RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491889.5

GLIS3-217, Transcript of GLIS family zinc finger 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene GLIS3, Length 797 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLIS3-217ENST00000491889 CADPS2Q86UW7 1296 aa29.42■■■□□ 2.3
GLIS3-217ENST00000491889 PRAM1Q96QH2 718 aa29.42■■■□□ 2.3
GLIS3-217ENST00000491889 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa29.42■■■□□ 2.3
GLIS3-217ENST00000491889 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa29.41■■■□□ 2.3
GLIS3-217ENST00000491889 RALGAPBQ86X10 1494 aa29.41■■■□□ 2.3
GLIS3-217ENST00000491889 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP29.41■■■□□ 2.3
GLIS3-217ENST00000491889 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP29.4■■■□□ 2.3
GLIS3-217ENST00000491889 POGKQ9P215 609 aa29.38■■■□□ 2.29
GLIS3-217ENST00000491889 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa29.37■■■□□ 2.29
GLIS3-217ENST00000491889 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP29.37■■■□□ 2.29
GLIS3-217ENST00000491889 SLAIN2Q9P270 581 aa29.37■■■□□ 2.29
GLIS3-217ENST00000491889 GPRASP1Q5JY77 1395 aa29.37■■■□□ 2.29
GLIS3-217ENST00000491889 MST1RQ04912 1400 aa29.37■■■□□ 2.29
GLIS3-217ENST00000491889 ADGRB2O60241 1585 aa29.35■■■□□ 2.29
GLIS3-217ENST00000491889 FMN2Q9NZ56 1722 aa29.33■■■□□ 2.29
GLIS3-217ENST00000491889 C1orf167Q5SNV9 1468 aa29.29■■■□□ 2.28
GLIS3-217ENST00000491889 QRICH2Q9H0J4 1663 aa29.28■■■□□ 2.28
GLIS3-217ENST00000491889 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP29.28■■■□□ 2.28
GLIS3-217ENST00000491889 CARD11Q9BXL7 1154 aa29.26■■■□□ 2.27
GLIS3-217ENST00000491889 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP29.25■■■□□ 2.27
GLIS3-217ENST00000491889 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP29.24■■■□□ 2.27
GLIS3-217ENST00000491889 BRINP3Q76B58 766 aa29.23■■■□□ 2.27
GLIS3-217ENST00000491889 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP29.23■■■□□ 2.27
GLIS3-217ENST00000491889 HSPA1LP34931 641 aa29.22■■■□□ 2.27
GLIS3-217ENST00000491889 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP29.22■■■□□ 2.27
GLIS3-217ENST00000491889 USP32Q8NFA0 1604 aa29.2■■■□□ 2.27
GLIS3-217ENST00000491889 NUTM2FA1L443 756 aa29.2■■■□□ 2.26
GLIS3-217ENST00000491889 PHLPP1O60346 1717 aa29.19■■■□□ 2.26
GLIS3-217ENST00000491889 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP29.19■■■□□ 2.26
GLIS3-217ENST00000491889 NHSL1Q5SYE7 1610 aa29.18■■■□□ 2.26
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GLIS3-217ENST00000491889 TULP4Q9NRJ4 1543 aa29.16■■■□□ 2.26
GLIS3-217ENST00000491889 ANKARQ7Z5J8 1434 aa29.16■■■□□ 2.26
GLIS3-217ENST00000491889 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP29.13■■■□□ 2.25
GLIS3-217ENST00000491889 KIF1AQ12756 1690 aa29.12■■■□□ 2.25
GLIS3-217ENST00000491889 ESCO1Q5FWF5 840 aa29.12■■■□□ 2.25
GLIS3-217ENST00000491889 PRR36Q9H6K5 1346 aa29.11■■■□□ 2.25
GLIS3-217ENST00000491889 ATP7BP35670 1465 aa29.1■■■□□ 2.25
GLIS3-217ENST00000491889 ITSN1Q15811 1721 aa29.09■■■□□ 2.25
GLIS3-217ENST00000491889 CDK19Q9BWU1 502 aa29.09■■■□□ 2.25
GLIS3-217ENST00000491889 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa29.09■■■□□ 2.25
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GLIS3-217ENST00000491889 EVC2Q86UK5 1308 aa29.03■■■□□ 2.24
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GLIS3-217ENST00000491889 PHF8Q9UPP1 1060 aa29.03■■■□□ 2.24
GLIS3-217ENST00000491889 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa29.02■■■□□ 2.24
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GLIS3-217ENST00000491889 PXDNQ92626 1479 aa29■■■□□ 2.23
GLIS3-217ENST00000491889 CABP2Q9NPB3 220 aa29■■■□□ 2.23
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GLIS3-217ENST00000491889 CCDC61Q9Y6R9 512 aa28.96■■■□□ 2.23
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GLIS3-217ENST00000491889 ATAD2Q6PL18 1390 aa28.89■■■□□ 2.22
GLIS3-217ENST00000491889 PLEKHG3A1L390 1219 aa28.89■■■□□ 2.22
GLIS3-217ENST00000491889 KRT28Q7Z3Y7 464 aa28.89■■■□□ 2.22
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GLIS3-217ENST00000491889 SLC24A1O60721 1099 aa28.87■■■□□ 2.21
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GLIS3-217ENST00000491889 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP28.84■■■□□ 2.21
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GLIS3-217ENST00000491889 SBNO1A3KN83 1393 aa28.84■■■□□ 2.21
GLIS3-217ENST00000491889 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP28.83■■■□□ 2.21
GLIS3-217ENST00000491889 TMF1P82094 1093 aa28.83■■■□□ 2.21
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GLIS3-217ENST00000491889 TNS3Q68CZ2 1445 aa28.83■■■□□ 2.21
GLIS3-217ENST00000491889 ALS2Q96Q42 1657 aa28.82■■■□□ 2.2
GLIS3-217ENST00000491889 AKAP12Q02952 1782 aa28.82■■■□□ 2.2
GLIS3-217ENST00000491889 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa28.8■■■□□ 2.2
GLIS3-217ENST00000491889 LRP6O75581 1613 aa28.78■■■□□ 2.2
GLIS3-217ENST00000491889 USP6P35125 1406 aa28.75■■■□□ 2.19
GLIS3-217ENST00000491889 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP28.75■■■□□ 2.19
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GLIS3-217ENST00000491889 ARHGEF10O15013 1369 aa28.74■■■□□ 2.19
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GLIS3-217ENST00000491889 TMC1Q8TDI8 760 aa28.73■■■□□ 2.19
GLIS3-217ENST00000491889 ABCA3Q99758 1704 aa28.72■■■□□ 2.19
GLIS3-217ENST00000491889 NRKQ7Z2Y5 1582 aa28.72■■■□□ 2.19
GLIS3-217ENST00000491889 CDCA8Q53HL2 280 aa28.72■■■□□ 2.19
GLIS3-217ENST00000491889 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa28.72■■■□□ 2.19
GLIS3-217ENST00000491889 MYOM1P52179 1685 aa28.71■■■□□ 2.19
GLIS3-217ENST00000491889 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP28.71■■■□□ 2.19
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