RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494420.1

HOXB-AS3-215, HOXB cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 2

Gene HOXB-AS3, Length 431 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB-AS3-215ENST00000494420 POTEAQ6S8J7 498 aa28.23■■■□□ 2.11
HOXB-AS3-215ENST00000494420 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP28.23■■■□□ 2.11
HOXB-AS3-215ENST00000494420 TECPR2O15040 1411 aa28.23■■■□□ 2.11
HOXB-AS3-215ENST00000494420 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP28.23■■■□□ 2.11
HOXB-AS3-215ENST00000494420 DCAF11Q8TEB1 546 aa28.22■■■□□ 2.11
HOXB-AS3-215ENST00000494420 NRXN1Q9ULB1 1477 aa28.21■■■□□ 2.11
HOXB-AS3-215ENST00000494420 ESCO1Q5FWF5 840 aa28.2■■■□□ 2.1
HOXB-AS3-215ENST00000494420 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa28.2■■■□□ 2.1
HOXB-AS3-215ENST00000494420 SIRT1Q96EB6 747 aa28.19■■■□□ 2.1
HOXB-AS3-215ENST00000494420 NHSL1Q5SYE7 1610 aa28.18■■■□□ 2.1
HOXB-AS3-215ENST00000494420 NUTM2FA1L443 756 aa28.18■■■□□ 2.1
HOXB-AS3-215ENST00000494420 LRP6O75581 1613 aa28.18■■■□□ 2.1
HOXB-AS3-215ENST00000494420 SHPRHQ149N8 1683 aa28.17■■■□□ 2.1
HOXB-AS3-215ENST00000494420 STAC3Q96MF2 364 aa28.15■■■□□ 2.1
HOXB-AS3-215ENST00000494420 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa28.13■■■□□ 2.09
HOXB-AS3-215ENST00000494420 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP28.13■■■□□ 2.09
HOXB-AS3-215ENST00000494420 KNDC1Q76NI1 1749 aa28.12■■■□□ 2.09
HOXB-AS3-215ENST00000494420 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP28.12■■■□□ 2.09
HOXB-AS3-215ENST00000494420 PRAM1Q96QH2 718 aa28.12■■■□□ 2.09
HOXB-AS3-215ENST00000494420 POGKQ9P215 609 aa28.12■■■□□ 2.09
HOXB-AS3-215ENST00000494420 PNPLA6Q8IY17 1366 aa28.11■■■□□ 2.09
HOXB-AS3-215ENST00000494420 LAMC1P11047 1609 aa28.11■■■□□ 2.09
HOXB-AS3-215ENST00000494420 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP28.11■■■□□ 2.09
HOXB-AS3-215ENST00000494420 FOXO3O43524 673 aa28.09■■■□□ 2.09
HOXB-AS3-215ENST00000494420 NPHP3Q7Z494 1330 aa28.09■■■□□ 2.09
HOXB-AS3-215ENST00000494420 TRAK1Q9UPV9 953 aa28.08■■■□□ 2.09
HOXB-AS3-215ENST00000494420 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP28.05■■■□□ 2.08
HOXB-AS3-215ENST00000494420 C8orf37Q96NL8 207 aa28.03■■■□□ 2.08
HOXB-AS3-215ENST00000494420 ADAMTS2O95450 1211 aa28.02■■■□□ 2.08
HOXB-AS3-215ENST00000494420 AFF2P51816 1311 aa28.01■■■□□ 2.07
HOXB-AS3-215ENST00000494420 ADGRB1O14514 1584 aa28.01■■■□□ 2.07
HOXB-AS3-215ENST00000494420 DLC1Q96QB1 1528 aa28■■■□□ 2.07
HOXB-AS3-215ENST00000494420 FMN2Q9NZ56 1722 aa27.98■■■□□ 2.07
HOXB-AS3-215ENST00000494420 NGLY1Q96IV0 654 aa27.98■■■□□ 2.07
HOXB-AS3-215ENST00000494420 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP27.97■■■□□ 2.07
HOXB-AS3-215ENST00000494420 PHF8Q9UPP1 1060 aa27.97■■■□□ 2.07
HOXB-AS3-215ENST00000494420 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP27.96■■■□□ 2.07
HOXB-AS3-215ENST00000494420 RXRBP28702 533 aa27.96■■■□□ 2.07
HOXB-AS3-215ENST00000494420 KRT28Q7Z3Y7 464 aa27.96■■■□□ 2.07
HOXB-AS3-215ENST00000494420 PXDNQ92626 1479 aa27.95■■■□□ 2.07
HOXB-AS3-215ENST00000494420 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP27.92■■■□□ 2.06
HOXB-AS3-215ENST00000494420 PSME1Q06323 249 aa27.91■■■□□ 2.06
HOXB-AS3-215ENST00000494420 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa27.89■■■□□ 2.06
HOXB-AS3-215ENST00000494420 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa27.89■■■□□ 2.05
HOXB-AS3-215ENST00000494420 KIF1AQ12756 1690 aa27.88■■■□□ 2.05
HOXB-AS3-215ENST00000494420 WASLO00401 505 aaPredicted RBP27.88■■■□□ 2.05
HOXB-AS3-215ENST00000494420 SIN3AQ96ST3 1273 aa27.87■■■□□ 2.05
HOXB-AS3-215ENST00000494420 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP27.86■■■□□ 2.05
HOXB-AS3-215ENST00000494420 ANKARQ7Z5J8 1434 aa27.86■■■□□ 2.05
HOXB-AS3-215ENST00000494420 NEUROD1Q13562 356 aa27.86■■■□□ 2.05
HOXB-AS3-215ENST00000494420 USP21Q9UK80 565 aa27.86■■■□□ 2.05
