP35.87■■■■□ 3.33
ALYREF-203ENST00000511412 PRR36Q9H6K5 1346 aa35.86■■■■□ 3.33
ALYREF-203ENST00000511412 ITSN1Q15811 1721 aa35.86■■■■□ 3.33
ALYREF-203ENST00000511412 LMOD2Q6P5Q4 547 aa35.85■■■■□ 3.33
ALYREF-203ENST00000511412 ATAD2Q6PL18 1390 aa35.85■■■■□ 3.33
ALYREF-203ENST00000511412 PLCH1Q4KWH8 1693 aa35.84■■■■□ 3.33
ALYREF-203ENST00000511412 ALS2Q96Q42 1657 aa35.82■■■■□ 3.33
ALYREF-203ENST00000511412 GPRASP1Q5JY77 1395 aa35.82■■■■□ 3.32
ALYREF-203ENST00000511412 CABLES1Q8TDN4 633 aa35.82■■■■□ 3.32
ALYREF-203ENST00000511412 UNC5CLQ8IV45 518 aa35.81■■■■□ 3.32
ALYREF-203ENST00000511412 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP35.81■■■■□ 3.32
ALYREF-203ENST00000511412 NWD2Q9ULI1 1742 aa35.8■■■■□ 3.32
ALYREF-203ENST00000511412 PLEKHG5O94827 1062 aa35.8■■■■□ 3.32
ALYREF-203ENST00000511412 ATP7BP35670 1465 aa35.8■■■■□ 3.32
ALYREF-203ENST00000511412 GLI3P10071 1580 aa35.79■■■■□ 3.32
ALYREF-203ENST00000511412 RALGAPBQ86X10 1494 aa35.77■■■■□ 3.32
ALYREF-203ENST00000511412 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP35.73■■■■□ 3.31
ALYREF-203ENST00000511412 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa35.72■■■■□ 3.31
ALYREF-203ENST00000511412 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa35.7■■■■□ 3.31
ALYREF-203ENST00000511412 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP35.69■■■■□ 3.3
ALYREF-203ENST00000511412 NBPF1Q3BBV0 1214 aa35.67■■■■□ 3.3
ALYREF-203ENST00000511412 NRAPQ86VF7 1730 aa35.66■■■■□ 3.3
ALYREF-203ENST00000511412 CDK19Q9BWU1 502 aa35.66■■■■□ 3.3
ALYREF-203ENST00000511412 VPS72Q15906 364 aa35.65■■■■□ 3.3
ALYREF-203ENST00000511412 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP35.65■■■■□ 3.3
ALYREF-203ENST00000511412 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP35.64■■■■□ 3.3
ALYREF-203ENST00000511412 FAM83GA6ND36 823 aa35.62■■■■□ 3.29
ALYREF-203ENST00000511412 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP35.61■■■■□ 3.29
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