RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498817.5

ALS2CL-210, Transcript of ALS2 C-terminal like, humanhuman

TSL 3

Gene ALS2CL, Length 1,065 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CL-210ENST00000498817 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP30.16■■■□□ 2.42
ALS2CL-210ENST00000498817 SHPRHQ149N8 1683 aa30.15■■■□□ 2.42
ALS2CL-210ENST00000498817 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP30.15■■■□□ 2.42
ALS2CL-210ENST00000498817 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP30.13■■■□□ 2.41
ALS2CL-210ENST00000498817 NRXN1Q9ULB1 1477 aa30.12■■■□□ 2.41
ALS2CL-210ENST00000498817 HRCP23327 699 aa30.12■■■□□ 2.41
ALS2CL-210ENST00000498817 NUTM2FA1L443 756 aa30.1■■■□□ 2.41
ALS2CL-210ENST00000498817 PNPLA6Q8IY17 1366 aa30.1■■■□□ 2.41
ALS2CL-210ENST00000498817 MYOM2P54296 1465 aa30.1■■■□□ 2.41
ALS2CL-210ENST00000498817 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP30.07■■■□□ 2.4
ALS2CL-210ENST00000498817 ESCO1Q5FWF5 840 aa30.07■■■□□ 2.4
ALS2CL-210ENST00000498817 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa30.06■■■□□ 2.4
ALS2CL-210ENST00000498817 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa30.06■■■□□ 2.4
ALS2CL-210ENST00000498817 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP30.03■■■□□ 2.4
ALS2CL-210ENST00000498817 KNDC1Q76NI1 1749 aa30.02■■■□□ 2.4
ALS2CL-210ENST00000498817 DCAF11Q8TEB1 546 aa30.02■■■□□ 2.4
ALS2CL-210ENST00000498817 SIRT1Q96EB6 747 aa30.02■■■□□ 2.4
ALS2CL-210ENST00000498817 LAMC1P11047 1609 aa30.01■■■□□ 2.39
ALS2CL-210ENST00000498817 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP30.01■■■□□ 2.39
ALS2CL-210ENST00000498817 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP30■■■□□ 2.39
ALS2CL-210ENST00000498817 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP30■■■□□ 2.39
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ALS2CL-210ENST00000498817 PRAM1Q96QH2 718 aa29.99■■■□□ 2.39
ALS2CL-210ENST00000498817 AFF2P51816 1311 aa29.98■■■□□ 2.39
ALS2CL-210ENST00000498817 ADAMTS2O95450 1211 aa29.97■■■□□ 2.39
ALS2CL-210ENST00000498817 C8orf37Q96NL8 207 aa29.97■■■□□ 2.39
ALS2CL-210ENST00000498817 NPHP3Q7Z494 1330 aa29.96■■■□□ 2.39
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ALS2CL-210ENST00000498817 ADGRB1O14514 1584 aa29.93■■■□□ 2.38
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ALS2CL-210ENST00000498817 POGKQ9P215 609 aa29.91■■■□□ 2.38
ALS2CL-210ENST00000498817 FMN2Q9NZ56 1722 aa29.9■■■□□ 2.38
ALS2CL-210ENST00000498817 RXRBP28702 533 aa29.88■■■□□ 2.37
ALS2CL-210ENST00000498817 DLC1Q96QB1 1528 aa29.87■■■□□ 2.37
ALS2CL-210ENST00000498817 NGLY1Q96IV0 654 aa29.87■■■□□ 2.37
ALS2CL-210ENST00000498817 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP29.85■■■□□ 2.37
ALS2CL-210ENST00000498817 STAC3Q96MF2 364 aa29.84■■■□□ 2.37
ALS2CL-210ENST00000498817 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP29.84■■■□□ 2.37
ALS2CL-210ENST00000498817 PHF8Q9UPP1 1060 aa29.84■■■□□ 2.37
ALS2CL-210ENST00000498817 KRT28Q7Z3Y7 464 aa29.83■■■□□ 2.37
ALS2CL-210ENST00000498817 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP29.82■■■□□ 2.36
ALS2CL-210ENST00000498817 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa29.8■■■□□ 2.36
ALS2CL-210ENST00000498817 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP29.79■■■□□ 2.36
ALS2CL-210ENST00000498817 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa29.77■■■□□ 2.36
ALS2CL-210ENST00000498817 USP21Q9UK80 565 aa29.77■■■□□ 2.36
ALS2CL-210ENST00000498817 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP29.77■■■□□ 2.36
ALS2CL-210ENST00000498817 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP29.76■■■□□ 2.35
