RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484266.5

CHKB-210, Transcript of choline kinase beta, humanhuman

TSL 2

Gene CHKB, Length 1,401 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHKB-210ENST00000484266 PIP4K2BP78356 416 aa47.06■■■■■ 5.12
CHKB-210ENST00000484266 CADPS2Q86UW7 1296 aa47.06■■■■■ 5.12
CHKB-210ENST00000484266 ATF3P18847 181 aa47.05■■■■■ 5.12
CHKB-210ENST00000484266 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP47.03■■■■■ 5.12
CHKB-210ENST00000484266 RALGAPBQ86X10 1494 aa47.02■■■■■ 5.12
CHKB-210ENST00000484266 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP47.02■■■■■ 5.12
CHKB-210ENST00000484266 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa47■■■■■ 5.11
CHKB-210ENST00000484266 POGKQ9P215 609 aa47■■■■■ 5.11
CHKB-210ENST00000484266 SLAIN2Q9P270 581 aa46.98■■■■■ 5.11
CHKB-210ENST00000484266 GPRASP1Q5JY77 1395 aa46.98■■■■■ 5.11
CHKB-210ENST00000484266 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP46.97■■■■■ 5.11
CHKB-210ENST00000484266 MST1RQ04912 1400 aa46.95■■■■■ 5.11
CHKB-210ENST00000484266 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa46.93■■■■■ 5.1
CHKB-210ENST00000484266 ADGRB2O60241 1585 aa46.9■■■■■ 5.1
CHKB-210ENST00000484266 FMN2Q9NZ56 1722 aa46.86■■■■■ 5.09
CHKB-210ENST00000484266 CARD11Q9BXL7 1154 aa46.82■■■■■ 5.09
CHKB-210ENST00000484266 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP46.82■■■■■ 5.09
CHKB-210ENST00000484266 C1orf167Q5SNV9 1468 aa46.81■■■■■ 5.08
CHKB-210ENST00000484266 QRICH2Q9H0J4 1663 aa46.8■■■■■ 5.08
CHKB-210ENST00000484266 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP46.79■■■■■ 5.08
CHKB-210ENST00000484266 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP46.79■■■■■ 5.08
CHKB-210ENST00000484266 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP46.74■■■■■ 5.07
CHKB-210ENST00000484266 BRINP3Q76B58 766 aa46.74■■■■■ 5.07
CHKB-210ENST00000484266 HSPA1LP34931 641 aa46.72■■■■■ 5.07
CHKB-210ENST00000484266 NUTM2FA1L443 756 aa46.7■■■■■ 5.07
CHKB-210ENST00000484266 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP46.69■■■■■ 5.06
CHKB-210ENST00000484266 WASLO00401 505 aaPredicted RBP46.67■■■■■ 5.06
CHKB-210ENST00000484266 USP32Q8NFA0 1604 aa46.66■■■■■ 5.06
CHKB-210ENST00000484266 ORAI2Q96SN7 254 aa46.65■■■■■ 5.06
CHKB-210ENST00000484266 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP46.64■■■■■ 5.06
CHKB-210ENST00000484266 NHSL1Q5SYE7 1610 aa46.63■■■■■ 5.05
CHKB-210ENST00000484266 PHLPP1O60346 1717 aa46.62■■■■■ 5.05
CHKB-210ENST00000484266 TULP4Q9NRJ4 1543 aa46.62■■■■■ 5.05
CHKB-210ENST00000484266 ANKARQ7Z5J8 1434 aa46.62■■■■■ 5.05
CHKB-210ENST00000484266 ESCO1Q5FWF5 840 aa46.59■■■■■ 5.05
CHKB-210ENST00000484266 CDK19Q9BWU1 502 aa46.55■■■■■ 5.04
CHKB-210ENST00000484266 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP46.54■■■■■ 5.04
CHKB-210ENST00000484266 PRR36Q9H6K5 1346 aa46.54■■■■■ 5.04
CHKB-210ENST00000484266 KIF1AQ12756 1690 aa46.53■■■■■ 5.04
CHKB-210ENST00000484266 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa46.53■■■■■ 5.04
CHKB-210ENST00000484266 ATP7BP35670 1465 aa46.51■■■■■ 5.04
CHKB-210ENST00000484266 USP47Q96K76 1375 aa46.51■■■■■ 5.04
CHKB-210ENST00000484266 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP46.49■■■■■ 5.03
CHKB-210ENST00000484266 ITSN1Q15811 1721 aa46.48■■■■■ 5.03
CHKB-210ENST00000484266 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa46.45■■■■■ 5.03
CHKB-210ENST00000484266 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa46.44■■■■■ 5.03
CHKB-210ENST00000484266 EVC2Q86UK5 1308 aa46.44■■■■■ 5.02
