RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484988.2

SGIP1-211, Transcript of SH3 domain GRB2 like endophilin interacting protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene SGIP1, Length 440 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1-211ENST00000484988 PLA2G2CQ5R387 149 aa6.96□□□□□ -1.3
SGIP1-211ENST00000484988 LIAT1Q6ZQX7 453 aa6.96□□□□□ -1.3
SGIP1-211ENST00000484988 TBC1D2Q9BYX2 928 aa6.96□□□□□ -1.3
SGIP1-211ENST00000484988 PRDM9Q9NQV7 894 aa6.96□□□□□ -1.3
SGIP1-211ENST00000484988 GJA5P36382 358 aa6.95□□□□□ -1.3
SGIP1-211ENST00000484988 MMP16P51512 607 aa6.95□□□□□ -1.3
SGIP1-211ENST00000484988 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
SGIP1-211ENST00000484988 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
SGIP1-211ENST00000484988 SPTLC1O15269 473 aa6.94□□□□□ -1.3
SGIP1-211ENST00000484988 DXOO77932 396 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
SGIP1-211ENST00000484988 SPRYD7Q5W111 196 aa6.94□□□□□ -1.3
SGIP1-211ENST00000484988 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
SGIP1-211ENST00000484988 RETREG3Q86VR2 466 aa6.93□□□□□ -1.3
SGIP1-211ENST00000484988 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
SGIP1-211ENST00000484988 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
SGIP1-211ENST00000484988 RPIAP49247 311 aa6.91□□□□□ -1.3
SGIP1-211ENST00000484988 RIC3Q7Z5B4 369 aa6.91□□□□□ -1.3
SGIP1-211ENST00000484988 KDM4CQ9H3R0 1056 aa6.91□□□□□ -1.3
SGIP1-211ENST00000484988 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
SGIP1-211ENST00000484988 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa6.91□□□□□ -1.3
SGIP1-211ENST00000484988 C6orf229H3BNL8 230 aa6.9□□□□□ -1.3
SGIP1-211ENST00000484988 JUNDP17535 347 aa6.9□□□□□ -1.3
SGIP1-211ENST00000484988 MYSM1Q5VVJ2 828 aa6.9□□□□□ -1.3
SGIP1-211ENST00000484988 TRIM67Q6ZTA4 783 aa6.9□□□□□ -1.3
SGIP1-211ENST00000484988 SPDYE5A6NIY4 337 aa6.89□□□□□ -1.31
SGIP1-211ENST00000484988 GFRA3O60609 400 aa6.89□□□□□ -1.31
SGIP1-211ENST00000484988 MTMR2Q13614 643 aa6.89□□□□□ -1.31
SGIP1-211ENST00000484988 LAPTM4AQ15012 233 aa6.89□□□□□ -1.31
SGIP1-211ENST00000484988 TUSC1Q2TAM9 212 aa6.89□□□□□ -1.31
SGIP1-211ENST00000484988 ZNF697Q5TEC3 545 aa6.88□□□□□ -1.31
SGIP1-211ENST00000484988 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
SGIP1-211ENST00000484988 RSPH6AQ9H0K4 717 aa6.88□□□□□ -1.31
SGIP1-211ENST00000484988 LIMD1Q9UGP4 676 aa6.88□□□□□ -1.31
SGIP1-211ENST00000484988 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
SGIP1-211ENST00000484988 GDF9O60383 454 aa6.87□□□□□ -1.31
SGIP1-211ENST00000484988 HRCP23327 699 aa6.87□□□□□ -1.31
SGIP1-211ENST00000484988 TPRNQ4KMQ1 711 aa6.87□□□□□ -1.31
SGIP1-211ENST00000484988 DESI1Q6ICB0 168 aa6.87□□□□□ -1.31
SGIP1-211ENST00000484988 PRR7Q8TB68 274 aa6.87□□□□□ -1.31
SGIP1-211ENST00000484988 FAM117AQ9C073 453 aa6.87□□□□□ -1.31
SGIP1-211ENST00000484988 PLEKHG3A1L390 1219 aa6.86□□□□□ -1.31
SGIP1-211ENST00000484988 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
SGIP1-211ENST00000484988 PRR20EP86478 221 aa6.86□□□□□ -1.31
SGIP1-211ENST00000484988 PRR20CP86479 221 aa6.86□□□□□ -1.31
SGIP1-211ENST00000484988 PRR20DP86480 221 aa6.86□□□□□ -1.31
SGIP1-211ENST00000484988 PRR20BP86481 221 aa6.86□□□□□ -1.31
SGIP1-211ENST00000484988 PRR20AP86496 221 aa6.86□□□□□ -1.31
SGIP1-211ENST00000484988 DDRGK1Q96HY6 314 aa6.86□□□□□ -1.31
SGIP1-211ENST00000484988 ZBTB3Q9H5J0 574 aa6.86□□□□□ -1.31
SGIP1-211ENST00000484988 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa6.86□□□□□ -1.31
