RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483092.1

CCSAP-204, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CCSAP, Length 3,492 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-204ENST00000483092 IGHDP01880 384 aa20.58■□□□□ 0.89
CCSAP-204ENST00000483092 MLECQ14165 292 aa20.58■□□□□ 0.88
CCSAP-204ENST00000483092 PANK1Q8TE04 598 aa20.57■□□□□ 0.88
CCSAP-204ENST00000483092 STAC3Q96MF2 364 aa20.57■□□□□ 0.88
CCSAP-204ENST00000483092 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
CCSAP-204ENST00000483092 TRAK2O60296 914 aa20.56■□□□□ 0.88
CCSAP-204ENST00000483092 CLUAP1Q96AJ1 413 aa20.56■□□□□ 0.88
CCSAP-204ENST00000483092 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
CCSAP-204ENST00000483092 SLFN5Q08AF3 891 aa20.56■□□□□ 0.88
CCSAP-204ENST00000483092 STAG3Q9UJ98 1225 aa20.56■□□□□ 0.88
CCSAP-204ENST00000483092 NSD3Q9BZ95 1437 aa20.55■□□□□ 0.88
CCSAP-204ENST00000483092 ERVK-7P63135 1459 aa20.55■□□□□ 0.88
CCSAP-204ENST00000483092 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
CCSAP-204ENST00000483092 MTHFSP49914 203 aa20.55■□□□□ 0.88
CCSAP-204ENST00000483092 TET3O43151 1660 aa20.54■□□□□ 0.88
CCSAP-204ENST00000483092 PODXL2Q9NZ53 605 aa20.54■□□□□ 0.88
CCSAP-204ENST00000483092 FOXD4L1Q9NU39 408 aa20.54■□□□□ 0.88
CCSAP-204ENST00000483092 LAMC1P11047 1609 aa20.54■□□□□ 0.88
CCSAP-204ENST00000483092 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
CCSAP-204ENST00000483092 RBM10P98175 930 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
CCSAP-204ENST00000483092 NPATQ14207 1427 aa20.53■□□□□ 0.88
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa20.53■□□□□ 0.88
CCSAP-204ENST00000483092 ZBTB7CA1YPR0 619 aa20.53■□□□□ 0.88
CCSAP-204ENST00000483092 ESPNB1AK53 854 aa20.53■□□□□ 0.88
CCSAP-204ENST00000483092 MCM4P33991 863 aa20.53■□□□□ 0.88
CCSAP-204ENST00000483092 CLCN1P35523 988 aa20.53■□□□□ 0.88
CCSAP-204ENST00000483092 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
CCSAP-204ENST00000483092 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa20.53■□□□□ 0.88
CCSAP-204ENST00000483092 IDI1Q13907 227 aa20.52■□□□□ 0.88
CCSAP-204ENST00000483092 TBC1D2Q9BYX2 928 aa20.52■□□□□ 0.88
CCSAP-204ENST00000483092 CEP152O94986 1710 aa20.52■□□□□ 0.88
CCSAP-204ENST00000483092 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
CCSAP-204ENST00000483092 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
CCSAP-204ENST00000483092 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
CCSAP-204ENST00000483092 IQGAP1P46940 1657 aa20.51■□□□□ 0.87
CCSAP-204ENST00000483092 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
CCSAP-204ENST00000483092 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP20.51■□□□□ 0.87
CCSAP-204ENST00000483092 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
CCSAP-204ENST00000483092 ABCA9Q8IUA7 1624 aa20.51■□□□□ 0.87
CCSAP-204ENST00000483092 GGNBP2Q9H3C7 697 aa20.5■□□□□ 0.87
CCSAP-204ENST00000483092 ABCA6Q8N139 1617 aa20.49■□□□□ 0.87
CCSAP-204ENST00000483092 TCP11L2Q8N4U5 519 aa20.48■□□□□ 0.87
CCSAP-204ENST00000483092 PLEKHG5O94827 1062 aa20.48■□□□□ 0.87
CCSAP-204ENST00000483092 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa20.48■□□□□ 0.87
CCSAP-204ENST00000483092 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
CCSAP-204ENST00000483092 MRE11P49959 708 aa20.47■□□□□ 0.87
CCSAP-204ENST00000483092 GRPEL1Q9HAV7 217 aa20.47■□□□□ 0.87
CCSAP-204ENST00000483092 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF521Q96K83 1311 aa20.47■□□□□ 0.87
CCSAP-204ENST00000483092 VGFO15240 615 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
