RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000510074.5

SH3BP2-215, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 649 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-215ENST00000510074 HFM1A2PYH4 1435 aa23.95■■□□□ 1.42
SH3BP2-215ENST00000510074 KIF1BO60333 1816 aa23.95■■□□□ 1.42
SH3BP2-215ENST00000510074 ATRNO75882 1429 aa23.94■■□□□ 1.42
SH3BP2-215ENST00000510074 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP23.94■■□□□ 1.42
SH3BP2-215ENST00000510074 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP23.94■■□□□ 1.42
SH3BP2-215ENST00000510074 LAMC1P11047 1609 aa23.93■■□□□ 1.42
SH3BP2-215ENST00000510074 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP23.92■■□□□ 1.42
SH3BP2-215ENST00000510074 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP23.91■■□□□ 1.42
SH3BP2-215ENST00000510074 NUTM2FA1L443 756 aa23.91■■□□□ 1.42
SH3BP2-215ENST00000510074 STK26Q9P289 416 aa23.91■■□□□ 1.42
SH3BP2-215ENST00000510074 BCL9LQ86UU0 1499 aa23.88■■□□□ 1.41
SH3BP2-215ENST00000510074 WAPLQ7Z5K2 1190 aa23.87■■□□□ 1.41
SH3BP2-215ENST00000510074 MYOM2P54296 1465 aa23.87■■□□□ 1.41
SH3BP2-215ENST00000510074 NAIPQ13075 1403 aa23.86■■□□□ 1.41
SH3BP2-215ENST00000510074 PRAG1Q86YV5 1406 aa23.86■■□□□ 1.41
SH3BP2-215ENST00000510074 UNC5CLQ8IV45 518 aa23.85■■□□□ 1.41
SH3BP2-215ENST00000510074 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP23.84■■□□□ 1.41
SH3BP2-215ENST00000510074 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP23.83■■□□□ 1.41
SH3BP2-215ENST00000510074 RGL3Q3MIN7 710 aa23.83■■□□□ 1.41
SH3BP2-215ENST00000510074 PXDNQ92626 1479 aa23.82■■□□□ 1.4
SH3BP2-215ENST00000510074 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP23.82■■□□□ 1.4
SH3BP2-215ENST00000510074 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa23.82■■□□□ 1.4
SH3BP2-215ENST00000510074 KRT28Q7Z3Y7 464 aa23.8■■□□□ 1.4
SH3BP2-215ENST00000510074 TMEM132EQ6IEE7 984 aa23.79■■□□□ 1.4
SH3BP2-215ENST00000510074 EP400Q96L91 3159 aa23.79■■□□□ 1.4
SH3BP2-215ENST00000510074 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa23.79■■□□□ 1.4
SH3BP2-215ENST00000510074 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa23.78■■□□□ 1.4
SH3BP2-215ENST00000510074 PLEKHG5O94827 1062 aa23.77■■□□□ 1.4
SH3BP2-215ENST00000510074 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP23.77■■□□□ 1.4
SH3BP2-215ENST00000510074 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP23.76■■□□□ 1.39
SH3BP2-215ENST00000510074 PSME1Q06323 249 aa23.76■■□□□ 1.39
SH3BP2-215ENST00000510074 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP23.76■■□□□ 1.39
SH3BP2-215ENST00000510074 DEFB132Q7Z7B7 95 aa23.75■■□□□ 1.39
SH3BP2-215ENST00000510074 SEPT12Q8IYM1 358 aa23.75■■□□□ 1.39
SH3BP2-215ENST00000510074 ABCC11Q96J66 1382 aa23.75■■□□□ 1.39
SH3BP2-215ENST00000510074 RALGAPBQ86X10 1494 aa23.75■■□□□ 1.39
SH3BP2-215ENST00000510074 PPLO60437 1756 aa23.74■■□□□ 1.39
SH3BP2-215ENST00000510074 LMOD2Q6P5Q4 547 aa23.73■■□□□ 1.39
SH3BP2-215ENST00000510074 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa23.73■■□□□ 1.39
SH3BP2-215ENST00000510074 CCDC144AA2RUR9 1427 aa23.72■■□□□ 1.39
SH3BP2-215ENST00000510074 SLIT2O94813 1529 aa23.72■■□□□ 1.39
SH3BP2-215ENST00000510074 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP23.72■■□□□ 1.39
SH3BP2-215ENST00000510074 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa23.71■■□□□ 1.39
SH3BP2-215ENST00000510074 VPS72Q15906 364 aa23.71■■□□□ 1.39
SH3BP2-215ENST00000510074 CABLES1Q8TDN4 633 aa23.71■■□□□ 1.39
SH3BP2-215ENST00000510074 TECPR2O15040 1411 aa23.7■■□□□ 1.38
SH3BP2-215ENST00000510074 PHF8Q9UPP1 1060 aa23.7■■□□□ 1.38
SH3BP2-215ENST00000510074 A0A0G2JS52 829 aa23.68■■□□□ 1.38
