RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487548.2

SENP6-210, Transcript of SUMO specific peptidase 6, humanhuman

TSL 2

Gene SENP6, Length 427 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Exosome, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP6-210ENST00000487548 TRIM32Q13049 653 aa8.75□□□□□ -1.01
SENP6-210ENST00000487548 MSS51Q4VC12 460 aa8.75□□□□□ -1.01
SENP6-210ENST00000487548 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
SENP6-210ENST00000487548 CTC1Q2NKJ3 1217 aa8.74□□□□□ -1.01
SENP6-210ENST00000487548 HLA-CQ95604 372 aa8.74□□□□□ -1.01
SENP6-210ENST00000487548 MRGPRX2Q96LB1 330 aa8.74□□□□□ -1.01
SENP6-210ENST00000487548 J3QL48 77 aa8.73□□□□□ -1.01
SENP6-210ENST00000487548 WNT7AO00755 349 aa8.73□□□□□ -1.01
SENP6-210ENST00000487548 SMPD1P17405 629 aa8.73□□□□□ -1.01
SENP6-210ENST00000487548 Q3C1V9 767 aa8.73□□□□□ -1.01
SENP6-210ENST00000487548 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
SENP6-210ENST00000487548 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
SENP6-210ENST00000487548 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
SENP6-210ENST00000487548 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
SENP6-210ENST00000487548 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
SENP6-210ENST00000487548 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa8.71□□□□□ -1.02
SENP6-210ENST00000487548 KDM4AO75164 1064 aa8.7□□□□□ -1.02
SENP6-210ENST00000487548 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
SENP6-210ENST00000487548 PLCB2Q00722 1185 aa8.7□□□□□ -1.02
SENP6-210ENST00000487548 CD46P15529 392 aa8.69□□□□□ -1.02
SENP6-210ENST00000487548 MMP16P51512 607 aa8.69□□□□□ -1.02
SENP6-210ENST00000487548 GUCA2AQ02747 115 aa8.69□□□□□ -1.02
SENP6-210ENST00000487548 HPS1Q92902 700 aa8.69□□□□□ -1.02
SENP6-210ENST00000487548 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
SENP6-210ENST00000487548 DXOO77932 396 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
SENP6-210ENST00000487548 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
SENP6-210ENST00000487548 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
SENP6-210ENST00000487548 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
SENP6-210ENST00000487548 ALDH1A1P00352 501 aa8.65□□□□□ -1.02
SENP6-210ENST00000487548 SKOR1P84550 965 aa8.65□□□□□ -1.02
SENP6-210ENST00000487548 MAP2K5Q13163 448 aa8.65□□□□□ -1.02
SENP6-210ENST00000487548 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
SENP6-210ENST00000487548 HOXA2O43364 376 aa8.63□□□□□ -1.03
SENP6-210ENST00000487548 TRIM47Q96LD4 638 aa8.63□□□□□ -1.03
SENP6-210ENST00000487548 IRF6O14896 467 aa8.62□□□□□ -1.03
SENP6-210ENST00000487548 SENP2Q9HC62 589 aa8.62□□□□□ -1.03
SENP6-210ENST00000487548 TERTO14746 1132 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
SENP6-210ENST00000487548 USP46P62068 366 aa8.61□□□□□ -1.03
SENP6-210ENST00000487548 JUNDP17535 347 aa8.6□□□□□ -1.03
SENP6-210ENST00000487548 WNT7BP56706 349 aa8.6□□□□□ -1.03
SENP6-210ENST00000487548 LCE2CQ5TA81 110 aa8.6□□□□□ -1.03
SENP6-210ENST00000487548 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
SENP6-210ENST00000487548 CCDC102AQ96A19 550 aa8.6□□□□□ -1.03
SENP6-210ENST00000487548 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
SENP6-210ENST00000487548 BMP1P13497 986 aa8.59□□□□□ -1.03
SENP6-210ENST00000487548 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
SENP6-210ENST00000487548 NUTM1Q86Y26 1132 aa8.59□□□□□ -1.03
