RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483859.6

SENP6-208, Transcript of SUMO specific peptidase 6, humanhuman

TSL 3

Gene SENP6, Length 1,013 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Exosome, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP6-208ENST00000483859 TRIM32Q13049 653 aa8.77□□□□□ -1.01
SENP6-208ENST00000483859 BMP1P13497 986 aa8.76□□□□□ -1.01
SENP6-208ENST00000483859 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
SENP6-208ENST00000483859 BRICD5Q6PL45 260 aa8.76□□□□□ -1.01
SENP6-208ENST00000483859 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
SENP6-208ENST00000483859 ATP6V1AP38606 617 aa8.75□□□□□ -1.01
SENP6-208ENST00000483859 ERBB4Q15303 1308 aa8.75□□□□□ -1.01
SENP6-208ENST00000483859 SLC16A10Q8TF71 515 aa8.74□□□□□ -1.01
SENP6-208ENST00000483859 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
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SENP6-208ENST00000483859 OATP04181 439 aa8.72□□□□□ -1.01
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SENP6-208ENST00000483859 KIFC2Q96AC6 838 aa8.72□□□□□ -1.01
SENP6-208ENST00000483859 TRIM46Q7Z4K8 759 aa8.71□□□□□ -1.02
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SENP6-208ENST00000483859 IRF7Q92985 503 aa8.68□□□□□ -1.02
SENP6-208ENST00000483859 PHOX2BQ99453 314 aa8.67□□□□□ -1.02
SENP6-208ENST00000483859 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
SENP6-208ENST00000483859 H3BM21 787 aa8.65□□□□□ -1.02
SENP6-208ENST00000483859 SEMA3EO15041 775 aa8.65□□□□□ -1.02
SENP6-208ENST00000483859 KCTD17Q8N5Z5 321 aa8.65□□□□□ -1.02
SENP6-208ENST00000483859 HLA-CQ95604 372 aa8.65□□□□□ -1.02
SENP6-208ENST00000483859 MMP16P51512 607 aa8.64□□□□□ -1.03
SENP6-208ENST00000483859 SOBPA7XYQ1 873 aa8.63□□□□□ -1.03
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SENP6-208ENST00000483859 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
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SENP6-208ENST00000483859 HIC1Q14526 733 aa8.61□□□□□ -1.03
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SENP6-208ENST00000483859 GSK3AP49840 483 aa8.6□□□□□ -1.03
SENP6-208ENST00000483859 ZFP42Q96MM3 310 aa8.6□□□□□ -1.03
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SENP6-208ENST00000483859 WASF2Q9Y6W5 498 aa8.55□□□□□ -1.04
SENP6-208ENST00000483859 Q3C1V9 767 aa8.54□□□□□ -1.04
SENP6-208ENST00000483859 EHBP1Q8NDI1 1231 aa8.54□□□□□ -1.04
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SENP6-208ENST00000483859 KDM4AO75164 1064 aa8.48□□□□□ -1.05
SENP6-208ENST00000483859 JUNDP17535 347 aa8.47□□□□□ -1.05
SENP6-208ENST00000483859 LINC01559Q495D7 138 aa8.47□□□□□ -1.05
SENP6-208ENST00000483859 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
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SENP6-208ENST00000483859 RASSF7Q02833 373 aa8.45□□□□□ -1.06
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SENP6-208ENST00000483859 NNTQ13423 1086 aa8.44□□□□□ -1.06
SENP6-208ENST00000483859 TMEM151AQ8N4L1 468 aa8.44□□□□□ -1.06
SENP6-208ENST00000483859 HOXA2O43364 376 aa8.43□□□□□ -1.06
SENP6-208ENST00000483859 TIMP2P16035 220 aa8.43□□□□□ -1.06
SENP6-208ENST00000483859 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
SENP6-208ENST00000483859 KRT76Q01546 638 aa8.42□□□□□ -1.06
SENP6-208ENST00000483859 BAP1Q92560 729 aa8.42□□□□□ -1.06
SENP6-208ENST00000483859 WDR4P57081 412 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
SENP6-208ENST00000483859 SCARF1Q14162 830 aa8.41□□□□□ -1.06
SENP6-208ENST00000483859 C6orf118Q5T5N4 469 aa8.41□□□□□ -1.06
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SENP6-208ENST00000483859 PPFIA3O75145 1194 aa8.4□□□□□ -1.06
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SENP6-208ENST00000483859 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa8.38□□□□□ -1.07
SENP6-208ENST00000483859 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa8.38□□□□□ -1.07
SENP6-208ENST00000483859 UNC93B1Q9H1C4 597 aa8.38□□□□□ -1.07
SENP6-208ENST00000483859 ZFAND3Q9H8U3 227 aa8.38□□□□□ -1.07
SENP6-208ENST00000483859 MAN1A2O60476 641 aa8.37□□□□□ -1.07
SENP6-208ENST00000483859 GPAT2Q6NUI2 795 aa8.37□□□□□ -1.07
SENP6-208ENST00000483859 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
SENP6-208ENST00000483859 PLCB2Q00722 1185 aa8.36□□□□□ -1.07
SENP6-208ENST00000483859 PCDHGC3Q9UN70 934 aa8.36□□□□□ -1.07
SENP6-208ENST00000483859 ADH1CP00326 375 aa8.35□□□□□ -1.07
SENP6-208ENST00000483859 CCNYL3P0C7X3 344 aa8.34□□□□□ -1.07
SENP6-208ENST00000483859 RETREG3Q86VR2 466 aa8.34□□□□□ -1.07
SENP6-208ENST00000483859 ITPKCQ96DU7 683 aa8.34□□□□□ -1.07
SENP6-208ENST00000483859 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
SENP6-208ENST00000483859 MS4A1P11836 297 aa8.33□□□□□ -1.08
SENP6-208ENST00000483859 USP46P62068 366 aa8.33□□□□□ -1.08
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