SGIP1-211ENST00000484988 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
SGIP1-211ENST00000484988 LILRB3O75022 631 aa6.85□□□□□ -1.31
SGIP1-211ENST00000484988 CABLES1Q8TDN4 633 aa6.85□□□□□ -1.31
SGIP1-211ENST00000484988 PKD2L1Q9P0L9 805 aa6.85□□□□□ -1.31
SGIP1-211ENST00000484988 CFAP99D6REC4 459 aa6.84□□□□□ -1.31
SGIP1-211ENST00000484988 CLK2P49760 499 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
SGIP1-211ENST00000484988 QPCTQ16769 361 aa6.84□□□□□ -1.31
SGIP1-211ENST00000484988 PTPRNQ16849 979 aa6.84□□□□□ -1.31
SGIP1-211ENST00000484988 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa6.84□□□□□ -1.31
SGIP1-211ENST00000484988 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
SGIP1-211ENST00000484988 CCDC24Q8N4L8 307 aa6.84□□□□□ -1.31
SGIP1-211ENST00000484988 NUDT12Q9BQG2 462 aa6.84□□□□□ -1.31
SGIP1-211ENST00000484988 POLR3EQ9NVU0 708 aa6.84□□□□□ -1.31
SGIP1-211ENST00000484988 TRIM32Q13049 653 aa6.83□□□□□ -1.32
SGIP1-211ENST00000484988 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
SGIP1-211ENST00000484988 SH3D19Q5HYK7 790 aa6.83□□□□□ -1.32
SGIP1-211ENST00000484988 EVA1BQ9NVM1 165 aa6.83□□□□□ -1.32
SGIP1-211ENST00000484988 CCNYL3P0C7X3 344 aa6.82□□□□□ -1.32
SGIP1-211ENST00000484988 LYPD8Q6UX82 237 aa6.82□□□□□ -1.32
SGIP1-211ENST00000484988 Q6ZNB5 142 aa6.82□□□□□ -1.32
SGIP1-211ENST00000484988 TNFRSF10AO00220 468 aa6.81□□□□□ -1.32
SGIP1-211ENST00000484988 LCE2BO14633 110 aa6.81□□□□□ -1.32
SGIP1-211ENST00000484988 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
SGIP1-211ENST00000484988 NEUROD2Q15784 382 aa6.81□□□□□ -1.32
SGIP1-211ENST00000484988 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
SGIP1-211ENST00000484988 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
SGIP1-211ENST00000484988 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
SGIP1-211ENST00000484988 KCNH2Q12809 1159 aa6.8□□□□□ -1.32
SGIP1-211ENST00000484988 FOXC1Q12948 553 aa6.8□□□□□ -1.32
SGIP1-211ENST00000484988 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
SGIP1-211ENST00000484988 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
SGIP1-211ENST00000484988 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
SGIP1-211ENST00000484988 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP6.8□□□□□ -1.32
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SGIP1-211ENST00000484988 WNT7BP56706 349 aa6.79□□□□□ -1.32
SGIP1-211ENST00000484988 SKOR1P84550 965 aa6.79□□□□□ -1.32
SGIP1-211ENST00000484988 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
SGIP1-211ENST00000484988 TOR4AQ9NXH8 423 aa6.79□□□□□ -1.32
SGIP1-211ENST00000484988 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
SGIP1-211ENST00000484988 DGAT1O75907 488 aa6.78□□□□□ -1.32
SGIP1-211ENST00000484988 F12P00748 615 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
SGIP1-211ENST00000484988 PPP2R2DQ66LE6 453 aa6.78□□□□□ -1.32
SGIP1-211ENST00000484988 TRAF7Q6Q0C0 670 aa6.78□□□□□ -1.32
SGIP1-211ENST00000484988 GOPCQ9HD26 462 aa6.78□□□□□ -1.32
SGIP1-211ENST00000484988 UNC93B1Q9H1C4 597 aa6.77□□□□□ -1.33
SGIP1-211ENST00000484988 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
SGIP1-211ENST00000484988 SH3BP2P78314 561 aa6.76□□□□□ -1.33
SGIP1-211ENST00000484988 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
SGIP1-211ENST00000484988 IL27Q8NEV9 243 aa6.76□□□□□ -1.33
SGIP1-211ENST00000484988 MRGPRX2Q96LB1 330 aa6.76□□□□□ -1.33
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