RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486517.5

C1orf61-217, Transcript of chromosome 1 open reading frame 61, humanhuman

TSL 3

Gene C1orf61, Length 726 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61-217ENST00000486517 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa23.56■■□□□ 1.36
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C1orf61-217ENST00000486517 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
C1orf61-217ENST00000486517 ORAI2Q96SN7 254 aa23.5■■□□□ 1.35
C1orf61-217ENST00000486517 LRP5O75197 1615 aa23.49■■□□□ 1.35
C1orf61-217ENST00000486517 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
C1orf61-217ENST00000486517 BCL9LQ86UU0 1499 aa23.49■■□□□ 1.35
C1orf61-217ENST00000486517 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
C1orf61-217ENST00000486517 MYOM2P54296 1465 aa23.47■■□□□ 1.35
C1orf61-217ENST00000486517 CLTCL1P53675 1640 aa23.46■■□□□ 1.35
C1orf61-217ENST00000486517 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
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C1orf61-217ENST00000486517 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa23.45■■□□□ 1.34
C1orf61-217ENST00000486517 BRWD3Q6RI45 1802 aa23.45■■□□□ 1.34
C1orf61-217ENST00000486517 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
C1orf61-217ENST00000486517 CCDC144AA2RUR9 1427 aa23.43■■□□□ 1.34
C1orf61-217ENST00000486517 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa23.43■■□□□ 1.34
C1orf61-217ENST00000486517 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa23.42■■□□□ 1.34
C1orf61-217ENST00000486517 GLI3P10071 1580 aa23.4■■□□□ 1.34
C1orf61-217ENST00000486517 DEFB132Q7Z7B7 95 aa23.4■■□□□ 1.34
C1orf61-217ENST00000486517 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa23.4■■□□□ 1.34
C1orf61-217ENST00000486517 ROBO2Q9HCK4 1378 aa23.39■■□□□ 1.33
C1orf61-217ENST00000486517 RALGAPBQ86X10 1494 aa23.37■■□□□ 1.33
C1orf61-217ENST00000486517 PXDNQ92626 1479 aa23.36■■□□□ 1.33
C1orf61-217ENST00000486517 VGFO15240 615 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
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C1orf61-217ENST00000486517 NPHP3Q7Z494 1330 aa23.35■■□□□ 1.33
C1orf61-217ENST00000486517 ESCO1Q5FWF5 840 aa23.32■■□□□ 1.32
C1orf61-217ENST00000486517 UNC5CLQ8IV45 518 aa23.32■■□□□ 1.32
C1orf61-217ENST00000486517 SLIT2O94813 1529 aa23.32■■□□□ 1.32
C1orf61-217ENST00000486517 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
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C1orf61-217ENST00000486517 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa23.31■■□□□ 1.32
C1orf61-217ENST00000486517 STAC3Q96MF2 364 aa23.29■■□□□ 1.32
C1orf61-217ENST00000486517 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
C1orf61-217ENST00000486517 FOXO3O43524 673 aa23.28■■□□□ 1.32
C1orf61-217ENST00000486517 USP32Q8NFA0 1604 aa23.26■■□□□ 1.31
C1orf61-217ENST00000486517 SEPT12Q8IYM1 358 aa23.26■■□□□ 1.31
C1orf61-217ENST00000486517 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
C1orf61-217ENST00000486517 PLCH1Q4KWH8 1693 aa23.22■■□□□ 1.31
C1orf61-217ENST00000486517 RGL3Q3MIN7 710 aa23.21■■□□□ 1.31
C1orf61-217ENST00000486517 NWD2Q9ULI1 1742 aa23.21■■□□□ 1.31
C1orf61-217ENST00000486517 PPLO60437 1756 aa23.2■■□□□ 1.3
C1orf61-217ENST00000486517 NRXN1Q9ULB1 1477 aa23.2■■□□□ 1.3
C1orf61-217ENST00000486517 KRT27Q7Z3Y8 459 aa23.2■■□□□ 1.3
C1orf61-217ENST00000486517 BAG6P46379 1132 aa23.19■■□□□ 1.3
C1orf61-217ENST00000486517 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa23.18■■□□□ 1.3
