RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476860.1

MFSD1-211, Transcript of major facilitator superfamily domain containing 1, humanhuman

TSL 3

Gene MFSD1, Length 460 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD1-211ENST00000476860 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
MFSD1-211ENST00000476860 MAP2K5Q13163 448 aa8.71□□□□□ -1.02
MFSD1-211ENST00000476860 PRDM9Q9NQV7 894 aa8.71□□□□□ -1.02
MFSD1-211ENST00000476860 FOXC1Q12948 553 aa8.7□□□□□ -1.02
MFSD1-211ENST00000476860 NLRP7Q8WX94 980 aa8.7□□□□□ -1.02
MFSD1-211ENST00000476860 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
MFSD1-211ENST00000476860 TREML4Q6UXN2 200 aa8.69□□□□□ -1.02
MFSD1-211ENST00000476860 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
MFSD1-211ENST00000476860 SLC24A3Q9HC58 644 aa8.69□□□□□ -1.02
MFSD1-211ENST00000476860 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
MFSD1-211ENST00000476860 CTC1Q2NKJ3 1217 aa8.68□□□□□ -1.02
MFSD1-211ENST00000476860 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa8.68□□□□□ -1.02
MFSD1-211ENST00000476860 IRF6O14896 467 aa8.67□□□□□ -1.02
MFSD1-211ENST00000476860 DACH1Q9UI36 760 aa8.67□□□□□ -1.02
MFSD1-211ENST00000476860 MMP16P51512 607 aa8.66□□□□□ -1.02
MFSD1-211ENST00000476860 CCDC102AQ96A19 550 aa8.66□□□□□ -1.02
MFSD1-211ENST00000476860 CD46P15529 392 aa8.65□□□□□ -1.02
MFSD1-211ENST00000476860 CYP4X1Q8N118 509 aa8.65□□□□□ -1.02
MFSD1-211ENST00000476860 WNT7AO00755 349 aa8.64□□□□□ -1.03
MFSD1-211ENST00000476860 AK7Q96M32 723 aa8.64□□□□□ -1.03
MFSD1-211ENST00000476860 GRIPAP1Q4V328 841 aa8.63□□□□□ -1.03
MFSD1-211ENST00000476860 AXIN1O15169 862 aa8.62□□□□□ -1.03
MFSD1-211ENST00000476860 Q3C1V9 767 aa8.62□□□□□ -1.03
MFSD1-211ENST00000476860 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
MFSD1-211ENST00000476860 DXOO77932 396 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
MFSD1-211ENST00000476860 SMPD1P17405 629 aa8.61□□□□□ -1.03
MFSD1-211ENST00000476860 TRIM32Q13049 653 aa8.61□□□□□ -1.03
MFSD1-211ENST00000476860 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
MFSD1-211ENST00000476860 TRIM66O15016 1216 aa8.59□□□□□ -1.03
MFSD1-211ENST00000476860 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
MFSD1-211ENST00000476860 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
MFSD1-211ENST00000476860 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
MFSD1-211ENST00000476860 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
MFSD1-211ENST00000476860 KDM4AO75164 1064 aa8.57□□□□□ -1.04
MFSD1-211ENST00000476860 MRGPRX2Q96LB1 330 aa8.57□□□□□ -1.04
MFSD1-211ENST00000476860 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
MFSD1-211ENST00000476860 USP46P62068 366 aa8.56□□□□□ -1.04
MFSD1-211ENST00000476860 AMHR2Q16671 573 aa8.56□□□□□ -1.04
MFSD1-211ENST00000476860 HOXA2O43364 376 aa8.55□□□□□ -1.04
MFSD1-211ENST00000476860 WIPF1O43516 503 aa8.55□□□□□ -1.04
MFSD1-211ENST00000476860 WFS1O76024 890 aa8.55□□□□□ -1.04
MFSD1-211ENST00000476860 PDE4DQ08499 809 aa8.55□□□□□ -1.04
MFSD1-211ENST00000476860 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
MFSD1-211ENST00000476860 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa8.55□□□□□ -1.04
MFSD1-211ENST00000476860 J3QL48 77 aa8.54□□□□□ -1.04
MFSD1-211ENST00000476860 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
MFSD1-211ENST00000476860 WNT7BP56706 349 aa8.54□□□□□ -1.04
MFSD1-211ENST00000476860 NEUROD2Q15784 382 aa8.54□□□□□ -1.04
