RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495022.5

TRDMT1-211, Transcript of tRNA aspartic acid methyltransferase 1, humanhuman

TSL 2

Gene TRDMT1, Length 1,374 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDMT1-211ENST00000495022 ORAI2Q96SN7 254 aa33.63■■■□□ 2.97
TRDMT1-211ENST00000495022 RGL3Q3MIN7 710 aa33.62■■■□□ 2.97
TRDMT1-211ENST00000495022 PIK3C2GO75747 1445 aa33.59■■■□□ 2.97
TRDMT1-211ENST00000495022 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP33.58■■■□□ 2.97
TRDMT1-211ENST00000495022 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP33.57■■■□□ 2.96
TRDMT1-211ENST00000495022 C8orf37Q96NL8 207 aa33.57■■■□□ 2.96
TRDMT1-211ENST00000495022 ABCC11Q96J66 1382 aa33.55■■■□□ 2.96
TRDMT1-211ENST00000495022 STK26Q9P289 416 aa33.51■■■□□ 2.96
TRDMT1-211ENST00000495022 NPHP3Q7Z494 1330 aa33.51■■■□□ 2.95
TRDMT1-211ENST00000495022 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP33.5■■■□□ 2.95
TRDMT1-211ENST00000495022 FMN2Q9NZ56 1722 aa33.49■■■□□ 2.95
TRDMT1-211ENST00000495022 ESCO1Q5FWF5 840 aa33.49■■■□□ 2.95
TRDMT1-211ENST00000495022 PXDNQ92626 1479 aa33.49■■■□□ 2.95
TRDMT1-211ENST00000495022 WAPLQ7Z5K2 1190 aa33.48■■■□□ 2.95
TRDMT1-211ENST00000495022 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP33.48■■■□□ 2.95
TRDMT1-211ENST00000495022 ADAMTS2O95450 1211 aa33.47■■■□□ 2.95
TRDMT1-211ENST00000495022 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP33.47■■■□□ 2.95
TRDMT1-211ENST00000495022 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP33.47■■■□□ 2.95
TRDMT1-211ENST00000495022 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP33.47■■■□□ 2.95
TRDMT1-211ENST00000495022 TMEM132EQ6IEE7 984 aa33.47■■■□□ 2.95
TRDMT1-211ENST00000495022 NGLY1Q96IV0 654 aa33.47■■■□□ 2.95
TRDMT1-211ENST00000495022 NRXN1Q9ULB1 1477 aa33.46■■■□□ 2.95
TRDMT1-211ENST00000495022 MYOM2P54296 1465 aa33.46■■■□□ 2.95
TRDMT1-211ENST00000495022 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa33.44■■■□□ 2.94
TRDMT1-211ENST00000495022 RGS12O14924 1447 aa33.44■■■□□ 2.94
TRDMT1-211ENST00000495022 KIF1AQ12756 1690 aa33.44■■■□□ 2.94
TRDMT1-211ENST00000495022 SIRT1Q96EB6 747 aa33.41■■■□□ 2.94
TRDMT1-211ENST00000495022 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP33.41■■■□□ 2.94
TRDMT1-211ENST00000495022 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa33.4■■■□□ 2.94
TRDMT1-211ENST00000495022 FOXO3O43524 673 aa33.39■■■□□ 2.94
TRDMT1-211ENST00000495022 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP33.39■■■□□ 2.94
TRDMT1-211ENST00000495022 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP33.37■■■□□ 2.93
TRDMT1-211ENST00000495022 USP21Q9UK80 565 aa33.36■■■□□ 2.93
TRDMT1-211ENST00000495022 NUTM2FA1L443 756 aa33.35■■■□□ 2.93
TRDMT1-211ENST00000495022 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP33.35■■■□□ 2.93
TRDMT1-211ENST00000495022 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP33.33■■■□□ 2.93
TRDMT1-211ENST00000495022 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP33.33■■■□□ 2.93
TRDMT1-211ENST00000495022 CFAP70Q5T0N1 1121 aa33.32■■■□□ 2.92
TRDMT1-211ENST00000495022 ATRNO75882 1429 aa33.31■■■□□ 2.92
TRDMT1-211ENST00000495022 DLC1Q96QB1 1528 aa33.29■■■□□ 2.92
TRDMT1-211ENST00000495022 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP33.28■■■□□ 2.92
TRDMT1-211ENST00000495022 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa33.26■■■□□ 2.91
TRDMT1-211ENST00000495022 BCL9LQ86UU0 1499 aa33.25■■■□□ 2.91
TRDMT1-211ENST00000495022 EP400Q96L91 3159 aa33.24■■■□□ 2.91
TRDMT1-211ENST00000495022 ADGRB1O14514 1584 aa33.23■■■□□ 2.91
TRDMT1-211ENST00000495022 PRAM1Q96QH2 718 aa33.22■■■□□ 2.91
TRDMT1-211ENST00000495022 ADGRB2O60241 1585 aa33.22■■■□□ 2.91
TRDMT1-211ENST00000495022 ATAD2Q6PL18 1390 aa33.21■■■□□ 2.91