HOXB-AS3-215ENST00000494420 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP27.85■■■□□ 2.05
HOXB-AS3-215ENST00000494420 NBPF1Q3BBV0 1214 aa27.85■■■□□ 2.05
HOXB-AS3-215ENST00000494420 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP27.85■■■□□ 2.05
HOXB-AS3-215ENST00000494420 LMOD2Q6P5Q4 547 aa27.84■■■□□ 2.05
HOXB-AS3-215ENST00000494420 L3MBTL2Q969R5 705 aa27.84■■■□□ 2.05
HOXB-AS3-215ENST00000494420 ADGRB2O60241 1585 aa27.83■■■□□ 2.05
HOXB-AS3-215ENST00000494420 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP27.83■■■□□ 2.05
HOXB-AS3-215ENST00000494420 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP27.82■■■□□ 2.04
HOXB-AS3-215ENST00000494420 PLEKHG5O94827 1062 aa27.81■■■□□ 2.04
HOXB-AS3-215ENST00000494420 PRR36Q9H6K5 1346 aa27.81■■■□□ 2.04
HOXB-AS3-215ENST00000494420 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP27.8■■■□□ 2.04
HOXB-AS3-215ENST00000494420 SBNO1A3KN83 1393 aa27.79■■■□□ 2.04
HOXB-AS3-215ENST00000494420 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP27.79■■■□□ 2.04
HOXB-AS3-215ENST00000494420 USP32Q8NFA0 1604 aa27.78■■■□□ 2.04
HOXB-AS3-215ENST00000494420 TNS3Q68CZ2 1445 aa27.78■■■□□ 2.04
HOXB-AS3-215ENST00000494420 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP27.77■■■□□ 2.04
HOXB-AS3-215ENST00000494420 CDK19Q9BWU1 502 aa27.77■■■□□ 2.04
HOXB-AS3-215ENST00000494420 TULP4Q9NRJ4 1543 aa27.77■■■□□ 2.04
HOXB-AS3-215ENST00000494420 GPRASP1Q5JY77 1395 aa27.76■■■□□ 2.03
HOXB-AS3-215ENST00000494420 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP27.76■■■□□ 2.03
HOXB-AS3-215ENST00000494420 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa27.76■■■□□ 2.03
HOXB-AS3-215ENST00000494420 CABLES1Q8TDN4 633 aa27.76■■■□□ 2.03
HOXB-AS3-215ENST00000494420 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP27.76■■■□□ 2.03
HOXB-AS3-215ENST00000494420 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP27.76■■■□□ 2.03
HOXB-AS3-215ENST00000494420 ARHGEF10O15013 1369 aa27.73■■■□□ 2.03
HOXB-AS3-215ENST00000494420 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP27.72■■■□□ 2.03
HOXB-AS3-215ENST00000494420 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP27.69■■■□□ 2.02
HOXB-AS3-215ENST00000494420 BCL9LQ86UU0 1499 aa27.69■■■□□ 2.02
HOXB-AS3-215ENST00000494420 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP27.68■■■□□ 2.02
HOXB-AS3-215ENST00000494420 RGS12O14924 1447 aa27.68■■■□□ 2.02
HOXB-AS3-215ENST00000494420 ATRNO75882 1429 aa27.68■■■□□ 2.02
HOXB-AS3-215ENST00000494420 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP27.68■■■□□ 2.02
HOXB-AS3-215ENST00000494420 UNC5CLQ8IV45 518 aa27.67■■■□□ 2.02
HOXB-AS3-215ENST00000494420 CCDC61Q9Y6R9 512 aa27.66■■■□□ 2.02
HOXB-AS3-215ENST00000494420 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP27.66■■■□□ 2.02
HOXB-AS3-215ENST00000494420 ATP7BP35670 1465 aa27.65■■■□□ 2.02
HOXB-AS3-215ENST00000494420 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP27.65■■■□□ 2.02
HOXB-AS3-215ENST00000494420 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP27.64■■■□□ 2.02
HOXB-AS3-215ENST00000494420 ACEP12821 1306 aa27.61■■■□□ 2.01
HOXB-AS3-215ENST00000494420 SLIT2O94813 1529 aa27.61■■■□□ 2.01
HOXB-AS3-215ENST00000494420 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP27.6■■■□□ 2.01
HOXB-AS3-215ENST00000494420 PLEKHG3A1L390 1219 aa27.6■■■□□ 2.01
HOXB-AS3-215ENST00000494420 FAM83GA6ND36 823 aa27.6■■■□□ 2.01
HOXB-AS3-215ENST00000494420 NBPF8Q3BBV2 869 aa27.6■■■□□ 2.01
HOXB-AS3-215ENST00000494420 CABP2Q9NPB3 220 aa27.6■■■□□ 2.01
HOXB-AS3-215ENST00000494420 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP27.59■■■□□ 2.01
HOXB-AS3-215ENST00000494420 ITSN1Q15811 1721 aa27.58■■■□□ 2.01
HOXB-AS3-215ENST00000494420 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP27.56■■■□□ 2
HOXB-AS3-215ENST00000494420 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP27.55■■■□□ 2
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