MFSD1-211ENST00000476860 SKOR1P84550 965 aa8.53□□□□□ -1.04
MFSD1-211ENST00000476860 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
MFSD1-211ENST00000476860 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
MFSD1-211ENST00000476860 LCE2CQ5TA81 110 aa8.53□□□□□ -1.04
MFSD1-211ENST00000476860 HLA-CQ95604 372 aa8.53□□□□□ -1.04
MFSD1-211ENST00000476860 CLCN1P35523 988 aa8.52□□□□□ -1.05
MFSD1-211ENST00000476860 PARP9Q8IXQ6 854 aa8.52□□□□□ -1.05
MFSD1-211ENST00000476860 TRIM47Q96LD4 638 aa8.52□□□□□ -1.05
MFSD1-211ENST00000476860 GPCPD1Q9NPB8 672 aa8.52□□□□□ -1.05
MFSD1-211ENST00000476860 HPS1Q92902 700 aa8.5□□□□□ -1.05
MFSD1-211ENST00000476860 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
MFSD1-211ENST00000476860 SENP2Q9HC62 589 aa8.5□□□□□ -1.05
MFSD1-211ENST00000476860 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
MFSD1-211ENST00000476860 JUNDP17535 347 aa8.49□□□□□ -1.05
MFSD1-211ENST00000476860 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
MFSD1-211ENST00000476860 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
MFSD1-211ENST00000476860 KDM4CQ9H3R0 1056 aa8.48□□□□□ -1.05
MFSD1-211ENST00000476860 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
MFSD1-211ENST00000476860 SIAH2O43255 324 aa8.47□□□□□ -1.05
MFSD1-211ENST00000476860 GUCA2AQ02747 115 aa8.47□□□□□ -1.05
MFSD1-211ENST00000476860 KIFC2Q96AC6 838 aa8.47□□□□□ -1.05
MFSD1-211ENST00000476860 STK17AQ9UEE5 414 aa8.47□□□□□ -1.05
MFSD1-211ENST00000476860 TERTO14746 1132 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
MFSD1-211ENST00000476860 RETREG3Q86VR2 466 aa8.46□□□□□ -1.06
MFSD1-211ENST00000476860 CCDC24Q8N4L8 307 aa8.45□□□□□ -1.06
MFSD1-211ENST00000476860 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
MFSD1-211ENST00000476860 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
MFSD1-211ENST00000476860 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
MFSD1-211ENST00000476860 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
MFSD1-211ENST00000476860 MS4A1P11836 297 aa8.42□□□□□ -1.06
MFSD1-211ENST00000476860 NUDT12Q9BQG2 462 aa8.42□□□□□ -1.06
MFSD1-211ENST00000476860 PCDHGC3Q9UN70 934 aa8.42□□□□□ -1.06
MFSD1-211ENST00000476860 ALDH1A1P00352 501 aa8.4□□□□□ -1.06
MFSD1-211ENST00000476860 SH3BP2P78314 561 aa8.39□□□□□ -1.07
MFSD1-211ENST00000476860 FAM117AQ9C073 453 aa8.39□□□□□ -1.07
MFSD1-211ENST00000476860 CCNYL3P0C7X3 344 aa8.38□□□□□ -1.07
MFSD1-211ENST00000476860 FDX1P10109 184 aa8.38□□□□□ -1.07
MFSD1-211ENST00000476860 PTPRNQ16849 979 aa8.38□□□□□ -1.07
MFSD1-211ENST00000476860 TRIM46Q7Z4K8 759 aa8.38□□□□□ -1.07
MFSD1-211ENST00000476860 NPAS3Q8IXF0 933 aa8.38□□□□□ -1.07
MFSD1-211ENST00000476860 EHBP1Q8NDI1 1231 aa8.38□□□□□ -1.07
MFSD1-211ENST00000476860 DDRGK1Q96HY6 314 aa8.38□□□□□ -1.07
MFSD1-211ENST00000476860 NUTM1Q86Y26 1132 aa8.37□□□□□ -1.07
MFSD1-211ENST00000476860 MPNDQ8N594 471 aa8.37□□□□□ -1.07
MFSD1-211ENST00000476860 BEGAINQ9BUH8 593 aa8.37□□□□□ -1.07
MFSD1-211ENST00000476860 EVA1BQ9NVM1 165 aa8.36□□□□□ -1.07
MFSD1-211ENST00000476860 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
MFSD1-211ENST00000476860 PLEKHG3A1L390 1219 aa8.35□□□□□ -1.07
MFSD1-211ENST00000476860 LORP23490 312 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
MFSD1-211ENST00000476860 DESI1Q6ICB0 168 aa8.35□□□□□ -1.07
MFSD1-211ENST00000476860 IL27Q8NEV9 243 aa8.35□□□□□ -1.07
MFSD1-211ENST00000476860 SPIRE2Q8WWL2 714 aa8.35□□□□□ -1.07
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