RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481641.1

CLK1-211, Transcript of CDC like kinase 1, humanhuman

TSL 4

Gene CLK1, Length 690 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK1-211ENST00000481641 TECPR2O15040 1411 aa27.41■■□□□ 1.98
CLK1-211ENST00000481641 ABCC11Q96J66 1382 aa27.4■■□□□ 1.98
CLK1-211ENST00000481641 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP27.4■■□□□ 1.98
CLK1-211ENST00000481641 NUTM2FA1L443 756 aa27.39■■□□□ 1.98
CLK1-211ENST00000481641 CFAP70Q5T0N1 1121 aa27.39■■□□□ 1.98
CLK1-211ENST00000481641 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP27.39■■□□□ 1.97
CLK1-211ENST00000481641 ESCO1Q5FWF5 840 aa27.38■■□□□ 1.97
CLK1-211ENST00000481641 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP27.38■■□□□ 1.97
CLK1-211ENST00000481641 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa27.38■■□□□ 1.97
CLK1-211ENST00000481641 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP27.38■■□□□ 1.97
CLK1-211ENST00000481641 LAMC1P11047 1609 aa27.38■■□□□ 1.97
CLK1-211ENST00000481641 KNDC1Q76NI1 1749 aa27.37■■□□□ 1.97
CLK1-211ENST00000481641 NRXN1Q9ULB1 1477 aa27.36■■□□□ 1.97
CLK1-211ENST00000481641 AFF2P51816 1311 aa27.36■■□□□ 1.97
CLK1-211ENST00000481641 MYOM2P54296 1465 aa27.34■■□□□ 1.97
CLK1-211ENST00000481641 C8orf37Q96NL8 207 aa27.33■■□□□ 1.97
CLK1-211ENST00000481641 ADAMTS2O95450 1211 aa27.31■■□□□ 1.96
CLK1-211ENST00000481641 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP27.31■■□□□ 1.96
CLK1-211ENST00000481641 FOXO3O43524 673 aa27.3■■□□□ 1.96
CLK1-211ENST00000481641 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa27.29■■□□□ 1.96
CLK1-211ENST00000481641 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP27.29■■□□□ 1.96
CLK1-211ENST00000481641 RXRBP28702 533 aa27.28■■□□□ 1.96
CLK1-211ENST00000481641 NPHP3Q7Z494 1330 aa27.27■■□□□ 1.96
CLK1-211ENST00000481641 HRCP23327 699 aa27.27■■□□□ 1.96
CLK1-211ENST00000481641 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP27.27■■□□□ 1.96
CLK1-211ENST00000481641 SIRT1Q96EB6 747 aa27.27■■□□□ 1.96
CLK1-211ENST00000481641 FMN2Q9NZ56 1722 aa27.26■■□□□ 1.95
CLK1-211ENST00000481641 PXDNQ92626 1479 aa27.25■■□□□ 1.95
CLK1-211ENST00000481641 DCAF11Q8TEB1 546 aa27.25■■□□□ 1.95
CLK1-211ENST00000481641 PRAM1Q96QH2 718 aa27.25■■□□□ 1.95
CLK1-211ENST00000481641 NGLY1Q96IV0 654 aa27.24■■□□□ 1.95
CLK1-211ENST00000481641 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP27.22■■□□□ 1.95
CLK1-211ENST00000481641 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP27.2■■□□□ 1.94
CLK1-211ENST00000481641 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP27.19■■□□□ 1.94
CLK1-211ENST00000481641 ADGRB1O14514 1584 aa27.19■■□□□ 1.94
CLK1-211ENST00000481641 POGKQ9P215 609 aa27.19■■□□□ 1.94
CLK1-211ENST00000481641 TRAK1Q9UPV9 953 aa27.19■■□□□ 1.94
CLK1-211ENST00000481641 DLC1Q96QB1 1528 aa27.16■■□□□ 1.94
CLK1-211ENST00000481641 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP27.14■■□□□ 1.94
CLK1-211ENST00000481641 KRT28Q7Z3Y7 464 aa27.14■■□□□ 1.94
CLK1-211ENST00000481641 USP21Q9UK80 565 aa27.14■■□□□ 1.94
CLK1-211ENST00000481641 PHF8Q9UPP1 1060 aa27.14■■□□□ 1.94
CLK1-211ENST00000481641 KIF1AQ12756 1690 aa27.14■■□□□ 1.93
CLK1-211ENST00000481641 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP27.13■■□□□ 1.93
CLK1-211ENST00000481641 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP27.13■■□□□ 1.93
CLK1-211ENST00000481641 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP27.12■■□□□ 1.93
CLK1-211ENST00000481641 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa27.12■■□□□ 1.93
CLK1-211ENST00000481641 RGS12O14924 1447 aa27.1■■□□□ 1.93