CCSAP-204ENST00000483092 WWC1Q8IX03 1113 aa20.47■□□□□ 0.87
CCSAP-204ENST00000483092 FAM13BQ9NYF5 915 aa20.47■□□□□ 0.87
CCSAP-204ENST00000483092 ARAP3Q8WWN8 1544 aa20.46■□□□□ 0.87
CCSAP-204ENST00000483092 MROH1Q8NDA8 1641 aa20.46■□□□□ 0.87
CCSAP-204ENST00000483092 SYNMO15061 1565 aa20.46■□□□□ 0.87
CCSAP-204ENST00000483092 EFCAB6Q5THR3 1501 aa20.46■□□□□ 0.87
CCSAP-204ENST00000483092 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa20.46■□□□□ 0.87
CCSAP-204ENST00000483092 E9PSI1 815 aa20.46■□□□□ 0.87
CCSAP-204ENST00000483092 TNNQ9UQP3 1299 aa20.45■□□□□ 0.86
CCSAP-204ENST00000483092 DEPDC5O75140 1603 aa20.45■□□□□ 0.86
CCSAP-204ENST00000483092 NCLP19338 710 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
CCSAP-204ENST00000483092 FBLN1P23142 703 aa20.45■□□□□ 0.86
CCSAP-204ENST00000483092 PIK3C2GO75747 1445 aa20.45■□□□□ 0.86
CCSAP-204ENST00000483092 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
CCSAP-204ENST00000483092 SLC24A1O60721 1099 aa20.44■□□□□ 0.86
CCSAP-204ENST00000483092 PLPPR3Q6T4P5 718 aa20.44■□□□□ 0.86
CCSAP-204ENST00000483092 MROH2AA6NES4 1674 aa20.44■□□□□ 0.86
CCSAP-204ENST00000483092 KIF1BO60333 1816 aa20.44■□□□□ 0.86
CCSAP-204ENST00000483092 POGZQ7Z3K3 1410 aa20.44■□□□□ 0.86
CCSAP-204ENST00000483092 CGNL1Q0VF96 1302 aa20.44■□□□□ 0.86
CCSAP-204ENST00000483092 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa20.44■□□□□ 0.86
CCSAP-204ENST00000483092 EVC2Q86UK5 1308 aa20.43■□□□□ 0.86
CCSAP-204ENST00000483092 HSCBQ8IWL3 235 aa20.43■□□□□ 0.86
CCSAP-204ENST00000483092 CFAP53Q96M91 514 aa20.43■□□□□ 0.86
CCSAP-204ENST00000483092 USP19O94966 1318 aa20.43■□□□□ 0.86
CCSAP-204ENST00000483092 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa20.42■□□□□ 0.86
CCSAP-204ENST00000483092 PRAM1Q96QH2 718 aa20.42■□□□□ 0.86
CCSAP-204ENST00000483092 CHMP5Q9NZZ3 219 aa20.42■□□□□ 0.86
CCSAP-204ENST00000483092 VWDEQ8N2E2 1590 aa20.41■□□□□ 0.86
CCSAP-204ENST00000483092 FAM69CQ0P6D2 419 aa20.41■□□□□ 0.86
CCSAP-204ENST00000483092 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP20.41■□□□□ 0.869e-8■■□□□ 13.9
CCSAP-204ENST00000483092 RUNDC1Q96C34 613 aa20.39■□□□□ 0.86
CCSAP-204ENST00000483092 MYOM1P52179 1685 aa20.39■□□□□ 0.85
CCSAP-204ENST00000483092 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
CCSAP-204ENST00000483092 MYOM2P54296 1465 aa20.39■□□□□ 0.85
CCSAP-204ENST00000483092 MSNP26038 577 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
CCSAP-204ENST00000483092 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
CCSAP-204ENST00000483092 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa20.39■□□□□ 0.85
CCSAP-204ENST00000483092 YEATS2Q9ULM3 1422 aa20.38■□□□□ 0.85
CCSAP-204ENST00000483092 ERBB4Q15303 1308 aa20.37■□□□□ 0.85
CCSAP-204ENST00000483092 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
CCSAP-204ENST00000483092 C22orf23Q9BZE7 217 aa20.37■□□□□ 0.85
CCSAP-204ENST00000483092 ANTXR1Q9H6X2 564 aa20.36■□□□□ 0.85
CCSAP-204ENST00000483092 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa20.36■□□□□ 0.85
CCSAP-204ENST00000483092 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
CCSAP-204ENST00000483092 WAPLQ7Z5K2 1190 aa20.34■□□□□ 0.85
CCSAP-204ENST00000483092 TBC1D32Q96NH3 1257 aa20.34■□□□□ 0.85
CCSAP-204ENST00000483092 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
CCSAP-204ENST00000483092 DDX11L8A8MPP1 907 aa20.33■□□□□ 0.84
CCSAP-204ENST00000483092 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa20.33■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.5 ms