RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489343.5

NPHP3-AS1-201, NPHP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NPHP3-AS1, Length 2,957 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
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NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa20.45■□□□□ 0.86
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GGNBP2Q9H3C7 697 aa20.45■□□□□ 0.86
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DMRT2Q9Y5R5 561 aa20.45■□□□□ 0.86
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RNF123Q5XPI4 1314 aa20.45■□□□□ 0.86
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GLI2P10070 1586 aa20.45■□□□□ 0.86
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PREX1Q8TCU6 1659 aa20.45■□□□□ 0.86
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NUTM2FA1L443 756 aa20.45■□□□□ 0.86
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TRHP20396 242 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SKAP1Q86WV1 359 aa20.44■□□□□ 0.86
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa20.44■□□□□ 0.86
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa20.43■□□□□ 0.86
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa20.43■□□□□ 0.86
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KIF13AQ9H1H9 1805 aa20.41■□□□□ 0.86
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 EVC2Q86UK5 1308 aa20.41■□□□□ 0.86
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 C20orf194Q5TEA3 1177 aa20.4■□□□□ 0.86
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MTHFSP49914 203 aa20.4■□□□□ 0.86
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP20.4■□□□□ 0.86
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NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TULP4Q9NRJ4 1543 aa20.38■□□□□ 0.85
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa20.38■□□□□ 0.85
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa20.38■□□□□ 0.85
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CABP1Q9NZU7 370 aa20.37■□□□□ 0.85
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CDK19Q9BWU1 502 aa20.36■□□□□ 0.85
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NEURL4Q96JN8 1562 aa20.35■□□□□ 0.85
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZMYM3Q14202 1370 aa20.34■□□□□ 0.85
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa20.34■□□□□ 0.85
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa20.34■□□□□ 0.85
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CRBNQ96SW2 442 aa20.33■□□□□ 0.85
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 A0A1W2PP64 1363 aa20.33■□□□□ 0.84
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PDE3BQ13370 1112 aa20.31■□□□□ 0.84
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SLC26A8Q96RN1 970 aa20.31■□□□□ 0.84
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CGNL1Q0VF96 1302 aa20.31■□□□□ 0.84
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RIMS2Q9UQ26 1411 aa20.3■□□□□ 0.84
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa20.3■□□□□ 0.84
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZRANB1Q9UGI0 708 aa20.3■□□□□ 0.84
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MYO3AQ8NEV4 1616 aa20.3■□□□□ 0.84
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GOLGA2Q08379 1002 aa20.29■□□□□ 0.84
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DUSP27Q5VZP5 1158 aa20.29■□□□□ 0.84
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 A2ML1A8K2U0 1454 aa20.29■□□□□ 0.84
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 METP08581 1390 aa20.29■□□□□ 0.84
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NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PTPRMP28827 1452 aa20.27■□□□□ 0.84
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 BCAR3O75815 825 aa20.27■□□□□ 0.84
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SOX12O15370 315 aa20.25■□□□□ 0.83
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 BCL2L13Q9BXK5 485 aa20.25■□□□□ 0.83
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FYB1O15117 783 aa20.25■□□□□ 0.83
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SLC24A1O60721 1099 aa20.24■□□□□ 0.83
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LTKP29376 864 aa20.24■□□□□ 0.83
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TCP11L2Q8N4U5 519 aa20.24■□□□□ 0.83
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa20.23■□□□□ 0.83
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa20.22■□□□□ 0.83
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa20.21■□□□□ 0.83
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PDE4AP27815 886 aa20.21■□□□□ 0.83
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SLFN5Q08AF3 891 aa20.21■□□□□ 0.83
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZNF521Q96K83 1311 aa20.21■□□□□ 0.83
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NME9Q86XW9 330 aa20.19■□□□□ 0.82
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 WWC1Q8IX03 1113 aa20.19■□□□□ 0.82
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TNRQ92752 1358 aa20.19■□□□□ 0.82
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TERF2IPQ9NYB0 399 aa20.18■□□□□ 0.82
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZFYVE9O95405 1425 aa20.18■□□□□ 0.82
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TNNQ9UQP3 1299 aa20.18■□□□□ 0.82
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 AGLP35573 1532 aa20.17■□□□□ 0.82
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PLEKHG5O94827 1062 aa20.16■□□□□ 0.82
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CFAP53Q96M91 514 aa20.16■□□□□ 0.82
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HMOX1P09601 288 aa20.15■□□□□ 0.82
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa20.15■□□□□ 0.82
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CD163L1Q9NR16 1453 aa20.15■□□□□ 0.82
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa20.15■□□□□ 0.82
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.82
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RUNDC1Q96C34 613 aa20.13■□□□□ 0.81
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SHPRHQ149N8 1683 aa20.12■□□□□ 0.81
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 WASLO00401 505 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CLUAP1Q96AJ1 413 aa20.12■□□□□ 0.81
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RGS3P49796 1198 aa20.11■□□□□ 0.81
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