CHKB-210ENST00000484266 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP46.44■■■■■ 5.02
CHKB-210ENST00000484266 PHF8Q9UPP1 1060 aa46.44■■■■■ 5.02
CHKB-210ENST00000484266 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP46.41■■■■■ 5.02
CHKB-210ENST00000484266 CABP2Q9NPB3 220 aa46.4■■■■■ 5.02
CHKB-210ENST00000484266 FOXO3O43524 673 aa46.39■■■■■ 5.02
CHKB-210ENST00000484266 NPHP3Q7Z494 1330 aa46.39■■■■■ 5.02
CHKB-210ENST00000484266 TESK2Q96S53 571 aa46.38■■■■■ 5.02
CHKB-210ENST00000484266 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP46.36■■■■■ 5.01
CHKB-210ENST00000484266 PXDNQ92626 1479 aa46.35■■■■■ 5.01
CHKB-210ENST00000484266 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa46.35■■■■■ 5.01
CHKB-210ENST00000484266 CCDC61Q9Y6R9 512 aa46.33■■■■■ 5.01
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CHKB-210ENST00000484266 SLC24A1O60721 1099 aa46.22■■■■■ 4.99
CHKB-210ENST00000484266 KRT28Q7Z3Y7 464 aa46.22■■■■■ 4.99
CHKB-210ENST00000484266 ATAD2Q6PL18 1390 aa46.21■■■■■ 4.99
CHKB-210ENST00000484266 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP46.2■■■■■ 4.99
CHKB-210ENST00000484266 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP46.2■■■■■ 4.99
CHKB-210ENST00000484266 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP46.2■■■■■ 4.99
CHKB-210ENST00000484266 PSME1Q06323 249 aa46.19■■■■■ 4.98
CHKB-210ENST00000484266 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP46.17■■■■■ 4.98
CHKB-210ENST00000484266 DISP3Q9P2K9 1392 aa46.16■■■■■ 4.98
CHKB-210ENST00000484266 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP46.16■■■■■ 4.98
CHKB-210ENST00000484266 ACEP12821 1306 aa46.16■■■■■ 4.98
CHKB-210ENST00000484266 PNPLA6Q8IY17 1366 aa46.15■■■■■ 4.98
CHKB-210ENST00000484266 CABP1Q9NZU7 370 aa46.15■■■■■ 4.98
CHKB-210ENST00000484266 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP46.14■■■■■ 4.98
CHKB-210ENST00000484266 TMF1P82094 1093 aa46.13■■■■■ 4.98
CHKB-210ENST00000484266 SBNO1A3KN83 1393 aa46.11■■■■■ 4.97
CHKB-210ENST00000484266 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa46.1■■■■■ 4.97
CHKB-210ENST00000484266 TNS3Q68CZ2 1445 aa46.09■■■■■ 4.97
CHKB-210ENST00000484266 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP46.08■■■■■ 4.97
CHKB-210ENST00000484266 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa46.06■■■■■ 4.96
CHKB-210ENST00000484266 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP46.06■■■■■ 4.96
CHKB-210ENST00000484266 AKAP12Q02952 1782 aa46.05■■■■■ 4.96
CHKB-210ENST00000484266 ALS2Q96Q42 1657 aa46.04■■■■■ 4.96
CHKB-210ENST00000484266 LRP6O75581 1613 aa45.99■■■■■ 4.95
CHKB-210ENST00000484266 CDCA8Q53HL2 280 aa45.97■■■■■ 4.95
CHKB-210ENST00000484266 TMC1Q8TDI8 760 aa45.97■■■■■ 4.95
CHKB-210ENST00000484266 USP6P35125 1406 aa45.97■■■■■ 4.95
CHKB-210ENST00000484266 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP45.97■■■■■ 4.95
CHKB-210ENST00000484266 CD163L1Q9NR16 1453 aa45.96■■■■■ 4.95
CHKB-210ENST00000484266 ARHGEF10O15013 1369 aa45.96■■■■■ 4.95
CHKB-210ENST00000484266 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa45.95■■■■■ 4.95
CHKB-210ENST00000484266 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP45.94■■■■■ 4.94
CHKB-210ENST00000484266 NINLQ9Y2I6 1382 aa45.93■■■■■ 4.94
CHKB-210ENST00000484266 MON2Q7Z3U7 1717 aa45.93■■■■■ 4.94
CHKB-210ENST00000484266 LMOD2Q6P5Q4 547 aa45.93■■■■■ 4.94
CHKB-210ENST00000484266 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP45.91■■■■■ 4.94
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