C1orf61-217ENST00000486517 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa23.18■■□□□ 1.3
C1orf61-217ENST00000486517 NUTM2FA1L443 756 aa23.18■■□□□ 1.3
C1orf61-217ENST00000486517 VPS72Q15906 364 aa23.18■■□□□ 1.3
C1orf61-217ENST00000486517 KIF1AQ12756 1690 aa23.18■■□□□ 1.3
C1orf61-217ENST00000486517 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
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C1orf61-217ENST00000486517 PIK3C2GO75747 1445 aa23.16■■□□□ 1.3
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C1orf61-217ENST00000486517 ABCA3Q99758 1704 aa23.14■■□□□ 1.3
C1orf61-217ENST00000486517 FMN2Q9NZ56 1722 aa23.14■■□□□ 1.3
C1orf61-217ENST00000486517 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.29
C1orf61-217ENST00000486517 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
C1orf61-217ENST00000486517 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
C1orf61-217ENST00000486517 A0A0G2JS52 829 aa23.1■■□□□ 1.29
C1orf61-217ENST00000486517 MYT1Q01538 1121 aa23.1■■□□□ 1.29
C1orf61-217ENST00000486517 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
C1orf61-217ENST00000486517 KRT28Q7Z3Y7 464 aa23.1■■□□□ 1.29
C1orf61-217ENST00000486517 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
C1orf61-217ENST00000486517 CABLES1Q8TDN4 633 aa23.09■■□□□ 1.29
C1orf61-217ENST00000486517 TNS3Q68CZ2 1445 aa23.08■■□□□ 1.29
C1orf61-217ENST00000486517 WAPLQ7Z5K2 1190 aa23.08■■□□□ 1.29
C1orf61-217ENST00000486517 NRAPQ86VF7 1730 aa23.08■■□□□ 1.28
C1orf61-217ENST00000486517 PLEKHG5O94827 1062 aa23.07■■□□□ 1.28
C1orf61-217ENST00000486517 KNDC1Q76NI1 1749 aa23.07■■□□□ 1.28
C1orf61-217ENST00000486517 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
C1orf61-217ENST00000486517 DCAF11Q8TEB1 546 aa23.06■■□□□ 1.28
C1orf61-217ENST00000486517 SIRT1Q96EB6 747 aa23.06■■□□□ 1.28
C1orf61-217ENST00000486517 TECPR2O15040 1411 aa23.06■■□□□ 1.28
C1orf61-217ENST00000486517 ABCC11Q96J66 1382 aa23.05■■□□□ 1.28
C1orf61-217ENST00000486517 STK26Q9P289 416 aa23.05■■□□□ 1.28
C1orf61-217ENST00000486517 YY1P25490 414 aa23.04■■□□□ 1.28
C1orf61-217ENST00000486517 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
C1orf61-217ENST00000486517 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa23.03■■□□□ 1.28
C1orf61-217ENST00000486517 DISP2A7MBM2 1401 aa23.01■■□□□ 1.27
C1orf61-217ENST00000486517 PSME1Q06323 249 aa23.01■■□□□ 1.27
C1orf61-217ENST00000486517 FAM83GA6ND36 823 aa23■■□□□ 1.27
C1orf61-217ENST00000486517 FAM182BQ5T319 152 aa23■■□□□ 1.27
C1orf61-217ENST00000486517 LMOD2Q6P5Q4 547 aa23■■□□□ 1.27
C1orf61-217ENST00000486517 PCGF6Q9BYE7 350 aa23■■□□□ 1.27
C1orf61-217ENST00000486517 CFAP70Q5T0N1 1121 aa22.99■■□□□ 1.27
C1orf61-217ENST00000486517 SIN3AQ96ST3 1273 aa22.98■■□□□ 1.27
C1orf61-217ENST00000486517 PHF8Q9UPP1 1060 aa22.98■■□□□ 1.27
C1orf61-217ENST00000486517 CLSPNQ9HAW4 1339 aa22.98■■□□□ 1.27
C1orf61-217ENST00000486517 SBNO1A3KN83 1393 aa22.98■■□□□ 1.27
C1orf61-217ENST00000486517 ARHGEF10O15013 1369 aa22.98■■□□□ 1.27
C1orf61-217ENST00000486517 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
C1orf61-217ENST00000486517 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
C1orf61-217ENST00000486517 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
C1orf61-217ENST00000486517 L3MBTL2Q969R5 705 aa22.96■■□□□ 1.27
C1orf61-217ENST00000486517 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa22.96■■□□□ 1.27
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