RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481211.1

NISCH-208, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 557 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-208ENST00000481211 EVC2Q86UK5 1308 aa18.22■□□□□ 0.51
NISCH-208ENST00000481211 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP18.22■□□□□ 0.51
NISCH-208ENST00000481211 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa18.21■□□□□ 0.51
NISCH-208ENST00000481211 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP18.21■□□□□ 0.51
NISCH-208ENST00000481211 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa18.21■□□□□ 0.51
NISCH-208ENST00000481211 LRRC7Q96NW7 1537 aa18.19■□□□□ 0.5
NISCH-208ENST00000481211 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP18.19■□□□□ 0.5
NISCH-208ENST00000481211 DCCP43146 1447 aa18.19■□□□□ 0.5
NISCH-208ENST00000481211 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa18.19■□□□□ 0.5
NISCH-208ENST00000481211 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP18.18■□□□□ 0.5
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NISCH-208ENST00000481211 TMEM94Q12767 1356 aa18.17■□□□□ 0.5
NISCH-208ENST00000481211 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP18.17■□□□□ 0.5
NISCH-208ENST00000481211 TULP4Q9NRJ4 1543 aa18.17■□□□□ 0.5
NISCH-208ENST00000481211 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP18.17■□□□□ 0.5
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NISCH-208ENST00000481211 C14orf37Q86TY3 774 aa18.13■□□□□ 0.49
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NISCH-208ENST00000481211 C1orf167Q5SNV9 1468 aa18.01■□□□□ 0.47
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NISCH-208ENST00000481211 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa17.95■□□□□ 0.46
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NISCH-208ENST00000481211 ESCO1Q5FWF5 840 aa17.94■□□□□ 0.46
NISCH-208ENST00000481211 AKAP12Q02952 1782 aa17.93■□□□□ 0.46
NISCH-208ENST00000481211 CD163L1Q9NR16 1453 aa17.93■□□□□ 0.46
NISCH-208ENST00000481211 A0A1W2PP64 1363 aa17.92■□□□□ 0.46
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NISCH-208ENST00000481211 ACEP12821 1306 aa17.92■□□□□ 0.46
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NISCH-208ENST00000481211 USP6P35125 1406 aa17.89■□□□□ 0.46
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NISCH-208ENST00000481211 NPHP3Q7Z494 1330 aa17.89■□□□□ 0.45
NISCH-208ENST00000481211 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa17.88■□□□□ 0.45
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NISCH-208ENST00000481211 PSME1Q06323 249 aa17.86■□□□□ 0.45
NISCH-208ENST00000481211 CGNL1Q0VF96 1302 aa17.86■□□□□ 0.45
NISCH-208ENST00000481211 SSH2Q76I76 1423 aa17.86■□□□□ 0.45
NISCH-208ENST00000481211 UBAP1LF5GYI3 381 aa17.85■□□□□ 0.45
NISCH-208ENST00000481211 NHSL1Q5SYE7 1610 aa17.85■□□□□ 0.45
NISCH-208ENST00000481211 CARD14Q9BXL6 1004 aa17.85■□□□□ 0.45
NISCH-208ENST00000481211 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa17.85■□□□□ 0.45
NISCH-208ENST00000481211 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP17.84■□□□□ 0.45
NISCH-208ENST00000481211 SBNO1A3KN83 1393 aa17.83■□□□□ 0.45
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