TRDMT1-211ENST00000495022 KRT28Q7Z3Y7 464 aa33.21■■■□□ 2.91
TRDMT1-211ENST00000495022 PHF8Q9UPP1 1060 aa33.21■■■□□ 2.91
TRDMT1-211ENST00000495022 USP32Q8NFA0 1604 aa33.21■■■□□ 2.91
TRDMT1-211ENST00000495022 TNS3Q68CZ2 1445 aa33.19■■■□□ 2.9
TRDMT1-211ENST00000495022 ANKARQ7Z5J8 1434 aa33.17■■■□□ 2.9
TRDMT1-211ENST00000495022 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP33.17■■■□□ 2.9
TRDMT1-211ENST00000495022 PSME1Q06323 249 aa33.16■■■□□ 2.9
TRDMT1-211ENST00000495022 POGKQ9P215 609 aa33.16■■■□□ 2.9
TRDMT1-211ENST00000495022 ABCA3Q99758 1704 aa33.15■■■□□ 2.9
TRDMT1-211ENST00000495022 SLIT2O94813 1529 aa33.15■■■□□ 2.9
TRDMT1-211ENST00000495022 HRCP23327 699 aa33.15■■■□□ 2.9
TRDMT1-211ENST00000495022 STAC3Q96MF2 364 aa33.14■■■□□ 2.9
TRDMT1-211ENST00000495022 SBNO1A3KN83 1393 aa33.14■■■□□ 2.9
TRDMT1-211ENST00000495022 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP33.11■■■□□ 2.89
TRDMT1-211ENST00000495022 NWD2Q9ULI1 1742 aa33.1■■■□□ 2.89
TRDMT1-211ENST00000495022 UNC5CLQ8IV45 518 aa33.09■■■□□ 2.89
TRDMT1-211ENST00000495022 DCAF11Q8TEB1 546 aa33.09■■■□□ 2.89
TRDMT1-211ENST00000495022 ARHGEF10O15013 1369 aa33.09■■■□□ 2.89
TRDMT1-211ENST00000495022 PLCH1Q4KWH8 1693 aa33.08■■■□□ 2.89
TRDMT1-211ENST00000495022 TRAK1Q9UPV9 953 aa33.08■■■□□ 2.89
TRDMT1-211ENST00000495022 GLI3P10071 1580 aa33.07■■■□□ 2.89
TRDMT1-211ENST00000495022 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP33.07■■■□□ 2.88
TRDMT1-211ENST00000495022 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP33.07■■■□□ 2.88
TRDMT1-211ENST00000495022 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa33.07■■■□□ 2.88
TRDMT1-211ENST00000495022 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP33.05■■■□□ 2.88
TRDMT1-211ENST00000495022 RALGAPBQ86X10 1494 aa33.05■■■□□ 2.88
TRDMT1-211ENST00000495022 TULP4Q9NRJ4 1543 aa33.04■■■□□ 2.88
TRDMT1-211ENST00000495022 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP33.04■■■□□ 2.88
TRDMT1-211ENST00000495022 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa33.02■■■□□ 2.88
TRDMT1-211ENST00000495022 BRWD3Q6RI45 1802 aa33.02■■■□□ 2.88
TRDMT1-211ENST00000495022 ALS2Q96Q42 1657 aa33.02■■■□□ 2.88
TRDMT1-211ENST00000495022 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP33.01■■■□□ 2.88
TRDMT1-211ENST00000495022 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP33.01■■■□□ 2.87
TRDMT1-211ENST00000495022 CABLES1Q8TDN4 633 aa33■■■□□ 2.87
TRDMT1-211ENST00000495022 ITSN1Q15811 1721 aa33■■■□□ 2.87
TRDMT1-211ENST00000495022 LMOD2Q6P5Q4 547 aa32.98■■■□□ 2.87
TRDMT1-211ENST00000495022 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa32.98■■■□□ 2.87
TRDMT1-211ENST00000495022 WASLO00401 505 aaPredicted RBP32.96■■■□□ 2.87
TRDMT1-211ENST00000495022 CCDC125Q86Z20 511 aa32.96■■■□□ 2.87
TRDMT1-211ENST00000495022 PRR36Q9H6K5 1346 aa32.96■■■□□ 2.87
TRDMT1-211ENST00000495022 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa32.96■■■□□ 2.87
TRDMT1-211ENST00000495022 GPRASP1Q5JY77 1395 aa32.96■■■□□ 2.87
TRDMT1-211ENST00000495022 VPS72Q15906 364 aa32.94■■■□□ 2.86
TRDMT1-211ENST00000495022 NRAPQ86VF7 1730 aa32.93■■■□□ 2.86
TRDMT1-211ENST00000495022 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa32.92■■■□□ 2.86
TRDMT1-211ENST00000495022 PLEKHG5O94827 1062 aa32.91■■■□□ 2.86
TRDMT1-211ENST00000495022 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP32.9■■■□□ 2.86
TRDMT1-211ENST00000495022 ATP7BP35670 1465 aa32.88■■■□□ 2.85
TRDMT1-211ENST00000495022 FAM83GA6ND36 823 aa32.87■■■□□ 2.85
TRDMT1-211ENST00000495022 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP32.85■■■□□ 2.85
TRDMT1-211ENST00000495022 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP32.84■■■□□ 2.85
TRDMT1-211ENST00000495022 SEPT12Q8IYM1 358 aa32.84■■■□□ 2.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.8 ms