ALS2CL-210ENST00000498817 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP29.75■■■□□ 2.35
ALS2CL-210ENST00000498817 KIF1AQ12756 1690 aa29.75■■■□□ 2.35
ALS2CL-210ENST00000498817 PRR36Q9H6K5 1346 aa29.74■■■□□ 2.35
ALS2CL-210ENST00000498817 USP32Q8NFA0 1604 aa29.73■■■□□ 2.35
ALS2CL-210ENST00000498817 PLEKHG5O94827 1062 aa29.72■■■□□ 2.35
ALS2CL-210ENST00000498817 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP29.72■■■□□ 2.35
ALS2CL-210ENST00000498817 ADGRB2O60241 1585 aa29.72■■■□□ 2.35
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ALS2CL-210ENST00000498817 WASLO00401 505 aaPredicted RBP29.71■■■□□ 2.35
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ALS2CL-210ENST00000498817 RGS12O14924 1447 aa29.7■■■□□ 2.34
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ALS2CL-210ENST00000498817 LMOD2Q6P5Q4 547 aa29.67■■■□□ 2.34
ALS2CL-210ENST00000498817 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP29.67■■■□□ 2.34
ALS2CL-210ENST00000498817 TNS3Q68CZ2 1445 aa29.67■■■□□ 2.34
ALS2CL-210ENST00000498817 BCL9LQ86UU0 1499 aa29.66■■■□□ 2.34
ALS2CL-210ENST00000498817 SBNO1A3KN83 1393 aa29.65■■■□□ 2.34
ALS2CL-210ENST00000498817 ATRNO75882 1429 aa29.64■■■□□ 2.34
ALS2CL-210ENST00000498817 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP29.63■■■□□ 2.33
ALS2CL-210ENST00000498817 TULP4Q9NRJ4 1543 aa29.63■■■□□ 2.33
ALS2CL-210ENST00000498817 L3MBTL2Q969R5 705 aa29.63■■■□□ 2.33
ALS2CL-210ENST00000498817 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP29.61■■■□□ 2.33
ALS2CL-210ENST00000498817 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP29.59■■■□□ 2.33
ALS2CL-210ENST00000498817 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP29.59■■■□□ 2.33
ALS2CL-210ENST00000498817 CDK19Q9BWU1 502 aa29.59■■■□□ 2.33
ALS2CL-210ENST00000498817 NEUROD1Q13562 356 aa29.58■■■□□ 2.33
ALS2CL-210ENST00000498817 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP29.57■■■□□ 2.32
ALS2CL-210ENST00000498817 ARHGEF10O15013 1369 aa29.56■■■□□ 2.32
ALS2CL-210ENST00000498817 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP29.56■■■□□ 2.32
ALS2CL-210ENST00000498817 SLIT2O94813 1529 aa29.55■■■□□ 2.32
ALS2CL-210ENST00000498817 GPRASP1Q5JY77 1395 aa29.55■■■□□ 2.32
ALS2CL-210ENST00000498817 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa29.55■■■□□ 2.32
ALS2CL-210ENST00000498817 UNC5CLQ8IV45 518 aa29.55■■■□□ 2.32
ALS2CL-210ENST00000498817 ATP7BP35670 1465 aa29.55■■■□□ 2.32
ALS2CL-210ENST00000498817 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP29.54■■■□□ 2.32
ALS2CL-210ENST00000498817 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP29.52■■■□□ 2.32
ALS2CL-210ENST00000498817 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP29.5■■■□□ 2.31
ALS2CL-210ENST00000498817 FAM83GA6ND36 823 aa29.49■■■□□ 2.31
ALS2CL-210ENST00000498817 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP29.46■■■□□ 2.31
ALS2CL-210ENST00000498817 CCDC61Q9Y6R9 512 aa29.46■■■□□ 2.31
ALS2CL-210ENST00000498817 RALGAPBQ86X10 1494 aa29.46■■■□□ 2.31
ALS2CL-210ENST00000498817 ABCA3Q99758 1704 aa29.45■■■□□ 2.31
ALS2CL-210ENST00000498817 ALS2Q96Q42 1657 aa29.45■■■□□ 2.31
ALS2CL-210ENST00000498817 ACEP12821 1306 aa29.44■■■□□ 2.3
ALS2CL-210ENST00000498817 CABP2Q9NPB3 220 aa29.43■■■□□ 2.3
ALS2CL-210ENST00000498817 GLI3P10071 1580 aa29.43■■■□□ 2.3
ALS2CL-210ENST00000498817 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP29.42■■■□□ 2.3
ALS2CL-210ENST00000498817 NBPF8Q3BBV2 869 aa29.42■■■□□ 2.3
ALS2CL-210ENST00000498817 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP29.42■■■□□ 2.3
ALS2CL-210ENST00000498817 ATAD2Q6PL18 1390 aa29.41■■■□□ 2.3
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