RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495357.1

CCDC39-AS1-201, CCDC39 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CCDC39-AS1, Length 283 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CYP4X1Q8N118 509 aa11.43□□□□□ -0.58
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 AXIN1O15169 862 aa11.41□□□□□ -0.58
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CD46P15529 392 aa11.41□□□□□ -0.58
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SMPD1P17405 629 aa11.41□□□□□ -0.58
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MMP16P51512 607 aa11.41□□□□□ -0.58
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 WNT7AO00755 349 aa11.4□□□□□ -0.58
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CTC1Q2NKJ3 1217 aa11.4□□□□□ -0.58
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LCE2CQ5TA81 110 aa11.38□□□□□ -0.59
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GPIHBP1Q8IV16 184 aa11.38□□□□□ -0.59
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP11.37□□□□□ -0.59
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TRIM32Q13049 653 aa11.37□□□□□ -0.59
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DXOO77932 396 aaKnown RBP11.36□□□□□ -0.59
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP11.36□□□□□ -0.59
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 HLA-CQ95604 372 aa11.36□□□□□ -0.59
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 BCANQ96GW7 911 aa11.35□□□□□ -0.59
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP11.34□□□□□ -0.59
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP11.34□□□□□ -0.59
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 J3QL48 77 aa11.34□□□□□ -0.59
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP11.34□□□□□ -0.59
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MRGPRX2Q96LB1 330 aa11.34□□□□□ -0.59
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GRIPAP1Q4V328 841 aa11.33□□□□□ -0.6
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 WFS1O76024 890 aa11.32□□□□□ -0.6
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SKOR1P84550 965 aa11.32□□□□□ -0.6
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 Q3C1V9 767 aa11.32□□□□□ -0.6
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KDM4AO75164 1064 aa11.31□□□□□ -0.6
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MAP2K5Q13163 448 aa11.31□□□□□ -0.6
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa11.31□□□□□ -0.6
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 HPS1Q92902 700 aa11.29□□□□□ -0.6
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 IRF6O14896 467 aa11.27□□□□□ -0.61
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 HOXA2O43364 376 aa11.27□□□□□ -0.61
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 WIPF1O43516 503 aa11.27□□□□□ -0.61
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP11.26□□□□□ -0.61
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GUCA2AQ02747 115 aa11.26□□□□□ -0.61
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TRIM47Q96LD4 638 aa11.25□□□□□ -0.61
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 USP46P62068 366 aa11.24□□□□□ -0.61
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 WNT7BP56706 349 aa11.21□□□□□ -0.61
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP11.21□□□□□ -0.61
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.61
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP11.2□□□□□ -0.62
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 JUNDP17535 347 aa11.2□□□□□ -0.62
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CCDC24Q8N4L8 307 aa11.2□□□□□ -0.62
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CCDC102AQ96A19 550 aa11.2□□□□□ -0.62
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TERTO14746 1132 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SIAH2O43255 324 aa11.19□□□□□ -0.62
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP11.17□□□□□ -0.62
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SENP2Q9HC62 589 aa11.17□□□□□ -0.62
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 STK17AQ9UEE5 414 aa11.16□□□□□ -0.62
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PCDHGC3Q9UN70 934 aa11.16□□□□□ -0.62
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GPCPD1Q9NPB8 672 aa11.15□□□□□ -0.62
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZMYND10O75800 440 aa11.13□□□□□ -0.63
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TRIM46Q7Z4K8 759 aa11.13□□□□□ -0.63
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RETREG3Q86VR2 466 aa11.13□□□□□ -0.63
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ALDH1A1P00352 501 aa11.12□□□□□ -0.63
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NUDT12Q9BQG2 462 aa11.12□□□□□ -0.63
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 BARGINQ6ZT62 677 aa11.11□□□□□ -0.63
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KIFC2Q96AC6 838 aa11.11□□□□□ -0.63
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LORP23490 312 aaPredicted RBP11.1□□□□□ -0.63
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CLCN1P35523 988 aa11.1□□□□□ -0.63
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SH3BP2P78314 561 aa11.1□□□□□ -0.63
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP11.1□□□□□ -0.63
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 BMP1P13497 986 aa11.08□□□□□ -0.64
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FDX1P10109 184 aa11.07□□□□□ -0.64
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 EHBP1Q8NDI1 1231 aa11.06□□□□□ -0.64
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NUTM1Q86Y26 1132 aa11.05□□□□□ -0.64
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SPIRE2Q8WWL2 714 aa11.05□□□□□ -0.64
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CCNYL3P0C7X3 344 aa11.04□□□□□ -0.64
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP11.03□□□□□ -0.64
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NDUFV2P19404 249 aa11.03□□□□□ -0.64
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 EVA1BQ9NVM1 165 aa11.03□□□□□ -0.64
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP11.03□□□□□ -0.64
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 C6orf229H3BNL8 230 aa11.02□□□□□ -0.65
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MS4A1P11836 297 aa11.02□□□□□ -0.65
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PTPRNQ16849 979 aa11.02□□□□□ -0.65
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 UNC93B1Q9H1C4 597 aa11.02□□□□□ -0.65
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MOXD2PA6NHM9 499 aa11.01□□□□□ -0.65
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP11.01□□□□□ -0.65
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GMPRP36959 345 aa11.01□□□□□ -0.65
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP11.01□□□□□ -0.65
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TLL2Q9Y6L7 1015 aa11.01□□□□□ -0.65
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 BAP1Q92560 729 aa11□□□□□ -0.65
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LINC01559Q495D7 138 aa10.99□□□□□ -0.65
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 WASF2Q9Y6W5 498 aa10.99□□□□□ -0.65
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KCNH2Q12809 1159 aa10.98□□□□□ -0.65
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 H3BM21 787 aa10.97□□□□□ -0.65
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 VEGFBP49765 207 aa10.97□□□□□ -0.65
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NPAS3Q8IXF0 933 aa10.97□□□□□ -0.65
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MPNDQ8N594 471 aa10.97□□□□□ -0.65
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PRR7Q8TB68 274 aa10.97□□□□□ -0.65
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ERBB4Q15303 1308 aa10.97□□□□□ -0.65
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZNF511Q8NB15 262 aa10.96□□□□□ -0.65
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZFP42Q96MM3 310 aa10.96□□□□□ -0.65
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DESI1Q6ICB0 168 aa10.95□□□□□ -0.66
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP10.95□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 9.7 ms