SH3BP2-215ENST00000510074 MYT1Q01538 1121 aa23.68■■□□□ 1.38
SH3BP2-215ENST00000510074 KRT27Q7Z3Y8 459 aa23.68■■□□□ 1.38
SH3BP2-215ENST00000510074 SIRT1Q96EB6 747 aa23.68■■□□□ 1.38
SH3BP2-215ENST00000510074 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP23.66■■□□□ 1.38
SH3BP2-215ENST00000510074 GLI3P10071 1580 aa23.65■■□□□ 1.38
SH3BP2-215ENST00000510074 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP23.65■■□□□ 1.38
SH3BP2-215ENST00000510074 MPHOSPH9Q99550 1183 aa23.65■■□□□ 1.38
SH3BP2-215ENST00000510074 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP23.65■■□□□ 1.38
SH3BP2-215ENST00000510074 TNS3Q68CZ2 1445 aa23.62■■□□□ 1.37
SH3BP2-215ENST00000510074 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa23.62■■□□□ 1.37
SH3BP2-215ENST00000510074 FAM83GA6ND36 823 aa23.62■■□□□ 1.37
SH3BP2-215ENST00000510074 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP23.62■■□□□ 1.37
SH3BP2-215ENST00000510074 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
SH3BP2-215ENST00000510074 BAG6P46379 1132 aa23.61■■□□□ 1.37
SH3BP2-215ENST00000510074 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
SH3BP2-215ENST00000510074 KIF1AQ12756 1690 aa23.6■■□□□ 1.37
SH3BP2-215ENST00000510074 USP32Q8NFA0 1604 aa23.6■■□□□ 1.37
SH3BP2-215ENST00000510074 SBNO1A3KN83 1393 aa23.6■■□□□ 1.37
SH3BP2-215ENST00000510074 ARHGEF10O15013 1369 aa23.6■■□□□ 1.37
SH3BP2-215ENST00000510074 PIK3C2GO75747 1445 aa23.59■■□□□ 1.37
SH3BP2-215ENST00000510074 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa23.59■■□□□ 1.37
SH3BP2-215ENST00000510074 PRAM1Q96QH2 718 aa23.59■■□□□ 1.37
SH3BP2-215ENST00000510074 POGKQ9P215 609 aa23.59■■□□□ 1.37
SH3BP2-215ENST00000510074 FMN2Q9NZ56 1722 aa23.59■■□□□ 1.37
SH3BP2-215ENST00000510074 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
SH3BP2-215ENST00000510074 CFAP70Q5T0N1 1121 aa23.58■■□□□ 1.37
SH3BP2-215ENST00000510074 BRWD3Q6RI45 1802 aa23.57■■□□□ 1.36
SH3BP2-215ENST00000510074 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
SH3BP2-215ENST00000510074 BTG4Q9NY30 223 aa23.56■■□□□ 1.36
SH3BP2-215ENST00000510074 KNDC1Q76NI1 1749 aa23.54■■□□□ 1.36
SH3BP2-215ENST00000510074 NRXN1Q9ULB1 1477 aa23.52■■□□□ 1.36
SH3BP2-215ENST00000510074 HRCP23327 699 aa23.52■■□□□ 1.36
SH3BP2-215ENST00000510074 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
SH3BP2-215ENST00000510074 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
SH3BP2-215ENST00000510074 GPRASP1Q5JY77 1395 aa23.5■■□□□ 1.35
SH3BP2-215ENST00000510074 NWD2Q9ULI1 1742 aa23.5■■□□□ 1.35
SH3BP2-215ENST00000510074 IFT172Q9UG01 1749 aa23.48■■□□□ 1.35
SH3BP2-215ENST00000510074 FAM182BQ5T319 152 aa23.48■■□□□ 1.35
SH3BP2-215ENST00000510074 PLCH1Q4KWH8 1693 aa23.48■■□□□ 1.35
SH3BP2-215ENST00000510074 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
SH3BP2-215ENST00000510074 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
SH3BP2-215ENST00000510074 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
SH3BP2-215ENST00000510074 ANKARQ7Z5J8 1434 aa23.45■■□□□ 1.34
SH3BP2-215ENST00000510074 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
SH3BP2-215ENST00000510074 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
SH3BP2-215ENST00000510074 TRAK1Q9UPV9 953 aa23.45■■□□□ 1.34
SH3BP2-215ENST00000510074 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa23.44■■□□□ 1.34
SH3BP2-215ENST00000510074 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa23.44■■□□□ 1.34
SH3BP2-215ENST00000510074 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
SH3BP2-215ENST00000510074 PRDM11Q9NQV5 511 aa23.43■■□□□ 1.34
SH3BP2-215ENST00000510074 LRP5O75197 1615 aa23.43■■□□□ 1.34
SH3BP2-215ENST00000510074 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 73.6 ms