CLK1-211ENST00000481641 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP27.1■■□□□ 1.93
CLK1-211ENST00000481641 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP27.1■■□□□ 1.93
CLK1-211ENST00000481641 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa27.08■■□□□ 1.93
CLK1-211ENST00000481641 USP32Q8NFA0 1604 aa27.08■■□□□ 1.93
CLK1-211ENST00000481641 STAC3Q96MF2 364 aa27.07■■□□□ 1.92
CLK1-211ENST00000481641 PLEKHG5O94827 1062 aa27.06■■□□□ 1.92
CLK1-211ENST00000481641 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP27.06■■□□□ 1.92
CLK1-211ENST00000481641 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP27.06■■□□□ 1.92
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CLK1-211ENST00000481641 PSME1Q06323 249 aa27.04■■□□□ 1.92
CLK1-211ENST00000481641 ATRNO75882 1429 aa27.03■■□□□ 1.92
CLK1-211ENST00000481641 BCL9LQ86UU0 1499 aa27.02■■□□□ 1.92
CLK1-211ENST00000481641 TNS3Q68CZ2 1445 aa27.02■■□□□ 1.92
CLK1-211ENST00000481641 ANKARQ7Z5J8 1434 aa27.02■■□□□ 1.92
CLK1-211ENST00000481641 PRR36Q9H6K5 1346 aa27.02■■□□□ 1.92
CLK1-211ENST00000481641 CABLES1Q8TDN4 633 aa27.02■■□□□ 1.92
CLK1-211ENST00000481641 LMOD2Q6P5Q4 547 aa27.01■■□□□ 1.91
CLK1-211ENST00000481641 WASLO00401 505 aaPredicted RBP27■■□□□ 1.91
CLK1-211ENST00000481641 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP26.99■■□□□ 1.91
CLK1-211ENST00000481641 SBNO1A3KN83 1393 aa26.98■■□□□ 1.91
CLK1-211ENST00000481641 TULP4Q9NRJ4 1543 aa26.96■■□□□ 1.91
CLK1-211ENST00000481641 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP26.96■■□□□ 1.91
CLK1-211ENST00000481641 NBPF1Q3BBV0 1214 aa26.94■■□□□ 1.9
CLK1-211ENST00000481641 SLIT2O94813 1529 aa26.93■■□□□ 1.9
CLK1-211ENST00000481641 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP26.93■■□□□ 1.9
CLK1-211ENST00000481641 UNC5CLQ8IV45 518 aa26.92■■□□□ 1.9
CLK1-211ENST00000481641 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP26.92■■□□□ 1.9
CLK1-211ENST00000481641 ARHGEF10O15013 1369 aa26.92■■□□□ 1.9
CLK1-211ENST00000481641 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP26.91■■□□□ 1.9
CLK1-211ENST00000481641 ABCA3Q99758 1704 aa26.9■■□□□ 1.9
CLK1-211ENST00000481641 GPRASP1Q5JY77 1395 aa26.89■■□□□ 1.9
CLK1-211ENST00000481641 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP26.89■■□□□ 1.9
CLK1-211ENST00000481641 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP26.89■■□□□ 1.9
CLK1-211ENST00000481641 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP26.89■■□□□ 1.9
CLK1-211ENST00000481641 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa26.89■■□□□ 1.9
CLK1-211ENST00000481641 CDK19Q9BWU1 502 aa26.88■■□□□ 1.89
CLK1-211ENST00000481641 SIN3AQ96ST3 1273 aa26.87■■□□□ 1.89
CLK1-211ENST00000481641 ATP7BP35670 1465 aa26.87■■□□□ 1.89
CLK1-211ENST00000481641 ATAD2Q6PL18 1390 aa26.86■■□□□ 1.89
CLK1-211ENST00000481641 RALGAPBQ86X10 1494 aa26.86■■□□□ 1.89
CLK1-211ENST00000481641 ALS2Q96Q42 1657 aa26.85■■□□□ 1.89
CLK1-211ENST00000481641 GLI3P10071 1580 aa26.85■■□□□ 1.89
CLK1-211ENST00000481641 FAM83GA6ND36 823 aa26.85■■□□□ 1.89
CLK1-211ENST00000481641 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP26.85■■□□□ 1.89
CLK1-211ENST00000481641 L3MBTL2Q969R5 705 aa26.84■■□□□ 1.89
CLK1-211ENST00000481641 PLCH1Q4KWH8 1693 aa26.84■■□□□ 1.89
CLK1-211ENST00000481641 ITSN1Q15811 1721 aa26.82■■□□□ 1.88
CLK1-211ENST00000481641 NEUROD1Q13562 356 aa26.8■■□□□ 1.88
CLK1-211ENST00000481641 VPS72Q15906 364 aa26.79■■□□□ 1.88
CLK1-211ENST00000481641 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP26.79■■□□□ 1.88
CLK1-211ENST00000481641 NWD2Q9ULI1 1742 aa26.79■■□□□ 1.88
CLK1-211ENST00000481641 EP400Q96L91 3159 aa26.76■■□□□ 1.87
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