SENP6-210ENST00000487548 EHBP1Q8NDI1 1231 aa8.59□□□□□ -1.03
SENP6-210ENST00000487548 STK17AQ9UEE5 414 aa8.59□□□□□ -1.03
SENP6-210ENST00000487548 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa8.59□□□□□ -1.03
SENP6-210ENST00000487548 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
SENP6-210ENST00000487548 NUDT12Q9BQG2 462 aa8.58□□□□□ -1.04
SENP6-210ENST00000487548 C6orf229H3BNL8 230 aa8.57□□□□□ -1.04
SENP6-210ENST00000487548 WIPF1O43516 503 aa8.57□□□□□ -1.04
SENP6-210ENST00000487548 KIFC2Q96AC6 838 aa8.57□□□□□ -1.04
SENP6-210ENST00000487548 WASF2Q9Y6W5 498 aa8.57□□□□□ -1.04
SENP6-210ENST00000487548 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
SENP6-210ENST00000487548 GPCPD1Q9NPB8 672 aa8.56□□□□□ -1.04
SENP6-210ENST00000487548 CLCN1P35523 988 aa8.55□□□□□ -1.04
SENP6-210ENST00000487548 VEGFBP49765 207 aa8.55□□□□□ -1.04
SENP6-210ENST00000487548 LINC01559Q495D7 138 aa8.55□□□□□ -1.04
SENP6-210ENST00000487548 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
SENP6-210ENST00000487548 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
SENP6-210ENST00000487548 FDX1P10109 184 aa8.54□□□□□ -1.04
SENP6-210ENST00000487548 RETREG3Q86VR2 466 aa8.54□□□□□ -1.04
SENP6-210ENST00000487548 MS4A1P11836 297 aa8.52□□□□□ -1.05
SENP6-210ENST00000487548 TRIM46Q7Z4K8 759 aa8.52□□□□□ -1.05
SENP6-210ENST00000487548 SLC16A10Q8TF71 515 aa8.52□□□□□ -1.05
SENP6-210ENST00000487548 PCDHGC3Q9UN70 934 aa8.52□□□□□ -1.05
SENP6-210ENST00000487548 SIAH2O43255 324 aa8.51□□□□□ -1.05
SENP6-210ENST00000487548 SH3BP2P78314 561 aa8.51□□□□□ -1.05
SENP6-210ENST00000487548 TLL2Q9Y6L7 1015 aa8.51□□□□□ -1.05
SENP6-210ENST00000487548 CCNYL3P0C7X3 344 aa8.5□□□□□ -1.05
SENP6-210ENST00000487548 NDUFV2P19404 249 aa8.5□□□□□ -1.05
SENP6-210ENST00000487548 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
SENP6-210ENST00000487548 GMPRP36959 345 aa8.49□□□□□ -1.05
SENP6-210ENST00000487548 BAP1Q92560 729 aa8.48□□□□□ -1.05
SENP6-210ENST00000487548 UNC93B1Q9H1C4 597 aa8.48□□□□□ -1.05
SENP6-210ENST00000487548 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
SENP6-210ENST00000487548 MOXD2PA6NHM9 499 aa8.46□□□□□ -1.06
SENP6-210ENST00000487548 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
SENP6-210ENST00000487548 PRR7Q8TB68 274 aa8.46□□□□□ -1.06
SENP6-210ENST00000487548 SPIRE2Q8WWL2 714 aa8.46□□□□□ -1.06
SENP6-210ENST00000487548 ZFP42Q96MM3 310 aa8.46□□□□□ -1.06
SENP6-210ENST00000487548 IRF7Q92985 503 aa8.45□□□□□ -1.06
SENP6-210ENST00000487548 CTHP32929 405 aa8.44□□□□□ -1.06
SENP6-210ENST00000487548 NNTQ13423 1086 aa8.44□□□□□ -1.06
SENP6-210ENST00000487548 PTPRNQ16849 979 aa8.44□□□□□ -1.06
SENP6-210ENST00000487548 SOBPA7XYQ1 873 aa8.43□□□□□ -1.06
SENP6-210ENST00000487548 KCNH2Q12809 1159 aa8.43□□□□□ -1.06
SENP6-210ENST00000487548 ZNF511Q8NB15 262 aa8.43□□□□□ -1.06
SENP6-210ENST00000487548 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
SENP6-210ENST00000487548 EVA1BQ9NVM1 165 aa8.43□□□□□ -1.06
SENP6-210ENST00000487548 ERBB4Q15303 1308 aa8.43□□□□□ -1.06
SENP6-210ENST00000487548 FAM181BA6NEQ2 426 aa8.42□□□□□ -1.06
SENP6-210ENST00000487548 ARID5BQ14865 1188 aa8.42□□□□□ -1.06
SENP6-210ENST00000487548 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa8.42□□□□□ -1.06
SENP6-210ENST00000487548 WDR4P57081 412 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
SENP6-210ENST00000487548 MTMR2Q13614 643 aa8.41□□□□□ -1.06
SENP6-210ENST00000487548 PLEKHG3A1L390 1219 aa8.4□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.9 ms