RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477448.1

SOBP-202, Transcript of sine oculis binding protein homolog, humanhuman

TSL 5

Gene SOBP, Length 1,535 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBP-202ENST00000477448 SLAIN2Q9P270 581 aa36.28■■■■□ 3.4
SOBP-202ENST00000477448 QRICH2Q9H0J4 1663 aa36.26■■■■□ 3.4
SOBP-202ENST00000477448 DLC1Q96QB1 1528 aa36.25■■■■□ 3.39
SOBP-202ENST00000477448 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP36.24■■■■□ 3.39
SOBP-202ENST00000477448 FAM135BQ49AJ0 1406 aa36.24■■■■□ 3.39
SOBP-202ENST00000477448 TESK2Q96S53 571 aa36.24■■■■□ 3.39
SOBP-202ENST00000477448 STK26Q9P289 416 aa36.24■■■■□ 3.39
SOBP-202ENST00000477448 ROBO2Q9HCK4 1378 aa36.23■■■■□ 3.39
SOBP-202ENST00000477448 ABCC11Q96J66 1382 aa36.22■■■■□ 3.39
SOBP-202ENST00000477448 ATF3P18847 181 aa36.21■■■■□ 3.39
SOBP-202ENST00000477448 TECPR2O15040 1411 aa36.21■■■■□ 3.39
SOBP-202ENST00000477448 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP36.2■■■■□ 3.38
SOBP-202ENST00000477448 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP36.18■■■■□ 3.38
SOBP-202ENST00000477448 CADPS2Q86UW7 1296 aa36.18■■■■□ 3.38
SOBP-202ENST00000477448 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa36.17■■■■□ 3.38
SOBP-202ENST00000477448 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa36.16■■■■□ 3.38
SOBP-202ENST00000477448 WASHC2AQ641Q2 1341 aa36.15■■■■□ 3.38
SOBP-202ENST00000477448 PTCH1Q13635 1447 aa36.14■■■■□ 3.38
SOBP-202ENST00000477448 CCDC7Q96M83 1385 aa36.13■■■■□ 3.37
SOBP-202ENST00000477448 KIF7Q2M1P5 1343 aa36.11■■■■□ 3.37
SOBP-202ENST00000477448 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa36.1■■■■□ 3.37
SOBP-202ENST00000477448 DISP3Q9P2K9 1392 aa36.1■■■■□ 3.37
SOBP-202ENST00000477448 WAPLQ7Z5K2 1190 aa36.09■■■■□ 3.37
SOBP-202ENST00000477448 PRAM1Q96QH2 718 aa36.09■■■■□ 3.37
SOBP-202ENST00000477448 SIRT1Q96EB6 747 aa36.08■■■■□ 3.37
SOBP-202ENST00000477448 NALCNQ8IZF0 1738 aa36.08■■■■□ 3.37
SOBP-202ENST00000477448 TMF1P82094 1093 aa36.08■■■■□ 3.37
SOBP-202ENST00000477448 SLC24A1O60721 1099 aa36.06■■■■□ 3.36
SOBP-202ENST00000477448 POGKQ9P215 609 aa36.06■■■■□ 3.36
SOBP-202ENST00000477448 DCCP43146 1447 aa36.06■■■■□ 3.36
SOBP-202ENST00000477448 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa36.04■■■■□ 3.36
SOBP-202ENST00000477448 MST1RQ04912 1400 aa36.03■■■■□ 3.36
SOBP-202ENST00000477448 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP36.02■■■■□ 3.36
SOBP-202ENST00000477448 BRINP3Q76B58 766 aa36.02■■■■□ 3.36
SOBP-202ENST00000477448 TULP4Q9NRJ4 1543 aa36■■■■□ 3.35
SOBP-202ENST00000477448 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP35.95■■■■□ 3.35
SOBP-202ENST00000477448 CDCA8Q53HL2 280 aa35.94■■■■□ 3.34
SOBP-202ENST00000477448 POLR3GLQ9BT43 218 aa35.94■■■■□ 3.34
SOBP-202ENST00000477448 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP35.94■■■■□ 3.34
SOBP-202ENST00000477448 PHLPP1O60346 1717 aa35.93■■■■□ 3.34
SOBP-202ENST00000477448 ADGRB2O60241 1585 aa35.91■■■■□ 3.34
SOBP-202ENST00000477448 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP35.91■■■■□ 3.34
SOBP-202ENST00000477448 EVC2Q86UK5 1308 aa35.91■■■■□ 3.34
SOBP-202ENST00000477448 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP35.9■■■■□ 3.34
SOBP-202ENST00000477448 MYOM1P52179 1685 aa35.9■■■■□ 3.34
SOBP-202ENST00000477448 C1orf167Q5SNV9 1468 aa35.9■■■■□ 3.34
SOBP-202ENST00000477448 ORAI2Q96SN7 254 aa35.89■■■■□ 3.34
SOBP-202ENST00000477448 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP35.89■■■■□ 3.34
SOBP-202ENST00000477448 NUTM2FA1L443 756 aa35.87■■■■□ 3.33
SOBP-202ENST00000477448 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP35.85■■■■□ 3.33
SOBP-202ENST00000477448 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP35.84■■■■□ 3.33
