RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496281.1

RTEL1-TNFRSF6B-204, Transcript of RTEL1-TNFRSF6B readthrough (NMD candidate), humanhuman

TSL 2

Gene RTEL1-TNFRSF6B, Length 5,314 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 PPP2R1AP30153 589 aa21.92■■□□□ 1.1
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RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 RABEP1Q15276 862 aa21.91■■□□□ 1.1
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RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 OSCARQ8IYS5 282 aa21.91■■□□□ 1.1
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RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 SMC3Q9UQE7 1217 aa21.87■■□□□ 1.09
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 CFTRP13569 1480 aa21.87■■□□□ 1.09
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RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 GCC1Q96CN9 775 aa21.87■■□□□ 1.09
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RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa21.86■■□□□ 1.09
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RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 CPLX1O14810 134 aa21.84■■□□□ 1.09
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RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 TSPY26PQ9H489 355 aa21.84■■□□□ 1.09
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RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 MAP3K1Q13233 1512 aa21.82■■□□□ 1.08
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RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 ERC2O15083 957 aa21.8■■□□□ 1.08
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 TRIM29Q14134 588 aa21.79■■□□□ 1.08
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 CCDC70Q6NSX1 233 aa21.79■■□□□ 1.08
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RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
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RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 HOMER1Q86YM7 354 aa21.78■■□□□ 1.08
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
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RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa21.78■■□□□ 1.08
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa21.78■■□□□ 1.08
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RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 BCAR3O75815 825 aa21.77■■□□□ 1.08
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 RNF214Q8ND24 703 aa21.77■■□□□ 1.08
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RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa21.74■■□□□ 1.07
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 MVPQ14764 893 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 MNS1Q8NEH6 495 aa21.74■■□□□ 1.07
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 ARHGAP5Q13017 1502 aa21.74■■□□□ 1.07
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 ACBD3Q9H3P7 528 aa21.73■■□□□ 1.07
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 GRIN2BQ13224 1484 aa21.73■■□□□ 1.07
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 GNAI3P08754 354 aa21.73■■□□□ 1.07
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 NEUROD6Q96NK8 337 aa21.73■■□□□ 1.07
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 NLRP2Q9NX02 1062 aa21.72■■□□□ 1.07
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 SLFN5Q08AF3 891 aa21.72■■□□□ 1.07
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 CEP89Q96ST8 783 aa21.72■■□□□ 1.07
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
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