SOBP-202ENST00000477448 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP35.83■■■■□ 3.33
SOBP-202ENST00000477448 ILDR2Q71H61 639 aa35.8■■■■□ 3.32
SOBP-202ENST00000477448 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa35.8■■■■□ 3.32
SOBP-202ENST00000477448 CDK19Q9BWU1 502 aa35.78■■■■□ 3.32
SOBP-202ENST00000477448 JCADQ9P266 1359 aa35.78■■■■□ 3.32
SOBP-202ENST00000477448 WASLO00401 505 aaPredicted RBP35.78■■■■□ 3.32
SOBP-202ENST00000477448 ESCO1Q5FWF5 840 aa35.78■■■■□ 3.32
SOBP-202ENST00000477448 CABP2Q9NPB3 220 aa35.78■■■■□ 3.32
SOBP-202ENST00000477448 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP35.76■■■■□ 3.31
SOBP-202ENST00000477448 NHSL1Q5SYE7 1610 aa35.74■■■■□ 3.31
SOBP-202ENST00000477448 ATAD2Q6PL18 1390 aa35.72■■■■□ 3.31
SOBP-202ENST00000477448 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP35.71■■■■□ 3.31
SOBP-202ENST00000477448 FMN2Q9NZ56 1722 aa35.69■■■■□ 3.3
SOBP-202ENST00000477448 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP35.67■■■■□ 3.3
SOBP-202ENST00000477448 FOXO3O43524 673 aa35.66■■■■□ 3.3
SOBP-202ENST00000477448 ATP7BP35670 1465 aa35.66■■■■□ 3.3
SOBP-202ENST00000477448 USP32Q8NFA0 1604 aa35.65■■■■□ 3.3
SOBP-202ENST00000477448 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa35.65■■■■□ 3.3
SOBP-202ENST00000477448 NINLQ9Y2I6 1382 aa35.65■■■■□ 3.3
SOBP-202ENST00000477448 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP35.64■■■■□ 3.3
SOBP-202ENST00000477448 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP35.63■■■■□ 3.29
SOBP-202ENST00000477448 PANK3Q9H999 370 aa35.63■■■■□ 3.29
SOBP-202ENST00000477448 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP35.63■■■■□ 3.29
SOBP-202ENST00000477448 TMC1Q8TDI8 760 aa35.62■■■■□ 3.29
SOBP-202ENST00000477448 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP35.62■■■■□ 3.29
SOBP-202ENST00000477448 ITSN1Q15811 1721 aa35.62■■■■□ 3.29
SOBP-202ENST00000477448 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa35.62■■■■□ 3.29
SOBP-202ENST00000477448 PRR36Q9H6K5 1346 aa35.6■■■■□ 3.29
SOBP-202ENST00000477448 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP35.6■■■■□ 3.29
SOBP-202ENST00000477448 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP35.6■■■■□ 3.29
SOBP-202ENST00000477448 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP35.6■■■■□ 3.29
SOBP-202ENST00000477448 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP35.6■■■■□ 3.29
SOBP-202ENST00000477448 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa35.59■■■■□ 3.29
SOBP-202ENST00000477448 SHPRHQ149N8 1683 aa35.59■■■■□ 3.29
SOBP-202ENST00000477448 LRP6O75581 1613 aa35.59■■■■□ 3.29
SOBP-202ENST00000477448 NPHP3Q7Z494 1330 aa35.57■■■■□ 3.28
SOBP-202ENST00000477448 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa35.56■■■■□ 3.28
SOBP-202ENST00000477448 ANKARQ7Z5J8 1434 aa35.56■■■■□ 3.28
SOBP-202ENST00000477448 PNPLA6Q8IY17 1366 aa35.55■■■■□ 3.28
SOBP-202ENST00000477448 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP35.55■■■■□ 3.28
SOBP-202ENST00000477448 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa35.55■■■■□ 3.28
SOBP-202ENST00000477448 PHF8Q9UPP1 1060 aa35.54■■■■□ 3.28
SOBP-202ENST00000477448 CCDC61Q9Y6R9 512 aa35.54■■■■□ 3.28
SOBP-202ENST00000477448 CD163L1Q9NR16 1453 aa35.54■■■■□ 3.28
SOBP-202ENST00000477448 CABP1Q9NZU7 370 aa35.52■■■■□ 3.28
SOBP-202ENST00000477448 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa35.52■■■■□ 3.28
SOBP-202ENST00000477448 AKAP12Q02952 1782 aa35.51■■■■□ 3.28
SOBP-202ENST00000477448 PXDNQ92626 1479 aa35.51■■■■□ 3.27
SOBP-202ENST00000477448 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP35.5■■■■□ 3.27
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